任兵教授PNAS发表重要测序技术

高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环绕着组蛋白形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。染色质结构对于DNA转录、复制和修复非常关键,决定着基因的表达和细胞的生理状态。人们通常使用核酸酶MNase和DNase I进行染色质结构分析,但在某些情况下这样的酶切分析并不能很好的反映真实情况。 日前,加州大学的研究团队开发了对染色质结构进行全基因组分析的新方法,MPE-seq(methidiumpropyl-EDTA sequencing)。这一成果发表在六月十五日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,文章的通讯作者是加州大学的任兵(Bing Ren)教授和James T. Kadonaga。 任兵教授早年毕业于中国科技大学,现为加州大学圣地亚哥分校Ludwig癌症研究所基因调控实验室主任,主要从事哺乳动物细胞基因调控网络分析及细胞表观遗传学调控机制的研究。近年来在Scie......阅读全文

Nature:解析核小体的重塑机制

  在细胞核中,基因组DNA紧紧包裹在核小体上形成染色质,但基因在如此紧密的包装中是无法表达的。现在德国慕尼黑大学LMU的研究团队,揭示了局部释放核小体DNA的分子机制,正是这一机制使染色体DNA得以转录。文章发表在本期的Nature杂志上。   高等生物的细胞核负责储存基因组DNA,这些DNA环

核小体的概念

核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。每个核小体由146bp的DNA缠绕组蛋白八聚体1.75圈形成。核小体核心颗粒之间通过50bp左右的连接DNA相连。H1结合在盘绕在八聚体上的DNA双链开口处,核小体的形状类似一个扁平的碟子或一个圆柱体,此时DNA的长度压缩7倍,称染色质纤维。染色质就

关于核小体的简介

  核小体是由DNA和组蛋白形成的染色质基本结构单位。每个核小体由146bp的DNA缠绕组蛋白八聚体1.75圈形成。核小体核心颗粒之间通过50bp左右的连接DNA相连。H1结合在盘绕在八聚体上的DNA双链开口处,核小体的形状类似一个扁平的碟子或一个圆柱体,此时DNA的长度压缩7倍,称染色质纤维。染色

染色质非组蛋白HMG框结构模式

  在发现一组丰富的高速泳动族蛋白(high mobility group protein)以后,首先命名HMG框结构模式。该结构由3个α螺旋组成 boomerang-shaped 结构模式,具有弯曲DNA的能力。因此,具有HMG框结构的转录因子又称为“构件因子(architectural fact

衰老的先兆是“松弛”的染色质结构?

5月24日,中国科学院动物研究所研究员刘光慧课题组、研究员曲静课题组同中国科学院北京基因组研究所研究员张维绮课题组合作,于《发育细胞》杂志在线发表研究论文。该研究通过深度解析人类干细胞衰老的表观基因组图谱,解码了衰老过程中不同层次表观基因组重塑的规律,发现染色质的“熵增”和胎盘相关基因的异常表达是细

染色质的前期组装过程

  ①最开始是H3·H4四聚体的结合,由CAF-1介导与新合成的裸露的DNA结合。  ②然后是两个H2A·H2B二聚体由NAP-1和NAP-2介导加入。为了形成一个核心颗粒,新合成的组蛋白被特异地修饰。组蛋白H4的Lys5和Lys12两个位点典型地被乙酰化。  ③核小体最后的成熟需要ATP来创建一个

细胞核的组成物质

  核被膜  核被膜使细胞核成为细胞中一个相对独立的体系,使核内形成一相对稳定的环境。同时,核被膜又是选择性渗透膜,起着控制核和细胞质之间的物质交换作用。  核被膜(nuclear envelope)包裹在核表面,由基本平行的内膜、外膜两层膜构成。两层膜的间隙宽10~15nm,称为核周隙(perin

研究发现染色质装配因子1具有重要表观遗传调控作用

  中国科学院生物物理研究所焦仁杰研究员课题组最新研究发现,染色质装配因子 1(chromatin assembly factor 1, CAF-1)对异染色质区域的基因表达发挥十分重要的表观遗传调控作用。他们的成果已被细胞生物学研究领域的专业期刊J. Cell Sci.接受发表。

染色质的实验依据介绍

  1、用温和的方法裂解细胞核,将染色质铺展在电镜铜网上,通过电镜观察,未经处理的染色质自然结构为30nm的纤丝,经盐溶液处理后解聚的染色质呈现一系列核小体彼此连接的串珠状结构,串珠的直径为10nm。  2、用非特异性微球菌核酸酶消化染色质时,经过蔗糖梯度离心及琼脂糖凝胶电泳分析,发现绝大多数DNA

揭示H2A.Z染色质组装的新机制

  1月30日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院生物物理研究所周政课题组的研究论文“Role of a DEF/Y motif in histone H2A-H2B recognition and nucleosome editing”。该研究揭示了SWR复合物亚基Swc5特异

利用纳米孔测序技术揭示基因表达的染色质调控基础

  作为染色质的基本单元,核小体由大约147 bp的DNA和组蛋白八聚体(H2A, H2B, H3和H4)组成。核小体的动态定位和折叠组织会产生两种不同的染色质状态:“开放”(open)和“闭合”(closed)。核小体的定位和染色质状态的动态变化对以DNA为模板的生物学过程(比如,转录、DNA复制

我国科学家率先解析了30纳米染色质高清晰结构

  困扰研究人员30多年的最基本分子生物学问题获得了突破。4月25日,《科学》杂志刊登了中国科学家的长篇论文,宣布解析了“30纳米染色质高级结构”,这使人类知道了决定同卵双胞胎存有差异的“30纳米染色质”的结构。   据该论文的作者之一、中科院生物物理研究所研究员李国红介绍,遗传信息DNA是经过凝

研究揭示H2A.Z染色质组装的机制

  1月30日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院生物物理研究所周政课题组的研究论文“Role of a DEF/Y motif in histone H2A-H2B recognition and nucleosome editing”。该研究揭示了SWR复合物亚基Swc5特异

关于x染色质的简介

  x染色质曾称巴氏小体或x小体,为紧贴细胞核膜内面的团块状结构,直径约1um,染色程度较其他染色质深。其形态不一,常呈三角、半圆、平凸或球形。利用放射自显影技术的研究发现,女性的两条x染色体中有一条DNA复制延迟,称迟复制x。迟复制的x染色体在间期时表现为x染色质。当细胞内有一条以上x染色体时,在

染色质的组装模型介绍

人的每个体细胞所含DNA约6×109bp分布在46条染色体中,总长达2米,平均每条染色体DNA分子长约5厘米,而细胞核直径只有5~8微米,这就意味着从染色质DNA组装成染色体要压缩近万倍,相当于一个网球内包含有2千米长的细线。 多级螺旋模型由DNA与组蛋白组装成核小体,在组蛋白H1的介导下核小体彼此

核小体模型的建立基础和研究

人们接着用化学交联、高盐分离组蛋白,以及X衍射等方法进一步研究组蛋白多聚体的结构、排列以及怎样和DNA结合的,从而建立了核小体模型。1984年Klug和Butler进行了修正。核小体的构造可用图表示:每一个核小体结合的DNA总量为200bp左右,一般在150~250变化范围(micrococcal

核小体的研究进展的介绍

  国内已有少数医院开展了AnuA的检测,也已发表了数篇相关报道。有文献报道,以核小体多肽特异性抗原治疗鼠狼疮模型的研究发现,核小体多肽特异性抗原可以抑制TH细胞和B细胞的激活,从而为研究SLE的发病机制治疗带来了新的曙光[20]。但需要指出的是:AnuA的检测对SLE的诊断有重要意义,不同的核小体

植物转录起始调控机制研究获进展

在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。  转录复合体将DNA转录

华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展

  转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布

陈柱成/李雪明-SNF2介导的染色质重塑中DNA滑移的机理

  2019年3月13日,清华大学生命科学学院陈柱成课题组、李雪明课题组以及中科院物理所李明课题组合作在Nature上发表了题为Mechanism of DNA translocation underlying chromatin remodeling by Snf2的研究论文,析了不同核苷酸状态下

图像分析在植物染色体和染色质结构研究中的应用

  染色体核型分析对遗传进化和多样化的研究有重要作用,详细的染色体图谱被认为有助于植物育种,并帮助生物学家进行基本的生物学和遗传学研究。图像分析在染色体核型研究中应用广泛,然而通过计算机技术对染色质结构图像进行客观分析存在诸多困难。近日,来自日本神户大学的Nobuko Ohmido团队系统地介绍了测

研究揭示拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构

  6月11日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro

许瑞明课题组Nature子刊解析Sir3转录沉默新机制

  8月11日,Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nu

科学家绘出表观遗传和转录起始研究“框架图”

10月7日,《科学》在线发表复旦大学教授徐彦辉课题组的研究成果。研究人员解析了包含+1核小体的PIC-Mediator复合物结构,首次展示了转录起始复合物与+1核小体的紧密结合,表明+1核小体对转录起始复合物在染色质上组装的重要调控作用,建立了表观遗传和转录起始的直接关联。作为基因表达调控的核心,转

研究揭示EB病毒抑制宿主DNA损伤应答新机制

  DNA承载着细胞的遗传信息,其稳定传递和精确复制对于生命体生存至关重要。病毒基因组的整合、DNA错配或环境物理化学因子的影响,均会造成DNA损伤发生并导致基因组不稳定,进而诱发癌症等疾病。因此,细胞进化出一套完整的DNA损伤应答(DDR)体系来应对这些挑战。同时,由于较多病毒侵染宿主细胞后会引起

南方医科大颜光玗教授Nature揭示基因表达调控机制

  由来自法国巴黎-萨克雷大学、中国南方医科大学、美国宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家组成的一个国际研究小组,揭示出了一些特殊的酶重塑细胞核中极其凝缩的遗传物质,由此控制哪些基因获得利用的机制。这一研究发现发布在1月27日的《自然》(Nature)杂志上。  中国南方医科大学的颜光玗(Kuangyu

异染色质的定义

异染色质(heterochromatin)是指在细胞周期中具有固缩特性的染色体。

染色质的发现过程

1879年,W. Flemming提出了染色质(chromatin)这一术语,用以描述细胞核中能被碱性染料强烈着色的物质。1888年,Waldeyer正式提出染色体的命名。经过一个多世纪的研究,人们认识到,染色质和染色体是在细胞周期不同阶段可以相互转变的形态结构。

染色质重塑的概念

染色质重塑chromatin remodeling :基因表达的复制和重组等过程中,染色质的包装状态、核小体中组蛋白以及对应DNA分子会发生改变的分子机理。

染色质凝聚的概念

中文名称染色质凝聚英文名称chromatin condensation;chromatin agglutination定  义染色质凝缩进一步形成染色体的过程。应用学科遗传学(一级学科),细胞遗传学(二级学科)