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刘小乐教授:CRISPR高通量筛选的新算法

高通量的CRISPR筛选,已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日,华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualization of CRISPR screens with MAGeCK-VISPR”的学术研究论文,为CRISPR筛选提出了一套综合质控(QC)、分析和可视化的工作流程——MAGeCK-VISPR。 CRISPR/Cas9系统是一种强大的遗传工程技术,可让我们以一种经济合算的方式,在大多数模式生物中直接修饰基因组位点。基于这一系统,最近开发的高通量CRISPR筛选技术,已经在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力,从而让研究人员能够系统地识别与各种表型相关的基因。CRISPR筛选,既可以通过用CRISPR/Cas9的直接基因敲除进行,也......阅读全文

药物高通量筛选技术的研究

  药物高通量筛选技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。   ■发展中的高通量筛选技术   高通量筛选的组合模式。近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基

高通量药物筛选的含义及其在我国的发展趋势

高通量筛选的含义近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术(High throughput screening, HTS),该技术将化学、基因组研究、生物信息,以及自动化仪器等先进技术,有机组合成一个高程序、高自动化的新模式,从而创造了发现新药的新程序。由于该技术具有

高通量药物筛选的含义及其在中国的发展趋势

高通量筛选的含义  近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术(High throughput screening, HTS),该技术将化学、基因组研究、生物信息,以及自动化仪器等先进技术,有机组合成一个高程序、高自动化的新模式,从而创造了发现新药的新程序。由于该技术

药物高通量筛选技术的研究进展

药物高通量筛选技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。■发展中的高通量筛选技术高通量筛选的组合模式。近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、生物信息,以及自动化仪器

高通量筛选技术简要综述

  药物高通量筛选(HTS)技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。  发展中的高通量筛选技术  高通量筛选的组合模式近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、生物信

药物高通量筛选技术的研究进展

  药物高通量筛选技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。   ■发展中的高通量筛选技术   高通量筛选的组合模式。近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、

PKI在蓉建客户体验中心:欲穷千里目,更上一层楼

四川大学分析仪器研究中心 段忆翔教授   四川大学分析仪器研究中心的段忆翔教授做了题为《等离子体技术在分析化学及相关领域的应用》的报告。等离子体是物质的第4态,这是一个典型的氧等离子体,雷电中也会产生等离子体。在分析化学中,等离子体可以做发射光谱、吸收光谱、电离源、荧光光谱、微等

药物高通量筛选技术

药物高通量筛选技术简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识。一.概念高通量筛选(High throughputscreening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数

非接触式纳升级声波移液平台—ATS的应用案例

ATS诞生于专注技术研发,低调的美国公司EDC,并很快地被GSK,Novartis,Merck, Pfizer 等公司采用。Broad Institute和美国伯克利国家重点实验室也在文章中标注采用ATS进行基于定量PCR 的高通量药物筛选和高通量质谱分析实验。ATS到底是怎样一个技术? 

方群:在微流控领域掌握自主知识产权

  研究工作2:高通量进样和分析筛选  方教授研究组的另一个方向,是做高通量低消耗的分析和筛选,这对于大规模筛选领域非常有意义。在许多筛选领域(如药物筛选),样品量很少,一些生化试剂也非常贵,减少耗样量、提高通量将大大降低筛选成本。比如现在的生物学研究很多依赖于筛选实验,筛选规模量级是上千

Nature:用二维码构建“DNA编码库”

  麻省沃尔瑟姆市(Waltham, Massachusetts)的一座钢筋混泥土建筑的二楼,一个实验室冰箱里的塑料盒中,包含着无数种化学分子。这些分子是葛兰素史克制药公司(GlaxoSmithKline,GSK)合成的带DNA标签的分子,数目达到万亿种——这是银河系恒星数目的10倍。  各大制药公

生物芯片技术在药物R&D中的应用(三)

2 生物芯片作为超高通量筛选平台的应用  在过去的十几年里,随着科学的进步以及在巨大的经济利益驱使下,药物筛选技术得到了飞速的发展。在80年代中期(高通量筛选形成之初),每天只能筛选30种化合物,到90年代中期,每天可筛选1,500种化合物,而如今每天可筛选超过 100,000个化合物。高速

新药研发成功率降低,高内涵筛选能否力挽狂澜?

  研究人员认为,结合机器学习算法的高内涵筛选将广泛用于药物的研发。  上个世纪80年代,科研人员开发出了高通量筛选(high throughput screening),这是一种能对大量化合物样品进行药理活性评价分析的技术。在过去的几十年里,高通量筛选曾在新药的研发中发挥了重要的作用。  但在最近

强磁场中心建成高通量药物筛选和测试技术平台

  近日,由中国科学院强磁场科学中心刘青松研究员课题组承担的中科院合肥物质科学研究院“一三五”战略规划重点支持项目——高通量药物筛选和测试技术平台一期建设初步完成,进入实用阶段。该平台是目前安徽省内少数高水平的高通量药物筛选测试技术平台,也是国内少数以组合药物筛选为主要任务的应用平台,它的建成使用将

吉凯基因中药功能基因研究方案(肿瘤方向)

  季博心中有个结,当年在复旦工作的时候,帮一位临床医生看课题,结局是拿了两个国自然面上。这个结局很好吗?如果好,就不是季博心中的结了。因为,由于实验技术的限制,没能有5分以上的文章。   在做科研中,有两个事情,一个是提出科学问题后,我知道怎么去做。另一个是,我怎么做到。“知道”和“做到”。其实

基因中药功能基因研究方案(肿瘤方向)

我想做中药研究,你能帮我做什么季博心中有个结,当年在复旦工作的时候,帮一位临床医生看课题,结局是拿了两个国自然面上。这个结局很好吗?如果好,就不是季博心中的结了。因为,由于实验技术的限制,没能有5分以上的文章。在做科研中,有两个事情,一个是提出科学问题后,我知道怎么去做。另一个是,我怎么做到。“知道

SLAS 2013分会:从药物筛选到新药研发

  实验室自动化与筛选协会2013亚洲会展于2013年6月6日在上海金茂君悦大酒店盛大开幕,国内外知名药企、生物医学研究专家、学者等应邀参会。当日下午A厅举办“从药物筛选到新药研发”分论坛会议,由罗氏公司首席科学家Joergen Nielsen博士、颜士翔博士、Marcie Glick

基因检测行业调研(包含企业梳理、行业监管)

  一、基因检测公司梳理  目前全国涉及基因检测概念的公司有200余家,按照业务范围划分,这些公司可以分为:①最上游的基因检测仪器开发企业(测序仪、芯片扫描仪、PCR设备),②提供样本处理试剂和耗材的中上游企业(建库试剂盒、检测试剂盒、工具酶、基因芯片),③提供第三方基因检测服务的中游企业

高通量彗星实验箱COMPAC-50的应用和优势

  高通量彗星实验箱COMPAC-50---成就更好的彗星实验   单细胞凝胶电泳(彗星实验)作为评估DNA损伤的实验方法一直受到广泛关注。从传统的院校和科研机构,到相关的医药企业,越来越多的研究者表现了对彗星实验浓厚的兴趣。例如制药企业中遗传毒性药物的筛选等。   Figure 1 碱性彗星实

高通量彗星实验箱COMPAC-50的应用和优势

单细胞凝胶电泳(彗星实验)作为评估DNA损伤的实验方法一直受到广泛关注。从传统的院校和科研机构,到相关的医药企业,越来越多的研究者表现了对彗星实验浓厚的兴趣。例如制药企业中遗传毒性药物的筛选等。Figure 1 碱性彗星实验流程图 任何方式的彗星实验,都要经历以上几个实验步骤。然而,样品通量低、操作

实验室自动化与筛选协会2013亚洲会展分论坛简介

分论坛1a:通过筛选获得崭新生物学作用机制和疾病靶点   联合主席:   赵强博士,高级总监,中美冠科生物技术有限公司,江苏太仓   张立新博士,病原微生物与免疫学重点学重点实验室副主任,中国科学院微生物研究所   分论坛简介:   本分会涉及的内容为新型生物机制和疾病靶标的发现

微生物所提出1-脱氧野尻霉素高通量筛选方法

  小分子化合物的高通量筛选技术对优化小分子的生物合成途径研究十分重要。合成途径中关键酶的活性及相关酶表达通量的均衡性等因素均可能影响目标产物的产量,一项设计巧妙的高通量筛选方法可以为优化或解决这些瓶颈提供极大助益。  1-脱氧野尻霉素(1-DNJ)是一种多羟基哌啶类生物碱,具有葡萄糖类似结构,可以

第二代高通量药物筛选平台更容易发现磷脂酰肌醇信号...

第二代高通量药物筛选平台更容易发现磷脂酰肌醇信号通路低亲合力抑制剂EJ Dell1, JL Tardieu2, F. Degorce2, Michael Fejtl11 BMG LABTECH Inc. NC, USA edward.dell@bmglabtech.com2 Cisbio Bioas

DNA编码化合物库技术在化合物筛选上的作用

  伴随着组合化学技术的发展,出现了成千上万的化合物,为大规模的药物筛选创造了物质基础。为了进行高效、高速、低成本的化合物筛选,最大限度地发现药物,高通量筛选技术应运而生并快速发展起来。在药物发现领域,DNA编码化合物库是一项可以在上亿化合物中进行化合物筛选,发现先导化合物以支持新药发现的前沿技术。

DNA编码化合物库技术在化合物筛选上的作用

  伴随着组合化学技术的发展,出现了成千上万的化合物,为大规模的药物筛选创造了物质基础。为了进行高效、高速、低成本的化合物筛选,最大限度地发现药物,高通量筛选技术应运而生并快速发展起来。在药物发现领域,DNA编码化合物库是一项可以在上亿化合物中进行化合物筛选,发现先导化合物以支持新药发现的前沿技术。

首届微纳流细胞分析学术报告会在北京圆满落幕

  分析测试百科网讯 2018年9月25-26日,首届微纳流细胞分析学术报告会在北京圆满落幕。(相关报道:关注细胞分析!首届微纳流细胞分析学术报告会京召开)本次会议,受邀的百余位业内专家学者交流与探讨了微流控及细胞研究领域的最新研究成果,分析测试百科网作为支持媒体做现场报道。会议现场清华大学副教授

布鲁克经营之道:科学家和科学家间的交流

  ——专访布鲁克.道尔顿亚太区高级副总裁Rohan Thakur  这家创办于1960年的德国企业一直对科学和极限产品保持激情,从享誉全球的核磁共振到分辨率达到千万级的FT-ICR离子回旋共振质谱。BCEIA 2015在布鲁克公司的新品发布会上,分析测试百科网记者采访了布鲁克.

C100HT:助力生物制药研发中细胞培养条件优化和克隆筛选

  一个生物药的诞生,从发现/筛选到商品化需要很长时间,其中靶标发现和验证靶标消耗的时间就需要几周。最近,SCIEX在其2018年年会期间推出一款颠覆传统筛选方法的新型生物制品分析仪C100HT,它将为生物药的研发带来哪些变革?  分析测试百科网近期采访到SCIEX CE&Biopharm部

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(一)

Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M.

SLAS 2014年四月研讨会在京举行

  2014年4月23日,实验室自动化与筛选协会(SLAS)2014系列研讨会在中国科学院微生物研究所举行,该会议与各地学术机构合作已研讨会的形式在多个城市开展,旨在让更多的研究人员和技术人员受益,为其进一步的研究与交流打下良好的基础,同时满足制药企业,CRO以及学术机构对人员教