454高通量测序——研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环的“调节器”[1]、土壤养分植物有效性的“转化器”和污染环境的“净化器”等多方面生态功能[2]。土壤微生物是气候和土壤环境条件变化的敏感指标，土壤微生物群落结构和多样性及其变化在一定程度上反映了土壤的质量。土壤微生物多样性一般包括微生物分类群的多样性、遗传(基因) 多样性、生态特征多样性和功能多样性[3]。由于土壤微生物的复杂性、土壤本身的多变性和研究方法不完善等原因的限制, 以往人们对土壤微生物多样性的研究与动、植物相比远远落后。随着多聚酶链反应(PCR)、核酸测序等现代生物学分子生物学技术的迅速发展, 人们对土壤微生物多样性有了更多......阅读全文
454高通量测序研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物质循环的
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（三）
注：已用454焦磷酸测序法发表的文章总结1、Archaea predominate among ammonia-oxidizing prokaryotes in soils—— (2006) Nature 442: 806-809——if 36.1012、454 Pyrosequencing ana
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（二）
二、高通量测序在土壤微生物研究中的应用 1.1 研究土壤微生物的物种多样性 微生物物种多样性主要从对微生物类群即细菌、真菌和放线菌这三大类群的数量及其比例组成来描述微生物多样性，或者按照微生物在生态系统中的作用将其划分成不同的功能群(function group)，通过某一功能群中物种的分类
454高通量测序——研究土壤微生物的新手段（一）
在陆地生态系统中，在土壤中生活有数量庞大的微生物种群，包括原核微生物如细菌、蓝细菌、放线菌及超显微结构微生物, 以及真核生物如真菌、藻类( 蓝藻除外) 、地衣等。它们与植物和动物有着明确的分工，主要扮演“分解者”的角色，几乎参与土壤中一切生物和生物化学反应，担负着地球C、N、P、S 等物
罗氏454高通量测序平台的特点及应用
Genome Sequencer FLX (GS FLX)系统是罗氏454 公司的第二代测序台，GS FLX的命名正是来源于其在多领域的灵活(flexible)应用。随着该系统性能和应用领域的不断提升和扩展，必将带动整个测序领域的技术发展，对大规模基因序列研究的相关应用领域产生巨大的推动作用。美吉生
Roche－454（GS－FLX－Titanium－System）超高通量测序技术原理
Roche 454（GS FLX Titanium System）超高通量测序技术原理2005年底，454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System，被《Nature》杂志以里程碑事件报道，开创了边合成边测序的先河。2007
DNA测序仪：454测序仪
454测序仪的出现极大促进了测序业务的开展，科研人员已经将测序技术作为解决科研工作中许多常见 问题的利器。这是因为454测序仪在以下几个方面取得了质的突破：首先是解决了高通量测序问题；其次它简 化了样品准备步骤，将以往转化大肠杆菌扩增质粒的繁琐过程全部用简单的体外PCR扩增法替代了；最后， 它缩小了
DNA测序454－焦磷酸测序简介
该方法在油溶液包裹的水滴中扩增DNA（即emulsion PCR）,每一个水滴中开始时仅包含一个包被大量引物的磁珠和一个链接到微珠上的DNA模板分子（控制DNA浓度出现的大概率事件）。将emlusion PCR产物加载到特制的PTP板上，板上有上百万个孔，每个微孔只能容纳一个磁珠。DNA Pol
454测序应用于花生种子败育研究
花生为豆科作物，是我国优质食用油主要油料品种之一，又名“落花生”或“长生果”，在全国各地均有种植，主要分布于辽宁、山东、河北、河南、江苏、福建、广东、广西、贵州、四川等地区。在花生种子的生长发育过程中，胚栓插入土壤，膨压将种皮推开后露出胚轴是一个重要过程，因此，胚栓入土失败、胚轴的膨压
高通量测序在微生物多样性研究中的应用
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结构提供了新的技术平台，并
高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结
高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍
1、高通量测序在微生物多样性研究中的应用介绍 微生物环境基因组学又叫宏基因组学，它是研究某一环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落多样性的一门科学，它是一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质（或获得新基因）的新理念和新方法。 第二代高通量测序技术为研究微生物群落结
454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发
罗氏454测序分析软件升级
罗氏公司近日宣布推出一款新的软件包(v2.8)，能显著改善其GS FLX+系统上长读取鸟枪法测序的性能。这一测序平台能带来百万个读取，其读长超过1000 bp。此次改进将让研究人员发现更多复杂的遗传变异，并揭开隐藏在基因组、转录组和宏基因组样品中难以测序的区域下的生物学秘密。 罗氏
高通量测序技术系统研究大豆连作障碍发生的微生物机制
黑龙江省是我国大豆的主产区，大豆种植面积占全国种植面积40%左右，随着国家作物种植结构的调整和大豆产业振兴计划的实施，黑龙江省大豆种植面积逐步增加。长期的定位试验和多点的田间调查证实，大豆连作1年、2年和3年产量分别下降10-15%、15-20%和20-30%。因此，东北区大豆连作障碍的发生是一
454测序参与棉花基因组进化研究工作
棉花是全球重要的经济作物之一。它的纤维，俗称皮棉，是纺织工业主要的天然原料。全世界棉花种植面积约5亿亩，我国常年种植面积近8千万亩。棉花不但是重要的纤维和油料植物，而且是重要的植物蛋白来源。在食用油中，棉籽油的亚油酸含量最高，达到55.6%。除此以外，棉花种子中还含有极为丰富的蛋白质和脂肪等物质
高通量测序
高通量测序技术又称“下一代”测序技术，以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。高通量测序包括：大规模平行签名测序、聚合酶克隆、454焦磷酸测序、离子半导体测序和DNA 纳米球测序等技术。 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DN
高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用（二）
二、肠道菌群与疾病发生之间的关联1. Gut Microbiota in Human Adults with Type 2 Diabetes Differs from Non-Diabetic Adults——2010《PLoS One》以往文献报道肠道菌群与人类代谢疾病之间存在着某种关联，为了研
高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用
在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群，它们的种类繁多，可达上千种，数量也很惊人，是人体细胞总量的10倍以上，迄今为止，仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系，对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡，能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
土壤细菌和氨氧化微生物群落组成对土地利用研究获进展
土壤微生物是土壤的重要组成部分，是土壤养分(C、N、P等)转化和循环的主要动力，又是土壤养分的储备库和植物生长可利用养分的一个重要来源，是土壤肥力水平的活性指标，在土壤生态系统中起着非常重要的作用。其中氨氧化微生物是氮素循环中关键微生物之一，已有研究表明不同土地利用方式以及不同农业措施对土壤细菌
神秘微生物的发现为海洋生态系统研究带来新视角
首篇利用454测序系统全新GS FLX Titanium试剂发表的论文聚焦宏基因组学 一种在公海中发现的非同寻常的微生物迫使科学家们不得不重新思考他们对于海洋生态系统中碳氮循环的理解。一个来自美国加利福尼亚大学的研究小组利用罗氏属下454生命科学公司全新的GS FLX Titanium系列试
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
转录组高通量测序
（第二代高通量测序技术-454） 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
高通量测序的意义
高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱
高通量测序的步骤
当然，首先地提取出您想要测序的东西，比如RNA、DNA 。再就是建库-测序-分析。建库需要将序列片段化、加接头、PCR。不同的业务有细微的差别，比如RNA要先反转录成cDNA等等。然后就是上机测序了！最后就是数据分析了。数据分析分为流程分析（基本分析）和个性分析（根据老师课题分析）。这些以后呢，就是
高通量测序技术研究进展介绍
第二代测序技术， 又称新一代测序技术， 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(