发布时间:2012-07-23 00:00 原文链接: Nature子刊:癌症单细胞测序新技术

  只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画,你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点,从远处看就形成了一幅图像。与之相似,生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱,然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。

  发布在7月22日《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的一项新研究首次表明一种称为Smart-Seq的新基因组测序方法可以帮助科学家们深入分析临床相关的单细胞。Smart-Seq有许多可能的应用,包括帮助科学家们更好地了解肿瘤形成的复杂性。这非常的重要因为许多临床上重要的细胞仅少量存在,需要进行单细胞分析。这项研究由来自美国路德维格癌症研究学会、瑞典卡罗琳斯卡医学院、加州大学圣地亚哥分析和Illumina Inc的研究人员组成的一个研究小组完成。

  美国路德维格癌症研究学会研究人员、瑞典卡罗琳斯卡医学院细胞和分子生物学系课题组长、生物医学科学家Rickard Sandberg 说:“虽然我们的结果是初步的,我们证明了开展个体的、临床相关的细胞研究是有可能的。世界各地的癌症研究人员现在能够更系统地分析这些细胞,使得他们能够在未来生成更好的诊断和治疗方法。”

  以往的研究表明通过原拷贝不同剪切和粘贴配置,一种基因生成同一蛋白的几种形式是非常常见的。这种现象就称之为剪接(splicing),表明来自相同组织的细胞并非如从前认为的那样同质。

  研究小组现在将研究向前推进了一步,开发出了一种方法可完整绘制单个细胞基因表达图谱。在显示哪些基因活性表达的同时,现在还有可能准确描述和研究来自相同组织的单个细胞间的基因表达差异。

  Sandberg说:“科学家们在很长的时间里一直在等待这样一种方法出现,但是技术局限使得难于生成足够敏感和强大的方法。新方法具有几个方面的应用包括癌症研究,可用于研究在个体患者中哪些细胞类型形成了癌性肿瘤。”

  在这项研究中,科学家们研究了复发性黑色素瘤患者血液系统中的肿瘤细胞。一旦他们在常规血液检测中鉴别出肿瘤细胞,研究小组就采用Smart- Seq来分析它们的基因表达。通过这种方法,研究人员能够证实肿瘤细胞激活了许多重要的膜蛋白,这些膜蛋白被认为对它们能够逃避机体监控细胞,在血液或淋巴中扩散负责任。

相关文章

安捷伦荣获两项科学家选择奖

2025年6月4日,北京——安捷伦科技公司宣布荣获两项科学家选择奖:公司凭借所举办的《为未来而生的HPLC:隆重推出全新AgilentInfinityIII液相色谱系列》荣获“2024年度在线研讨会”......

6月杭州|首届单细胞蛋白质组学术会议第一轮通知

作为当前生物医学研究的前沿热点领域,单细胞蛋白质组学通过在单细胞层面上探索蛋白质表达模式,精确揭示细胞异质性,为解码生命过程和疾病发生机制提供了独特视角,已成为赋能精准医疗和生物医药创新的关键技术,是......

解锁布鲁克BeaconDiscovery™,开启活体单细胞功能分析新时代

BeaconDiscovery™单细胞功能表征平台将帮助研究者解锁活体单细胞功能分析的全部潜力。它采用Beacon®的光电定位(OEP)和微流体芯片光技术,使研究人员能够实时探索多模态和动态细胞反应,......

2025单细胞分析技术及应用会议在京召开,共促产学研深度融合!

2025年4月26日,由北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心)、创新方法研究会科学工具专业委员会、北京理化测试技术有限公司主办,北京市科学技术研究院生物技术与健康研究所、宁波华仪......

动态单细胞转录组揭示喉气管狭窄中细胞异质性和新型软骨损伤相关成纤维细胞亚群

喉气管狭窄(LTS)作为临床上棘手的上呼吸道疾病,其典型特征是细胞外基质(ECM)异常沉积导致的气道狭窄。随着COVID-19等公共卫生事件中气管插管应用的增加,医源性LTS的发生率显著上升。尽管手术......

方群:单细胞蛋白质组学二十年梦想成真

由于无法对蛋白实现扩增,因此在单细胞多组学的研究中,单细胞蛋白质组学是最具挑战的研究,近年来已取得突飞猛进的进展。除了质谱仪检测灵敏度的提升,在前端取样、预处理和分离方面的巨大进步是重要因素,这和微流......

驱动染色质拓扑关联结构域形成关键因素获揭示

华南农业大学教授刘柏平团队与香港科技大学讲师常富杰、华南师范大学教授罗琼团队合作,首次揭示染色质物理特性中的DNA压缩密度是驱动染色质拓扑关联结构域形成的关键因素,为理解基因组三维结构形成机理提供了全......

单细胞鉴定6000+蛋白,多场景实测数据震撼来袭!

过去几年里,单细胞蛋白质组学技术取得了长足发展,单细胞蛋白质组学逐渐走向成熟,后续有望广泛应用于肿瘤异质性分析、免疫学研究、发育生物学、神经科学以及精准医学等领域。然而,从技术发展成熟到实际场景应用分......

NatureMethods|单细胞多模态测序的未来:UDAseq如何引领新革命?

近年来,单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而,仅依赖单一的转录组信息往往难以区分分子相似但功能差异显著的细胞类别。因此,融合多种模......

首个棉花纤维起始发育单细胞时空组学图谱发布

近日,中国农业科学院棉花研究所乡村振兴科技创新团队牵头构建了首个结合单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱。利用该图谱可以识别关键基因的表达模式及其与代谢途径的关系,深入剖析纤维发......