科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组比较,研究发现褐牙鲆和半滑舌鳎两者的基因组存在高达85%的相似性。比较其基因组学后,筛选到153个比目鱼类特异的基因家族以及12个比目鱼扩张的基因家族与细胞分裂和凋亡、眼睛大小调控、视网膜神经递质、软骨重构等比目鱼变态过程中的生物学现象密切相关。 值得一提的是,hipk基因家族的扩张可能参与了比目鱼变态过程中眼睛的移动。此外,研究还鉴定出106个比目鱼的正选择基因,这些基因与体轴发育、神经模式、骨骼肌重建、甲状腺激素、视黄酸信号通路等密切相关。 研究揭示的甲状腺激素和视黄酸信号通路在比目鱼变态中的协同调控作用与昆虫变态发育过程中的蜕......阅读全文

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功

  从20世纪70年代开始,云南省怒江州就开始种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩,不仅是全国草果的核心产区,也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。 为了加快提高草果遗传改良效率,培育高产、抗病、优质、安全新品种,对从源头创新保障草果产业健康可持续发展,2019年9月,怒江州联合华南农业

科研人员首绘小黄鱼全基因组精细图谱

17日,记者从浙江省农科院获悉,该院水生生物研究所小黄鱼科研团队与美国奥本大学、厦门大学合作,首次完成小黄鱼全基因组组装注释与精细图谱绘制,为建立小黄鱼基因组选择育种、培育高产抗病优质良种提供了基因资源和技术手段,相关研究论文近日在线发表于学术期刊《分子生态学资源》上。 小黄鱼是中国重要的海产经

解开花鲈的基因密码

  “破译鱼类基因组序列,完成其基因组精细图谱的绘制意义重大,可以为开展鱼类重要经济性状的遗传解析、基因组选择育种以及良种培育提供基因组资源和技术支撑,使鱼类遗传育种研究进入一个全新的阶段。”中国水产科学研究院黄海水产研究所(以下简称黄海所)研究员陈松林在接受采访时表示。花鲈基因家族分析 陈松林供图

科学家完成糜子全基因组精细图谱

  1月25日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组和朱健康研究组题为The genome of broomcorn millet 的研究论文。该研究完成了糜子基因组精细图

研究团队合作发布白木香基因组精细图谱

  近日,中国热带农业科学院热带生物技术研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所崔鹏团队合作发布了白木香基因组精细图谱,相关研究结果已发表在GigaScience期刊。该基因组精细图谱的发布将为野生白木香种群保护生物学、沉香结香机制和香味基因及树种的进化研究奠定良好基础,也为进一步基于基因组的白木

OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序

鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同

我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制

日前,中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制,探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等,在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物,进化学家推测这些双侧对称动物可能起

世界首个杜仲全基因组精细图绘出

  记者从位于郑州的中国林科院经济林研究开发中心了解到,该研究中心副主任杜红岩研究员主持的项目“杜仲育种群体建立与综合利用技术研究”取得重大突破,日前通过国家林业局验收。项目选育出的10个杜仲良种通过国家林木良种审定,获得国家发明ZL14项,荣获国家和省部级科技进步奖5项;绘制完成杜仲全基因组精细图

小须鲸全基因组图谱获破译

  11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等

中国启动十万人基因组计划:绘制国人精细基因组图谱

  科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱,来研究疾病健康和基因遗传的关系。  此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。  基因是DNA上有遗传效应的片断,人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和

草鱼全基因组序列图谱绘制完成

  近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一

牡蛎全基因组序列图谱绘制完成

牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物  牡蛎养殖  近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,

我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制

       4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱

首张非洲人全基因组图谱问世

据《自然》杂志报道,2月6日,美国加州Illumina生物技术公司宣布,他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前,科学家已经对两位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中国男性进行了全基因组测序,但从未对非洲人进行研究。因此,这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男

我国学者成功完成小麦A基因组的测序和精细图谱绘制

  小麦是全球最重要的粮食作物,养活了世界上40%的人口,提供了人类所需热能和蛋白质的20%。我国是世界上小麦生产和消费大国,常年种植面积为2,400万公顷左右,年产量近1.3亿吨。生产上广泛种植的普通小麦是一个经两次自然杂交而形成异源六倍体,含有A、B和D三个亚基因组,其基因组大(约17 Gb,是

斜纹夜蛾精细基因图谱绘出

  28日,记者从西南大学获悉,该校家蚕基因组生物学国家重点实验室联合法国、日本、美国等多国研究机构,在全球首次绘制出斜纹夜蛾精细基因图谱,并于25日发表于国际权威期刊《自然·生态学与进化》上。该研究成果揭示了斜纹夜蛾的高质量基因组精细图谱,以及群体变异图谱和基因表达图谱,可为其防治提供科学依据。 

香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱

  香港中文大学7日宣布,该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱,这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。  鼻咽癌是华南地区常见的癌症,也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍,鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于确诊时已届晚

中国学者最新Nature-Genetics文章:破译又一关键基因组

  生物通报道:来自中国水产科学研究院黄海水产研究所等处的研究人员发表了题为“The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry”的文章,破译了日本牙鲆(Japanese

多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱

  近日,来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章,绘制

首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱

  DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现,它在导致癌症的(如白血病和实体瘤)易位(translocations)异常重排中表现活跃。  II型拓扑异构酶(type II topoisomerase, TOP2)通过断裂DNA双链磷酸二酯键,来更正DNA连环数,使细胞DNA正常转录、复

我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱

  12月25日,由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成,这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱,也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。   藏羚羊是我国青藏高原特有的物种,其生存环境高寒、缺氧,自然条件极为严酷。在喜

我国科学家发布大黄鱼全基因组图谱

  由浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等高校研究机构联合破译的大黄鱼全基因组图谱,日前在世界权威期刊——《自然》周刊发表。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,标志着我国海洋生物学的研究真正进入基因组时代。   自1985年大黄鱼人工养殖

破解了香气之谜-蜡梅的染色体水平精细基因组图谱公布

  “一花香十里,更值满枝开。”凌寒怒放的蜡梅,是万花凋零的寒冬里一道亮丽的风景,其香味浓郁而独特,成为历代文人墨客挥笔高歌的对象。蜡梅为何冬季开花?其独特香味由何而来?蜡梅 华中农大供图  近日,华中农业大学刘秀群、赵凯歌研究组和金双侠研究组联合西南林业大学陈龙清研究组,在《基因组生物学》在线发表

我国科研机构联合破译白公式豚全基因组图谱

  南京师范大学、华大基因等单位的科研人员成功破译了白鱀豚全基因组图谱,为解析白鱀豚独特的生活习性及进化历程奠定了重要的遗传学基础,同时也为哺乳动物尤其是鲸类的研究与保护提供了宝贵资源。最新研究成果今天在《自然·通讯》杂志发表。   科研人员对一只雄性白鱀豚进行了全基因组测序,并构建了高质量基因组

科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱

近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合

我国绘制完成世界首个鹅全基因组序列图谱

  6月3日,深圳华大基因研究院和浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所联合召开新闻发布会,宣布“鹅全基因组序列图谱绘制完成”。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱,这一研究成果对于揭示家鹅繁殖、抗逆、生长、肉质、羽色等性状的遗传基础,鹅的驯化、不同鹅种的生物学分类、中国家鹅

我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制

   近日,由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头,中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队,完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—

科学家首次绘制小鼠全基因组沉默子图谱

近日,中国农业科学院农业基因组研究所猪基因组设计育种创新团队构建了小鼠全基因组沉默子图谱,阐明了其基本特征,并发现了影响细胞重编程效率的重要沉默子。相关研究成果发表在《先进科学》(Advanced Science)上。转录调控在生物体发育和细胞分化中至关重要,而沉默子作为关键的顺式调控元件,通过结合