琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期,小编将为大家带来一篇19年2月发表于质谱权威期刊《Molecular & Cellular Proteomics》的文章,该文章运用琥珀酰化修饰、代谢组,揭示了水产病原菌的琥珀酰化修饰在群体感应与代谢中的关键作用。 Integrated Succinylome Profiling and Metabolomics Reveal Crucial Role of S-ribosylhomocysteine lyase in Quorum Sensing and Metabolism of Aeromonas hydrophila M......阅读全文

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

  随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇1

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

   随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇

琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(一)

琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了

琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...(二)

2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能进一步,作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证(LuxS、PkG等),先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白,随后利用琥珀酰化抗体进行WB,证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后,作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究

上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰通路研究中取得进展

  蛋白翻译后修饰对蛋白质的结构和功能起着关键作用,是细胞精细调节生理活动的关键之一。因而,蛋白翻译后修饰通路研究是目前新药研发的重要热点之一。   中科院上海药物研究所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密西根大学合作研究,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了

中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰

  来自密西根大学,中科院上海药物研究所,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底

Science:逆转传统认知,代谢组学揭示重要机制

  来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物,通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物,干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合,而并未参

蛋白琥珀酰修饰通路研究获突破

  近日,中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密歇根大学在一项合作研究中,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了系统的蛋白质组学研究,在779个蛋白上鉴定出2500多个琥珀酰位点,并研究揭示了蛋白琥珀酰修饰具有广泛调节细胞代谢的作用,同时也提示此修饰

Cell揭示细胞代谢调控新机制

  在Helen McNeill博士的领导下,来自Lunenfeld-Tanenbaum研究所的研究人员揭示了一种令人兴奋的、且不同寻常的生化联系。他们的研究发现对于线粒体相关疾病具有重要的意义,线粒体是我们的细胞内能量生成的主要来源。相关论文发表在9月11日的《细胞》(Cell)杂志上。  McN

上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰研究中取得新进展

  蛋白翻译后修饰对蛋白的结构和功能起着非常重要的调节作用,赖氨酸琥珀酰化是中科院上海药物研究所和芝加哥大学共同合作在原核和真核细胞中最新发现的蛋白翻译后修饰通路。研究团队开创性地对哺乳动物细胞中的去乙酰化修饰酶Sirt5调控的琥珀酰化修饰底物进行了系统的蛋白质组学研究,发现了琥珀酰化修饰对能量代谢

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组服务介绍​​

  代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动,而实际上细胞内许多生命活动是与代谢物相关的,如细胞信号(cell signaling)、能量传递等都是受代谢物调控的。代谢组学正是研究代谢物——在某一

北京基因组所等揭示肥胖相关基因FTO调控能量代谢新机制

  肥胖相关基因(FTO)是第一个被发现在肥胖中发挥重要作用的基因,在调节体重和脂肪含量方面具有重要作用,但具体的分子机制以及是否能够利用小分子化合物抑制FTO活性来治疗肥胖相关的代谢类疾病一直以来并不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队与北京生命科学研究所黄牛和张二荃团队合作发现,恩他卡

肿瘤代谢基因调控的新机制揭示

  中国科学技术大学生命科学学院高平课题组和张华凤课题组在肿瘤代谢基因调控研究领域取得重要进展,相关研究成果日前在线发表于《自然·通信》上。  众所周知,肿瘤通过对自身细胞代谢的重编程而获得增殖优势。因此,探索肿瘤代谢异常的机制已成为肿瘤研究的焦点。c-Myc是一个重要的癌基因,它的异常表达会导致3

研究揭示尼古丁代谢调控的新机制

  近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队揭示了烟草转录因子NtMYB305a参与尼古丁代谢调控的分子机制。相关研究结果在线发表于《植物生理学(Plant Physiology)》杂志。  据张洪博研究员介绍,尼古丁是一种重要的天然生物碱,在烟草中的含量最为丰富,约占烟草总生物

利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征

  过去二十年里,代谢(脂质)组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用(LC-HRMS)技术是目前内源性代谢物最常用的手段,然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本,其组分化学性质各异,同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性,导致生物学信

Cell:广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史

  继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后,2018年1月11日,《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农

揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制

  结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。  近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛

上海药物所阐明代谢性疾病生化机理并发现潜在药物靶标

  蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译

揭示瘦素调控能量代谢平衡机制

11月17日,美国《国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所刘勇研究组和美国德州大学达拉斯西南医学中心的合作研究结果,揭示了瘦素受体介导的不同信号机制在能量平衡与葡萄糖代谢中的生理学调控功能。 全球处于流行之势的肥胖症是引发Ⅱ型糖尿病和心血管疾病的重要高危因

研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子

  近日,中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作,通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物,系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化(Kbhb)的关键调控因子。相关研究成果于2月25日在线发表在Science Advance上。  细胞代谢为生命过程提供能量,同时

黄勋研究组PLoS揭示脂代谢与细胞生长发育协同调控新机制

  多细胞生物的个体及器官大小是如何决定的是发育生物学领域一个基础的生物学问题。在细胞生长过程中,脂质扮演着重要的角色。例如,磷脂是各种膜结构 的主要组分,而脂肪则是生物体内能量的主要贮存形式。细胞的生长需要动员贮存在机体内的大量能量,同时也需要许多结构脂质来满足细胞各种膜组分扩张的需 要。

研究发现全新蛋白质修饰类型

  细胞代谢为生命过程提供能量。同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸)为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下,肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源,且与多种病理生理状态密

研究发现全新组蛋白修饰类型——赖氨酸乙酰乙酰化

  细胞代谢为生命过程提供能量。同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸)为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下,肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源,且与多种病理生理状态密

Cell子刊揭示重要代谢调控因子

  由于其与长寿、糖尿病、癌症和代谢调控相关联,近年来Sirtuin脱乙酰酶家族受到了相当大的关注。在发表于12月3日《细胞代谢》(Cell Metabolism)杂志上的一项新研究中,Buck研究所的研究人员现在确定了一些代谢相关蛋白受到了线粒体sirtuin——SIRT5的广泛调控。   

研究揭示SIRT5调控棕色脂肪分化的生理功能和作用机制

  4月22日,国际期刊Diabetes 在线发表了中国科学院上海药物研究所李静雅课题组、李佳课题组针对SIRT5参与调控棕色脂肪分化的研究结果。该研究揭示了Sirtuins家族中SIRT5调控棕色脂肪分化的生理功能和作用机制,进一步拓展了表观遗传学与脂肪生物学之间的联系,深化了对表观遗传机制调控脂

Cell-Metabolism:代谢性疾病生化机理并发现新的潜在药物靶标

  蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一,也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一,并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此,负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例,近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译后修饰调控