NatureBiotechnology:可取代ChIPseq的新技术

生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。 这样的基因表达受到转录因子的控制,但人们一直很难定位功能性转录因子在DNA上的结合位点。之前的全基因组分析让人感到更加困惑,似乎转录因子在DNA上到处结合,甚至结合在不开/关基因的地方。 日前,Stowers医学研究所的研究人员开发了一个能够在基因组中精确定位转录因子结合位点的新技术,该技术分辨率很高,大大优于之前的分析方法。这一成果发表在三月九日的Nature Biotechnology杂志上。 研究显示,功能性的转录因子结合位点存在清晰的印迹,也就是说转录因子结合在特定的序列上。而那些可疑的结合位点并没有特定的模式,非常散乱。 “我们鉴定了转录因子结合位点独有的序列模体(motif),还发现了其他与结合特异性有关的序......阅读全文

使用转录定位法进行基因定位

许多 RNA病毒的整个基因组往往作为一个单位转录。随着转录的进行,由基因组上各个基因所编码的蛋白质也依序在寄主细胞中出现。当寄主细胞被紫外线照射使本身的蛋白质合成受到抑制时,病毒蛋白的出现更为明显。紫外线照射也起着抑制病毒基因组的转录的作用。紫外线在 RNA分子的某一部位造成损伤后,损伤的部位和它后

基因表达转录调控的主要途径

基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

关于基因表达的转录调控介绍

  基因表达的转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白

关于基因表达的转录机制介绍

  基因表达的转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使

基因转录图的结构或功能

转录图基因转录图即是把细胞内染色体或DNA上所有基因定位在染色体或DNA基因组的不同位置上,反映在 正常或受控条件下能够表达的cDNA片段数目、种类、结构与功能的信息,是用来表示DNA上哪些核苷酸序列可以编码蛋白质。生物性状是由结构或功能蛋白决定的,功能蛋白是由信使RNA(mRNA)编码的,mRNA

基因表达的转录调控的介绍

  可分为三种主要途径:  1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);  2)调控转录因子与转录机制相互作用;  3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰             实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR

Cell:揭秘转录因子如何相互作用制造心脏

  刊登于Cell杂志上的一项研究报告中,来自格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)的科学家们近日通过研究发现三种转录因子可以彼此相互作用,并且同基因组相互作用从而影响胚胎心脏的形成,如果没有这些蛋白质(转录因子)的相互作用就会引发新生儿出现严重的先天性心脏缺损;通过理解心脏发育

转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成

近日,山东理工大学农业工程与食品科学学院教授李富军团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture,JIA)正式发表。该研究发现了转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成的分子机制。表皮蜡质是影响果蔬品质形成与保持的重要因子。植物激素乙

Cell子刊发布首个植物转录因子文库

  近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。  该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究

PIL家族转录因子抑制植物分蘖机制获解析

近日,山东省农业科学院水稻研究所研究员谢先芝、中国农业科学院作物科学研究所研究员孙加强和孔秀英等合作,报道了PIL家族转录因子直接与SPLs互作,并在抑制小麦、水稻和拟南芥分蘖/分枝方面发挥重要作用。相关论文在线发表于《新植物学家》。株高、分蘖数、分蘖角等结构是小麦、水稻等作物株型的重要决定因素之一

Pol-II转录暂停因子NELF促进抗肿瘤免疫

多个转录因子在调控记忆T细胞分化中发挥重要作用,包括TCF1、FOXO1和MYB等。特别是,由TCF7基因编码的TCF1蛋白在T细胞发育、分化和耗竭(T cell exhaustion)时效应功能的保留中发挥着至关重要的作用。在免疫检查点阻断免疫疗法中,TCF1+ T细胞群的响应同样很关键。尽管目前

大鼠核转录因子(NFkB-)ELISA检测法

大鼠核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒 原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗大鼠 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗大鼠NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加

转化生长因子β信号通路与CoSMAD结合

磷酸化的RSMAD与coSMAD(如SMAD4)有很强的亲和力,并与coSMAD形成复合体。在这个反应中,RSMAD的磷酸基并没有作为coSMAD的停泊位点发挥作用,而是磷酸化打开了一段氨基酸,从而RSMAD和coSMAD能相互反应。

两项研究:肝病防护转录因子FOXO3

  来自堪萨斯大学的研究者在最新一期American Journal of Pathology杂志上分别发表了两项研究成果,表明转录因子FOXO3能够预防丙型肝炎和酒精引起的肝脏损伤。他们认为,对FOXO3通路的调整,能够为由HCV-酒精引起的肝脏损伤提供一种潜在的治疗方法。   最新一期的A

人核转录因子(NFkB-)ELISA试剂盒

人核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗人 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗人NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加入底物工

EMBO-Reports:果蝇揭示肠癌中关键性转录因子

  近日,西班牙研究人员弄清楚了一种称为Mirror的转录因子是如何调节果蝇肠道中肿瘤样生长的。相关研究结果发表在EMBO Reports杂志上。  每年在全球范围内,大肠癌导致超过五十万人死亡。该疾病起源于胃肠道的上皮细胞,主要是由于肠道细胞中的分子信号活动异常导致的。  研究人员已经能够利用果蝇

转录因子MEF2:认知功能的护身符?

  人类寿命的延长伴随着痴呆症发病率的上升,良好的认知功能可保障老年人群自身的生活自理能力,减轻社会医疗负担。我国老龄人口众多,始终对于长寿有着美好追求,比如人们到环境优美的巴马长寿乡旅居,以期望外部环境的优化实现长寿。但有时不得不承认,在长寿方面,自身遗传因素也是不容小觑。SCIENCE TRAN

人核转录因子elisa试剂盒使用说明

检测范围                                                     80 ng/L -2000 ng/L 使用目的本试剂盒用于测定人血清、血浆及相关液体样本中核转录因子(NF-kB )含量。实验原理本试剂盒应用双抗体夹心法测定标本中人核转录因子(NF-k

研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制

9月25日,中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队,在《自然》(Nature)上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra

科学家揭示水稻转录因子高产抗病调控机制

  近日,《科学》在线发表了四川农业大学陈学伟团队、中科院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队及美国加州大学戴维斯分校Pamela Ronald团队合作在水稻产量与抗病协同调控机制研究领域取得的最新进展,揭示了水稻理想株型建成的关键基因IPA1既能提高产量又能提高稻瘟病抗性的调控新机制。  高产抗病

研究揭示GRAS转录因子调控香蕉果实后熟机制

  在国家自然科学基金等项目资助下,广东省农业科学院果树研究所研究员易干军/毕方铖团队,成功揭示GRAS转录因子调控香蕉果实后熟机制。相关成果近日发表于《高级研究杂志》(Journal of Advanced Research)。MaEIL9-MaZIP5-MaSCL8分子模块调控香蕉后熟模式。研究

研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制

9月25日,中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队,在《自然》(Nature)上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra

胚胎干细胞转录因子NANOG的新发现

  在胚胎干细胞的自我更新中,转录因子Nanog 具有关键性的作用,这一因子也一直是近年来研究的热点。最近,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的科学家们发现,NANOG也调控成体生物分层上皮细胞的细胞分裂,分层上皮细胞是皮肤表皮的组成部分,或者覆盖在食管和阴道表面。相关研究结果发表在最近的《自然通讯

研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制

  纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体,在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达,从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中,一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思

小鼠核转录因子(NFkB-)ELISA试剂盒

小鼠核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒 原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗小鼠 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗小鼠NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加

关于基因转录的基本内容介绍

  基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板,按照碱基互补配对原则,在RNA聚合酶作用下合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。  如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时,基因不表达;而从靶基因上去除阻遏蛋白