TRIM5α基因多态性与HIV1易感性的关系研究取得进展
在生物的整个进化过程中,生物体进化出了各种“武器”来对抗各种病毒的入侵。为了对付HIV-1的感染,灵长类针对HIV-1在细胞内的复制过程产生了各种抑制HIV-1病毒复制的限制因子,如三模体蛋白5α(TRIM5α)、载脂蛋白B mRNA编辑酶3G(APOBEC3G)、束缚蛋白(tetherin) 和锌指结构抗病毒蛋白(ZAP)等。限制因子的基因多态性往往与个体对病毒易感性和感染后病程进展的差异密切相关。人TRIM5α的基因多态性与HIV-1易感性及病程进展相关性研究所得到的结论并不一致,而且缺乏中国规模人群TRIM5α多态性的研究。 中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室博士生刘丰亮等人在导师郑永唐研究员及香港中文大学邓亮生教授的指导下,对云南省的1294名汉族或傣族静脉吸毒者的TRIM5α的基因多态性与HIV-1易感性的相关性进行研究。研究共发现14个基因变异,除之前已有报道的-2G/C......阅读全文
PLoS-Genet:为什么有些人对HIV1免疫?
医生们早就感到迷惑,为何HIV-1会快速恶化某些患者的病情,而在另一些人中病毒“想要站稳脚跟”却很困难。 现在通过研究HIV-1和感染细胞的遗传变异,美国明尼苏达大学研究人员已发现HIV-1的盔甲缝隙,至少部分地解释令人费解,并有可能帮助开发新的治疗方法。相关研究发表在PLOS Genetic
上海巴斯德所HIV1新型防治策略研究取得进展
近日,国际知名病毒学杂志Journal of Virology在线发表了中科院上海巴斯德研究所周保罗研究组的研究论文Potent and broad anti-HIV-1 activity exhibited by a GPI-anchored peptide derived f
清华大学教授JBC破解艾滋病奥秘
来自清华大学,艾滋病研究中心的长江特聘教授张林琦是著名旅美中国学者、美国洛克菲勒大学艾伦・戴蒙德艾滋病研究中心首席华裔科学家,近期其研究组在《JBC》杂志上发表文章,解析了对于一种新发现,能中和高达90%的艾滋病病毒菌株的抗体,出现耐药性病毒菌株的作用机理,指出了其中V5区的一个单残基在其中扮演
上海巴斯德所揭示宿主细胞限制HIV1复制的新机制
目前,艾滋病疫苗尚未取得根本性突破,针对艾滋病毒I型(HIV-1)感染的临床治疗药物主要通过抑制病毒蛋白的功能来抑制病毒的复制,如HIV-1逆转录酶及蛋白水解酶的抑制剂等。但这些针对病毒蛋白的药物易产生耐药性,并且毒副作用大,病人依从性差,难以取得预期的理想治疗效果。 事实上,
基因“魔剪”成功灭活HIV基因-有望带来根治艾滋病的新疗法
科技日报东京5月22日电 日本神户大学近日宣布,该校龟冈正典准教授领导的研究小组利用基因“魔剪”CRISPR/Cas9编辑技术,开发出一种有效方法,能破坏艾滋病病毒(人类免疫缺陷病毒1型,HIV-1)的调节基因,成功抑制感染细胞内HIV-1的增殖。 HIV-1感染者现在主要通过多药联合治疗
基因芯片的应用
1998 年底美国科学促进会将基因芯片技术列为 1998 年度自然科学领域十大进展之一,足见其在科学史上的意义。现在,基因芯片这一时代的宠儿已被应用到生物科学众多的领域之中。它以其可同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的威力。这些应用主要包括基因表达检测、突变检测、基因组多态
973项目最新文章揭示HIV1复制新机制
来自中科院上海巴斯德所,浙江理工大学的研究人员发表了题为“Translation of Pur-α is targeted by cellular miRNAs to modulate the differentiation-dependent susceptibility of monoc
什么是扩增片段长度多态性?
扩增片段长度多态性(AFLP)是1993年荷兰科学家Zabeau和Vos发展起来的一种检测DN A多态性的新方法。
分子生态学词汇遗传多态性
中文名称:遗传多态性外文名称:genetic polymorphism现 象:一群体中两种或两种以上变异类型定 义:遗传多态性是在同一群体中,某个基因座上存在两个或两个以上的等位基因,且等位基因的频率大于0.01的现象。其形成机制是基因突变。评价遗传多态性的主要参数是基因频率
单链构象多态性分析(SSCP)技术
SSCP是一种简便快速的检测DNA或cDNA突变的技术。 其技术原理和过程是:将PCR扩增到的待测DNA或cDNA片段变性,成为单链DNA,在一定条件下,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳将单链DNA变性。 由于单链DNA的空间构象与分子内碱基组成密切相关,一个碱基的差异即可形成不同
单链构象多态性的实验步骤
利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。利用λ-外切核酸酶消化掉一条链(其中一个PCR引物被磷酸化,这条链将被去除)。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。
扩增片段长度多态性的方法
AFLP 是 RFLP 与PCR相结合的产物,其基本原理是先利用限制性内切酶水解基因组 DNA 产生不同大小的 DNA 片段,再使双链人工接头的酶切片段相边接,作为扩增反应的模板 DNA,然后以人工接头的互补链为引物进行预扩增,最后在接头互补链的基础上添加 1—3个选择性核苷酸作引物对模板 DNA
单链构象多态性的应用介绍
单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。可对其中的某一个条带进行测序,并与数据库中已知序列比对。
随机扩增多态性DNA技术特点
(1)不需要了解研究对象基因组的任何序列,只需很少纯度不高的模板,就可以检测出大量的信息。(2)无需专门设计RAW)反应引物,随机设计长度为8-10个碱基的核苷酸序列就可应用。(3)操作简便,不涉及分子杂交、放射自显影等技术。(4)需要很少的DNA样本。 (5)不受环境、发育、数量性状遗传等的影
单核苷酸多态性的特点
在遗传学分析中,SNP作为一类遗传标记得以广泛应用, 主要源于这几个特点:(1)密度高SNP在人类基因组的平均密度估计为1\1000 bp , 在整个基因组的分布达3×106个,遗传距离为 2~3cM,密度比微卫星标记更高,可以在任何一个待研究基因的内部或附近提供一系列标记。(2)富有代表性某些位于
单核苷酸多态性的概念
单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每300个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起,也可
卫星DNA的多态性和保守性
卫星DNA具有多态性和保守性,卫星位点由微卫星的核心序列与其两侧的侧翼序列构成,侧翼序列使某一卫星特异地定位于染色体的某一部位,而卫星本身的重复单位变异则是形成微卫星多态性的基础。在某一个体基因组中两条同源染色体的相对(侧翼序列相同)位置上如两侧翼序列间所包含的卫星重复单位数相同与不同,则分别表
随机扩增多态性DNA技术简介
随机扩增多态 DNA (randomly amplified polymorphic DNA, RAPD),是美国学者Williams和Welsh于1990年首先提出的该技术是通过分析DNA的PCR产物的多态性来推测生物体内基因排布与外在性状表现的规律的技术。RAPD技术是以8-lObp的随机寡核苷
分子遗传学词汇DNA多态性
中文名称:DNA多态性外文名称:polymorphism定 义:DNA多态性是指群体内某个基因座存在2个或多个等位基因形成而造成的同种DNA分子的多样性,是单一基因座等位基因变异性在群体水平的体现。凡在群体中出现频率大于1%的变异体,不论其是正常还是致病性,称多态性;频率低于1%的变异体,
单链构象多态性的实验步骤
利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。利用λ-外切核酸酶消化掉一条链(其中一个PCR引物被磷酸化,这条链将被去除)。非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。
单核苷酸多态性(SNP)实验
SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,可以用于检测由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。实验方法原理由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个
单核苷酸多态性的概念
单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每300个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。SNP是一种二态的标记,由单个碱基的转换或颠换所引起,也可
单链构象多态性的原理简介
单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等[9]用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下,单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象,它影响了DNA在非变性凝胶中
随机扩增多态性DNA的简介
随机扩增多态 DNA (randomly amplified polymorphic DNA, RAPD),是美国学者Williams和Welsh于1990年首先提出的该技术是通过分析DNA的PCR产物的多态性来推测生物体内基因排布与外在性状表现的规律的技术。RAPD技术是以8-lObp的随机寡
专一扩增多态性额概念
中文名称专一扩增多态性英文名称specific amplified polymorphism;SAP定 义利用专一性的引物扩增的多态性,属于扩增片段长度多态性分析的一种形式。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
单核苷酸多态性(SNP)实验
实验方法原理 SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于限制性片段长度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(S
单核苷酸多态性(SNP)实验
基本方案 实验方法原理 由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较
根据酶的多态性产生原因介绍
根据酶的多态性产生原因不同,大致可以分为三类:(1)多座位同工酶(multiple loci determining isozyme):是指由不同基因座位决定的同工酶。例如乳酸氢酶(lactic dehydrogenase,LDH)有A、B两种亚基,分别由LDHA基因(定位于11p15-p14)和L
DNA的多态性的检测方法介绍
、限制性片段长度多态性一个人的两套单倍体DNA是不完全相同的,一般每100-500个碱基对就有一个是不相同的。换言之,如果把两套基因组DNA(各3.2×109bp)排列起来,那么平均有1000万处不同,它们多位于内含子序列中。实际上,除单卵双生子外,人群中没有两个个体的基因组DNA是完全相同的。
人类遗传多态性的主要类型介绍
人类基因的研究较为深入,从分子生物学上看,人类遗传多态性主要有染色体多态性、酶和蛋白质多态性、抗原多态性、DNA多态性等五类。染色体多态性染色体的多态性又称异态性(heteromorphism),是指正常人群中经常可见到各种染色体形态的微小变异。这种变异主要表现为同源染色体大小形态或着色等方面的变异