生物学术语表达序列标签的原理

EST是从一个随机选择的cDNA克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20到7000bp不等,平均长度为360±120bp 。EST来源于一定环境下一个组织总mRNA所构建的cDNA文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。......阅读全文

生物学术语表达序列标签的原理

EST是从一个随机选择的cDNA克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20到7000bp不等,平均长度为360±120bp 。EST来源于一定环境下一个组织总mRNA所构建的cDNA文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水

生物学术语表达序列标签的方法

EST作为表达基因所在区域的分子标签因编码DNA序列高度保守而具有自身的特殊性质,与来自非表达序列的标记(如AFLP、RAPD、SSR 等)相比更可能穿越家系与种的限制,因此EST标记在亲缘关系较远的物种间比较基因组连锁图和比较质量性状信息是特别有用。同样,对于一个DNA序列缺乏的目标物种,来源于其

生物学术语表达序列标签的定义

表达序列标签从互补DNA(cDNA)分子所测得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库,代表在一定的发育时期或特定的环境条件下,特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达,推导全长cDNA序列,或作为标签标志

表达序列标签的应用原理

EST是从一个随机选择的cDNA克隆进行5’端和3’端单一次测序获得的短的cDNA部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20到7000bp不等,平均长度为360±120bp 。EST来源于一定环境下一个组织总mRNA所构建的cDNA文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水

表达序列标签的应用

EST作为表达基因所在区域的分子标签因编码DNA序列高度保守而具有自身的特殊性质,与来自非表达序列的标记(如AFLP、RAPD、SSR 等)相比更可能穿越家系与种的限制,因此EST标记在亲缘关系较远的物种间比较基因组连锁图和比较质量性状信息是特别有用。同样,对于一个DNA序列缺乏的目标物种,来源于其

表达序列标签的作用

⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱;⑵ 作为探针用于放射性杂交;⑶ 用于定位克隆;⑷ 借以寻找新的基因;⑸ 作为分子标记;⑹ 用于研究生物群体多态性;⑺ 用于研究基因的功能;⑻ 有助于药物的开发、品种的改良;⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能,使其得到了充分的利用

表达序列标签的方法

首先从样品组织中提取mRNA,在逆转录酶的作用下用oligo(dT)作为引物进行RT-PCR合成cDNA,再选择合适的载体构建cDNA 文库,对各菌株加以整理,将每一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行两端一次性自动化测序,这就是EST序列的产生过程。

什么是表达序列标签?

表达序列标签从互补DNA(cDNA)分子所测得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库,代表在一定的发育时期或特定的环境条件下,特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达,推导全长cDNA序列,或作为标签标志

表达序列标签的作用表现

⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱;⑵ 作为探针用于放射性杂交;⑶ 用于定位克隆;⑷ 借以寻找新的基因;⑸ 作为分子标记;⑹ 用于研究生物群体多态性;⑺ 用于研究基因的功能;⑻ 有助于药物的开发、品种的改良;⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能,使其得到了充分的利用

表达序列标签图的定义

中文名称表达序列标签图英文名称expressed sequence tag map定  义标明表达序列标签在基因组上位置的物理图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

序列标签位点的简介

任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。这种序列在染色体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,STS适宜于作为人类基因组的一种

序列标签位点的定义

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

序列标签位点图的定义

中文名称序列标签位点图英文名称sequence tagged site map定  义标明序列标签位点在基因组上位置的物理图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

生物学术语稳态

稳态(Homeostasis )指的是把正常机体通过调节作用,使得各个器官、系统的协调活动,共同维持内环境的相对稳定状态。内环境保持相对稳定是生物体自由生存的条件。

生物学术语底物

底物为参与生化反应的物质,可为化学元素、分子或化合物,作用可形成产物。一个生化反应的底物往往同时也是另一个化学反应的产物。

生物学术语别构酶

当某些化合物与酶分子中的别构部位可逆地结合后,酶分子的构象发生改变,使酶活性部位对底物的结合与催化作用受到影响,从而调节酶促反应速度及代谢过程,这种效应称为别构效应。具有别构效应的酶称为别构酶。别构酶常是代谢途径中催化第一步反应或处于代谢途径分支点上的一类调节酶,大多能被代谢最终产物所抑制,对代谢调

BIORAD-采用-Profinity-eXactTM融合标签表达系统纯化无标签...

BIORAD 采用 Profinity eXactTM融合标签表达系统纯化无标签的重组蛋白亲和标签已成为后基因组学时代纯化重组蛋白常用手段。此方法无需了解蛋白质的生化特性或生理活性,就可通过带标签的重组融合蛋白选择性地与层析基质上的配体结合,从而得以纯化任何蛋白质。此方法与常规的层析方法不同之处在于

用于蛋白质表达的标签实验

实验步骤一、设计具有标签的蛋白质时需要考虑的因素亲和力和可溶性的选择在大肠埃布氏菌中生产外源蛋白时面临两个挑战: 一? 是所用蛋白质表达系统的表达水平很低; 二是所表达的蛋白质被错误折叠进不溶性的聚集体—包涵体中。弱启动子、低转录起始或稀有密码子的存在引起的表达问题都可以通过在装配过表达质粒时将矫正

用于蛋白质表达的标签实验

实验步骤 一、设计具有标签的蛋白质时需要考虑的因素 亲和力和可溶性的选择 在大肠埃布氏菌中生产外源蛋白时面临两个挑战: 一? 是所用蛋白质表达系统的表达水平很低; 二是所表达的蛋白质被错误折叠进不溶性的聚集体—包涵体中。弱启

生物学术语稳态的意义

对人和高等动物而言,内环境的稳态是细胞维持正常生理功能,乃至机体维持正常生命活动的必要条件。内环境的稳态就是指在正常情况下机体内环境的各种成分和理化性质只在很小的范围内发生变动。例如体温维持在37°C左右,血浆pH维持在7.4左右,动脉血压、血浆中的氧和二氧化碳分压、葡萄糖浓度等也都维持在相对恒定的

生物学术语前稳态

酶-底物复合物的浓度随时间的增加而增加,尚未达到稳态的状态。其反应非常快,只有应用测定快速反应的停流装置或弛豫技术才有可能跟踪。

生物学术语假底物

可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。有些酶具有假底物结构域,其中的特定序列或残基作为假底物结合到酶的活性部位,抑制酶活性,当酶与配基结合后发生构象变化,释放假底物,恢复催化功能。这是体内调节酶活性的一种重要方式。

生物学术语-渗透作用

渗透作用(Osmosis)指两种不同浓度的溶液隔以半透膜(允许溶剂分子通过,不允许溶质分子通过的膜),水分子或其它溶剂分子从低浓度的溶液通过半透膜进入高浓度溶液中的现象。或水分子从水势高的一方通过半透膜向水势低的一方移动的现象。

关于外显子的表达序列介绍

  在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外

表达基因的克隆策略与分离表达基因序列的技术方法

人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基因组中绝大部

用于蛋白质表达的标签实验2

三、标签的去除由于蛋白标签可能会干扰目标蛋白质的正常功能,所以在完成其促进溶解或亲和纯化的作用后,标签的去除对于生物学和功能研究很有帮助,对 GST 或 MBP 这样的大标签尤其如此,尽管有一些例子显示融合了标签的蛋白质更易结晶 (Smythetal.,2003)。大多数用来向目标蛋白质添加标签的商

用于蛋白质表达的标签实验(一)

一、设计具有标签的蛋白质时需要考虑的因素亲和力和可溶性的选择在大肠埃布氏菌中生产外源蛋白时面临两个挑战: 一? 是所用蛋白质表达系统的表达水平很低; 二是所表达的蛋白质被错误折叠进不溶性的聚集体—包涵体中。弱启动子、低转录起始或稀有密码子的存在引起的表达问题都可以通过在装配过表达质粒时将矫正

用于蛋白质表达的标签实验(二)

二、可溶性标签在重组蛋白表达中,特别是当在细菌中表达真核蛋白时,主要的瓶颈在于蛋白质的正确折叠与可溶性。一些可溶性蛋白已被作为标签用来改善目标蛋白质的折叠。这些标签应该与其他方法共同使用来促进蛋白质的折叠,如诱导后降低培养温度或者共表达伴侣蛋白(BaneyxandMujacic,2004;deMar

重组蛋白表达的几种常用标签介绍

 重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。本文将简要介绍几个常用载体标签及其功能和优点。一. GST标签GST(谷胱甘肽巯基转移酶) 标签蛋白本身是一个在解毒过程中起到重要作用的转移酶,它的天然大小为26KD。将它应用在原