新一代测序技术连接古今人类关系

新一代测序(NGS)是一种颠覆性的技术,它的出现使得科研工作者能够以较少的经费,测取数以百万计的短DNA序列数来进行各方面的研究应用,这其中既包括对古生物的全基因组测序。 7月24日,science杂志上的一篇短评“New life for old bones”揭示了新一代基因测序技术在古生物DNA检测中的应用。 早在2010年,由斯万特·帕博(Svante P&bo)带领的队伍在德国马克斯·普朗克人类学进化研究所(MPI für evolutionäre Anthropologie)就从克罗地亚Vindija洞穴中采集的三个样本基础上对尼安德特人的整个基因组进行了测序,为探索现代人的基因与这个古老的古人类物种之间的关系提供了重要的遗传信息。 2013年,科学家对70万年的史前真马属进行了全基因组测序,并发布在Nature杂志上。揭示基因测序,不仅需要保存较好的生物碎片,还需利用先进的计算机技术和信息学,......阅读全文

破译基因测序行业的投资密码

随着基因测序技术的发展和成熟,测序成本快速降低,以及国内对该领域审批政策的放开,市场预计基因测序会有越来越多的临床应用,相关产业进入高速增长期  5月13日,A股基因测序概念集体大涨,千山药机涨停,达安基因涨逾7%,其它概念股也均有不同程度涨幅。  消息面上,5月12日,全球最大的基因测序

测序解读基因组,真的好吗?

测序解读基因组,真的好吗?   “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire,在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说,“尤其是对自己基因组信息的了解。”  虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年,但

中国莲基因组测序完成

  继中国科学家成功完成水稻、玉米基因组测序工作后,近日,中国科学院武汉植物园研究人员与国外多家科研机构合作,顺利完成中国莲的基因组测序,构建了首张中国莲全基因组图谱,相关论文在线发表于《基因组生物学》杂志。   “该项目为将来的莲分子育种提供了坚实的基础,也标志着我国相关研究将对生物进

ASHG年度大会热议基因测序

  近年来,基因测序在美国和欧洲已被快速应用到临床领域,但关于临床测序的监管体系仍没有形成。近日,在美国人类遗传学协会(ASHG)年度大会上,临床测序的监管问题再遭热议。参与讨论的成员包括美国及欧洲临床研究人员以及FDA的代表人员等。  哥伦比亚大学临床分子遗传学家:扩展基因测序规模,需要卫生保健提

晚期肿瘤患者可免费测序基因

  对于肿瘤,除了传统诊疗方法外,未来还可对患者的基因进行测序,找出容易引发肿瘤的变异基因,再针对该基因选择对应的靶向药物。4月20日,“MATCH中国·测序中心”三方联合实验室在中山大学附属第一医院(以下简称“中山一院”)正式挂牌。该院将借助美国国家癌症研究所NCI-MATCH计划,开展大规模的高

基因测序科技文章登上《福布斯》封面

  最新一期的美国《福布斯》于2010年12月底正式出刊,本期封面文章标题为“基因测序科技突飞猛进”。文章对基因创业企业家Jonathan Rothberg和他发明的功能强大的基因测序仪器做了介绍。文章认为,这项发明可能会在医药、食品、能源,甚至消费产品上的一场革命,由此形成规模可达1000亿美元的

Nature突破:香蕉基因组测序

  由法国的研究人员领导的一个国际小组近日完成了对香蕉品种小果野蕉(Musa acuminata)的基因组测序,并开始分析这一基因组草图。相关研究成果发布在了7月11日的《自然》(Nature)杂志上。   研究人员采用Roche 454、Sanger和Illumina的测序方法绘制出了双单倍

Nature完成桉树基因组测序

  一个横跨五大洲的科学团队宣布,巨桉(Eucalyptus grandis)的基因组测序已经完成,巨桉是世界上最广泛种植的树木之一。这一成果于六月十一日发表在Nature杂志上。  巨桉生长速度快,可以用作燃料和木材,是纤维、纸浆、生物燃料、药物和工业用油的重要可再生原料。这种树木原产于澳大利亚东

基因测序:解读上帝的语言

  2000年6月基因图谱完成的发表会上,克林顿说:”这是上帝创造生命所用的语言”。而如今我们逐渐开始解读上帝的语言了,人类一直受到病痛的困扰,如果可以预先知道可能会患有什么疾病,就可以提前预防,安吉丽娜·朱莉在2013年4月27日接受预防性的双乳房切除术,以降低罹癌风险,皆因在此前被检测出BRCA

中国基因测序界杀出“黑马”

  “别人是买枪打鸟,我们是自己造炮。”深圳瀚海基因生物有限公司发起人——美国莱斯大学生物物理学博士、斯坦福大学博士后贺建奎这样生动说明自主研发的第三代单分子测序仪。昨天,记者采访时了解到,中国首台自主开发的测序仪样机已经通过院士团队评审,而真正的产品化预计10月就可以做出来了!   中科院陈润生院

仪器短板掣肘本土基因测序产业

图为研究人员正在将处理后的样品点到基因芯片。  我国市场上用于基因测序服务的设备和试剂大多来自于少数几家国外供应商,不得不承受比供应商所在国家更高的设备购置和应用费用。  如今的基因测序行业,正广泛应用于法医鉴定、疾病控制和诊疗、食品安全等与公众生活密切相关的领域。  所谓“工欲善其

基因测序仪的定义和应用

基因测序仪又称DNA测序仪,是测定DNA片段的碱基顺序、种类和定量的仪器。主要应用在人类基因组测序、人类遗传病、传染病和癌症的基因诊断、法医的亲子鉴定和个体识别、生物工程药物的筛选、动植物杂交育种等方面。

游走在疏堵间的基因测序

  一项新技术或产品的问世,给人们带来欣喜的同时,也必然会引起担忧。基因测序技术便是其中之一。  基因测序技术被看作自疫苗问世以来疾病预防最重要的科技突破。它不仅可以大大降低遗传相关的疾病发生率,减少出生缺陷,还可以实现对疾病预测、预防、预警以及个体化诊疗。  但目前,国内的基因测序市场却并不让人满

让基因组测序绕过PCR

 在基因组测序中,PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而,PCR也带来一些问题,包括不均匀扩增,导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序(NGS)平台而言,测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-

基因组测序的具体过程

讲起来很复杂哈,简单来说,就是边合成边测序,把所要测序的序列通过各种手段来建库,然后加上5‘和3’都加上接头,放在一个小玻璃片一样的芯片上,上面一般是8个lane,把样品加入到lane上之后和上面长好的接头序列相结合(之前的建库时加的接头与之反向互补),然后再经过PCR扩增的过程形成一个DNA簇,然

测序基因组勘探食品污染

   上周,两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂(Blue  Bell Creameries)已确认有少量食品原料已感染李斯特菌,目

基因测序仪的优势及用途

  基因测序仪是一台能自动灌胶、自动进样、自动数据收集分析等全自动电脑控制的测定基因片段的精密仪器。基因测序仪带有高的光路灵敏度和分离胶保证你低成本地获得高质量的基因序列分析数据;多种自动化设计使人工操作失误的机会降小;优化的分离胶在保证高质量数据的同时大大提高了产率。基因测序仪在医学上的应用有: 

基因测序仪成人类“解密神器”

定制型基因诊断         神器,网络热词之一,形容特别好用的工具。目前,基因测序仪可谓生命科学的神器,帮助人们越来越快速准确地解开生命的奥秘,并影响着人们的生活。  拉登被击毙后,如何确定死者就是其本人?德国暴发大肠杆菌疫情背后的元凶是谁?怎样为不同患者有针

近期基因测序研究领域新成果!

  本文中,小编整理了多篇研究报道,共同聚焦科学家们在测序研究领域取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Nature  【1】Nature:中国科学家使用单细胞测序来揭示人类胚胎植入的秘密  doi:10.1038/s41586-019-1500-0  近日,中国多家机构的一个研究团队利用单细胞测

基因测序的基本含义要了解

 基因测序的基因就是DNA大分子的一个片断。核酸分为DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)两类,它们共同执掌着细胞的新陈代谢,核酸作为生命的根源是遗传因子的本体,能完全控制细胞的分裂、成长与能量的产生。生命从诞生到死亡,均受核酸支配。与基因密切联系的真正在幕后操纵生命的,是一个崭新的概念“核酸”

基因测序的主要功能

基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。  基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要孕妇5毫升血,通过化验血液中甲型胎儿蛋白(AFP)、人类绒毛膜促性腺激素(β-hCG)的浓度,就可以算出胎儿出现唐氏综合征的危险性。  最近公众关注

什么是基因二代测序

第二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(Sequencing by Synthesis),即通过捕捉新合成的末端的标

测序技术如何助推精准医学?

主要应用领域基因测序的一个重要应用是测出生缺陷,包括单基因病、遗传病、无创产前、基因检测,这是目前应用的最多、最成熟的产业。整个肿瘤基因组结构非常复杂,一个肿瘤基因组数据量大约有几十个G,要完整地测一个肿瘤单细胞,则需要更多工具,数据量也更大。移植配型白血病、骨髓配型,包括基因身份证和整个的器官移植

PCR技术(十六):PCR产物测序

PCR技术代替了为测序而反复进行的分子克隆和模板制备步骤。PCR技术与自动测 序技术相结合后,它将成为一种最快、最有效的测定核苷权序列的方法。本章主要综 述各种测模板的制备以及如何完成PCR产物的直接测序。与传统的将PCR片段克隆入质 粒或病毒基因组相比,直接序列分析有两个主要的优点:1)由于它是一

关于DNA测序技术的概述

  人类基因组这部由A、T、G、C四个字母组成的卷帙浩繁的生命天书如同一座宝库,保藏着几千年来人们迫切想知道的秘密,DNA测序技术就好似“芝麻开门”这样的咒语,是我们打开宝库的金钥匙。世界上第一个测定DNA序列的方法是由英国生化学家弗雷德里克·桑格尔发明的。自此DNA测序的速度就一直呈加速态势。20

AFDIL:DNA测序技术鉴定

  1972年,美国空军中尉Michael Joseph Blassie在越南战争中牺牲。因无法确认身份,Blassie的遗体被埋葬在无名烈士墓中,供人们瞻仰。直至1998年,经过线粒体DNA检测, Blassie中尉的遗体才得以确认,并运回家乡。从此,DNA测序开始在鉴定美国士兵残骸中发挥

Illumina宣布测序技术大创新

  生物通报道 Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新,从样品制备到系统改进再到数据分析,这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进,测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。   样品制备新品   简化和加速样品制备的过程对改善测序流程和降低周转时间至关重要,这也是测

新测序技术——Riboseseq

  核糖核苷酸是RNA的基本单位,它们会在DNA复制和修复过程中嵌入基因组DNA,进而影响基因组的稳定性。然而,迄今为止人们还无法鉴定和定位这些插入DNA的核糖核苷酸。  为此,乔治亚理工学院和科罗拉多大学的科学家们开发了一种新测序技术,Ribose-seq。该技术可以鉴定和分析插入基因组DNA的核

高通量测序技术的应用

  测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测

焦磷酸测序(Pyrosequencing)技术原理

焦磷酸测序(Pyrosequencing)技术是新一代DNA序列分析技术,该技术无须进行电泳,DNA片段也无须荧光标记,操作极为简便。Pyrosequencing技术是由4种酶催化的同一反应体系中的酶级联化学发光反应(参见Pyrosequecing的原理),在每一轮测序反应中,只加入一种dNTP,若