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中国科大发现新型非编码RNA

最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。单革教授实验室发现了一类新型的环状非编码RNA,在这类环状RNA中,内含子没有被除去、而是被保留在环形RNA当中,因此这类RNA被作者命名为外显子-内含子环形RNA(EIciRNA)。该文研究了外显子-内含子环形RNA的功能,发现此类非编码RNA可以调控其自身所在的基因的表达。进一步的研究表明,外显子-内含子环形RNA是通过招募U1小RNA蛋白复合物(U1 snRNP)来促进基因转录的起始。 环形RNA分子是最近数年才引起研究人员注意的,而此前的研究主要集中在线形RNA分子上。在此研究之前,报导的已知......阅读全文

环形RNA获新研究进展

  9月18日,国际著名学术期刊《细胞》在线发表了中科院上海生命科学研究院计算生物学伙伴研究所杨力课题组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组关于环形RNA研究的最新进展。该研究成果首次阐明了互补序列对外显子来源环形RNA产生的调节机制,并进一步揭示了互补序列竞争性配对介导的可变环化调控,以全新的

北京生科院在环形RNA研究领域取得新进展

  6月28日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组实验室赵方庆团队题为Comprehensive identification of internal structure and alternative splicing even

赵方庆团队提出环形RNA转录本重建和定量新方法

  在以往的研究中,环形RNA的识别方法主要是利用环形RNA特有结构——反向剪接序列特征进行识别。然而,由于二代测序的读长普遍较短,研究者们虽然可以获得大量的反向剪接位点,却无法高通量获得环形RNA的完整内部结构信息,也无法对不同可变剪接产物进行精确定量。  2018年1月19日,Genome Me

上海生科院发表关于神经系统环形RNA研究的专评

  6月4日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲和计算生物学研究所研究员杨力题为Gear up in circles的专评,对当期Molecular Cell 和4月刊Nature Neuroscien

海生院发现NF90/NF110对环形RNA表达调控和功能作用新机制

  6月15日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院-马普计算生物学研究所杨力研究组和中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA(circRNA)研究的最新进展:Coordinated circRNA biogenesis

生科院提出环形RNA内部序列结构可视化新方法

  1月18日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队于Bioinformatics 杂志上在线刊发了题为Visualization of circular RNAs and their internal splicing events from transcriptomic data 的研究。该研

环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制

  6月30日,国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展:Diverse alternative back-splicing and alternative spl

环形RNA与线性RNA定量比较分析新系统CLEAR发布

  1月15日,国际学术期刊Genomics,Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCexplorer3: A CLEAR Pipeline for Direct Comparis

上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制

  4月19日,国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制,揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。  环形RNA是一类通过反向

北京生科院提出环形RNA全长转录本重建和定量新方法

  国际学术期刊Genome Medicine 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为Reconstruction of full-length circular RNAs enables isoform-level quantification 的最新研究成果。该研

科学家首次阐述了环形RNA在细胞受病毒感染时的降解机制

  4月25日,国际学术期刊《细胞》(Cell)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA的最新研究进展:Structure and degradation of circular RNAs regulate PKR activation in innate immun

赵方庆团队开发环形RNA定量和差异表达分析新方法

  2020年1月3日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》(Nature Communications)杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw

研究人员开发环形RNA定量和剪接体转换识别新方法

  2020年1月3日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》(Nature Communications)杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw

北京生科院提出环形RNA识别的新方法

  环形RNA是一类新报道的结构特殊的非编码RNA。近两年的研究发现,环形RNA在动物细胞内广泛存在,且大多位于基因的外显子区域。另有研究表明,少数环形RNA分子可以充当microRNA“海绵”,在转录后水平对基因表达进行调控。然而,目前绝大多数的环形RNA功能仍不明确,科学家们推测其可能与蛋白质及

我国学者发现新型非编码核糖核酸

  中国科学技术大学单革教授实验室近期发现了一种新型的环状非编码核糖核酸(RNA),为进一步揭示人类生命原理,以及未来解释并防治一些重大疾病提供参考。该研究成果日前发表在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》上。   核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体,而非编码R

中科大发现新型生命“暗物质”或与重大疾病有关

  非编码RNA(核糖核酸),被称为生命体中 “暗物质”。日前,中国科学技术大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA,并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机理。成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。    非编码RNA是一大类不编码蛋白质,但在细胞中起着调控作用的RNA分子。正如

2019年中国学者86篇Cell,Nature及Science文章汇总

  2019年上半年很快就结束了,iNature盘点了中国学者在Cell,Nature及Science发表的成果,我们发现总共有86篇(截至2019年6月24日),具体介绍如下:  4-6月发表的文章  【1】2019年6月21日,西北工业大学王文,中科院昆明动物研究所/BGI 张国捷及丹麦哥本哈根

上海生科院等揭示环装RNA编码蛋白的重要机制

  3月10日,中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员王泽峰在《细胞研究》(Cell Research)上在线发表了题为Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine 的研究论文,该研究发现了大量的环形R

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

单革:非编码RNA的探索者

  日前,国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》刊发了中国科学技术大学单革教授的一篇文章,他的实验室发现了一类新型环状非编码RNA,并揭示了其功能和功能机理,相关成果得到了新华社、中科院官网等媒体关注。  记者了解到,在2012年9月,《自然·通讯》也在线发表了单革的研究成果,那次他发现了曾被认为是

科学家揭示内含子来源环形RNA新分子及转录调控功能机制

  9月27日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文,发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子,揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。   众所周知,人类基因组中存

中国学者Cell子刊揭示基因组“暗物质”中环状RNA新分子

  9月27日,国际学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)发表了中科院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲组与计算生物学所杨力组的最新合作研究论文,发现来源于基因内含子区域的环形RNA新分子,揭示其成环机制及在基因转录调控中的重要功能。   众所周知,人类基因组中存在大量被称为基因组

我国化学家取得真核生物基因组设计与化学合成重大突破

  在国家自然科学基金创新研究群体项目和重大项目(项目编号:21621004,21390203)等资助下,天津大学元英进团队在真核生物基因组设计与化学合成方向取得重大突破。该团队完成了2条真核生物酿酒酵母染色体(synⅤ、synⅩ)的从头设计与化学合成,相关研究成果分别以“‘Perfect’desi

上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制

  10月1日,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文,系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。  真核基

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

“科技冬奥”重点专项2020年度项目申报指南征求意见

  根据《国务院关于改进加强中央财政科研项目和资金管理的若干意见》(国发〔2014〕11号)、《国务院关于深化中央财政科技计划(专项、基金等)管理改革方案的通知》(国发〔2014〕64号)、《科技部 财政部关于印发<国家重点研发计划管理暂行办法>的通知》(国科发资〔2017〕152号)等

引力波探测启示:基础研究带科学发现来敲门

   春节期间,美国LIGO科学组织凭借一则“直接探测到引力波”的消息,刷爆了朋友圈、微博、各大网站及传统媒体版面,一时间“引力波”这个往日里略显“高冷”的术语,竟成了普通人口中不断谈及的“潮词”。  在各大媒体纷纷解析引力波的重要科学意义时,专家强调,引力波并不仅仅是探测宇宙天体过程的工具那么简单

组织学研究方法

(一)一般光学显微镜术应用一般光学显微镜(简称光镜)观察组织切片是组织学研究的最基本方法。取动物或人体的新鲜组织块,先用固定剂(fixative)固定(fixation),使组织中的蛋白质迅速凝固,防止细胞自溶和组织腐败。常用的固定剂如洒精、甲醛、醋酸、苦味酸、四氧化锇等,一般常将几种固定剂配制成混

2018基金委与俄罗斯基础研究基金会合作项目初审结果

  根据国家自然科学基金委员会(NSFC)与俄罗斯基础研究基金会(RFBR)双边合作协议,2018年双方共同资助中俄合作交流项目。经公开征集,我委共收到202项申请,经初步审查并与俄方核对项目清单,以下189项申请通过初审:序号科学部编号项目名称中方申请人中方依托单位俄方申请人俄方依托单位11181