NatureBiotechnology:可取代ChIPseq的新技术

生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分,从而实现特异性的功能。比如说,神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息,而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。 这样的基因表达受到转录因子的控制,但人们一直很难定位功能性转录因子在DNA上的结合位点。之前的全基因组分析让人感到更加困惑,似乎转录因子在DNA上到处结合,甚至结合在不开/关基因的地方。 日前,Stowers医学研究所的研究人员开发了一个能够在基因组中精确定位转录因子结合位点的新技术,该技术分辨率很高,大大优于之前的分析方法。这一成果发表在三月九日的Nature Biotechnology杂志上。 研究显示,功能性的转录因子结合位点存在清晰的印迹,也就是说转录因子结合在特定的序列上。而那些可疑的结合位点并没有特定的模式,非常散乱。 “我们鉴定了转录因子结合位点独有的序列模体(motif),还发现了其他与结合特异性有关的序......阅读全文

靶向转录因子,阻止肺纤维化

  迄今为止,肺纤维化的分子机理还未能得到很好阐明。  本月一篇名为“男子喝百草枯经抢救,依然在后悔中痛苦离世”的新闻将几乎无药可救的肺纤维化疾病再次拉入大众视线。  12月7日,马克斯普朗克心肺研究所(Max Planck Institute for Heart and Lung Research

依赖ρ因子的转录终止的功能介绍

依赖ρ因子的转录终止:在依赖ρ因子终止的转录中,产物RNA的3'-端会依照 DNA 模板,产生较丰富而且有规律的C碱基。ρ因子正是识别产物 RNA 上这些终止信号序列,并与之结合。结合 RNA后的ρ因子和 RNA pol都可发生构象变化,从而使RNA pol的移动停顿,ρ因子中的解旋酶活性使

分子遗传学词汇转录终止因子

中文名称:转录终止因子英文名称:transcription termination factor定  义:辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇转录延伸因子

中文名称:转录延伸因子英文名称:transcriptional elongation factor定  义:能够使基因转录不断进行的因子。如激活RNA聚合酶活性的蛋白质。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

分子遗传学词汇转录终止因子

中文名称:转录终止因子英文名称:transcription termination factor定  义:辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

转录因子的人工设计新方法

    人工设计转录因子来调控目标基因的表达已经不是梦想,基于锌指蛋白结构域的设计已经展开。锌指蛋白结构域能够结合于特定的三个碱基配对的DNA序列上。RNA干扰和反义核酸技术能够抑制基因的表达,而人工设计转录因子能够升高目标基因的表达,从而为疾病的新治疗方法开辟了新的思路。Nature Biotec

角朊细胞的其他转录因子介绍

  K17基因的上游启动子中有γ干扰素激活的STAT因子的结合位点,被称为γ干扰素活化序列(GAS),在皮肤发生迟发型接触性过敏时,STAT-91可转位至角朊细胞核内与启动子中的GAS元件结合而激活K17的表达[8]。兔K3基因的5’上游序列中则有NFκB的结合位点(5’GGGCTTTCC-3’),

关于转录因子的基本信息介绍

  真核生物转录起始过程十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡB,

分子遗传学词汇通用转录因子

中文名称:通用转录因子 外文名称:general transcription factors, GTFs定义:通用转录因子(general transcription factors, GTFs)  。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子  。

北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组,在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展,该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计

抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验

            实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。 实验材料 N-表达质粒 E.coi

抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验

实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料 N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒 储存液缓冲液仪器、耗材 蛋白胨培养基蛋白胨平板N-表达质粒组合文库培养板实验步骤 ―、材料与设备1. 通过比较 β-半乳糖苷酶表达

抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验

一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒储

核心结合因子的结构和作用

核心结合因子(cbf)是一种与许多增强子和启动子的核心元素结合的异二聚体转录因子。该基因编码的蛋白质代表CBF的α亚单位,被认为与正常造血的发育有关。涉及这一基因的染色体易位有很好的文献记载,并与几种类型的白血病有关。三种编码不同亚型的转录变体已经被发现。

基因表达的转录机制介绍

  转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的

关于基因转录的基本介绍

  基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板,按照碱基互补配对原则,在RNA聚合酶作用下合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。  如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时,基因不表达;而从靶基因上去除阻遏蛋白

关于基因转录的过程介绍

  (1)基因转录— 转录的启动  DNA上存在着转录的起始信号,它是特殊的核苷酸序列,称为启动子。  转录是由RNA聚合酶全酶结合于启动子而被启动的。  其机理是:s因子能识别启动子,并识别有义链,它与核心酶结合,引导核心酶定位到启动子部位。  (2)基因转录— 转录的起始  当聚合酶结合到启动子

信使RNA的启动子和转录因子

  一定义:酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录,弱启动子10分钟一次。  二原核生物:大肠杆菌在起点上游约-10碱基对处有保守序列TATAAT,称为pribnow box,有助于局部解链。在其上游还有TTGACA,称为-35序列,提供RNA聚合酶识别的信号。  三真核

Nature:T细胞功能调控的关键转录因子

  T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。  来自清华大学医学院,陆军军医大学全军临床病理学研究所的研究人员发表了题为“

转录因子和调节蛋白是包含关系吗

调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。

Nature:缺失重要转录因子让血管“疯长”

  血管在动物整个生命过程中都扮演着重要角色。血管生长决定着器官是否能够在胚胎发育阶段及时得到营养供应,到了成年阶段,新血管的发育在血管修复和再生过程中发挥重要作用,血管生长过程的紊乱是癌症,糖尿病以及眼部疾病发展的重要因素。  最近来自德国的科学家发现血管内皮细胞的生长能够通过代谢机制进行调控,这

人工转录因子的部件——人类锌指结构1

Human zinc fingers as building blocks in the construction of artificial transcription factorsKwang-Hee Bae1, 4, Young Do Kwon1, 2, 4, Hyun-Chul Shin1,

分子遗传学词汇转录起始因子

中文名称:转录起始因子英文名称:transcription initiation factor定  义:参与转录起始作用的因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Sox2:从转录因子到免疫卫士

  近日著名的免疫学杂志《自然免疫》发表了中科院生物物理所关于转录因子Sox2在固有免疫中的重要作用:Sox2在中性粒细胞中能够充当胞内DNA传感器的作用,当Sox2结合了细菌DNA后,Sox2会通过激酶TAK1和转接蛋白TAB2介导下游信号通路,开始转录翻译一系列的促炎因子。  检测到细胞中的外源

亮氨酸拉链的转录因子的介绍

  酵母转录因子GCN4是通过亮氨酸拉链(bZIP)结构结合DNA的蛋白质之一,当GCN4二聚体与DNA结合时,亮氨酸拉链区的2个单体结合为平行的卷曲螺旋结构,而其基区由无规线团结构变为α螺旋.为探讨亮氨酸拉链蛋白与DNA的结合机理,设计了含有GCN4亮氨酸拉链蛋白基区结合DNA的必需氨基酸的折叠片

能控制转录终止的蛋白质ρ因子

能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强 

人工转录因子的部件——人类锌指结构2

Table 2: Binding sites and identity of ZFPs used in VEGF activationWe then generated artificial transcription factors by fusing the three-finger domai

食欲刺激因子——酰基辅酶A结合蛋白(ACBP)

  近期研究发现,饥饿处理会使小鼠细胞释放被称为“酰基辅酶A结合蛋白”或“安定结合抑制因子”(ACBP / DBI)的一种细胞自噬依赖性释放的蛋白质,进而导致血浆中ACBP的浓度升高。  额外的ACBP产生是促进食欲及机体肥胖的一种诱因;中和该蛋白,小鼠就会表现出厌食反应,表明ACBP是食欲和脂代谢

Cell:揭秘转录因子如何相互作用制造心脏

  刊登于Cell杂志上的一项研究报告中,来自格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)的科学家们近日通过研究发现三种转录因子可以彼此相互作用,并且同基因组相互作用从而影响胚胎心脏的形成,如果没有这些蛋白质(转录因子)的相互作用就会引发新生儿出现严重的先天性心脏缺损;通过理解心脏发育