我国已完成31个大豆基因组重测序
由香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中国科学院等单位合作的“大豆回家”项目研究成果，“31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化选择模式”11月14日在国际著名杂志《自然—遗传学》上在线发表。 该研究首次对野生大豆和栽培大豆全基因组进行了大规模遗传多态性分析，为全球大豆的遗传学研究、大豆种质资源保护和分子育种提供了非常有价值的资源，有助农业发展。 据悉，这是首次全由中国科学家在大豆的故乡——中国完成的一项大型大豆基因组课题，突破了先进国家在大豆高端研究的垄断，亦是内地和香港之间的紧密合作获得显著科研突破的典范。 据介绍，研究人员运用新一代测序技术对17株野生大豆和14株栽培大豆进行了全基因组重测序，利用SOAP软件v2.18比对到大豆的参考基因组上，总共发现了630多万个单核甘酸多态性位点(SNPs)，建立了高密度的分子标记图谱。同时通过SOAPdenovo软件分别对野生大豆和栽培大豆进行组装，从而鉴定出......阅读全文
大豆“走失”的基因“回家”了
左上为栽培大豆种子，其余为多年生野生大豆种子。山东农大供图 多年生野生大豆植株 山东农大供图从又黑又小的野生大豆，到又黄又大的栽培大豆，3月15日《自然—植物》在线发表的论文证实，在这个过程中丢失了约70%的基因位点。现在，科学家让这些丰富的遗传资源“回家”了。论文通讯作者、山东
毛细管电泳仪在核酸分析中的应用
毛细管电泳仪（CE）是以毛细管为分离通道，以高压直流电场为驱动力，利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离，是分析科学继液相色谱仪之后的又一重大进展，使分析科学从微升级进入到了纳升级水平，不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能，也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。一、在DNA测序中的应
高效毛细管电泳仪在核酸分析中的应用
高效毛细管电泳仪（CE）是以毛细管为分离通道，以高压直流电场为驱动力，利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离，是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展，使分析科学从微升级进入到了纳升级水平，不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能，也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机
高效毛细管电泳仪在核酸分析中的应用
高效毛细管电泳仪（CE）是以毛细管为分离通道，以高压直流电场为驱动力，利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离，是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展，使分析科学从微升级进入到了纳升级水平，不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能，也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转
我国学者利用SMRT、HiC等技术破解大豆Gmax_ZH13基因组
大豆是重要的粮食经济作物，为人类提供了主要的油料和蛋白资源。大豆起源于中国，古称“菽”，约在5000年前由其野生种驯化而来，随后广泛传播于世界各地。大豆在引种和改良过程中产生了遗传瓶颈效应，使来自不同主产区的大豆品种间具有显著的遗传变异。目前，我们广泛采用的大豆参考基因组来源于美国品种“Will
遗传发育所大豆重要性状遗传网络解析取得新进展
不同复杂性状间的耦合是分子设计育种的关键科学问题。作物的产量、品质等大都是多基因控制的复杂性状，由于受到一因多效和遗传连锁累赘的影响，使某些性状在不同材料和育种后代中协同变化，呈现耦合性相关。解析复杂性状间耦合的遗传调控网络，明确关键调控单元，对分子设计育种具有重要意义。大豆原产中国，是人类和动
SNP的检测知识
SNP的检测知识：人类基因组中存在着广泛的多态性，最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代，即单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）。SNP通常是一种二等位基因的（biallelic），即二态的遗传变异，SNP的数量大、分布广，在组成人
高分辨率人类基因变异图谱绘成
由中、美、英等多国共同发起的国际合作项目“千人基因组计划”协作组近日宣布，已成功完成高分辨率人类基因组遗传变异整合图谱。相关研究论文11月1日在《自然》杂志上在线发表。 “千人基因组计划”是由中国华大基因研究院、英国桑格研究所、美国国立人类基因组研究所等多家机构共同启动的一项大规模人类基因
我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
近日，由中国水产科学研究院首席科学家孙效文牵头，中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队，完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制，在国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果于9月21日在国际生物学权威期刊《自然—
研究揭示多态性重复基因的基因组演化机制
近百年来，进化遗传学工作致力于探索重复基因的起源机制和功能演化过程。经典观点认为，基因重复后产生两个完全等同的拷贝，其中一个冗余拷贝在自然选择作用下获得新功能。也有观点认为，剂量效应和不完整基因重复等因素使重复基因并非是等同的冗余拷贝。剂量敏感基因（满足剂量平衡效应的蛋白复合体成员基因或X染色体
半导体测序助力胎儿遗传测试
来自中国广州医科大学等机构的科研人员报告了一种基于半导体的DNA测序平台可能有助于增加胎儿遗传测试的速度并减少成本。 近来基于大规模平行测序的方法已经促进了迅速的、非侵入式的出生前遗传测试，这种测试通过分析母亲血浆中流动的无细胞DNA从而测试被称为非整倍性的染色体拷贝数的异常。
重大测序成果，改写绵羊遗传史
在当前羊肉价格不断攀升、羊毛织品价格下跌之时，一项突破性的新研究利用先进的遗传测序技术，重写了绵羊沿着古老的丝绸之路育种及交易的历史。研究发现可以帮助发展中国家的当代牧民维持或恢复对于食物和经济安全至关重要的一些有价值的性状）。 这一发表在《MolecularBiologyandEvoluti
RNA测序发现杂交蝉遗传证据
据英国《通讯·生物学》杂志近日发表的一项动物学研究，日本科学家通过RNA测序，出乎意料地发现了13年蝉与近亲17年蝉杂交的遗传证据，而这两种蝉至少221年才相遇一次。研究显示，杂交蝉在极其漫长时间里都维持了各自不同的生命周期，目前科学家无法就这种平行趋异演化给出遗传学解释。长期以来，周期蝉的生命
基因芯片的应用
1998 年底美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一，足见其在科学史上的意义。现在，基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达检测、突变检测、基因组多态
科学家完成90个鹰嘴豆基因组测序
1月28日，《自然—生物技术》杂志在线发表了国际鹰嘴豆基因组测序协作组(ICGSC)90个鹰嘴豆基因组测序及分析的成果。该协作组由来自10个国家、23个研究机构的49名科学家组成，深圳华大基因研究院也参与了该项研究。 据了解，鹰嘴豆是全球第二大豆类作物，营养价值高、耐旱性强，主要集中在热带
中国大豆基因组公布并发现该基因组组装错误
大豆是重要的粮食经济作物，为人类提供了主要的油料和蛋白资源。大豆起源于中国，古称“菽”，约在5000年前由其野生种驯化而来，随后广泛传播于世界各地。大豆在引种和改良过程中产生了遗传瓶颈效应，使来自不同主产区的大豆品种间具有显著的遗传变异。目前，我们广泛采用的大豆参考基因组来源于美国品种“Will
基因芯片与SNP分析
基因芯片技术作为一种新兴的生物技术，近年来得到迅速发展，其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性（SNP）作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90
Cell惊人发现：DNA复制方案因人而异
人类细胞每次分裂的时候，都得复制六十亿DNA碱基，一个一个来显然是不现实的。事实上，DNA复制机器会同时介入多个起始点，进行分工合作。 哈佛大学医学院、Broad研究所和MIT的科学家们发现，人与人之间的DNA复制方案并不相同。他们鉴定了首个调控DNA复制时序（Replication timi
多国科学家携手绘制人类基因多态性图谱
包括中国在内的多国科学家正在携手绘制一组特殊的图卷，它们中的每一张都由23对染色体，约30亿个DNA碱基对组成，却各有异同，是迄今为止世界上最详尽的人类基因多态性图谱。 通过解读这一图谱，人们可以更加深入地了解人类自身生老病死的奥秘，为未来解决艾滋病、癌症等不治之症和其他疑难杂症找到理论基
首个韩国人基因组图谱绘制成功
据韩国联合通讯报道，韩国研究机构日前宣布，第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出，这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译，这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布，分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是
张亚平院士等Y染色体数据分析研究取得进展
记者从中科院昆明动物所了解到，在张亚平院士带领下，该所彭旻晟、贺军栋、樊隆等人开发出针对DNA芯片数据中Y染色体单核苷酸多态性位点的分析策略。相关研究11月27日在线发表于《欧洲人类遗传学》。 随着全基因组关联分析广泛应用于人类遗传学工作之中，相关的DNA芯片(微阵列)也不断得到发展。许多
作物基因组学研究进展（一）
作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展，对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展，已经实现对重要农作物，如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序，在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了２０１8年度主要农
研究揭示我国大豆驯化改良进化史
近日，中国农业科学院作物科学研究所大豆优异基因资源发掘与创新利用团队联合国内外科研机构，通过解析大豆地理扩张与育种的全基因组特征，提出大豆进化路线，发掘了大豆不同进化阶段受到选择的候选基因，并从中克隆了一个重要的开花基因GmSPA3c。近日，研究成果在线发表于《中国科学：生命科学》（SCIENC
人类基因组测序的缘起
虽然公众对于开展人类基因组测序已经翘首以待，但是为这项计划举办的首次协调会却令人泄气。1984年夏季，美国能源部（DOE）健康与环境研究项目主任查尔斯·德利西（Charles DeLisi）召开了专家会议，旨在评估人类基因组测序技术的可行性。自20世纪80年代早期以来，能源部的研究人员一直在致力
动物细胞基因组DNA－SNP的生物芯片检测1
实验原理：1、SNP的概念及意义单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在群体中的发生频率不小于1%。SNP在
首届国际基因组学大会美洲分会在费城成功召开
2012年9月27日至28日，为期两天的首届国际基因组学大会美洲分会(The International Conference on Genomics in the Americas，ICG Americas 2012)在美国费城儿童医院(CHOP)成功召开。本次会议由华大基因与费城儿童
科学家搜捕致病基因研究开始进入“收网期”
个性化医疗时代不再遥远 2007年，科学家找到大量常见疾病的基因根源。美国《科学》（Science）杂志今年宣告，寻找致病基因的研究开始进入“收网期”，经过多年挫折，“基因猎手们感到自己终于将猎物逼到了死角”。 过去一两年中，有关Ⅰ型和Ⅱ型糖尿病、精神分裂症、抑郁症、肠炎、青光眼、肥胖、风湿性关节
PacBio首次确认一种疾病大片段缺失突变
二代测序为生命科学研究带来了翻天覆地的变化，但是越来越多研究表明这种短读长测序 (short-read sequencing, SRS)虽然高通量，成本低，然而对于串联重复序列、高GC/AT序列、高度多态性区域、高度同源区域以及大片段结构变异的检测能力非常有限，难以全方位的捕捉基因组的变化。据估
大豆对孢囊线虫超亲遗传抗性研究中获进展
大豆孢囊线虫病是制约大豆生产的全球性病害之一。大豆孢囊线虫的抗性由多基因和数量性状控制。大多数研究是基于高抗和高感品种杂交形成的遗传分离群体，存在高抗基因时，微效基因时常被掩盖而不能被有效检测，但后代对线虫的表型反应相对于亲本显现为广泛的变异。此外，当前对大豆孢囊线虫的抗性评价是建立在每株孢囊数
科学家揭示大豆生态适应性遗传机制
大豆是世界上重要的经济粮食作物，起源于我国黄淮海地区，是典型的短日照作物。通常，当高纬度地区大豆品种引种到低纬度区域时，由于其对光周期极其敏感，成熟期大大提前，导致大豆植株生物量和产量降低，这极大程度限制了低纬度地区的大豆种植。大豆长童期 (Long Juvenile, LJ) 性状在上世纪70