核酸序列的检索实验

实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义;熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存;实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC060830和NM_000230,连接提取该序列内容,阅读序列格式的解释,理解其含义;2. GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存;3. 使用SRS信息查询系统检索核酸序列BC060830,连接提取该序列内容,阅读序列格式的解释,理解其含义; ......阅读全文

核酸序列的检索实验

实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法;熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义;了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义;熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存;实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1.  使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608

核酸序列分析实验

实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋

核酸序列分析

【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和

肽质量检索实验

基本方案 其他方案             实验方法原理 实验材料 蛋白样品

肽质量检索实验

实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被

标准核酸序列的分类

  标准核酸序列可分为植物来源、动物来源、微生物来源及重组生物制品的鉴别或鉴定用标准核酸序列等。  1.植物来源  植物来源的标准核酸序列系指用种属来源明确的植物样本按DNA测序技术指导原则测定得到的标准序列,可用于植物来源的物种如中药材、中药饮片或提取物等的原植物鉴别或鉴定。  2.动物来源  动

核酸序列扩增法的定义

中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定  义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN

什么是标准核酸序列?

标准核酸序列系指供药品标准中要求的种属源性鉴别或鉴定的核酸序列,其具有确定的碱基排列顺序,是实施核酸检测的基础,用于药品检验、药品质量控制中涉及的动物、植物、微生物以及重组生物制品的种属鉴别或鉴定。

未解析碎片离子的检索实验

实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准,可用于在序列数据库中检索,包括由表达序列标签翻译的序列数据库(图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生

未解析碎片离子的检索实验

基本方案 方案优化             实验方法原理 实验材料 蛋白样品

依赖核酸序列的扩增技术叙述

  国内外的研究结果均表明,草莓组织中富含多糖等物质,分离优质核酸较困难,核酸巾的杂质影响taq DNA聚合酶的活性,从而影响PCR技术在草莓病毒检测中的应用。为了提高利用PCR技术草莓病毒检测的稳定性,国内外的学者在草莓核酸提取方法做了较多的研究,利用OIAGEN公司生产的植物RNA提取试剂盒(P

依赖核酸序列的扩增技术检测

  1 核酸提取  NASBA 方法的核酸提取可按照常规的RNA提取方法进行,根据实际需要可以采取不同的方法。  2 核酸扩增  将纯化的RNA 加到标准的NASBA 反应体系中后,先在65 ℃条件下作用5 min 去除RNA 的二级结构,然后在恒温的42 ℃条件下开始扩增反应。  3 产物的检测 

依赖核酸序列的扩增技术简述

  该技术的检测反应有赖于AMV逆转录酶、噬菌体T7RNA多聚酶、核糖核酸酶H、两种特别设计的特异性寡核苷酸引物和分子信标探针共同协作而完成。  NASBA全称是nucleic acid sequence-based amplification,即依赖核酸序列的扩增技术。 依赖核酸序列的扩增技术,是

标准核酸序列的使用和维护

  标准核酸序列的使用  将按DNA测序技术指导原则测定得到的供试品DNA序列与标准核酸序列进行计算比对,进而结合判定标准进行种属鉴别或鉴定。判定标准的制定应考虑不同物种的变异范围,并在相应通则或品种项下予以明确。核酸序列比对方法一般建议根据样品特点从以下三种方法中选择采用。  1.BLAST法  

核酸序列的扩增技术优势

  相对于免疫学方法或其他基因检测法,NASBA在试验的快速、敏感性、特异性方面有更多的优势。  特异性强:NASBA是一种快速、等温的RNA扩增技术,通过AMV逆转录酶和T7 RNA聚合酶进行的扩增反应,因为反应条件温和以及比PCR短的反应时间,因此转录更加忠实于模板,错配率很低,因而特异性更强。

依赖核酸序列的扩增技术相关

  NASBA的简要过程如下:1.RNA模板链进入反应混合物后,第一个引物首先与模板链的3'端结束。2. 反转录酶,合成反义的补偿的DNA链。3. RNA 酶H(一种核糖核酸内切酶,能够特异性地水解杂交到DNA链上的RNA磷酸二酯键,分解RNA/DNA杂交体系中的RNA链,但不能消化单链或双

核酸序列扩增法的技术特点

中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定  义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN

依赖核酸序列的扩增技术解析

1.概述:依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence-basedamplification,NASBA),又称自主序列复制系统(self-sustainedsequence replication,3SR)或再生长序列复制技术。1990年Guatelli等首先报道了这一技术.NA

依赖核酸序列的扩增的基本方法

基本方法为:将引物,标本加入扩增反应液,65℃1min使RNA分子二级结构打开,降温至37℃加入逆转录酶,T7rna聚合酶和RNaseH,并在37℃反应1——1.5小时,其产物经琼脂 糖电泳,溴乙锭染色即可在紫外仪下看到条带.NASBA的特点为操作简便,不需特殊仪器,不需温度循环.整个反应过程由三种

肽质量检索实验_基本方案

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水

肽质量检索实验_其他方案

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤用肽质量数据鉴定蛋白质所控制的实验参数中,最具决定性的参数是肽质量测量的精确度 。质量精确度越高,结果判定越可信。另一决定性参数是所用酶(或化学试剂)的专一性。酶越纯,专一性胞高,检索结果可信。常用的酶是胰蛋内酶。但是要注意的是,即便是高纯度的胰蛋白酶也会在非

核酸序列的一般分析流程

1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b

核酸序列分析的一般流程

1.1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/b

遴选标准核酸序列的工作流程

  遴选标准核酸序列的工作流程包括:品种的确定、候选品种核酸物质原料的选择、候选标准核酸序列的建立和审核批准。  1.品种的确定  除另有规定外,根据药品标准制修订中拟采用待测物核酸序列进行质量控制的需要,确定需制备的品种。药品标准中采用核酸序列进行鉴定的品种,都应建立标准核酸序列。  2.候选品种

核酸序列的一般分析流程

核酸序列的一般分析流程1.1 核酸序列的检索http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 1.2 核酸序列的同源性分析 1.2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.nc

核酸序列扩增法的定义和原理

中文名称核酸序列扩增法英文名称nucleic acid sequence-based amplification;NASBA定  义一种在等温系统中扩增核酸的方法。即利用T7RNA聚合酶仅在结合核酸上相应位点时才能起作用的特点,将结合位点序列与靶序列相连,然后产生靶分子的RNA拷贝,形成反转录和RN

未解析碎片离子的检索实验——方案优化

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外,还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素(例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子),解析出部分序列信息,再结合以下参数:①

核酸和蛋白质序列分析1

在获得一个基因序列后,需要对其进行生物信息学分析,从中尽量发掘信息,从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析、表达谱分析等,能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等,识别调控区的顺式作用元件,可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本

核酸和蛋白质序列分析2

(2)输出:除了以文本形式外,还可以通过JalView显示和编辑结果。此外,还可以另外使用GeneDoc(常见于文献)及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列,需要进行ORF分析,每个生

依赖核酸序列的扩增技术的定义和原理

1.概述:依赖核酸序列的扩增(Nucleic acid sequence-based amplification,NASBA),又称自主序列复制系统(self- sustainedsequence replication,3SR)或再生长序列复制技术。1990年Guatelli等首先报道了这一技术.