Antpedia LOGO WIKI资讯

刘小乐教授发布CRISPR实用工具

必需基因是指细胞生存的关键基因。近年来,研究基因重要性(gene essentiality)的功能基因组技术发展很快。举例来说,大规模shRNA筛选已经被用于多个细胞系,帮助人们寻找必需基因。如果一个转录因子使细胞在特定条件下存活,就可以用ChIP-seq鉴定其调控靶标,进而找出必需基因。最近,CRISPR筛选成为了在基因组中分析基因重要性的新途径。 CRISPR-Cas9是细菌在漫长的进化史中演化出的重要防御机制。这一系统最初用于特异性修改基因序列,被视为基因组工程领域的革命性工具。细菌免疫系统的天然蛋白Cas9,能像分子剪刀一样精确切割或编辑特定的DNA片段。不过最近科学家们也开始用CRISPR-Cas9系统进行基因调控,随心所欲的开/关基因。 CRISPR筛选可以系统可靠地在不同条件下分析基因重要性。众所周知,生物学网络中高度关联的蛋白对于细胞生存尤为重要。此前人们已经通过整合蛋白互作网络,改善了RNAi筛选的结果......阅读全文

Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究进展Top20

  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统,其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。  CRISPR/Cas系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly inte

刘小乐教授连发多项研究成果

  华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐(X Shirley Liu)教授,也是教育部“长江学者”讲座教授、中组部“千人计划”入选者,是国际生物信息学界的领军人物。其带领的课题组长期致力于生物大数据的收集和信息挖掘、筛选治疗癌症药物的有效靶点,以及开发个性化癌症诊

刘小乐教授Nature Genetics发布癌症研究新工具

  哈佛大学研究团队五月三十日在Nature Genetics杂志上发布了一种新的计算方法,该方法可以帮助人们用RNA-seq数据从头组装肿瘤浸润T细胞的CDR3序列。这篇文章的通讯作者是哈佛大学的刘小乐 (X. Shirley Liu)教授和刘军(Jun S. Liu)教授。  肿瘤浸润T细胞是从

重磅回顾!2015年“魔剪”CRISPR技术重大突破 TOP30

  CRISPR作为基因编辑领域的明星技术俨然已经成了众多突破研究的“得力助手”。从技术改良、疾病治疗到作物改良,越来越多的科学研究离不开这项才进入科研领域短短几年的技术。张锋、胚胎编辑、George Church等热词让CRISPR在2015年“屡次刷屏”。  笔者从去年开始关注CRISPR技术,

一波新的CRISPR工具浮出水面

  当你读到这篇文章时,又一波CRISPR工具将会浮出水面。它们将需要接受测试和优化。不过,如果你询问开发者你在开展概念验证研究时是否应当试用它们时,你将仅获得鼓励。毕竟,迄今为止它们还不能从Addgene公司获得,但是将会很快上市了。  最新发布的一系列CRISPR工具包括新的谱系追踪方法,该方法

2019年8月CRISPR/Cas最新研究进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片

CRISPR关键专利判归张锋团队

   2月16日,美国专利及商标局传来重磅消息——该部门宣布,隶属于哈佛大学与麻省理工学院的Broad研究所继续保有2014年获批的CRISPR-Cas9应用专利,也让这项革命性基因编辑工具的专利之争大体尘埃落定。三行文字,决定了这项专利的归属(图片来源:STAT)  毫无疑问,CRISPR-Cas

专家指路:如何追上CRISPR技术快速发展的脚步?

  每个月都有一大波新的CRISPR工具来袭。比如,Cas9抑制剂的出现可在各种场景下防止脱靶效应。人们也将CRISPR-Cas9系统与前沿的单细胞测序技术相结合,开发出新的策略。与此同时,研究人员开发出Cas9以外的效应物核酸酶,比如C2c2,靶向RNA以实现编辑和成像应用。  对于这些热门的技术

CRISPR-Cas9蛋白提高基因编辑技术精准度

  由香港城市大学(香港城大)和瑞典卡罗琳医学院合组的一支研究团队,最近成功研发出一种新的蛋白质,有助提高基因组编辑过程中定位的精准度,相信对未来要求高精准度的人类基因治疗可发挥重要作用。  CRISPR-Cas9(成簇、规律、间隔、短回文的重複序列及其相关蛋白9)是一种具有广泛应用前景的基因编辑技

韩春雨:正实验研究论文结果无法重复原因

  一年前,英国《自然生物技术》杂志刊载了一篇有关“基因编辑工具”的论文。论文的负责人“一鸣惊人”,得到了学界和媒体给予的无限荣光。  在《自然》杂志社的所属期刊上发表论文,通常表明,该科研成果走在了世界科学研究的最前沿,并有可能对未来科学的发展起到关键性作用。  发表论文通讯作者韩春雨,来自河北科

Cell发布CRISPR/Cas9重要研究成果

  来自东京大学、麻省理工学院与哈佛大学Broad研究所的研究人员,在新研究中揭示出了新凶手弗朗西丝菌Cas9(FnCas9)的结构,并利用这一结构信息对FnCas9进行改造构建出了一个变异体。研究成果发布在2月25日的《细胞》(Cell)杂志上。  京东大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nu

CRISPR先驱Nature解析新一代CRISPR系统

  在4月20日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中,科学家们描绘了一种新型细菌CRISPR-Cpf1系统的分子细节,这为实现其他的基因编辑应用,如平行靶向多个基因打开了可能的途径。  领导这一研究的任职于德国马克思普朗克感染生物学研究所和瑞典于默奥大学的Emmanuelle Charp

年终盘点:2016年国内不容错过的重磅生物研究

  时间总是过得很快,2016年马上就要过去了,迎接我们的将是崭新的2017年,2016年,我国有很多优秀科研机构的科学家们都做出了意义重大、影响深远的研究成果,发表在国际顶级期刊上。本文中小编盘点了2016年我国科学家发表的一些重磅级研究,以饕读者。   --结构生物学 --  1.清华大学 施一

基因编辑CRISPR专利全球竞争激烈,中美占据主导地位

  基因编辑被誉为21世纪最伟大的生物医学突破技术之一,人们对该技术在癌症、遗传病等领域的未来潜力给予了厚望。今日,北京大学魏文胜课题组在顶尖学术期刊Nature Biotechnology上发布一种名为“LEAPER”的全新的RNA编辑技术,引发了各界关注。  如今,全世界范围内已经授予了数百项C

CRISPR专利全球竞争激烈,中美占据主导地位

  基因编辑被誉为21世纪最伟大的生物医学突破技术之一,人们对该技术在癌症、遗传病等领域的未来潜力给予了厚望。今日,北京大学魏文胜课题组在顶尖学术期刊Nature Biotechnology上发布一种名为“LEAPER”的全新的RNA编辑技术,引发了各界关注。  如今,全世界范围内已经授予了数百项C

The Scientist Magazine评出2015年生命科学领域创新产品Top 10

  分析测试百科网讯 近日,The Scientist Magazine评选出了2015年度生命科学领域十大创新产品,包含了7个基因组学、1个蛋白组学和2个代谢组学进入该名单。该奖项旨在表彰对科学和医学领域产生巨大影响的

外企在华申请“基因魔剪”专利会动谁的奶酪?

  “基因魔剪”CRISPR-Cas9技术的专利之争又有了新进展。美国时间和瑞士时间当地6月19日,Intellia Therapeutics和CRISPR Therapeutics两家公司相继发布消息称,其已经获得中国国家知识产权局授予的在CRISPR基因编辑技术上的专利。  “这项专利目前已经审

马涵慧博士再发CRISPR研究成果

  最近在《Journal of Cell Biology》发表的一项研究中,美国麻省大学医学院的科学家,揭示了“CRISPR-Cas9机器在活细胞内如何运作”的重要新细节,对于开发使用强大基因编辑工具的治疗方法,具有重要的意义。  本文通讯作者、生物化学与分子药理学教授Thoru Pederson

《自然》年度十大人物 生命科学成果斐然,邓宏魁教授入选

  本周,《自然》发布了“2019年度十大人物”。和历年一样,这份榜单评选的是这一年里在科学领域有重要影响的10个人。今年,生物医学相关领域共有5位科学家入选。如《自然》对这份名单的介绍所说,“他们可能已经取得了惊人的发现,或是引起了人们对重要问题的关注,甚至因为有争议的行为而声名狼藉”。  DNA

中科院团队解析新一代CRISPR系统

  CRISPR是规律成簇的间隔短回文重复(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)的缩写。CRISPR与内切酶Cas9是一对好基友,细菌依靠它们组成的防御系统对抗外来侵略者。CRISPR-Cas9能够在引导RNA的指引下,

浙江大学Nature子刊聚焦CRISPR–Cas的抑制系统

  来自浙江大学生命科学研究院的研究人员揭示出了,噬菌体蛋白AcrF3抑制Cas3的结构基础。他们的研究结果发布在7月25日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。  浙江大学生命科学研究院的朱永群(Yongqun Zh

The Scientist:2015年度十大创新产品

  The Scientist杂志终于揭晓了2015年的十大创新产品,评出了对科研和医学领域影响较大的测序仪、试剂盒、基因组编辑产品和其他技术。  值得注意的是,在高科技大行其道的时代一个增强版的传统技术强势逆袭:光学显微镜3D Cell Explorer不需要标记就可以揭示活细胞中的显著细节。此外

基因编辑从实验室到临床的突破,一场与时间的赛跑

  CRISPR在生物医疗领域抛头露面至今不过数年,就已经凭借着它在基因编辑中的灵巧身手名利双收:有人称它“基因魔剪”,有人称它“上帝之手”;更重要的是它对资本的巨大吸引力,加速了这把小剪刀的临床转化。  这几天有家名叫Editas Medicine的公司频频见诸中外各大医疗、财经媒体,它是CRIS

新型冠状病毒2019-nCoV/COVID-19最新研究进展(第3期)

  自2019年12月8日以来,中国湖北省武汉市报告了几例病因不明的肺炎。大多数患者在当地的华南海鲜批发市场工作或附近居住。在这种肺炎的早期阶段,严重的急性呼吸道感染症状出现了,一些患者迅速发展为急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)

1篇Nature、1项医学大奖!大神张锋又开挂了……

  5位CRISPR科学家包揽“大奖”  8月15日,美国最著名的医学大奖—— Albany Medical Center Prize in Medicine and Biomedical Research 的2017年获奖名单揭晓。包括张锋、Jennifer Doudna、Emmanuelle C

华人先锋《Nature Methods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱

  斯坦福大学亓磊(Lei Stanley Qi)教授早年毕业于清华大学,现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授,近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展,比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术,改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式(由此入选了生

Science发布创新性CRISPR/Cas9技术

  利用一种脱氨酶将单核苷酸改变导入DNA中,研究人员创建了一种改进的CRISPR/Cas9工具,它能够避免生成有害的双链断裂,减少采用CRISPR/Cas9技术可能引入的附加突变,且不需要添加DNA模板。这项发布在8月4日《科学》(Science)杂志上的新研究工作,是第二次报道这样的精确基因编辑

不容错过!2019年8月Nature子刊重磅研究一览!

  本文中小编为大家盘点了2019年8月Nature子刊的亮点研究,分享给大家一起学习进步,希望读者朋友们喜欢。  【1】Nat Commun:重复精液暴露促进宿主对HIV感染产生抵抗力,只是谁敢尝试呢?  DOI:10.1038/s41467-019-11814-5  长期以来,人们认为精液仅能作

2016(第三届)基因编辑研讨会在沪圆满闭幕

  2016年6月18日,由生物谷主办的“2016(第三届)基因编辑研讨会”在上海交通大学浩然高科技大厦圆满闭幕。来自不同高校和研究院所的专家学者齐聚一堂,对基因编辑技术的过去,现在和未来进行了深入的探讨,为参会嘉宾对整个领域的深入了解以及科研工作提供了更多的思路。  最初作为自然界细菌防御系统的C

华中农大:利用I型及III型CRISPR-Cas系统实现基因组编辑

  CRISPR-Cas系统广泛存在于细菌和古细菌中,近年来科学家们针对它们的分子机制开展研究促使开发出了基于II型系统的一些基因编辑技术(延伸阅读:中科院Cell发表CRISPR-Cas研究新成果 )。然而,却未有研究报道利用I型及III型系统来实现基因组编辑。  来自华中农业大学的研究人员报告称