Antpedia LOGO WIKI资讯

Nature子刊:首次实现活细胞RNA标记与无背景成像

生物大分子标记技术是生物分子成像的关键。在科学历史上,人们利用荧光蛋白“点亮”细胞内蛋白质, 实现了生命动态过程中蛋白质分子的可视化。荧光蛋白技术是当代生物科学研究中最重要的研究工具之一;在短短十余年内,其研究即被授予诺贝尔奖。RNA同样具有独特的结构、种类繁多的生物学功能以及复杂的时间空间分布。 与蛋白质相比,RNA种类更多,大部分种类结构功能尚未鉴定,被称为基因组中的“暗物质”。不同种类的RNA及其修饰形式的鉴定、功能与调控研究现已经成为了国际前沿。RNA研究也迫切需要一种类似于荧光蛋白这样的颠覆性标记技术,这是深入研究RNA功能机制极为有用的工具。 国际权威学术期刊《Nature Biotechnology》杂志以“Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fluorescent RNAs”为题,在线报道了华东理工大学生物反应器工程......阅读全文

活体生物发光成像技术的最新进展

活体动物体内光学成像(Optical in vivo Imaging)主要采用生物发光(bioluminescence)与荧光(fluorescence)两种技术。生物发光是用荧光素酶(Luciferase)基因标记细胞或DNA,而荧光技术则采用荧光报告基团(GFP、RFP, Cyt及dyes等)进

生物物理所在RNA定点特异标记研究中获得新进展

  2月18日,Angewandte Chemie International Edition 在线发表了中国科学院生物物理研究所王江云研究组题为A Covalent Approach for Site-Specific RNA Labeling in Mammalian Cells 的最新研究成果

量子点活细胞成像应用的实验方案建议

   量子点(Quantum dot, QD)是一种新型荧光纳米材料,又称半导体纳米晶,呈近似球形,三维尺寸在2-10nm,具有明显的量子效应,其物理、光学、电学特性优于传统有机荧光染料,是新一代荧光标记探针的优质选择。    Chan等将量子点与传统有机荧光染料进行了光学特性的比较,发现量子点的

基因技术专题-1

专题一:RNA干扰技术(RNAi)1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA。这些

量子点活细胞成像应用的实验方案

量子点(Quantum dot, QD)是一种新型荧光纳米材料,又称半导体纳米晶,呈近似球形,三维尺寸在2-10nm,具有明显的量子效应,其物理、光学、电学特性优于传统有机荧光染料,是新一代荧光标记探针的优质选择。Chan等将量子点与传统有机荧光染料进行了光学特性的比较,发现量子点的荧光亮度是传统荧

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

流式细胞术在血液学中的应用

  DNA倍体分析及细胞周期分析    在细胞周期内,DNA含量随细胞内时相发生周期性变化,正常情况下,大多数细胞处于休止期(Go), G1期细胞虽有DNA合成,但DNA含量仍为2N,为二倍体细胞,;处于活跃的DNA合成期(S期)的细胞DNA含量为2N-4N;正经历细胞分裂(G2/M期)的细胞

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(1)

1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA[1]。这些双链RNA是体外

Nature | 转移灶示踪新方法发现具有干细胞特性实质细胞

  肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)不但为肿瘤细胞提供了生存和增殖的土壤,还可以改变肿瘤细胞的增殖和侵袭行为,二者之间的相互作用促进着肿瘤生成、迁移转移、血管生成、免疫抑制及靶器官选择等过程发生。以往的多项研究表明,微环境中如激活的成纤维细胞、周细胞、内皮细胞、炎

研究蛋白质-RNA相互作用的新工具

  近日,赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit,让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵,轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比,这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。  蛋白

邹鹏/王建斌合作发展空间特异性RNA标记技术

  真核细胞转录组在三维空间中的分布特征对于基因表达具有重要调节作用。在记忆形成、胚胎发育、细胞增殖等一系列生理学过程中,细胞通过将特定RNA分子选择性富集在亚细胞区域,能够实现对蛋白质翻译过程的精准调控,或帮助建立和维持染色体三维结构。因此,发展一种能在转录组层面解析细胞中RNA三维空间定位的方法

Cell子刊论文解答细胞生物学谜题

  在任何教科书的简图中,一组红血细胞、皮肤细胞或神经细胞,通常大小都是相同的。但是,正如没有哪两个人的身高和体重是完全相同,在一个真正的细胞群体中,细胞的尺寸是有大有小的。  最近,宾夕法尼亚大学的一个研究小组表明,在大多数细胞染色体中的核DNA的两个拷贝,可以使细胞具有任何的尺寸大小。相关研究结

流式检测细胞凋亡还有哪些方法?

  前面讲到利用流式细胞术进行细胞凋亡检测的annexinV/PI双染色法,今天主要简要介绍SYTO/PI双染色法、细胞DNA含量分析法、TUNEL法。  SYTO/PI双染色法  SYTO系列染料是一种细胞膜通透性的核酸染料,可以自由进入活细胞与细胞内的DNA或者RNA结合,未结合时发射荧光信号的

细胞RNA实时成像或将“成为可能”?!

  结合并激活荧光染料的适体荧光 RNA(FR)已用于对丰富的细胞 RNA 种类进行成像。然而,诸如低亮度和具有不同光谱特性的染料 / 适体组合的有限可用性的局限性,限制了这些工具在活的哺乳动物细胞和体内的使用。  2019 年 9 月 23 日,华东理工大学朱麟勇及杨弋共同通讯在 Nature B

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术

  microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术   摘要:   已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分

凝胶迁移实验(EMSA)——凝胶迁移

凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)可以:(1)研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用;(2)可用于DNA定性和定量分析;(3)用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。实验方法原理一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初

Nature论述:单细胞基因组学揭开“免疫新世界”

  人类对生命的好奇,从来没有减退。一个多世纪以来,科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞,从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程,挖掘重要的细胞类型和信号通路。  但是,过去几十年,包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

科学家首次实现活细胞RNA标记与无背景成像

图为《自然—生物技术》11月期封面图片。它显示了利用荧光RNA可对单细胞中mRNA的翻译过程进行定量研究。癌细胞中mRNA水平与其编码蛋白质水平之间存在较低相关性,提示癌细胞的翻译调控显著失调,这为癌症的诊疗提供一种全新的思路。  华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的杨弋、朱麟勇等教授历经7年

国际首次|我国学者实现活细胞RNA标记与无背景成像

  华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的杨弋、朱麟勇等教授历经7年合作研究,在荧光RNA及活细胞RNA成像领域获突破性进展。他们原创的系列高性能荧光RNA,在国际上首次实现了不同种类RNA在动物细胞内的荧光标记与无背景成像。11月5日,该成果以封面论文形式发表于《自然—生物技术》。  荧光蛋白

酵母三杂交系统检测和分析RNA-蛋白相互作用实验

酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方

流式细胞仪在生物学中的应用

流式细胞仪在生物学中的应用 耿慧霞 ,王 来 ,王 强 (河南大学生命科学学院 ,河南开封 475001) 摘 要 :简要论述了流式细胞仪(flow cytometry ,FCM) 的工作原理 ,并对其在生物学基础科学研究中的应用进行阐述 ,包括 对细胞凋亡、细胞周期、免疫细胞、细胞受体的研

组织学研究方法

(一)一般光学显微镜术应用一般光学显微镜(简称光镜)观察组织切片是组织学研究的最基本方法。取动物或人体的新鲜组织块,先用固定剂(fixative)固定(fixation),使组织中的蛋白质迅速凝固,防止细胞自溶和组织腐败。常用的固定剂如洒精、甲醛、醋酸、苦味酸、四氧化锇等,一般常将几种固定剂配制成混

凝胶迁移实验(EMSA)

实验方法原理 凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列

解读单细胞RNA-seq技术

  多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。  我们都参加过大型生日派对:在拥挤的房间里,与许多人聊天、吃饭和庆祝。但是,试想你并不知道寿星是谁,只是像一个局外者看待这个派对。你可能会觉得整个事件看起来与

解读单细胞RNA-seq技术

多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运  多年来,跟踪一个单细胞的转录组,超出了我们的能力。但是现在,时代已经变了,新的单细胞RNA-seq方法,可以分析大量的细胞及它们的命运。  我们都参加过大型生日派

细胞凋亡及其检测技术-3

2、RT-PCR法检测细胞bcl-2 mRNA的表达:(1)总RNA提取:为了获得高质量的真核细胞mRNA,必须使用RNA酶抑制剂。操作过程中应避免RNA酶污染器材和试剂,因此所有剥离、塑料器材先用0.1%DEPC水溶液浸泡12h,然后用无菌的新鲜蒸馏水淋洗数次,塑料器材应采用高压蒸汽灭菌。玻璃器材

酵母三杂交系统检测和分析RNA-蛋白相互作用实验

实验方法原理 酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。试剂、试剂盒 YPD 和 SD 培养基鲑

流式细胞仪技术概述

流式细胞仪技术,主要是测量群体中单个细胞经适当染色后其成分所发出的散射光和荧光,经染色的细胞在悬液中以单行流过高强度光源的焦点,当每个细胞经过焦点时,发出一束散射光/或荧光。它们经过过滤及光镜系统收集到达一个光电检测器(光电倍增管或一个固态装置),光检测器把散射光定量转化成电信号,经数字转换器进行数

流式细胞仪技术概述

流式细胞仪技术,主要是测量群体中单个细胞经适当染色后其成分所发出的散射光和荧光,经染色的细胞在悬液中以单行流过高强度光源的焦点,当每个细胞经过焦点时,发出一束散射光/或荧光。它们经过过滤及光镜系统收集到达一个光电检测器(光电倍增管或一个固态装置),光检测器把散射光定量转化成电信号,经数字转换器进行数