染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制

日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。 真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特征,其中99%的真蕨植物为同型孢子真蕨。其中铁线蕨(Adiantum capillus-veneris L.)是其中具有代表性的同型孢子真蕨之一,常被当作模式生物进行研究。科研人员组装了铁线蕨基因组,获得首个铁线蕨高质量染色体级别参考基因组,拼接基因组达到4.83Gb,覆盖了97.58%的基因组,染色体数目为30。研究人员通过代谢组学和转录组学数据分析发现,真叶植物BRI1-BRL基因家族在维管束分布丰富的叶柄和叶片中表达显著,该基因亚家族的扩张很可能与真叶维管系统的起源有关,是推动真叶植物维管系统复杂化、进而产生真叶的分子动力。此外......阅读全文

染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制

   日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。  真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特

海绵基因组草图绘制完成

  一个国际研究小组在5日出版的英国《自然》杂志上报告说,他们绘制出了海绵的基因组草图,并从中发现了许多有助于探索多细胞动物起源的信息。  这个由美国、德国、澳大利亚等国研究人员组成的小组报告说,他们完成了大堡礁海绵基因组测序草图,结果显示其中包含约1.8万个基因。海绵6亿多年前就出现在地球上,是已

绘制基因组的“谷歌地图”

  染色体的功能远不止保持DNA整齐有序。这种基因组DNA和蛋白质组成的复合物有许多不同的结构和构象。这些结构和构象可能会影响周围基因的表达。在某些构象中,线性DNA中相距较远的两个序列可能实际上非常靠近,并影响彼此的活性;而在其他形式中,这两个序列又可能相距甚远。  美国麻省理工学院研究生Erez

小麦基因组草图绘制成功

  一个科研团队8月27日宣布,他们已经解开95%的小麦基因序列。这项研究成果将有助于缓解因全世界人口增长、气候变化和虫害爆发引发的粮食安全危机。  英国研究人员说,他们已经解开“中国春42系”(chinese spring line 42)品种小麦95%的基因序列。基因组草图已经对外公布

《自然》:海绵基因组草图绘制完成

  一个国际研究小组在8月5日出版的英国《自然》杂志上报告说,他们绘制出了海绵的基因组草图,并从中发现了许多有助于探索多细胞动物起源的信息。   这个由美国、德国、澳大利亚等国研究人员组成的小组报告说,他们完成了大堡礁海绵基因组测序草图,结果显示其中包含约1.8万个基因。海绵6亿多年前就出现在地球

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

首个家鸡基因组图谱绘制完成

西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中

印度绘制出结核杆菌基因组图谱

  印度科学与工业研究理事会会长布拉姆哈查里近日宣布,印度研究人员成功绘制出了结核杆菌的基因组图谱,这将有助于研发有效治疗结核病的新型药物。   综合当地媒体报道,来自印度全国的数百名研究人员参与绘制出了包含4000个基因的结核杆菌基因组图谱。   据悉,印度将在互联

草鱼全基因组序列图谱绘制完成

  近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一

牡蛎全基因组序列图谱绘制完成

牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物  牡蛎养殖  近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,

-首个越南人基因组图谱绘制完成

  越南科学家日前首次成功绘制出一名越南人的基因组图谱。   越通社报道说,来自河内国家大学下属科技大学的研究小组1月16日公布了这份基因组图谱绘制与分析的初步结果。   该研究组主任黎士荣表示,2013年年底,研究小组收到一名越南人的基因组数据,在此基础上对其进行分析排序,成功绘制出基因组图谱

历经13年-小麦基因组图谱绘制完成

经过13年努力,来自20个国家73个研究机构的200多名科学家终于绘制完成完整的小麦基因组图谱。这项“里程碑”工作为培育产量更高、营养更丰富、气候适应性更强的小麦品种奠定基础。 国际小麦基因组测序协会16日在说,他们以一种叫做“中国春”的小麦遗传研究模式品种为材料,研究整合了21条小麦染色

天津生物芯片参与绘制海参基因组

  海参属于棘皮动物,是其中体型与形态最为特殊的种类,且处于从无脊椎向脊椎动物分化的独特进化地位,也是国内外重要的海产经济物种,具有极高的营养与医用价值。  10月12号,国际学术期刊PLoS Biology在线刊发了天津生物芯片参与的海参全基因组精细参考图谱项目文章-“The sea cucumb

Nature新文章绘制油棕榈基因组图谱

  一个由多国科学家组成的研究小组,确定了一种称之为Shell的基因调控了油棕榈树的产量。油棕榈的果实和种子是全球近一半食用植物油的供应源,并且是最有前景的生物燃料来源之一。   新研究为我们提供了高质量的油棕榈全基因组图谱,并且还搜索了对于科学和工业均极为重要的基因序列。这一付诸多年努

美科学家绘制出瓜类基因组图谱

  炎炎夏日,以西瓜为代表的各种瓜类成为人们最爱。美国科研人员最新报告说,他们绘制出了西瓜等瓜类的基因组图谱,将来有望利用基因技术开发出更甜、更可口、更健康的瓜类新品种。   得克萨斯农机大学科研人员在新一期《美国园艺科学协会杂志》上报告说,此前法国和西班牙研究人员曾经完成了瓜类某些DNA(脱氧核

首个韩国人基因组图谱绘制成功

据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布,第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出,这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布,分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是

科学家成功绘制出大麦基因组草图

  据物理学家组织网10月17日报道,一个国际科学家小组在《自然》杂志上公布了高分辨率的大麦基因组草图。这项突破是朝着研发更优良的大麦新品种迈出的关键一步,不仅有助于防治禾谷类作物疾病,满足气候变化条件下的粮食需求,同时也会对啤酒和威士忌行业产生重要影响。   大麦基因组的大小几乎是人类基因组的两

中国科学家成功绘制人参基因组图谱

  3月4日,在钓鱼台国宾馆中国人参基因组图谱新闻发布会上,中科院基因组所副所长、世界知名基因组学专家于军向媒体公布:经过吉林省通化市政府、中科院北京基因组研究所、吉林紫鑫药业的共同努力,于2月底成功绘制出人参基因组图谱,揭开了人参的神秘面纱,为人参的种植、防病、开发与人参产业发展振兴提供

西藏成功绘制出全球首个青稞基因组图谱

  西藏自治区农牧科学院与华大科技2日向新华社记者透露,继全球首个大麦基因绘制成功后不久,他们率先在世界上完成青稞基因组图谱的绘制。该项科研成果将为深入揭示西藏青稞起源、驯化及栽培选育过程等提供坚实的遗传学基础。   青稞,在藏语中称为“乃”,在分类学上是一种裸大麦。青稞在青藏高原经过3500—4

我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制

       4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱

中国人参基因组图谱成功绘制

  3月4日,由吉林省通化市人民政府、中国科学院、吉林紫鑫药业共同主办的中国人参基因组图谱新闻发布会在北京钓鱼台国宾馆举行。吉林省省长王儒林、中科院副院长李家洋出席大会。中科院生物局、长春分院、北京分院、北京基因组研究所等科研单位的领导和专家、吉林省省直和通化市市直有关领导以及国内外新闻媒

中国科学家绘制小麦A、D基因组草图

  作为世界三大粮食作物之一,小麦养活了全球40%的人口,提供人类营养所需的20%的热能和蛋白质。   随着基因组学的发展,水稻和玉米的基因组相继被破译,但关于小麦基因组的测序研究依然困难重重、进展缓慢,小麦基因组成了横在科学家面前的一座大山。   中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工

RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?

  近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在

中国启动十万人基因组计划:绘制国人精细基因组图谱

  科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱,来研究疾病健康和基因遗传的关系。  此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。  基因是DNA上有遗传效应的片断,人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和

我科学家成功绘制小麦D基因组草图

  中国农科院作物科学研究所与深圳华大基因研究院等合作,在国际上率先完成了小麦D基因组供体种——粗山羊草基因组草图的绘制,结束了小麦没有组装基因组序列的历史。该项成果北京时间近日在线发表于《自然》杂志,标志着我国的小麦基因组研究跨入世界先进行列。   据项目牵头人、中国农科院作科所研究员贾继增介绍

云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功

  从20世纪70年代开始,云南省怒江州就开始种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩,不仅是全国草果的核心产区,也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。 为了加快提高草果遗传改良效率,培育高产、抗病、优质、安全新品种,对从源头创新保障草果产业健康可持续发展,2019年9月,怒江州联合华南农业

科学家绘制肝癌药物基因组学“蓝图”

  8月1日,国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape

科学家绘制出橡胶树基因组草图

  日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出橡胶树基因组草图,这将有助于培育更加高产的橡胶树,提高天然橡胶的产量。  日本理化学研究所日前发布一份公报说,该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序,绘制出的基因组草图包含了超过93.7%的橡胶树基因

我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制

日前,中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制,探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等,在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物,进化学家推测这些双侧对称动物可能起

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组