琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（一）
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。本期，小编将为大家带来一篇19年2月发表于质谱权威期刊《Molecular & Cellular Proteomics》的文章，该文章运用琥珀酰化修饰、代谢组，揭示了水产病原菌的琥珀酰化修饰在群体感应与代谢中的关键作用。Integrated Succinylome Profiling and Metabolomics Reveal CrucialRole of S-ribosylhomocysteine lyasein Quorum Sensing and Metabolism of Aero......阅读全文
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（一）
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（二）
2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能进一步，作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证（LuxS、PkG等），先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白，随后利用琥珀酰化抗体进行WB，证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后，作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期，小编将为大家带来一篇
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期，小编将为大家带来一篇1
中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰
来自密西根大学，中科院上海药物研究所，芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底
上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰通路研究中取得进展
蛋白翻译后修饰对蛋白质的结构和功能起着关键作用，是细胞精细调节生理活动的关键之一。因而，蛋白翻译后修饰通路研究是目前新药研发的重要热点之一。 中科院上海药物研究所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密西根大学合作研究，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了
蛋白琥珀酰修饰通路研究获突破
近日，中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密歇根大学在一项合作研究中，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了系统的蛋白质组学研究，在779个蛋白上鉴定出2500多个琥珀酰位点，并研究揭示了蛋白琥珀酰修饰具有广泛调节细胞代谢的作用，同时也提示此修饰
上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰研究中取得新进展
蛋白翻译后修饰对蛋白的结构和功能起着非常重要的调节作用，赖氨酸琥珀酰化是中科院上海药物研究所和芝加哥大学共同合作在原核和真核细胞中最新发现的蛋白翻译后修饰通路。研究团队开创性地对哺乳动物细胞中的去乙酰化修饰酶Sirt5调控的琥珀酰化修饰底物进行了系统的蛋白质组学研究，发现了琥珀酰化修饰对能量代谢
揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性
DNA是重要的遗传物质，储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息，影响生命活动，如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定，调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的，DNA骨架上硫原子取代磷原子上
改善肥胖动物乳腺发育的棕榈酰化修饰调控机制获揭示
在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助下，华南农业大学动物科学学院教授江青艳/王松波团队研究揭示了改善肥胖动物乳腺发育的棕榈酰化修饰调控机制。相关成果近日在线发表于《细胞与分子生物学快报》（Cellular & Molecular Biology Letters）。改善肥胖动物乳腺发育的棕
结核杆菌研究新进展：乙酰化修饰图谱公布
近日，发表于杂志Int J Biochem Cell Biol.上的一篇文章中，来自西南大学和杭州景杰生物科技有限公司的研究者公布了结核分歧杆菌的乙酰化修饰谱图。近年来科学家都非常有兴趣致力于病原微生物的蛋白质翻译后修饰研究，本文中作者首次全面鉴定了结核分歧杆菌的乙酰化修饰。这也是继公布首张结合
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学？代谢组学是用来解决什么问题的？ 代谢组学（Metabonomics/Metabolomics）是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科，是研究关于生物体被扰动后（如基因的改变或环境变化后）其代谢产物（内源性代谢物质）种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（一）
在疫情逐步可控的情形下，一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学，脂质组学，以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示，新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样，
研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日，中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。相关研究成果于2月25日在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量，同时
Science：逆转传统认知，代谢组学揭示重要机制
来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物，通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物，干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合，而并未参
利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征
过去二十年里，代谢（脂质）组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用（LC-HRMS）技术是目前内源性代谢物最常用的手段，然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本，其组分化学性质各异，同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性，导致生物学信
Cell：广泛靶向代谢组技术揭示番茄代谢育种与驯化历史
继广泛靶向代谢组技术成果在NG、NC、PNAS发表后，2018年1月11日，《Cell》在线发表了题为“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究论文。论文的通讯作者为迈维代谢首席科学家华中农业大学罗杰教授与中国农业科学院深圳农
GSDMD的棕榈酰化修饰
GSDMD是细胞焦亡过程中的关键蛋白，此前的研究表明GSDMD在细胞焦亡发生时可被Caspase切割，从而释放出N端结构域，释放出的N端结构域进一步形成寡聚体并上膜打孔，最终造成细胞死亡。但此前的研究发现人源GSDMD的C191A突变体会影响其寡聚和造成细胞死亡的能力，因此本文作者尝试探究GSDMD
代谢组服务介绍
代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科，是系统生物学的重要组成部分。基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动，而实际上细胞内许多生命活动是与代谢物相关的，如细胞信号（cell signaling）、能量传递等都是受代谢物调控的。代谢组学正是研究代谢物——在某一
代谢组学：一项艰巨的任务
学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢，一系列代谢通路，一大堆代谢产物，简直让人头晕眼花。然而，这又不能跳过。毕竟，DNA编码蛋白质，而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候，科学界对这些分子一无所知。 “如果你测定一滴血中的小分子，大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配，
FCDB：揭示SIRT5对急性心肌梗死的保护机制
Frontiers in Cell and Developmental Biology发表了中国科学院生物物理研究所与清华大学附属北京清华长庚医院合作完成的题为Cardio-protective role of SIRT5 in response to acute ischemia throug
上海药物所阐明代谢性疾病生化机理并发现潜在药物靶标
蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一，也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一，并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此，负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例，近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译
最新研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日，中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。相关研究成果在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量，同时代谢物可通过
Cell子刊揭示重要代谢调控因子
由于其与长寿、糖尿病、癌症和代谢调控相关联，近年来Sirtuin脱乙酰酶家族受到了相当大的关注。在发表于12月3日《细胞代谢》(Cell Metabolism)杂志上的一项新研究中，Buck研究所的研究人员现在确定了一些代谢相关蛋白受到了线粒体sirtuin——SIRT5的广泛调控。
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
生物物理所等揭示SIRT5对急性心肌梗死的保护机制
7月22日，Frontiers in Cell and Developmental Biology发表了中国科学院生物物理研究所与清华大学附属北京清华长庚医院合作完成的题为Cardio-protective role of SIRT5 in response to acute ischemia