中美科学家揭示玉米杂交机制

由中国农业大学玉米中心、华大基因研究院、美国爱荷华大学、明尼苏达大学等单位合作的研究成果“基因丢失与获得的多态变化揭示玉米中的杂交优势的机制”近日在国际著名杂志《自然—遗传学》上发表。该研究报道了中国重要玉米骨干亲本的全基因组的单核苷酸多态性、插入/缺失多态性以及基因获得和缺失变异图谱,为玉米的遗传学研究和分子育种提供了宝贵资源。 该研究对6个中国重要玉米杂交组合骨干亲本进行全基因组重测序,发现了100多万个单核苷酸多态性位点(SNPs)和3万多个插入缺失多态性位点(IDPs),建立了高密度分子标记基因图谱;同时研究还发现了101个低序列多态性区段,在这些区段中含有大量在选择过程中与玉米性状改良有关的候选基因。此外,通过将玉米自交系Mo17及其他自交系的基因序列与玉米自交系B73的基因序列比对,研究人员对玉米自交系中基因丢失与获得的多态性进行了研究,发现在不同的自交系中存在不用数量的基因丢失与获得性变异;利用SA......阅读全文

中美科学家揭示玉米杂交机制

  由中国农业大学玉米中心、华大基因研究院、美国爱荷华大学、明尼苏达大学等单位合作的研究成果“基因丢失与获得的多态变化揭示玉米中的杂交优势的机制”近日在国际著名杂志《自然—遗传学》上发表。该研究报道了中国重要玉米骨干亲本的全基因组的单核苷酸多态性、插入/缺失多态性以及基因获得和缺失变异图谱

单链构象多态性

单链构象多态性(signle strand conformation polymorphism,SSCP)是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异,这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同,从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。用SSCP法检查基因突变时,通常

玉米杂交方法与步骤

玉米由于是单性花、异花授粉,因此在杂交时,不需要去雄,因而也不需要整穗。其杂交方法和步骤主要为调节开花期、选株、隔离、采粉、授粉和收获等。 调节开花期:玉米由于单性花,在调节开花期方面,必须使母本的雌穗和父本的雄穗的花期一致。可用分期播种的方法调节父、母本的花期。 选株:父、母本均应选择生长健壮、无

单核苷酸多态性的特点

在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用, 主要源于这几个特点:(1)密度高SNP在人类基因组的平均密度估计为1\1000 bp , 在整个基因组的分布达3×106个,遗传距离为 2~3cM,密度比微卫星标记更高,可以在任何一个待研究基因的内部或附近提供一系列标记。(2)富有代表性某些位于

单核苷酸多态性的概念

单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每300个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起,也可

单核苷酸多态性(SNP)实验

SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,可以用于检测由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。实验方法原理由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个

单核苷酸多态性(SNP)实验

基本方案             实验方法原理 由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较

单核苷酸多态性的概念

单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每300个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起,也可

单核苷酸多态性(SNP)实验

实验方法原理 SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于限制性片段长度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(S

单链构象多态性简介

  单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的

单核苷酸多态性的数量分布

据估计,人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP,人类30亿碱基中共有300万以上的SNPs。SNP 遍布于整个人类基因组中,可位于基因编码区、基因的非编码区以及基因间区(基因和基因之间)。

单核苷酸多态性的应用特点

在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用, 主要源于这几个特点:(1)密度高SNP在人类基因组的平均密度估计为1\1000 bp , 在整个基因组的分布达3×106个,遗传距离为 2~3cM,密度比微卫星标记更高,可以在任何一个待研究基因的内部或附近提供一系列标记。(2)富有代表性某些位于

关于单核苷酸多态性的简介

  SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。  理论上讲,SNP既可能是二等位多态性,也可能是3个或4个等位多态性,但实际上,后两者非常少

关于DNA芯片的核苷酸多态性

  SNP标记是美国学者Lander E于1996年提出的第三代DNA遗传标记。SNP是指同一位点的不同等位基因之间仅有个别核苷酸的差异或只有小的插入、缺失等。从分子水平上对单个核苷酸的差异进行检测,SNP 标记可帮助区分两个个体遗传物质的差异。人类基因组大约每 1250 bp SNP 出现一次,已

单核苷酸多态性检测方法—SNapShot

SNP(Single Nucleotide Polymorphisms),即单核苷酸多态性,是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,它是人类可遗传的变异中最常见的一种,并作为第三代遗传标志。人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关,因此被广泛用于群体遗传学研

单链构象多态性的应用

单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序,并与数据库中已知序列比对。

单链构象多态性的原理

单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下,单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象,它影响了DNA在非变性凝胶中的迁

单链构象多态性的原理

单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下,单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象,它影响了DNA在非变性凝胶中的迁

PCR单链构象多态性分析

  PCR -单链构象多态性分析(PCR -single strand conformation analysis,PCR -SSCP) 是近年来在基因突变检测中运用最广泛的方法之一。PCR -SSCP 技术凭借突变可引起单链DNA三级构象改变,通过观察单链DNA在非变性聚丙烯酰胺凝胶中的迁移率漂移

基因多态性的检测方法

1.限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP):由DNA 的多态性,致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变,用限制酶切割基因组时,所产生的片段数目和每个片段的长度就不同,即所谓的限制性片段长度多态性,导致限制片段长度发生改

“杰出”的玉米是如何杂交的?

  作物的杂交后代比它的双亲表现出更大的生物量、更强的抗逆性、更高的产量,这就是杂种优势。百余年来,遗传学家一直在苦苦探寻其背后的遗传学机理,寻找能让后代比双亲更“杰出”的基因位点,却难以揭开其神秘的面纱。  近日,我国科学家在构建玉米核心自交系泛基因组、解析玉米杂种优势形成机理方面取得重要进展。评

单核苷酸多态性的基因分型

SNPs 的二态性,也有利于对其进行基因分型。对SNP进行基因分型包括三方面的内容:(1)鉴别基因型所采用的化学反应,常用的技术手段包括:DNA分子杂交、引物延伸、等位基因特异的寡核苷酸连接反应、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术;(2)完成这些化学反应所采用的模式,包括液相反应、固相支持物

关于单核苷酸多态性的基本介绍

  单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每300个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起,

关于单核苷酸多态性的特点介绍

  在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用, 主要源于这几个特点:  (1)密度高  SNP在人类基因组的平均密度估计为1\1000 bp , 在整个基因组的分布达3×106个,遗传距离为 2~3cM,密度比微卫星标记更高,可以在任何一个待研究基因的内部或附近提供一系列标记。  (2)富

盘点:单核苷酸多态性(SNP)检测方法

  单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,包括碱基的颠换、转换、插入和缺失。它是人类可遗传变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP作为第三代分子标记,被广泛应用于分子

单链构象多态性的实验步骤

利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。利用λ-外切核酸酶消化掉一条链(其中一个PCR引物被磷酸化,这条链将被去除)。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。

单链构象多态性的应用介绍

单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序,并与数据库中已知序列比对。

单链构象多态性的实验步骤

利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。利用λ-外切核酸酶消化掉一条链(其中一个PCR引物被磷酸化,这条链将被去除)。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。

单链构象多态性的原理简介

  单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下,单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象,它影响了DNA在非变性凝胶中

单链构象多态性分析(SSCP)技术

SSCP是一种简便快速的检测DNA或cDNA突变的技术。        其技术原理和过程是:将PCR扩增到的待测DNA或cDNA片段变性,成为单链DNA,在一定条件下,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳将单链DNA变性。        由于单链DNA的空间构象与分子内碱基组成密切相关,一个碱基的差异即可形成不同