GenomeBiology发布基因组测序重要成果

Genome Biology杂志发布了远东豹（Far Eastern Amur leopard）的首个全基因组序列，为人们揭示了肉食对基因多样性和种群规模的影响。

“我们将远东豹基因组与其它哺乳动物基因组进行比较，发现肉食似乎是很强的选择压力。这种现象在杂食动物和食草动物中并不明显。举例来说，牛吃肉对其健康并没有什么重要影响，但豹子吃草就会很快死亡，”文章作者Yunsung Cho解释道。

特别的饮食会使动物发生生理、生化和形态上的适应。研究人员认为，肉食在进化上是一种不稳定的饮食方式。猫科动物基因多样性相对较低，种群规模相对较小。这可能就是因为它们的饮食要求过于严格。

“与食肉有关的遗传适应（比如极端的灵活性和肌肉力量）使远东豹成为了成功的捕食者，但这种生活方式也使它们在遗传上相当脆弱，”Mr. Cho解释道。

研究人员用一只韩国雌性远东豹的肌肉样本进行基因组测序。随后他们分析了18种哺乳动物的基因组，包括8种食肉动物（家猫、老虎、猎豹、狮子、美洲豹、北极熊、虎鲸和袋獾）、五种杂食动物（人类、小鼠、狗、猪和负鼠）和五种食草动物（大熊猫、奶牛、马、兔子和大象）。研究显示，食肉动物共享两个独特的基因，这两个基因在骨骼发育和修复中起到了重要作用。研究人员希望远东豹参考基因组可以成为有用工具，帮助人们理解猫科动物的进化，实施更有效的动物保护措施。

前不久，浙江大学和Nebraska大学的科学家们在Nature Genetics杂志上发布了异源多倍体芥菜型油菜（Brassica juncea）的基因组序列。油菜在植物分类上属于十字花科芸薹属（Brassica genus），是世界广泛种植的油料作物。这类植物拥有三个二倍体基因组和三个异源多倍体基因组。

长颈鹿是身高接近六米的庞然大物，它们拥有异乎寻常的长脖子和大长腿，并且能够高速奔跑。科学家们首次完成了长颈鹿及其近亲（okapi）的基因组测序，揭示了推动长颈鹿进化的遗传学改变。这项研究发表在五月十七日的Nature Communications杂志上。

去年九月，冲绳科学技术研究院大学(OIST)、名古屋大学和东京大学的科学家们首次破解了“活化石”海豆芽（Lingula anatina）的基因组。他们分析了海豆芽基因组的三万四千多个基因，发现海豆芽的基因组一直在积极的进化，并不能称为活化石。