北京大学Nature子刊开发甲基化分析新技术
来自北京大学的研究人员称他们开发出了一种单细胞简化代表性重亚硫酸盐测序(single-cell reduced-representation bisulfite sequencing,scRRBS),并利用它绘制哺乳动物细胞的DNA甲基化组景观图。这一重要的成果发布在4月2日的《Nature Protocols》杂志上。 北京大学生命科学学院的汤富酬(Fuchou Tang)研究员和文路(Lu Wen)助理研究员是这篇文章的共同通讯作者。 DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷 酸5’-端的胞嘧啶(C)转变为5’-甲基胞嘧啶(5mC),其参与调控了基因表达。在哺乳动物体内,DNA甲基化在分化细胞中相对稳定;相比之下,在早 期胚胎发育和原始生殖细胞发育过程中会发生基因组范围的去甲基化和DNA甲基化谱式的再建立(remethyl......阅读全文
中国科学家首次发现线虫基因组存在DNA甲基化现象
中国科学家最新研究成果首次证实在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶并证实了DNA甲基化的存在,改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。同时也使以DNA甲基化序列做靶标进行抗寄生虫药物研发成为可能,为抗旋毛形线虫病的药物开发提供了全新思路。 吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院合作完成的
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
研究发现TNFα会刺激炎症基因响应,诱发DNA主动去甲基化
近期,中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室研究员朱冰课题组在eLife上,在线发表题为Sustained TNF-α stimulation leads to transcriptional memory that greatly enhances signal sensitivit
基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒使用说明
基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒产品说明书(中文版) 主要用途 基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒是一种旨在通过设计符合胞嘧啶转化的特殊引物,对转化基因组的CpG岛区域进行PCR扩增,探测基因甲基化信息的权威而经典的技术方法。该技术经过精心研制、成功实验证明的。可以
基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒使用说明
主要用途基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒是一种旨在通过设计符合胞嘧啶转化的特殊引物,对转化基因组的CpG岛区域进行PCR扩增,探测基因甲基化信息的权威而经典的技术方法。该技术经过精心研制、成功实验证明的。可以被用于父母印记、X染色体研究、肿瘤抑制基因等表观遗传学研究。产品即到即用,性能稳定
一例基因异常甲基化早期预测口腔白斑患者癌变病例分析
患者,女,61岁,2011年10月26日因发现口腔白斑1周来我科就诊。检查:15到17,27腭侧牙龈分别可见大小1.5 cm×2 cm、1 cm×1.5 cm的灰白色斑块,表面略粗糙、微突出于黏膜表面、质韧、边界不规则、界清、无触痛;14到26腭侧龈缘可见条带状的浅白色斑块,部分连接成片、界
DNA甲基化反应的作用机制
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因子(
概述DNA甲基化的机制
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因
DNA甲基化反应的作用机制描述
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因子(
DNA甲基化的过程介绍
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因子(
华东师大翁杰敏JBC发表新成果
四月二十一日,来自华东师范大学、中山大学癌症研究中心和芝加哥大学的研究人员,在国际学术期刊《Journal of Biological Chemistry》在线发表题为“Non-germline Restoration of Genomic Imprinting for a Small Subs
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初,Watson和Crick建立了DNA分子结构模型,极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生,如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
单细胞测序新技术:同时分析单个细胞的转录组和甲基...
单细胞测序新技术:同时分析单个细胞的转录组和甲基化组 单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而,由于细胞之间存在较大的差异,又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组,在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。 近日,加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授
上海生化细胞所发现受精卵DNA去甲基化重要机制
近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要机制
近日,中科院上海生科院生化与细胞所一项最新研究发现,小鼠早期胚胎中母源和父源基因组在单细胞的受精卵阶段,均会发生大规模的DNA主动和被动去甲基化,DNA双加氧酶Tet3介导了主动去甲基化的发生,而糖苷酶TDG并不参与该过程。相关研究成果在线发表于学术期刊《细胞—干细胞》。 该研究由中科院上海生
关于地西他宾的不良反应和用途介绍
1、不良反应 (1)中性白细胞减少(症)、血小板减少(症)、贫血、呕吐、疲劳、发热、咳嗽、恶心、便秘、腹泻、高血糖、热性的中性白细胞减少(症)。 (2)大剂量可引起神经毒性,表现为嗜睡、失语、偏瘫等,但停药后可恢复正常。 2、用途 是一种表观遗传修饰物,可抑制DNA转甲基酶活性,导致在D
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。 CpG岛的异常甲基化是导致基
一文了解甲基化研究领域新进展!
本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展,分享给大家!图片来源:Vossman/ Wikipedia 【1】Nature:母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生 doi:10.1038/s41586-019-1536-1 发育通常被认为是在
LightCycler应用:甲基化分析
主要应用:应用实时荧光PCR技术进行快速准确的DNA甲基化分析DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容之一,它可以在转录水平抑制基因的表达。具体的过程是在胞嘧啶-鸟嘧啶(CpG二核苷酸)的5位碳原子上添加了一个额外的甲基团,形成5-甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度较高的区域在人体基因组中呈非随机分布于,
哺乳类动物的DNA甲基化特点
哺乳类动物一生中DNA甲基化水平有着显著变化:在受精卵最初几次卵裂中,去甲基化酶清除DNA分子上几乎所有从亲代遗传下来的甲基化标记;在胚胎植入子宫时,一种新的甲基化遍布整个基因组,构建性甲基化酶使DNA重新建立一个新的甲基化模式,一旦细胞内新的甲基化模式建成,将通过维持甲基化酶以“甲基化维持”的形式
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
顶级科学家张毅Cell子刊表观遗传学新文章
几年前,汤姆森科技信息集团旗下《科学观察》(Science Watch)评出了的高影响力论文数量最多的研究人员。原北卡罗莱纳大学医学院生物化学与生物物理学系教授、霍华德•休斯医学研究院(HHMI)研究员张毅(现就职于哈佛医学院)成为分子生物学和遗传学领域高影响力论文的数量最多的前十位顶级科学家之
Nature:北大绘就首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
近日,北京大学交叉研究取得重要研究成果:绘就出世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。此项研究工作为人们提供了一个全面的人类早期胚胎DNA甲基化调控网络的研究框架,对于人类认识自身早期胚胎发育过程中表观遗传调控机制、辅助生殖技术的安全性评估与改善,以及临床上疑难病例的诊治均具有非常重要的意义
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
杰青朱冰团队发现CSE1L的表达影响DNA甲基化基因沉默机制
2018年4月10日《PNAS》杂志在线发表了朱冰课题组的研究论文“Roles of the CSE1L-mediated nuclear import pathway in epigenetic silencing”。该研究发现CSE1L作为细胞中经典入核转运途径中的重要蛋白,是维持部分甲基化
哪些抑制剂可以有效作用于DNA甲基化过程
一、 什么是DNA甲基化 在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,这常见于基因的5'-CG-3'序列。大多数脊椎动物基因组DNA都有少量的甲基化胞嘧啶,主要集中在基因5'端的非编码区,并成簇存在。甲基化位点可随DNA的复制而
哪些抑制剂可以有效作用于DNA甲基化过程
一、 什么是DNA甲基化 在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基,形成5-甲基胞嘧啶,这常见于基因的5'-CG-3'序列。大多数脊椎动物基因组DNA都有少量的甲基化胞嘧啶,主要集中在基因5'端的非编码区,并成簇存在。甲基化位点可随DNA的复制而
关于甲基化的功能介绍
甲基化是蛋白质和核酸的一种重要的修饰,调节基因的表达和关闭,与癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容之一。 最常见的甲基化修饰有DNA甲基化和组蛋白甲基化。 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA