生物物理所专家第九届全球蛋白质结构预测比赛中获佳绩
12月8日，2010年第九届全球蛋白结构预测比赛结果揭晓，中国科学院生物物理研究所蒋太交研究组发展的Jiang_Assembly蛋白质结构预测服务器进入了前二十名。这标志着我国在蛋白质三维结构预测领域中进入了世界上游水平。 众所周知，蛋白质三维结构预测是计算生物学领域中最具挑战性的一个研究方向，迄今为止还有很多问题悬而未决。为了客观和有效地评估蛋白质结构预测技术发展水平，1994年，美国科学家约翰·莫尔特（John Moult）倡议在全球范围内进行蛋白结构预测比赛（CASP，Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction）。CASP比赛每两年举行一次，已成为计算生物学领域中最权威和最富盛名的比赛，每次比赛都吸引了许多来自生物物理学、计算机科学、高能物理学、计算化学和计算数学等不同领域的专家参加。 第九......阅读全文
中国科大等首次揭示ATM激酶精细三维结构
中国科学技术大学蔡刚课题组与南京农业大学王伟武课题组、中国科大刘海燕课题组合作，首次揭示了毛细血管扩张共济失调症突变蛋白——ATM激酶的精细三维结构，为理解ATM激酶活性严谨调控的分子机制以及研发新型肿瘤放疗的增敏剂提供了重要线索，该研究成果发表于5月27日的《自然·通讯》上。论文第一作者为蔡刚
Nature：史上最详细转录因子TFIID三维结构出炉
你的DNA不只是控制你眼睛的颜色和你是否卷舌。你的基因含有制造你身体所有蛋白的指令，而这些指令是你的细胞让你存活所持续需要的。但是在此之前，基因表达在分子水平上如何运行的一些关键细节一直有点神秘。 在一项新的研究中，来自美国加州大学伯克利分校、劳伦斯伯克利国家实验室和西班牙国家研究委员会（CS
中国科学家首次揭示病毒内部三维结构
9月18日，国际顶级学术期刊《Science》杂志发表了一篇题为“冷冻电镜揭示双链RNA病毒内部聚合酶和病毒基因组的非线轴结构”的论文。论文中，两位中国科学家首次将病毒的观察视角从“衣壳”深入到内部，改变了过去认为该类型病毒的内部基因组应呈线轴状排列的主流观点，亦用一种全新方法，开启帮助人类认知
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称，英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构，显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉，但事实上，染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
《自然》：科学家破解整合酶的三维结构
英国和美国研究人员在1月31日的《自然》杂志上报告说，他们合作进行的一项最新研究模拟出整合酶的三维结构。整合酶在包括艾滋病病毒等逆转录酶病毒中可以找到，并且充当了艾滋病病毒在人体内复制时的“帮凶”。这项重大突破有助于科学家解决困扰了艾滋病研究领域长达20年的一个难题，从而找到更好的治疗艾滋病的方
Nature：首次！叶绿素合成关键酶三维结构被解析
10月23日，《自然》（Nature）在线发表叶绿素生物合成关键酶三维结构解析论文，该成果由中国农业科学院生物技术研究所微生物功能基因组创新团队联合国内外相关单位共同完成。该研究首次解析了叶绿素生物合成关键酶——光依赖型原叶绿素酸酯氧化还原酶（LPOR）的三维晶体结构，揭开了光合作用终极能量来源
美院士首次揭示DNA超螺旋的三维结构
最近，美国贝勒医学院的研究人员，使用一种多学科的方法，以前所未有的细节，揭示了超螺旋DNA的三维结构影像图，从而发现它的形状比著名的双螺旋更加动态。相关研究结果发表在最近的《Nature Communications》。 分子病毒学和微生物学系的Lynn Zechiedrich教授和美国科学院
Nature：鉴定出核孔复合物的三维结构
核孔复合物（Nuclear Pore Complex, NPC）是细胞中最大的通道，跨越核膜的双层膜。这个非凡的通道为细胞核和细胞质之间来回运输大分子提供通道。迄今为止，由于它的大尺寸和动态性，从结构和功能上全面理解它一直受到阻碍。 在一项新的研究中，美国研究人员首次获得酵母NPC的近乎完整的三维结
PNAS：单分子成像：结构生物学的未来
结构到功能的研究对生物学领域有着重要的意义。自从解析出DNA的三维结构后，结构生物学帮助科学家们解析出了更多的生物大分子的结构，解决了很多生物学的根基上的问题。然而，结构生物学的发展受到了技术层面上的重大瓶颈。新技术的出现，将对结构生物学的发展带了跨越式的进展。 传统的结构解析方法是X光衍射和
清华大学成立结构生物学中心
4月16日，清华大学结构生物学中心正式成立。结构生物学是现代生命科学研究的重要主流前沿方向，对于解决一系列生命领域重大基础科学问题，帮助人类更好地理解生命现象本质，指导新药研究与开发具有重要意义。 中科院院士、清华大学校长顾秉林在仪式上表示，结构生物学中心的成立，将有利于改变目前清华
理化所pH响应型可设计蛋白质基三维微结构研究取得进展
微纳尺度的可控刺激响应生物基材料微结构对生物医药领域具有重要意义。含有不同BSA浓度的微尺度罗马浮雕（标尺：20μm） 尤其是具有精确定义的几何形貌和可重复性好的智能响应型微尺度结构与器件一直是研究热点。双光子聚合微纳加工作为一门新兴的微纳加工技术，为高精细三维微尺度结构的制备提供了有力工具，
我国科学家在人源蛋白质三维结构研究中获得新突破
(A) 人源LanCL1三维结构的主链飘带示意图. 外围螺旋和内层螺旋分别显示红色和黄色. (B) 人源LanCL1的表面电势图. 球棍模型表示结合的谷胱甘肽. (C) 显示经过空pBI/eGFP vector或LanCL1野生型或各种突变体转染的PC12细胞用50 ng/
饶子和、杨海涛团队成功解析新冠病毒主蛋白酶三维结构
由上海科技大学饶子和/杨海涛团队与合作者组成的“抗新冠病毒攻关联盟”，率先在国际上成功解析新型冠状病毒关键药物靶点——主蛋白酶（Mpro）的高分辨率三维空间结构，并综合利用3种不同的药物发现策略，找到针对新冠病毒的潜在药物。 北京时间4月9日下午5点，经《自然》杂志邀请投稿，上述团队在该期刊上
蛋白质的二级结构与超二级结构结构的组装块
一、蛋白质的二级结构 蛋白质在细胞中必须通过详细的三维结构识别成千上万种的不同分子，这就需要蛋白质分子具有结构多样性。蛋白质结构研究得出的第一个重要的基本规律是水溶性球状蛋白质分子折叠的重要驱动力，它是将疏水侧链置于分子内部，产生一个"疏水内核"和一个亲水表面。为了把侧链放到分子内部去，相应的高度
蛋白质的一级结构及空间结构主要取决于结构基
一、氨基酸是构成蛋白质的基本化学成分 有20种由遗传密码所决定的标准氨基酸，根据侧链的化学性质，可分为疏水氨基酸〔Ala（A），Val（V），Le u（），lie（互），Phe（F），Pro（P）和Met（M）」、带电氨基酸［Asp（D），Gin（E），Lys（K）和Arg（R）］、极性氨基酸［
美科学家绘制出一种“长寿蛋白质”的三维结构图
美国耶鲁大学的科学家最近宣布，他们绘制出了与一种长寿和抗衰老有关的蛋白质的三维结构图，将有助于开发治疗糖尿病、癌症等疾病的新方法。 这种蛋白质名叫β-Klotho，是Klotho蛋白质家族的一员。后者得名于古希腊神话中纺出生命之线的命运女神，此前研究发现缺少这类蛋白质会导致早衰，给实验动物
澳研究确定一个抗癌“刹车”分子三维结构
澳大利亚研究人员近日宣布，他们确认了免疫系统中一个抗癌“刹车”分子CD96的三维结构。这将有利于研发癌症免疫疗法相关的靶向药物，更好地控制肿瘤扩散。 主持这项研究的澳大利亚莫纳什大学生物化学与分子生物学研究员理查德·贝里介绍，人体免疫系统“刹车”的作用是防止免疫系统攻击健康组织。很多肿瘤就利用
中美研究人员开发出三维纳米“剪纸”结构
新华社华盛顿７月７日中国和美国研究人员从中国传统艺术“拉花剪纸”中得到灵感，制备出形貌特异的三维纳米结构，有望在生物分子识别和光通信等领域获得应用。 发表在最新一期美国《科学进展》杂志上的研究显示，研究人员采用高剂量“聚焦离子束”作为“剪裁”手段，使厚度只有几十纳米的金膜从二维平面弯折成复
学者发布RNA三维结构预测评估研究成果
近日，广州医科大学-中国科学院广州生物医药与健康研究院联合生命科学学院特聘教授、广州实验室研究员苗智超团队与合作者，对来自全球18个团队的预测进行了大规模评估，涉及23个RNA结构，包括RNA元件、适配体、病毒元件、核酶和核开关等多种类型RNA结构。相关研究发表于《自然-方法》（Nature Met
南海珊瑚岛礁三维地质结构研究获重要进展
近日，中国科学院南海海洋研究所边缘海与大洋地质重点实验室研究员夏少红团队以突破珊瑚岛礁本体浅表三维精细成像为目标，利用海洋环境噪声透视珊瑚岛礁三维地质结构取得重要进展。相关研究近日发表于《工程学》（Engineering）。 珊瑚岛礁作为海洋中宝贵的国土资源，不仅是海洋资源开发和海洋权益保护的
《自然》：研究揭示端粒酶关键部位三维结构
美国科学家近日利用X射线结晶学方法，揭示了控制细胞衰老定时机制的端粒酶(Telomerase)的关键部位。这一成果有望为绝大部分的人类癌症提供安全的治疗手段。相关论文8月31日在线发表于《自然》(Nature)杂志上。 端粒酶维持着端粒的长度，它在胚胎干细胞中高度表达，使得胚胎干细胞不断进行分
我国科学家解析乙肝表面抗原三维结构
·这一研究不仅解决了结构生物学和病毒学领域的长期谜题，还为疫苗的优化、中和性抗体构效关系的理解提供了重要依据，特别是有望加速直接靶向病毒表面蛋白和囊膜组装的小分子药物以及引导表面蛋白降解的PROTAC（蛋白降解靶向嵌合体）的研发。乙型肝炎病毒（Hepatitis B Virus，HBV）感染是全球严
冷冻电镜三维重构解析揭示丝状病毒IKe结构
清华大学医学院向烨研究组与以色列特拉维夫大学Amir Goldbourt组合作于2019年2月28日在《美国科学院院报》（Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America， PNAS）杂
我国冷冻电镜再发Nature－三维结构解析免疫机制
10月2日，《自然》杂志在线发表了我国科学家的一项关于免疫系统如何发挥作用的重要成果。通过海量的实验与计算，来自中国科学院物理所、中国医学科学院等单位的研究人员，成功解析与原核短Ago系统相关的高分辨率三维蛋白结构，同时彻底弄清楚了原核短Ago系统在病毒入侵前后所发生的结构变化。原核短Ago中辅酶I
Cell：基因组三维结构存在细胞异质性
美国国家癌症研究所、哈佛大学、马萨诸塞大学和麻省理工学院联合开展的一项研究发现，不同细胞和不同等位基因之间的基因组组织结构存在很大差异。这项研究成果于本周发表在《Cell》杂志上。 研究人员利用高通量的染色质构象捕获（Hi-C）和高通量的荧光原位杂交（hiFISH）光学图谱绘制来分析人包皮成纤
中美研究人员开发出三维纳米“剪纸”结构
中国和美国研究人员从中国传统艺术“拉花剪纸”中得到灵感，制备出形貌特异的三维纳米结构，有望在生物分子识别和光通信等领域获得应用。 发表在最新一期美国《科学进展》杂志上的研究显示，研究人员采用高剂量“聚焦离子束”作为“剪裁”手段，使厚度只有几十纳米的金膜从二维平面弯折成复杂的三维立体结构，加工出
利用多视角观测揭示日珥气泡的三维磁场结构
暗条/日珥是悬浮于太阳高温稀薄大气中冷而密的等离子体云。当其位于日面上时，在Hα波段上表现为暗的吸收结构，被称为“暗条”（Filament）；而当其位于日面边缘时，则表现为亮的发射结构，被称作“日珥”（Prominence）。最近的日面边缘观测发现，在明亮日珥的下部常出现一些半圆形的空缺区域，并
著名结构生物学家发表HIV疫苗重要成果
从蜘蛛侠Peter Parker的致命蜘蛛咬伤，到Arthur国王在他统治时期开始时拔出石头中的宝剑，人人都想知道一个英雄的故事来源。 在这则新闻中，我们的英雄是来自我们身体免疫系统的强有力的抗体，结合并中和艾滋病病毒――这个故事可以带来一种疫苗对抗艾滋病。延伸阅读：PNAS：一些HIV疫苗为
著名结构生物学家发表HIV疫苗重要成果
从蜘蛛侠Peter Parker的致命蜘蛛咬伤，到Arthur国王在他统治时期开始时拔出石头中的宝剑，人人都想知道一个英雄的故事来源。 在这则新闻中，我们的英雄是来自我们身体免疫系统的强有力的抗体，结合并中和艾滋病病毒——这个故事可以带来一种疫苗对抗艾滋病。 在一项新的研究中，由美国斯克里普
可爱龙教授Cell评述重要结构生物学进展
在所有的非编码RNA中, piRNA 数量最多, 主要存在于生殖系统，这种RNA在动物生殖组织中可以引导PIWI蛋白质沉默有害的转座子。其关键作用复合物：piRNA诱导沉默复合体piRISC的生物合成涉及多个步骤，至今科学家尚未清楚了解这个步骤的分子机制。 近期一组研究人员报道了PIWI-cl