北京大学Nature子刊解析表观遗传修饰

来自北京大学的研究人员报道称,他们采用化学下拉(pulldown)方法揭示出了哺乳动物转录组的动态假尿嘧啶化 (pseudouridylation)。这一重要的研究成果发布在6月15日的《自然化学生物学》(Nature Chemical Biology)杂志上。 领导这一研究的是北京大学生命科学学院伊成器(Chengqi Yi)研究员,其主要研究领域是通过化学生物学、结构生物学、高通量测序等手段,对核酸修饰的生物功能及其生理调控机制进行研究。 与表观遗传功能相关的一些核酸化学修饰,提供了基因组序列之外的一些关键基因调控信息。除了已确定在DNA中发挥重要作用的5-甲基胞嘧啶(5mC)以外,近年来还鉴别出了包含5-羟甲基胞嘧啶(5hmc)、5 -甲酰基胞嘧啶(5fC)及5 -羧基胞嘧啶(5caC)的更为复杂和动态的DNA表观遗传调控网络。最近一些研究人员还证实了RNA也存在6-甲基腺嘌呤(6-methyladenosine)......阅读全文

假尿嘧啶核苷的生物化学性质

一种尿嘧啶核苷的天然结构类似物,核糖不是与尿嘧啶N1相连,而是与嘧啶环的C5连接。是存在于tRNA中的稀有核苷酸。

假尿嘧啶核苷的生物化学性质

一种尿嘧啶核苷的天然结构类似物,核糖不是与尿嘧啶N1相连,而是与嘧啶环的C5连接。是存在于tRNA中的稀有核苷酸。

细胞化学词汇氟尿嘧啶

中文名:氟尿嘧啶中文别名: 2,4-二羟基-5-氟嘧啶英文名称: 5-FluorouracilCAS号: 51-21-8分子式: C4H3FN2O2分子量: 130.08MDL号: MFCD00006018Beilstein号: 127172EINECS号: 200-085-6熔点:282-286℃

细胞化学词汇无嘧啶核酸

中文名称:无嘧啶核酸英文名称:apyrimidinic acid定  义:没有或脱去嘧啶碱基的核酸(DNA和RNA)分子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

假尿嘧啶核苷生物化学性质和用途

生物化学性质:一种尿嘧啶核苷的天然结构类似物,核糖不是与尿嘧啶N1相连,而是与嘧啶环的C5连接。是存在于tRNA中的稀有核苷酸。用途:检测其含量可诊断胃癌,肿瘤等恶疾。生化研究。制药。

细胞化学词汇胸腺嘧啶核糖核苷

中文名称:胸腺嘧啶核糖核苷英文名称:thymine ribnucleoside定  义:由胸腺嘧啶的N-1与D-核糖的C-1通过β糖苷键连成的化合物,其磷酸酯是胸苷酸。在转移核糖核酸中发现。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇无嘧啶位点

中文名称:无嘧啶位点英文名称:apyrimidinic site定  义:核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

氟尿嘧啶的计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:2氢键受体数量:3可旋转化学键数量:0互变异构体数量:9拓扑分子极性表面积:58.2重原子数量:9表面电荷:0复杂度:199同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:0不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0共价

研究实现木质素基嘧啶衍生物的定向制备

近日,中科院大连化学物理研究所张涛院士、研究员李昌志等人发展了一种无过渡金属催化解聚酚型β-O-4木质素模型化合物定向制备嘧啶衍生物的新策略,为木质素高值化转化制备含氮杂环医药中间体开辟了新路径。相关研究成果发表于《自然-通讯》。 通过氮原子参与解聚木质素来获得高附加值含氮芳香化学品,是木

2氨基嘧啶甲腈衍生物——第1.5亿个化学物质

  据美国化学与工程新闻(C&EN)报道5月8日,美国化学文摘社(CAS)注册了第1.5亿个独特的化学物质——2-氨基嘧啶甲腈衍生物。  CAS表示,这样的里程碑很重要,这不仅是一个数字,它对研究方向具有重要意义。全球化学研究的高速发展,CAS用了约40年时间,在2005年注册了2500万个物质。在

细胞化学词汇无嘌呤嘧啶位点

所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。AP位点所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位

细胞化学词汇5甲基胞嘧啶

中文名:5-甲基胞嘧啶叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在120kb到217kb之间,相当于噬菌体基因组的大小,例如,T4噬菌体的基因组约165kb。一个叶绿体中通常有一个到几十个叶绿体基因组。叶绿体DNA不含5—甲基胞嘧啶,这是鉴定叶绿体DNA及其纯度的特定指标。5-甲基胞嘧啶的脱

细胞化学词汇假尿嘧啶核苷

中文名称:假尿嘧啶核苷英文名称:PseudouricdineIUPAC命名:5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione分 子 式:C9H12N2O6分 子 量:244.20

细胞化学词汇二氢尿嘧啶

中文名称:二氢尿嘧啶英文名称:dihydrouracil;D定  义:学名:2,4-二羟基-5,6-二氢嘧啶。尿嘧啶的4,5-二氢加成物。是转移核糖核酸中经常出现的稀有碱基。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇嘧啶二聚体

嘧啶二聚体 pyrimidine dimer,通常是指环丁烷型嘧啶二聚体。通过紫外线照射,DNA或RNA上相邻的嘧啶以共价键相互结合形成的结构,为紫外线的生物学作用为主要原因。通过光解酶的催化作用,吸收光后再恢复为单体。

生物化学的概念和研究方向

生物化学,顾名思义是研究生物体中的化学进程的一门学科,常常被简称为生化。它主要用于研究细胞内各组分,如蛋白质、糖类、脂类、核酸等生物大分子的结构和功能。而对于化学生物学来说,则着重于利用化学合成中的方法来解答生物化学所发现的相关问题。

假尿嘧啶核苷的计算化学数据

1、疏水参数计算参考值(logP):-3.772、氢键供体数量:53、氢键受体数量:84、可旋转化学键数量:26、拓扑分子极性表面积(TPSA):128 Ų [1]  /136 Ų [4] 8、表面电荷:09、复杂度:38210、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:412、不确定原子立

假尿嘧啶核苷的计算化学数据

1、疏水参数计算参考值(logP):-3.772、氢键供体数量:53、氢键受体数量:84、可旋转化学键数量:26、拓扑分子极性表面积(TPSA):128 Ų /136 Ų 8、表面电荷:09、复杂度:38210、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:412、不确定原子立构中心数量:013

假尿嘧啶核苷的计算化学数据

1、疏水参数计算参考值(logP):-3.772、氢键供体数量:53、氢键受体数量:84、可旋转化学键数量:26、拓扑分子极性表面积(TPSA):128 Ų [1]  /136 Ų 8、表面电荷:09、复杂度:38210、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:412、不确定原子立构中心数

细胞化学词汇胸腺嘧啶二聚体

由来:紫外线可以造成DNA的损伤,将DNA分子中的胸腺嘧啶以环丁基环形成二聚体,称为胸腺嘧啶二聚体。这种变化在DNA链上相邻近的胸苷酸容易发生。二聚形成后,RNA引物的合成将停止在二聚体处,DNA的合成也受阻。修复:紫外线照射形成了胸腺嘧啶二聚体是以UvrABC进行修复的(某些化学造成的损伤也是以此

研究揭示中国近海物理化学生物协同演变规律

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505715.shtm 科技日报记者 王健高?宋迎迎 通讯员 王敏 7月29日记者获悉,中国科学院海洋研究所王凡研究员联合我国物理海洋、海洋化学、海洋生物、海洋生态和气候领域的十余位科学工作者,以“

化学生物学助力新药研究模式转变

   专家们认为,这些研究不仅为肿瘤、炎症等生物学基础研究提供了小分子化合物工具,也将推动疾病治疗领域创新药物的发现。  “基于化学小分子探针的信号转导过程研究”重大研究计划(以下简称“重大计划”)是国家自然科学基金委员会在“十一五”期间启动的第一个重大计划,也是化学生物学领域第一个重大计划。  在

细胞化学词汇二氢尿嘧啶臂

中文名称:二氢尿嘧啶臂英文名称:dihydrouracil arm;D arm定  义:转移核糖核酸二级(三叶草)结构和三级(倒L字母型)结构中的特定区域,该区域由二氢尿嘧啶环及相连接的茎区(通常是4~5碱基对的螺旋)组成。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇二氢尿嘧啶环

中文名称:二氢尿嘧啶环英文名称:dihydrouracil loop;D loop定  义:转移核糖核酸二氢尿嘧啶臂中的一个环区,因该区域常含有一个或多个二氢尿嘧啶(D)碱基而得名。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞生物学名词嘧啶核苷酸

嘧啶核苷酸的分解代谢是先去除磷酸和核糖生成嘧啶碱,嘧啶碱在肝内降解。降解产物易溶于水,这点与嘌呤碱不同,嘌呤碱的代谢产物尿酸仅微溶于水。嘧啶环中的脲基碳以形式从呼吸排出,并产生β-丙氨酸(有生理意义,为鹅肌肽、肌肽及泛酸的成分)及β-氨基异丁酸(经代谢进入三羧酸循环)。

研究揭示稀土矿床成矿生物地球化学过程

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/494928.shtm近日,中国科学院广州地球化学研究所研究员何宏平团队利用微生物溶解花岗岩的实验研究,揭示了微生物对花岗岩风化过程中稀土元素活化和分异的影响。相关研究成果在线发表于Geochimica e

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  近日,中国科学院广州地球化学研究所研究员何宏平团队利用微生物溶解花岗岩的实验研究,揭示了微生物对花岗岩风化过程中稀土元素活化和分异的影响。相关研究成果在线发表于Geochimica et Cosmochimica Acta。  离子吸附型稀土矿床主要发育于富含稀土元素的花岗岩风化壳中。风化过程中

蛋白激酶化学生物学研究获进展

  6月14日,中国科学技术大学姚雪彪团队与中国科学院生物化学与细胞生物学研究所张荣光合作团队在Cell Research 发表题为BubR1 phosphorylates CENP-E as a switch enabling the transition from lateral associa

广州能源所生物质化学链气化研究取得进展

  化学链气化是一种新颖的气化理念,它以晶格氧替代纯氧作为氧源。气化过程在两个独立的反应器中分步进行,气化反应器中控制晶格氧与燃料的比值,得到以CO和H2为主要组分的合成气;再生反应器中还原后的低价氧化物被空气氧化,恢复晶格氧。氧载体在两个反应器中循环,实现了化学链过程。  中科院广

代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学...(二)

组分提取软件的数据处理工作流程如图 4 所示。该软件能像分析人员一样解析数据,批量处理各个数据文件,而不是单独处理,并将每次运行得到的信息用于验证下一次运行获得的信息。按照这种方式,由于每种组分在数据集中的最大浓度点定义,从而大大减小了数据缺失值现象。同样的组分在低浓度样品中时,可以采用更靶标性