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ChIPseq&mRNAseq在外周淋巴瘤的药物联用实验中的应用

上海交通大学附属瑞金医院血液研究所赵维莅教授团队针对外周淋巴瘤的研究。近期,该课题组应用ChIP-seq联合分析揭示了联用西达本胺和地西他滨对组蛋白修饰基因突变的外周淋巴瘤的作用机制。该研究成果于月发表在血液科权威杂志《Haematologica》(影响因子7.7)上。(ChIP-seq及mRNA-seq均由云序生物提供技术服务) 研究背景: 由于不同的形态和免疫特征,约50%的外周淋巴瘤(PTCL)无法分类,并且呈现很差的临床表现,因此迫切需要找到可操作性的生物标志物以便临床上找到更好的治疗策略。已知表观遗传改变在肿瘤发展中起到很关键的作用。组蛋白修饰,尤其是甲基化和乙酰化,一般都会参与调控染色体的状态。在本研究中,作者首先通过靶向测序筛选到一系列组蛋白修饰相关基因的突变,接下来通过ChIP-seq和mRNA-seq进一步分析西达本胺和地西他滨联用对组蛋白修饰基因突变的外周T淋巴瘤的作用机制。 研究思路:......阅读全文

ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的药物联用实验中的应用

  上海交通大学附属瑞金医院血液研究所赵维莅教授团队针对外周淋巴瘤的研究。近期,该课题组应用ChIP-seq联合分析揭示了联用西达本胺和地西他滨对组蛋白修饰基因突变的外周淋巴瘤的作用机制。该研究成果于月发表在血液科权威杂志《Haematologica》(影响因子7.7)上。(ChIP-seq及mRN

ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的药物联用实验中的应用

上海交通大学附属瑞金医院血液研究所赵维莅教授团队针对外周淋巴瘤的研究。近期,该课题组应用ChIP-seq联合分析揭示了联用西达本胺和地西他滨对组蛋白修饰基因突变的外周淋巴瘤的作用机制。该研究成果于月发表在血液科权威杂志《Haematologica》(影响因子7.7)上。(ChIP-seq及mRNA-

ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的药物联用实验中的应用

  上海交通大学附属瑞金医院血液研究所赵维莅教授团队针对外周淋巴瘤的研究。近期,该课题组应用ChIP-seq联合分析揭示了联用西达本胺和地西他滨对组蛋白修饰基因突变的外周淋巴瘤的作用机制。该研究成果于月发表在血液科权威杂志《Haematologica》(影响因子7.7)上。(ChIP-seq及mRN

用CRISPR 突破ChIP-seq的局限

  生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞在转录因子的控制下表达不同的基因,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因有助于向其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达的基因有助于它们合成抗体。  将染色质免疫共沉淀技术与下一代高通量测序技术相结合的染色质免疫共沉淀测序(ChI

ChIP-Seq分析常见问题集锦

染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)是指对染色质免疫共沉淀(ChIP)获得的DNA片段进行大规模测序,并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。Roche GS FLX Titanium 、Illumina Hiseq2000和AB SOLID 4 这3种测序技术均可以用于ChIP-

Nature Biotechnology:可取代ChIP-seq的新技术

  生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。  这样的基因表达受到转录因子的控制,但人们一直很难定位功能性转录因子在DNA上的结合位点。之前的

淋巴瘤病理诊断中的抗体选择

  常常有人问我,在淋巴瘤诊断中如何选择抗体?选择多了会造成浪费,增加患者经济负担,甚至引发纠纷;选择少了不能满足诊断需要。这确实是一个很实际的问题, 也很难有一个统一和固定的标准。因为每个病例都不同,每个医生的形态学诊断和鉴别诊断水平也不一样,对抗体数量和种类需求也就有差异。一般

套细胞淋巴瘤 or 弥漫大B细胞淋巴瘤?

    2016年8月24日苏州大学附属第二医院的张宏老师在全国形态学诊断学术交流群分享了一例少见的淋巴瘤病例,引起群内专家老师热烈讨论。现将病例精华整理成章,方便大家学习和收藏。    张宏-苏州大学附属第二医院:在不参考病史和细胞形态的情况下,仅凭流式图,

强生淋巴瘤药物Imbruvia获FDA批准

  强生(JNJ)和Pharmacyclics 11月13日宣布,FDA已批准血癌药物ibrutinib(拟用商品名为Imbruvica),用于既往已接受至少一种其他药物(如Celgene公司的Revlimid)治疗的套细胞淋巴瘤(mantle cell lymphoma,MCL)成人患者的

盘点:淋巴瘤13种靶向药物(新疗法)

  淋巴瘤传统的治疗方法为化疗和放疗,但近年来,随着靶向疗法、免疫疗法的进展,淋巴瘤治愈正成为现实。本文盘点了13种已上市的淋巴瘤药物:  No.1  药品名称:Idelalisib(Zydelig)  生产厂商:Gilead Sciences,Inc.  作用机制:Idelalisib是一种PI3