Nature:进化中的CRISPR技术又有新突破

来自哈佛医学院和麻省总医院的研究者们在最新一期Nature杂志上发表了他们新改进的CRISPR-Cas9技术,识别序列的范围更大,识别也更为精准。文章第一作者Benjamin Kleinstiver介绍说新技术里的Cas9变种可以识别那些野生型Cas9无法修饰的人类和斑马鱼基因的位点,这使得CRISPR技术在多变的基因组里识别范围大大增加。 CRISPR-Cas9核酸酶由Cas9蛋白和20个核苷酸长的RNA分子组成。Cas9蛋白负责切断DNA双链,RNA分子用于识别目标序列,不过在目标序列旁边还要有可以被Cas9识别的protospacer adjacent motif (PAM)才能让酶发挥作用。实验室里通常使用的SpCas9来自于细菌Streptococcus pyogenes,它所需要的PAM序列一般为NGG形式,这在某种程度上限制了Cas9使用的范围。 为了克服这一限制,该研究组建立了一套工程化系统,用进化研究的......阅读全文

研究中NMR识别临床样品中的代谢变化的应用

本文所描述的方法和解决方案仅供研究之用,不作为临床诊断程序的依据。“我们的研究结果表明,血清与尿液中代谢物之间的日常可靠性差异很大,而脂蛋白亚组分则具有很高的可靠性。” 仅供研究之用。代谢组学是通过对存在于组织或细胞中的小分子中间产物和最终产物的分析来研究活性细胞过程。代谢组学分析通常使用核磁共振(

联合研究发现阿尔茨海默病早期识别标记

  记者8日从中国科学院自动化研究所获悉,该所脑网络组研究中心领衔联合中外多家单位,研究发现大脑海马区的影像组学特征可以作为一种阿尔茨海默病(AD)稳定、有效、可泛化的生物标记,有望应用于临床辅助诊断的生物标记的个体化诊断,对未来阿尔茨海默病临床的精准辅助识别、高危人群的纵向跟踪具有重要临床意义。H

最新研究通过面部活动识别个体心理健康症状

  心理健康状态对个体的身体健康、个人成就和主观幸福感有较大影响。除量表方法外,已有研究提出可以使用行为数据建立机器学习模型来自动识别个体的心理健康状态。然而,目前多数研究致力于识别某一种心理疾病的存在或程度,在一些非专业诊断的场景(如自我检测或大规模监测),识别个体全面的心理健康症状或许更有帮助。

研究发现简单重复序列对虾适应性进化的关键作用

  3月9日,记者从中国科学院海洋研究所获悉,由该所李富花课题组主导完成的科研论文《简单重复序列促进对虾基因组可塑性和适应性进化》在Nature子刊《通讯-生物学》(《Communications Biology》)在线发表。该研究成果为阐明生物体内SSR的功能和甲壳动物对环境的适应进化研究提供了新

血清丙型肝炎病毒感染指标及序列变异的动态研究

  摘要 目的:探讨动态观测HCV感染指标及序列变异的意义。方法:ELISA方法检测抗-HCV-IgG、IgM,RT-PCR方法检测HCV rNA, PCR产物直接测序。结果:6例感染HCV的血透析患者抗-HCV-IgG的表现类型分为持续阴性及持续阳性两种;抗-HCV-IgM有四种表现:一过性阳性、

研究揭示猕猴额叶皮层对空间序列信息的工作记忆编程

9月27日,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心王立平研究组在《科学》(Science)上,在线发表了题为《猕猴额叶皮层对空间序列信息的工作记忆编程》的研究论文。该研究通过训练猕猴在工作记忆中完成对空间序列的排序任务,发现了猕猴群体额叶神经元对时序记忆操作的表征与运行计算机制。对于时序信息的编码、

新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展

  2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。  通过对从患者收集的

揭秘口腔细菌Fretibacterium-fastidiosum的完整基因组序列-助力牙周病研究

人类口腔微生物组由多种细菌组成。由于体外培养存在挑战,并非所有口腔细菌都被充分研究。在这项研究中,研究人员报告了一种最近发现的口腔细菌 —— 苛求弗雷特杆菌(Fretibacterium fastidiosum)的完整基因组序列。口腔微生物组包含 700 多种细菌,其中超过三分之一尚未被培养出来。苛

匹配序列的结构特点

中文名称匹配序列英文名称matched sequence定  义在序列排比中,两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

高度重复序列的概念

高度重复序列是一组基因序列,在基因组中重复频率高,可达百万(10^6)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。

核酸序列的检索实验

实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义;熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存;实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1.  使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608

DNA序列分析技术2

3)电泳电极缓冲液 1 倍TBE(pH 值8.0)预电泳 30 分钟至1 小时恒温方式 测序胶板上夹盖铝恒温板电泳温度 50℃左右电泳条件 恒功率 90~110W电泳时间 2.5 小时至5 小时4)干胶制备和压片电泳结束后取下胶板,用工具撬开玻璃板,使胶留在其中一块板上。将裁剪好的新华3 号滤纸在胶

获取时间序列图像

获取时间序列图像  共聚焦显微镜的"Time-Series"功能,可以自动在实验者规定的时间内按照设定的时间间隔获取图像。只需设定所需的时间间隔以及所需图像数量,开启“Start T”功能键,即可进行实验。“Time-Series"功能大大减轻了实验者的劳动强度,对于荧光漂白恢复和钙离子成像等实验非

DNA序列家族的概念

中文名称DNA序列家族英文名称DNA sequence family;sequence family定  义DNA分子变性后可复性形成稳定的碱基配对双链分子的一组序列。序列之间有很高的同源性。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

细胞化学词汇匹配序列

中文名称:匹配序列英文名称:matched sequence定  义:在序列排比中,两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

反向重复[序列]的定义

存在于双链核酸分子中排列顺序方向相反的一段核苷酸序列。

表达序列标签的作用

⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱;⑵ 作为探针用于放射性杂交;⑶ 用于定位克隆;⑷ 借以寻找新的基因;⑸ 作为分子标记;⑹ 用于研究生物群体多态性;⑺ 用于研究基因的功能;⑻ 有助于药物的开发、品种的改良;⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能,使其得到了充分的利用

简述SD序列的作用

  SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。

中度重复序列的概念

中度重复序列(moderately repetitive sequence )一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如 rRNA基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上,有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列

常用的βactin-引物序列

human actin f ctc cat cct ggc ctc gct gt human actin r gct gtc acc ttc acc gtt cc product size:268 rabbit actin r agt gcg acg tgg aca tcc g rabbit act

RGD序列的结构特点

RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成,存在于多种细胞外基质中,可与11种整合素特异性结合,能有效地促进细胞对生物材料的粘附。

细胞化学词汇互补序列

中文名称:互补序列英文名称:complementary sequence定  义:在双链核酸中,一条多核苷酸链可与另一条多核苷酸链互补的那部分序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是表达序列标签?

表达序列标签从互补DNA(cDNA)分子所测得部分序列的短段DNA(通常300~500bp)。从cDNA文库所得到的许多表达序列标签集合组成表达序列标签数据库,代表在一定的发育时期或特定的环境条件下,特定的组织细胞基因表达的序列。可用于验证基因在特定组织中的表达,推导全长cDNA序列,或作为标签标志

停止转移序列的定义

停止转移序列(stop transfer sequence),肽链上的一段特殊序列,与内质网膜的亲合力很高,能阻止肽链继续进入内质网腔,使其成为跨膜蛋白质。

细胞化学词汇SD序列

中文名称:SD序列外文名称:Shine-Dalgarno sequence定       义:Shine-Dalgarno (SD)是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA,并将核糖体比对并结合到信使RNA(m

端粒DNA-序列的概念

端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的

重叠基因的调控序列

①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRN

低度重复序列的概念

低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质,其他

DNA序列分析技术1

物种的遗传多样性在本质上是DNA 一级序列的多样性。近年来,随着DNA 测序技术的迅速发展和日益普及,DNA 测序在遗传多样性的研究中正在起着越来越大的作用。本章将介绍目前在遗传多样性研究中常用的一种手动和一种全自动双链DNA 测序方法。1.DNA 模板的制备在遗传多样性的研究中,由于样本量一般都较

什么是标准核酸序列?

标准核酸序列系指供药品标准中要求的种属源性鉴别或鉴定的核酸序列,其具有确定的碱基排列顺序,是实施核酸检测的基础,用于药品检验、药品质量控制中涉及的动物、植物、微生物以及重组生物制品的种属鉴别或鉴定。