中国科大发现新型非编码RNA

最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。单革教授实验室发现了一类新型的环状非编码RNA,在这类环状RNA中,内含子没有被除去、而是被保留在环形RNA当中,因此这类RNA被作者命名为外显子-内含子环形RNA(EIciRNA)。该文研究了外显子-内含子环形RNA的功能,发现此类非编码RNA可以调控其自身所在的基因的表达。进一步的研究表明,外显子-内含子环形RNA是通过招募U1小RNA蛋白复合物(U1 snRNP)来促进基因转录的起始。 环形RNA分子是最近数年才引起研究人员注意的,而此前的研究主要集中在线形RNA分子上。在此研究之前,报导的已知......阅读全文

外显子捕获与扩增2

阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚:氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X

外显子捕获与扩增(二)

材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)酶及缓冲液胰酶-EDTA 溶液核酸与寡核苷酸DNA用于转染的质粒 DNA 制备见本方案阶段 1, 步骤 10~12。用作对照的质粒载体(步骤 3)培养基含 10% 热灭活胎牛血清的 Dulbecco's modified

外显子捕获与扩增(三)

凝胶琼脂糖凝胶(1.5%m/V), 用 TBE 配制核酸与寡核苷酸寡核苷酸引物 [20 mmol/L,TE(pH8.0) 配制]分别提取自转染有对照载体和重组载体的 COS-7 细胞的 RNA(阶段 3)。培养基含 50ug/ml 氨苄青霉素的 LB 琼脂平板专用设备自动微量加样器所用的加样器尖头微

全外显子怎么看

全外显子利用序列捕获技术高通量测序的方法查看。全外显子基因技术利用序列捕获技术高通量测序的方法可将全基因组中所有外显子区域DNA序列测序,可用于研究已知基因的单核苷酸多态性位点、插入缺失位点等。简言之,外显子就是指真核细胞的基因在表达过程中能编码蛋白质的核苷酸序列,全外显子基因检测建议到正规医院,专

关于外显子混编的介绍

  当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。  即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编

关于外显子捕获的简介

  外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接

外显子捕获与扩增(一)

实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3COS-7 细胞载体 pBluescriptⅡ大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 pSPL3 多克隆位点图谱限制性内切核酸酶PvuⅡT4DNA 连接酶LB 琼脂平板黏粒载体TESOC 培养基琼脂糖凝胶LB 肉汤培养基PBS胰酶-EDTA 溶液D

关于全外显子测序技术

在过去10年里,随着高通量测序技术的出现与发展,科研与临床医学领域的遗传学检测范围不断扩大,检测速度不断加快。时至今天,DNA测序技术不仅推进了遗传学研究,也被用于各种遗传疾病的检查。特别是利用全外显子组测序(whole exomesequencing,WES)与全基因组测序(wholegenome

外显子捕获的操作步骤

(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成

全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究

  研究背景   胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中,大约有40%胃癌发生于中国,多数人被诊断为胃癌时已是进展期,更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌,腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段,胃癌一旦发生腹膜转移

全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究

  研究背景   胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中,大约有40%胃癌发生于中国,多数人被诊断为胃癌时已是进展期,更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌,腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段,胃癌一旦发生腹膜转移

大模型驱动的基因组环形可视化生成研究获进展

近日,中国科学院计算机网络信息中心科研团队研发出大模型驱动的基因组环形可视化智能生成框架AuraGenome。AuraGenome突破“人工-脚本-静态”传统范式,开创“自然语言-智能体-交互”新模式,能够将基因组数据快速转化为高质量、可交互的可视化结果,并支持全流程的可追溯与复用。在急性髓系白血病

新研究揭示东南亚环形俯冲系统各向异性层析成像

  在国家自然科学基金、南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)重大专项、中国科学院广州地球化学研究所所长基金等项目的联合资助下,徐义刚院士团队博士后华远远联合日本东北大学赵大鹏教授,对东南亚环形俯冲系统进行了各向异性层析成像研究。相关研究近日发表于《地球物理学研究杂志:固体地球物理学》。  东南亚环

我国科学家在环形染色体重排研究方面取得突破进展

  近日,《自然·通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了我国科学家的研究论文 “Ring Synthetic Chromosome V SCRaMbLE”,证实了人工合成环形染色体在基因型和表型上的连续进化能力,显示与天然线性染色体相比,人工环形染色体具有更复杂的重排变化

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

外显子捕获的概念和方法

外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接,这

分子遗传学词汇外显子

断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语

关于外显子的结果应用介绍

  结果发现68例SAD患者中有4例患者的SSCP发生泳动异常,DNA序列分析发现:这4例SAD患者的130号密码子发了CTG→ATG错义突变(388位点发生C→A突变),使氨基酸由亮氨酸变为蛋氨酸(Leu130Met);157号密码子发生了GTG→CTG错义突变(469位点发生G→C突变),使氨基

外显子的跳跃突变的介绍

  超过一半的基因编码区的单核苷酸突变引起的疾病都是影响了RNA的剪切。例如这些突变导致基因的外显子缺失,被称为外显子跳跃现象。如果能将外显子重新恢复到基因转录本中去将会给许多疾病的治疗带来曙光。AdrianKrainerandLucaCartegni开发了一种新的方法ESSENCE(exon-sp

关于外显子的应用机理介绍

  应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。

外显子的基因反应的介绍

  剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的,外显子的识别及其拼接都是难题。 真核生物的基因,其线性表达被内含子阻断,这就是所谓的断裂基因(英语splitgene),该现象的发现者RichardJ.Ro

关于外显子的表达序列介绍

  在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外

环形激光器的功能介绍

环形激光器是飞机、卫星、潜艇等高速运动体的“大脑”,其重要性不亚于计算机芯片。20世纪60年代初,美国率先研制出第一台环形激光器,不仅引发了世界光学领域的一场革命,更使他们的飞机、卫星和武器装备遥遥领先。

环形激光器的功能介绍

环形激光器是飞机、卫星、潜艇等高速运动体的“大脑”,其重要性不亚于计算机芯片。20世纪60年代初,美国率先研制出第一台环形激光器,不仅引发了世界光学领域的一场革命,更使他们的飞机、卫星和武器装备遥遥领先。

环形激光器的研制历程

从上世纪70年代起,我国有10多家单位从事环形激光器研制,但后来因为困难重重,特别是配套基础工艺难度太大,除了国防科大,其余的单位都选择了放弃。在高伯龙院士的带领下,国防科大环形激光器团队咬定青山不放松,连续攻关30多年,攻克镀膜、精密光学加工等难题,研制出多种拥有完全自主知识产权的高精度环形激光器

环形变压器的分类

  根据国外文献介绍,环形变压器可分为标准型、经济型及隔离型等三类,各类的特点是  1)标准型电源变压器产品系列容量8~1500VA,有较小的电压调整率、满载运行温升仅为40℃,允许短时超载运行,适合于要求高的使用场合。 初次级绕组间采用B级(130℃)的聚酯薄膜绝缘,要求至少包三层绝缘带,能经受交

环形变压器的特点

  环形变压器的铁心是用优质冷轧 硅钢片(片厚一般为0.35mm以下),无缝地卷制而成,这就使得它的铁心性能优于传统的叠片式铁心。环形变压器的线圈均匀地绕在铁心上,线圈产生的磁力 线方向与铁心磁路几乎完全重合,与叠片式相比激磁能量和铁心损耗将减小25%,由此带来了下述一系列的优点。  1)电效率高铁

环形电子枪的原理简介

  环形枪结构简单、成本低,并能以简单的电源装置工作。枪体由环形灯丝、阳极、阴极、聚焦线圈和偏转线圈等组成。环形灯丝处于负高压,用做热电子发射源,在聚焦极的定向反射和阳极的加速作用下,使电子束会聚于坩埚蒸发源中心。环形枪和直形枪在使用时,高能电子束轰击材料将发射二次电子。

环形变压器的优点

  环形变压器的铁心是用优质冷轧 硅钢片(片厚一般为0.35mm以下),无缝地卷制而成,这就使得它的铁心性能优于传统的叠片式铁心。环形变压器的线圈均匀地绕在铁心上,线圈产生的磁力 线方向与铁心磁路几乎完全重合,与叠片式相比激磁能量和铁心损耗将减小25%,由此带来了下述一系列的优点。  优点一  1)

E-玫瑰花环形成实验

E玫瑰花环形成试验             实验方法原理 正常人外周血中 T 细胞在体外能直接和绵羊红细胞(SRBC)结合形成玫瑰花样细胞团。这是因为人的T 细胞膜上具有能和SR