中国科大发现新型非编码RNA
最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。单革教授实验室发现了一类新型的环状非编码RNA,在这类环状RNA中,内含子没有被除去、而是被保留在环形RNA当中,因此这类RNA被作者命名为外显子-内含子环形RNA(EIciRNA)。该文研究了外显子-内含子环形RNA的功能,发现此类非编码RNA可以调控其自身所在的基因的表达。进一步的研究表明,外显子-内含子环形RNA是通过招募U1小RNA蛋白复合物(U1 snRNP)来促进基因转录的起始。 环形RNA分子是最近数年才引起研究人员注意的,而此前的研究主要集中在线形RNA分子上。在此研究之前,报导的已知......阅读全文
环形RNA获新研究进展
9月18日,国际著名学术期刊《细胞》在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学伙伴研究所杨力课题组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组关于环形RNA研究的最新进展。该研究成果首次阐明了互补序列对外显子来源环形RNA产生的调节机制,并进一步揭示了互补序列竞争性配对介导的可变环化调控,以全新的
太阳环形耀斑及其相关活动研究获进展
太阳耀斑是太阳大气中短时间内剧烈的能量释放过程。环形耀斑(CRF:circular-ribbon flare)是TRACE太阳探测器于2009年发现的一种特殊耀斑,通常由一个圆形或椭圆形亮带和内部致密的亮带组成,具有特殊的磁拓扑结构。日冕暗化(coronal dimming)则是与太阳耀斑爆发相
研究开发出高效环形RNA检测与定量工具
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)高远团队与动物研究所赵方庆团队,开发出面向TB级转录组数据的高效环形RNA检测与定量工具CIRI3,通过反向剪接序列比对与跨样本整合算法设计,实现了TB级数据的超高速处理,并可高灵敏识别低丰度及非传统剪接信号的新型环形RNA,突破了环形RNA大规模
中国科大发现新型非编码RNA
最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
HBV相关的肝细胞癌外显子组研究
肝癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC)是一种严重威胁人们健康的恶性肿瘤,每年约有70万患者死于肝癌。在中国,肝癌每年发病人数超过25万人,其发病主要与乙肝病毒感染、酒精肝、食物受黄曲霉毒素污染等原因有关。肝癌的高致死率主要是由于其具有很强的侵润和转移能力,特别是常常侵
HBV相关的肝细胞癌外显子组研究
肝癌(Hepatocellular Carcinoma, HCC)是一种严重威胁人们健康的恶性肿瘤,每年约有70万患者死于肝癌。在中国,肝癌每年发病人数超过25万人,其发病主要与乙肝病毒感染、酒精肝、食物受黄曲霉毒素污染等原因有关。肝癌的高致死率主要是由于其具有很强的侵润和转移能力,特别是常常侵
北京生科院在环形RNA研究领域取得新进展
6月28日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组实验室赵方庆团队题为Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even
上海生科院发表关于神经系统环形RNA研究的专评
6月4日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲和计算生物学研究所研究员杨力题为Gear up in circles的专评,对当期Molecular Cell 和4月刊Nature Neuroscien
外显子应用机理
应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。
什么是外显子?
断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。
研究揭示环形RNA促进相分离调控肿瘤发展分子机制
环形RNA是由pre-mRNA通过反向剪接形成的闭合环状RNA分子,在生物体内可发挥miRNA海绵、结合蛋白以及翻译成短肽等分子功能来调控各种生理和病理过程。与线性mRNA相比,环形RNA独特的环状结构使其具有更高的稳定性,在细胞内可更稳定地存在。因此,环形RNA更适合作为肿瘤的分子标志物及治疗
环形变压器
使用环境 1、周围空气温度-30℃至+40℃,24小时的平均值不超过+35℃;超过+40℃时变压器的负载能力下降,低于0℃以下时,变压器的负载能力上升,负载功率可略超出额定功率。在-30℃的低温环境并不影响环形变压
显微镜环形灯
显微镜环形灯LED灯采用控流开关电源技术,体积小,重量轻,能效高,发热量小,环保,输出稳定,纹波小,寿命长等优点。输入功率:3W荧光灯源具有光效高、耗电省、显色性好,长时间照明不疲劳等优点。是新一代理想的绿色照明光源。我们一直秉诚信经营、质优价廉、真诚服务的作风、以及互惠互利的原则,为客户提供理想的
E花环形成试验
实验目的 1.掌握T淋巴细胞E花环试验的原理、正常值,了解其方法和用途。2.熟悉光镜下E花环的形态和计数方法。实验原理 T细胞表面具有能与绵羊红细胞(SRBC)表面糖肽结合的受体,称为E受体(CD2)。已证实E受体是人类T细胞所特有的表面标志。当T细胞与SRBC混合后,SRBC便粘附于T细胞表面,呈
外显子跳读的概念
中文名称外显子跳读英文名称exon skipping定 义跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
外显子捕获与扩增
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α
外显子的基因反应
剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的,外显子的识别及其拼接都是难题。 真核生物的基因,其线性表达被内含子阻断,这就是所谓的断裂基因(英语splitgene),该现象的发现者RichardJ.Robe
外显子重复的定义
中文名称外显子重复英文名称exon duplication定 义(1)一个基因内部产生一个或者多个外显子的复制拷贝。(2)两分子同种前体RNA进行反式剪接时,成熟RNA分子上出现重复的外显子序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
什么叫跨外显子
这是针对逆转录pcr而言,所谓的跨外显子就是一个引物(比如上游引物)、出现在两个外显子交界,那么做RT-PCR时,dna 由于2个外显子被内含子隔开,引物就不会起作用了
外显子插入的定义
中文名称外显子插入英文名称exon insertion定 义一个或者多个外显子从一个基因参入到另一个基因中去的现象。其结果是使剪接更有多样性,造成可读框移动,出现翻译终止密码子而使蛋白质合成中止或产生新的蛋白质。是进化中出现新事物的一个源泉。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控
外显子混编的功能
即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编而成。这种基因片段可能就是外显子,因此称为外显子混编。
酶催化八元氧杂桥环形成机制研究获进展
中国科学院深圳先进技术研究院研究员周佳海与上海有机化学研究所研究员唐功利课题组等合作,在《自然-催化》(Nature Catalysis)上,在线发表了题为Enzymatic catalysis favours eight-membered over five-membered ring clo
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日,国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展:Diverse alternative back-splicing and alternative spl
Twist-Bioscience与因美纳建立疾病研究外显子解决方案
Twist Bioscience 周二表示,它已与因美纳建立合作伙伴关系,以生产用于疾病研究的 Illumina Exome 2.0 Plus 面板的联合品牌 Twist Bioscience。 根据合作伙伴关系,Twist 将生产 Exome 2.0 Plus 面板,该面板可用于因美纳测序仪
环形混凝土电杆的技术要求
环形混凝土电杆的技术要求,分别从以下几方面阐述:一、混凝土抗压强度1.钢筋混凝土电杆的混凝土强度不低于C40,脱模时混凝土抗压强度不宜低于设计的混凝土强度等级的60%2.预应力混凝土电杆,部分预应力混凝土电杆的混凝土强度等级不低于C50,脱模时混凝土抗压强度不宜低于设计的混凝土强度等级的70%3.保
环形激光自动测角仪
大家对自动侧角装置的研制非常重视,特别是测角仪。其中一个很有发展前途的仪器是基于环形激光器的测角仪。这种测角仪容易实现自校,因此可以在测量过程中确定环形激光器的比例因子,从而大大地减少了测量误差。在测量时,当装有环形激光器的回转装置的角速度比较高时,其输出信号(即测量值)的非线性实际上不影响测角
环形RNA与线性RNA定量比较分析新系统CLEAR发布
1月15日,国际学术期刊Genomics,Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCexplorer3: A CLEAR Pipeline for Direct Comparison o
关于外显子混编的介绍
当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。 即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编
关于外显子捕获的简介
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接
外显子捕获与扩增2
阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚:氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X