最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近,英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员,开发并使用了一种新的技术,将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图,需要完成才能看到整幅图片,研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来,并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确定人类基因组中启动子和增强子之间的相互作用,这种能力就有很大潜力让我们了解疾病的遗传基础。 一个胚胎的发育以及体内不同细胞类型的建立,都依赖于一系列的基因组调控元件,在不同地点和不同时间安排基因的正确表达。为了对“在健康和疾病状况下基因如何被调控”有一个完整的了解,就必须对“有助于基因控制的调控因子”有一份全面的目录表。 Babraham研究所的研究人员完善了现有的一项技术,来研究小鼠基因组中一百万个调控元件,并将其与基因启动子联系起来,以理解基因是如何被打开和关闭的。同时,这项技术也被用来研究人类的血细胞类型。如果基因组被认为是......阅读全文
基因外启动子的定义
中文名称基因外启动子英文名称extragenic promoter定 义位于基因转录区以外的启动子。许多小RNA基因、H1 RNA基因和U6 RNA基因等具有基因外启动子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子的特性和功能介绍
启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录。启动子的特性最初是通过能增加或降低基因转录速率
双向启动子的基本特征
双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。
启动子的的概念和特性
启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录。启动子的特性最初是通过能增加或降低基因转录速率
关于强启动子的基本介绍
强启动子(strong promoter),指对RNA聚合酶有很高亲和力的启动子,它能指导合成大量的mRNA。 [1] 是对转录酶有较高的亲和力,可高效启动转录的启动子。主要有lacP(来源于大肠杆菌的乳糖操纵子,有乳糖存在可激活 [2] )、trpP(来自于大肠杆菌的色氨酸操纵子 [2] )
分子遗传学词汇启动子
中文名称:启动子外文名称:Promoter定义:启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,这些DNA序列可以被转录
启动子元件的基本特征
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子的基本结构及功能
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物,故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明,对许多启动子来说
启动子捕获的概念和方法
中文名称启动子捕获英文名称promoter trapping定 义用于确定基因组DNA启动子区域的一项技术。用做检测的载体含有报道基因可作表达的标记,但缺乏启动子,将拟检测的DNA序列克隆入这种载体的适当位置,导入细胞或个体,从报道基因表达的程度可分析出启动子的存在与否及其强弱。应用学科生物化学与
关于启动子的名词解释
启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。 起始时间和表达的程度。启动子(Promoters)就像“开关”,决定基因的活动。既然基因是成序列的核苷酸(nucleotides),那么启动子也应由DNA组成。启动子本身
核心启动子元件的基本定义
中文名称核心启动子元件英文名称core promoter element定 义真核生物基因启动子中介导基因转录起始的最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列,大小约为40个核苷酸。含有TATA框,起始子(Inr),TFⅡB识别元件(
基因内启动子的基本定义
中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定 义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
启动子和转录因子在动植物细胞中有不同的共演化模式
近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈洛南团队与西北工业大学教授王文团队等在Zoological Research上在线发表题为Coevolutionary insights between promoters and transcription factors in the plan
关于染色质免疫共沉淀的技术结合介绍
1、CHIP-seq ChIP-Seq的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等相
肖锐教授揭示RNA结合蛋白与转录因子具有广泛的关联作用
越来越多的证据表明,转录控制和染色质活性在很大程度上涉及调节类的RNA,这可能会产生特定的RNA结合蛋白(RBPs)。尽管多个RBP与转录控制有关,但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色质。 2019年6月27日,加州大学圣地亚哥分校付向东及武汉大学医学研究院肖锐共同通讯在Cell 在线发表题
流感病毒调控干扰素机制研究获新进展
9月7日,《公共科学图书馆—病原体》(PLoS Pathogens)杂志在线发表了暨南大学教授吴建国团队的最新研究成果。他们研究揭示了甲型流感病毒(IAV)感染、通过宿主鞘氨醇激酶SPHK2调控Ⅰ型干扰素合成进而影响病毒复制的新机制。 在流感爆发季节,流感病毒,因其高致病性、高致死率,给全
启动子和转录因子在动植物细胞中有不同的共演化模式
近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈洛南团队与西北工业大学教授王文团队等在Zoological Research上在线发表题为Coevolutionary insights between promoters and transcription factors in the plan
“看”得更清!RNA结构解析新技术孕育新发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516890.shtm“结构决定功能”是物质科学界的基本共识。目前,非编码RNA的结构解析难题是开展其调控功能和作用机制研究的一大瓶颈。与编码蛋白质的信使RNA(mRNA)不同,非编码RNA往往需要先形成二
定义癌症突变:破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中,DNA紧密地包裹在蛋白质周围,并以一种复杂的3D结构包装,我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤,而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组:展开呈现给细胞基因表达机器,然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中,一些区域被称为“拓扑关联域(TADs)
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增
翻滚启动子的功能和应用特点
中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定 义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表
分子遗传学词汇翻滚启动子
中文名称:翻滚启动子英文名称:flip-flop promoter定 义:可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基
基因外启动子的基本定义
中文名称基因外启动子英文名称extragenic promoter定 义位于基因转录区以外的启动子。许多小RNA基因、H1 RNA基因和U6 RNA基因等具有基因外启动子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
分子遗传学词汇启动子清除
中文名称:启动子清除定义:聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
分子遗传学词汇核心启动子
中文名称:核心启动子定义:指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区。(Hogness区)
分子遗传学词汇强启动子
中文名称:强启动子定义:强启动子(strong promoter),指对RNA聚合酶有很高亲和力的启动子,它能指导合成大量的mRNA。 学 科:生物
分子遗传学词汇启动子解脱
中文名称:启动子解脱英文名称:promoter escape定 义:发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与
启动子克隆方法研究进展(1)
随着基因工程的发展,常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大,是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法,对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。 迄今为止,国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道,国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、
启动子克隆方法研究进展(4)
1.6 TAlL-PCR 很早就有用随机引物的PCR,但由于无法有效地控制由随机引物引发的非特异产物的产生,所以一直未能广泛应用。近年来由IJiu等设计的TAIL-PCR(Termal Asymmetric Interlaced PCR)又叫热不对称交错PCR,则解决了这个问题,后来有研究表明,经
启动子克隆方法研究进展(5)
2 讨论 以上介绍的几种方法基本代表了现有的启动子克隆方法,它们分别具有不同的特点和适用范围。 利用启动子探针载体筛选启动子时,不需要知道具体的基因序列,避免了引物设计,并能获得大量的启动子片段;其缺点是需要构建1个穿梭质粒,建库、转化、筛选,工作量大,费时费力,而且克隆、亚克隆的过程繁琐。因此