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癌症eRNA表达图谱并揭示其在癌症临床中的应用

2019年10月8日,德克萨斯大学休斯敦健康研究中心的韩冷、李文博课题组合作在Nature Communications上在线发表题为“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy incancer”的研究。该研究构建了迄今为止最完整的癌症增强子RNA(eRNA)图谱并揭示了eRNA在癌症临床中的潜在应用。 该项研究通过检测eRNA在约1万名癌症病人及约1000个癌症细胞系中的表达构建了目前为止最全面的癌症eRNA图谱,揭示了eRNA的癌症特异性表达/癌症种系特异性表达的特征,同时强调了eRNA作为生物标记物在不同类型癌症临床上的应用。通过研究eRNA与转录因子之间的共表达关系,发现eRNA的特异性表达与转录因子特异性调控密切相关。通过分析eRNA与编码基因之间的基因组距离及表达相关性并结合多......阅读全文

癌症eRNA表达图谱并揭示其在癌症临床中的应用

  2019年10月8日,德克萨斯大学休斯敦健康研究中心的韩冷、李文博课题组合作在Nature Communications上在线发表题为“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted

基于八大基因组学数据库 构建迄今最完整的癌症eRNA图谱

  增强子RNA(eRNA)是一种从增强子转录的非编码RNA。目前,科学家已经在人类细胞中鉴定出数以万计的eRNA,其中许多都在RNA转录过程中发挥重要作用,以介导靶基因的激活。在人类癌症中,癌基因或致癌信号通路的激活通常引起增强子的激活和eRNA的产生。例如,ESR1的激活可以整体上增加乳腺癌中e

The scientist为你解读神秘的eRNA

  近年来科学家们发现,增强子也常常转录成RNA,不过他们还不能确定这些eRNA有何功能。日前,The scientist杂志刊发文章对这种神秘的eRNA进行了解读。  增强子大约发现于三十五年前,关于这一元件还有许多的未解之谜。与启动子不同的是,增强子能够上调较远距离的基因,这一距离并不一定,不过

eRNA与Super Enhancer RNA在转录调控中扮演的角色

增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件,能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录,产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具

临床物理检查方法--平衡法放射性核素心血管造影(ERNA)

平衡法放射性核素心血管造影(ERNA)介绍:  平衡法放射性核素心血管造影(ERNA) 包括以下几项:  (1) 血池显像,肝脾等脏器内占位病变的血池影像浓于正常组织,是海绵状血管瘤的特征。  (2) 室壁运动电影显示,室壁瘤的特征是静息时局部室壁无运动或已有反常搏动,运动后反常搏动出现或更加明显。

癌症治疗新曙光:癌症建模

  现在科学家们将患者的肿瘤细胞接种到小鼠体内,进而建立肿瘤模型,以用于分析和开展药物测试。目前研究人员已鉴定了一系列小儿实体肿瘤模型,同时相关数据的允许免费获取。  罕见癌症的研究面临着两方面的挑战:可用的肿瘤样本少;缺乏相应的小鼠模型。最近科学家们非常成功地开发了将人类肿瘤细胞高效移植到免疫缺陷

Nature癌症综述:复制应激与癌症

  基因组的稳定性直接关联到细胞是否发生癌变,而在这其中,DNA复制是最容易发生变化的过程,也是最容易致癌的过程。任何导致DNA损伤高水平发生的条件也都会引发复制应激(replication stress),这是基因组不稳定的来源之一,也是癌变前细胞和癌变细胞的一大标志。  来自西班牙塞维利亚大学的

癌症检测

什么是肿瘤标志物  肿瘤标志物是由肿瘤细胞产生的,存在于细胞.组织或体液中,能用化学或免疫方法定量、证明癌肿存在(或在某一脏器存在)、可以监测肿瘤治疗和预后的物质。有的肿瘤标志物在正常人体内不存在,罹忠癌症后才会出现,有的则是罹患癌症后水平会显著高于正常人,因此,肿瘤标志物检查可以检测到早期癌症的踪

Nature癌症综述:如何用CRISPR进行癌症研究

   CRISPR/Cas9系统可以很容易地改写多种生物的基因组,这一技术很快如风暴一般席卷了整个基因组工程领域。可想而知,以CRISPR/Cas9为基础的各种应用也将为癌症遗传学领域带来一场变革。麻省理工霍华德・休斯医学研究所的Tyler Jacks就是这方面的先行者,他去年连发两篇Nature文

癌症患者身心压力大将加快癌症扩散

  英媒称,新研究发现,癌症患者的身心压力与癌症扩散速度存在惊人关联——压力大导致癌症的扩散速度加快5倍。  英国《每日邮报》网站报道,这项研究揭示,这一关联可能让人体变成一条令癌症四处扩散的“高速公路”。  澳大利亚莫纳什药物科学研究所的肿瘤生物学家埃丽卡·斯隆博士对《每日邮报》澳大利亚版记者说: