Nature子刊:癌症单细胞测序新技术
只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画,你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点,从远处看就形成了一幅图像。与之相似,生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱,然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。 发布在7月22日《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的一项新研究首次表明一种称为Smart-Seq的新基因组测序方法可以帮助科学家们深入分析临床相关的单细胞。Smart-Seq有许多可能的应用,包括帮助科学家们更好地了解肿瘤形成的复杂性。这非常的重要因为许多临床上重要的细胞仅少量存在,需要进行单细胞分析。这项研究由来自美国路德维格癌症研究学会、瑞典卡罗琳斯卡医学院、加州大学圣地亚哥分析和Illumina Inc的研究人员组成的一个研究小组完成。 美国路德维格癌症研究学会研究人员、瑞典卡罗琳斯卡医学院细胞和分子生物学系课题组长......阅读全文
Science:新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
Science:人脑单细胞基因表达地图诉说惊人发现
人类大脑被称为世上最复杂的物质,里面有860亿错综复杂的、相互连接的神经元和数量同样庞大的胶质细胞。 有史以来人们对这一神秘器官一直充满好奇:它能生产浪漫的爱情诗歌,也能生产严谨的科学公式。由最初小小的胚胎和一点干细胞出发,成熟的大脑从何而来? 根据今天发表的《Science》,加州大学旧金
单细胞基因表达分析解密血液早期发育调控网络
近日,著名国际期刊nature biotechnology发表了英国科学家的一项最新研究成果,他们应用单细胞基因表达分析与计算方法描述了血液发育的转录调控网络。这项研究为分析器官发育的调控网络提供了一种可行的方法。 研究人员指出,重建调控器官发育的分子途经受限于缺少对胚胎祖细胞进行研究的方法,
花生茎秆单细胞基因表达图谱构建成功
广东省农业科学院作物研究所花生遗传育种团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,成功攻克了花生茎秆单细胞基因表达图谱构建的技术难题。近日,相关成果在线发表于《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)。花生茎秆单细胞基因表达图谱构建。研究团队供图
单细胞基因表达谱揭示小脑细胞分化机制
尽管小脑(Cerebellum)体积仅为全脑的十分之一左右, 但其神经元数量大约占全脑的一半以上。近来研究表明,小脑不仅对运动的调节和维持有着重要作用,而且影响情绪、认知等高级功能。小脑发育异常和功能障碍与许多神经和精神疾病有关,例如共济失调,震颤,自闭症障碍和精神分裂症等。了解疾病相关基因在小
单细胞基因表达分析的最新进展
将细胞培养板上的细胞放在显微镜下观察。表面上,它们都一样。实际上,它们一点都不相同。无论是DNA或RNA的水平,还是蛋白质或代谢物的水平,这些细胞相差甚远,而这些差异可能对细胞行为产生深远的影响。 多年来,研究人员一直缺乏工具,来高效拷问这些差异,不过今非昔比。有了新一代DNA测序仪和质谱仪,
首次揭示单细胞水平大豆根瘤基因表达的动态特征
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500742.shtm近日,中国农业科学院作物科学研究所大豆优异基因资源发掘与创新利用创新团队与国内高校合作,首次在单细胞水平解析了大豆根瘤成熟过程中基因表达的动态变化,并在未成熟的根瘤侵染细胞中成功鉴定到
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡(Langone)医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸(transcription elongation)的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上,他们表示,该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶(RNAP)之间的协同作用,因为这种协同作用使得转录率对应于
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡(Langone)医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸(transcription elongation)的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上,他们表示,该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶(RNAP)之间的协同作用,因为这种协同作用使得转录率对应于转
充满差异的单细胞蛋白表达
哈佛大学谢晓亮小组的最新研究结构显示,蛋白的数量(绿色)与mRNA的数量(红色)在各个细胞中有很大差异。 科学家们近日首次实现了对物种在整个表达谱范围内的蛋白表达噪声测量。该项成果是单分子技术与系统生物学交互融合的典范,预示了单细胞基因表达分析时代的来临。 在基因表达研究领域,传
两篇Cell文章:廉价的单细胞基因表达分析新技术
想象一下有人递给你一杯奶昔,要你鉴别出里面所有的东西。或许你能够辨别出有一点点的草莓或是酸奶的味道。但总体上它的味道就像是无法分辨的成分构成的混成品。 现在再想象一下,这杯奶昔是由来自大脑的2万个碾碎了的细胞所组成。你可以通过测试来确定样本中有什么分子,这就是科学家们现在所做的事情。这当然会提
利用微流体PCR进行准确可靠的单细胞基因表达分析(二)
整个流程可以让您轻松实现如下步骤: · 捕获—组细胞只需一步加样即能迅速地分离到96个独立的反应仓完成制备 · 确认—质控节点确认捕获细胞数量及分辨活细胞和死细胞 · 裂解—快速直接的细胞裂解方法可节约时间和费用且不需要RNA纯化步骤 · 逆转录和预扩增—cDNA合成及特异目的片段扩增在一个样品
利用微流体PCR进行准确可靠的单细胞基因表达分析(一)
· 达到更准确地检测单一细胞基因表达谱差异性· 避免测量样品中所有细胞的平均值的坏处· 鉴定以前不能分辨的细胞亚群和分解新的调控网络 在名义上均一的细胞群中,单一细胞在尺寸、蛋白质水平和mRNA表达转录上都存在差异,所以默认你的样品中每一个细胞都表现得完全一致是一种危险的赌博,测量集中到一起的多个细
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
华人科学家Nature操控基因表达的新技术
尽管人类细胞中有着大约2万个基因,根据细胞的需要,在特定的时间只有一小部分的基因表达开启,且每时每刻都可能发生改变。要弄清楚这些基因的功能,研究人员需要一些工具以同样短的时间尺度来操控它们的状态。 现在,麻省理工学院和Broad研究所开发的一项新技术使这一切成为可能,只需用光照射细胞就能够
单细胞分离用于单细胞基因扩增
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,
中国科学家打开人类胚胎“基因表达”的认知大门
记者从中国科学院北京基因组所获悉,由该所研究员刘江团队与山东大学附属生殖医院陈子江团队、广州医科大学刘见桥团队合作,在国际上首次研究出人类胚胎合子基因组的激活机制,进而揭示了人类胚胎发育和进化的奥秘,相关研究已于3月9日在国际顶级学术期刊《细胞》(CELL)发表。人类的生命始于受精卵,一个受精卵
科学家研制出肿瘤基因表达高效评估芯片
本报讯(记者潘希)日前,中科院深圳先进技术研究院医工所陈艳带领研究团队,研制了用于肿瘤细胞基因表达水平评估的高通量微流控芯片,这一技术可发展成为癌症的早期诊断和分析的新型技术。相关研究成果在线发表于该领域知名期刊《芯片实验室》上。 微流控技术是在微米级结构中操控纳升至皮升体积流体的技术与科
什么是基因表达调控?基因表达调控有什么意义
意义:1.适应环境、维持生长和增殖:生物体赖以生存的外环境是在不断变化的,为了生存,所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应,调节代谢,以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化:多细胞生物调节基因的表达除为适
应用单细胞基因表达研究艾滋病疫苗在细胞水平上的反...
应用单细胞基因表达研究艾滋病疫苗在细胞水平上的反应差异Fluidigm 技术应用· 单细胞基因表达· BioMark系统· 96.96整合微流体动态芯片 文中提到的研究是Lukas Flatz博士在美国国家卫生研究院做博士后时所进行的工作。他现在是瑞士洛桑医院大学皮肤科的医生和研究员。 简介美国疫苗
单细胞分离用于单细胞基因扩增介绍
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,用
基因表达的定义
基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质,所有已知的生命,都利用基因表达来合成生命的大分子。
-环境影响基因表达
日复一日、年复一年,我们的基因不断地和我们所生活的环境、邻居、家人,以及我们自己的心态“对话”。这些社会性互动的结果会进入我们细胞的控制室,改变基因的强弱表达,从而影响我们的习性、行为、生理、心理与健康。美国知名科学作家戴维·多布斯日前撰写了《基因的社会生活——改变你的分子组成》一文,介绍了科学
人脑基因表达图集
小鼠的全基因组基因表达的高分辨率图已经问世几年时间了,但是,对于人脑而言,此前只发表过相对来说比较粗糙的分布图。这是由于与小鼠相比,人脑规模增大了1000倍,以及死后组织供应有限和质量较差等因素所导致的。现在,Michael Hawrylycz及其在“艾伦脑科学研究
什么是基因表达?
基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。基因表达产物通常是蛋白质,所有已知的生命,都利用基因表达来合成生命的大分子。
什么是基因表达?
因的表达过程是将DNA上的遗传信息传递给mRNA,然后再经过翻译将其传递给蛋白质。在翻译过程中tRNA负责与特定氨基酸结合,并将它们运送到核糖体,这些氨基酸在那里相互连接形成蛋白质。这一过程由tRNA合成酶介导,一旦出现问题就会生成错误的蛋白质,进而造成灾难性的后果。值得庆幸的是,tRNA分子与氨基
基因表达的步骤
基因表达可以通过对其中的几个步骤,包括转录,RNA剪接,翻译和翻译后修饰,进行调控来实现对基因表达的调控。基因调控赋予细胞对结构和功能的控制,基因调控是细胞分化、形态发生以及任何生物的多功能性和适应性的基础。基因调控也可以作为进化改变的底物,因为控制基因表达的时间、位置和量可以对基因在细胞或多细胞生
电流激活基因表达
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505925.shtm
基因的表达过程
基因的表达过程是将DNA上的遗传信息传递给mRNA,然后再经过翻译将其传递给蛋白质。在翻译过程中tRNA负责与特定氨基酸结合,并将它们运送到核糖体,这些氨基酸在那里相互连接形成蛋白质。这一过程由tRNA合成酶介导,一旦出现问题就会生成错误的蛋白质,进而造成灾难性的后果。值得庆幸的是,tRNA分子与氨