饶子和院士、张荣光研究员发表重要病毒成果

冠状病毒(CoV)是目前基因组最大的一种RNA病毒,能够感染人类引起多种急性和慢性疾病,其中最引人注目的就是SARS和最近困扰韩国的MERS。 冠状病毒的庞大基因组编码了结构蛋白、非结构蛋白和一些辅助蛋白。科学家们发现,冠状病毒的非结构蛋白14(nsp14)对于病毒的复制和转录很重要。该蛋白的N端具有核糖核酸外切酶(ExoN)结构域,该结构域的校读功能可以防止基因组出现致死性突变。而nsp14的C端结构域具有甲基转移酶活性(N7-MTase),负责对病毒mRNA进行加帽。不过,人们并不了解nsp14行使这些重要功能的分子基础。 清华大学的饶子和(Zihe Rao)院士和中科院生物物理所的张荣光(Rongguang Zhang)研究员领导研究团队,首次揭示了nsp14–nsp10复合体的结构基础,并对其进行了功能分析。这一成果发表在七月九日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 非结构蛋白10(nsp10)是能够与nsp1......阅读全文

Nature-Commu:结构生物学研究揭示蛋白转运背后的新机制

  为了保证新合成的分泌蛋白和膜蛋白能够到达它们正确的目的地,这些蛋白一般都会带有一段信号序列作为一种运送标签。除此之外,它们还会利用信号识别颗粒将其导向到细胞膜。在最近发表在国际学术期刊Nature Communication的一项科学研究中,研究人员通过结构生物学的方法证明了信号识别颗粒是如何识

生物物理所解析出植物光保护蛋白PsbS的晶体结构

  植物与太阳光的关系是“爱恨交加”,一方面光能对于植物进行光合作用是必需的,但另一方面过量的光能又会导致植物光合作用装置的氧化性损伤,于是植物逐渐进化出了一种保护机制。在高光照条件下,植物类囊体腔侧的pH会由正常条件下的6.5降低至5.5–5.8,从而激活嵌在类囊体膜上的光保护蛋白PsbS,并进而

关于蛋白质结构的结构种类概述

  蛋白质分子是由氨基酸首尾相连缩合而成的共价多肽链,但是天然蛋白质分子并不是走向随机的松散多肽链。每一种天然蛋白质都有自己特有的空间结构或称三维结构,这种三维结构通常被称为蛋白质的构象,即蛋白质的结构。  蛋白质的分子结构可划分为四级,以描述其不同的方面:  一级结构:组成蛋白质多肽链的线性氨基酸

关于蛋白质结构的结构测定介绍

  专门存储蛋白质和核酸分子结构的蛋白质数据库中,接近90%的蛋白质结构是用X射线晶体学的方法测定的。X射线晶体学可以通过测定蛋白质分子在晶体中电子密度的空间分布,在一定分辨率下解析蛋白质中所有原子的三维坐标。大约9%的已知蛋白结构是通过核磁共振技术来测定的。该技术还可用于测定蛋白质的二级结构。除了

关于蛋白质结构的结构预测介绍

  测定蛋白质序列比测定蛋白质结构容易得多,而蛋白质结构可以给出比序列多得多的关于其功能机制的信息。因此,许多方法被用于从序列预测结构。  一、二级结构预测  二、三级结构预测  同源建模:需要有同源的蛋白三级结构为基础进行预测。  Threading法。“从头开始”(Ab initio):只需要蛋

原核生物的结构

  鞭毛  鞭毛是很多单细胞生物和一些多细胞生物细胞表面像鞭子一样的细胞器,用于运动及其它一些功能。在三个域中,鞭毛的结构各不相同。细菌的鞭毛是螺旋状的纤维,像螺钉一样旋转。古生菌的鞭毛表面上和细菌的类似,但很多细节不同,和细菌的鞭毛可能也不是同源的。真核生物,比如动物、植物、原生生物细胞的鞭毛是细

科学家通过生物矿化可控制备蛋白无机杂化纳米结构

  生物矿化是自然界的一种普遍现象,如牙齿、骨骼、磁小体等的形成。受其启发,近年来,以生物分子为模板进行矿化也成为材料学家可控合成新材料的一种重要途径,在纳米影像、高灵敏传感、肿瘤无创诊疗、疫苗、催化、电池等领域均有重要应用价值。  病毒纳米颗粒(virus-based nanoparticle)是

蛋白质二维结构的结构特点

二维结构是指原子或离子集团中的原子或离子具有在空间沿二维方向的正、反向延伸作有规律排布的结构。

蛋白质三级结构的结构特点

三级结构是由一个已经具有了某些a-螺旋和/或b折叠区的多肽链折叠成一个紧密包裹的、几乎成球形的空间结构,或称为天然构象。三级结构的一个重要特点是在一级结构上离得远的氨基酸残基在三级结构中可以靠的很近,它们的侧链可以发生相互作用。二级结构是靠骨架中的酰胺和羰基之间形成的氢键维持稳定的,三级结构主要是靠

生物蛋白如何保持活性

  生物活性蛋白对环境的要求很高,高浓度的生物活性蛋白在常温下保存很容易失去活性,为了确保这些珍稀成分的特殊活性与功能,只能采取生物冻干工艺,在无菌环境下采用-80度的极速超低温真空冻干技术,使生物活性蛋白进入休眠状态,达到完整的保存其生物活性的目的。

简述网格蛋白的结构

  有两种类型的轻链:α链和β链,二者的氨基酸有60%是相同的,但还不知道它们在功能上有什么差别。许多三腿复合物再组装成六边形或五边形网格结构,即包被亚基,然后由这些网格蛋白亚基组装成披网格蛋白小泡。

血管生成蛋白的结构特点

中文名称血管生成蛋白英文名称angiogenin定  义最初从人腺癌培养细胞中分离的一种小分子蛋白质。能使新血管在活组织中生长。健康的非癌组织也产生这种小分子蛋白质,有35%的序列与胰核糖核酸酶同源。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),激素与维生素(二级学科)

关于Ras蛋白的结构介绍

  Ras蛋白为膜结合型的GTP/GDP结合蛋白,相对分子质量为2.1万,定位于细胞膜内侧.它由188或189个氨基酸组成,它的第一个结构域为含有85个氨基酸残基的高度保守序列,接下来含有80个氨基酸残基的结构域中,Ras蛋白结构轻微不同,除了K2Ras末端25个氨基酸由于不同的外显子而分为A型和B

G蛋白偶联的结构特点

与G蛋白偶联的多种受体具有共同的结构功能特点:分子量40-50kDa左右,由350-500氨基酸组组成,形成7个由疏水氨基酸组成的α螺旋区段,反复7次穿越细胞膜的脂质双层。肽链的N末端在胞膜外,C末端在细胞内。N末端上常有许多糖基修饰。

G蛋白偶联受体结构介绍

G蛋白偶联受体均是膜内在蛋白(Integral membrane protein),每个受体内包含七个α螺旋组成的跨膜结构域,这些结构域将受体分割为膜外N端(N-terminus),膜内C端(C-terminus),3个膜外环(Loop)和3个膜内环。受体的膜外部分经常带有糖基化修饰。膜外环上包含有

黄素蛋白的结构与功能

FAD或FMN与酶蛋白部分之间是通过非共价键相连,但结合牢固,因此氧化与还原(即电子的失与得)都在同一个酶蛋白上进行,故黄素核苷酸的氧化还原电位取决于和它们结合的蛋白质,所以有关的标准还原电位指的是特定的黄素蛋白,而不是游离的FMN或FAD;在电子转移反应中它们只是在黄素蛋白的活性中心部分,而其本身

肌动蛋白的结构组成

肌动蛋白是细胞中两种细丝的单体 亚基 :细丝,细胞骨架的三个主要成分之一,以及细丝,是肌细胞中收缩装置的一部分。它可以作为称为G-肌动蛋白 (球状)的游离单体存在,或作为称为F-肌动蛋白 (丝状)的线性聚合物 微丝的一部分存在,这两者对于细胞的移动和收缩等重要的细胞功能是必不可少的。

载脂蛋白E的结构

  载脂蛋白E是一种富含精氨酸的碱性蛋白,人ApoE是由299个氨基酸残基组成,分子量为34145D,含32个Arg和12个Lys存在于血浆的CM、VLDL及其残粒和β-VLDL中均含有ApoE,一部分ApoE在血液中与ApoAⅡ形成复合体。  Shore于1973年首先发现ApoE,Rall等于1

微管蛋白的结构功能特点

是一种球蛋白,是细胞内微管的基本结构单位。它是由两个蛋白质分子,即α-、β-微管蛋白分子聚合而成的异二聚体;每个这样的二聚体又与两个核苷酸分子相结合,一个属紧密结合,另一个为疏松结合,而且可以快速交换。分子量12万,沉降系数6s。微管蛋白有两个尺寸相等而结构不同的亚基(α和β)。其亚基分子量为5.5

关于微管蛋白的结构简介

  是一种球蛋白,是细胞内微管的基本结构单位。它是由两个蛋白质分子,即α-、β-微管蛋白分子聚合而成的异二聚体;每个这样的二聚体又与两个核苷酸分子相结合,一个属紧密结合,另一个为疏松结合,而且可以快速交换。分子量12万,沉降系数6s。微管蛋白有两个尺寸相等而结构不同的亚基(α和β)。其亚基分子量为5

如何选择蛋白晶体结构?

在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准都有一个适用范围。我们在这里只讨论用于分子对接的蛋白晶体结构的选择原则和方法。1. 确定蛋白种属在实验当中,研究人员通常使用动物模型(如小鼠)来研究人源蛋白。这样做有许多原因,比如:1) 无

蛋白激酶A的结构简介

  PKA全酶以四聚体形式存在,但PKA被靶向到特定组分时,也会在细胞中形成更高阶的结构。经典的PKA全酶结构由两个调节亚基(R亚基)和两个催化亚基(C亚基)组成。催化亚基包含活性位点、在结合和水解ATP的蛋白激酶中发现的一系列典型残基以及结合调节亚基的结构域。调节亚基具有结合到cAMP的结构域,该

蛋白质整体的结构

 蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物大分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决定了它的功能。     一级结构:蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,以及二硫键的位置。     二级结构:蛋白质分子局区域内,多肽

免疫球蛋白的结构

  1.轻链和重链  Ig基本结构:两对四条肽链通过链间二硫键连接形成Ig的单体结构。两条相同的长链称为重链,即H链;另两条相同的短链称为轻链,即L链。  两条重链间,轻链与重链间以二硫键相连,整个Ig分子呈“子呈字型。结构域由链内二硫键所连接的两个β片层所组成。  2.可变区和恒定区  (1)可变

铁硫蛋白的结构功能

铁硫蛋白是含铁的蛋白质,也是细胞色素类蛋白。是在蛋白质的中央含有四个原子,其中两个是铁,另两个是硫,称为【2Fe-2S】,或在蛋白质的中央含有八个原子,其中四个是铁,另四个是硫,称为【4Fe-4S】,并且通过硫与蛋白质的半胱氨酸残基相连。

载脂蛋白CII的结构

  人Apo CⅡ为含79个 氨基酸残基的单链多肽,分子量为9.1kD。先合成的Apo CⅡ含101氨基酸残,其中 22个氨基酸构成信号肽,除去信号肽后则转变为成熟Apo CⅡ。Apo CⅡ的等电点为5.0,其氨基酸组成有3个特点: ⑴缺乏组氨酸和半胱氨酸; ⑵ 含有较多的极性氨基酸; ⑶苏氨酸及丝

蛋白质立体结构原则

1.由于C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子共振”,使肽键具有部 分双键的性质,不能自由旋转。   2.与肽键相连的六个原子构成刚性平面结构,称为肽单元或肽键平面。但由于α-碳原子与其他原子之间均形成单键,因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。此单键的旋

样本蛋白的结构性质

了解样本蛋白的结构性质有助于选择最合适的抗体,至少两方面因素需要考虑。待测样本蛋白的结构域:抗体是由各种不同免疫原免疫宿主而制备得来,其中的免疫原包括:全长蛋白、蛋白片断、多肽、全有机体(如:细菌)或细胞,抗体说明书一般都有免疫原的描述,如果打算检测的是蛋白片断或一种特殊的同型物或蛋白全长的某一区

铁蛋白的结构特点

铁蛋白的分子结构是由一层蛋白壳围绕着铁和磷酸盐分子组成的铁核,外径12~13nm,分子量500kDa。从不同来源(如人、马、牛蛙和细菌等)的铁蛋白结构特征来看,所有的铁蛋白虽然在一级结构上变化很大(氨基酸序列相似性有时才达到14%),但本质上都有相同的体系结构。蛋白壳均为由24个亚基以高度对称性方式

低密度脂蛋白的结构

每个天然低密度脂蛋白颗粒都能够乳化,即围绕所携带的脂肪酸,使这些脂肪能够在细胞外的水中在身体周围移动。每个颗粒包含一个载脂蛋白B-100分子(ApoB-100,一种具有4536个氨基酸残基和514kDa质量的蛋白质),以及80到100个额外的辅助蛋白质。每个低密度脂蛋白都有一个高度疏水的核心,由称为