张辰宇教授权威期刊连发miRNA及RNAi研究新成果
南京大学的张辰宇(Chen-Yu Zhang)主要从事microRNA、线粒体功能和人体及细胞能量代谢研究。近年来因发布了多项有关miRNA的惊人研究成果而广受关注。迄今已在包括Cell, Nature, Science及其子刊(~22篇)在内的国际学术期刊上发表论文约150余篇。 本月,张辰宇教授课题组分别在miRNA及RNAi研究中取得突破性成果,两篇研究论文发布在《Scientific Reports》及《Biomarkers》杂志上。 Targeted exosome-mediated delivery of opioid receptor Mu siRNA for the treatment of morphine relapse. 在这篇文章中,研究人员称他们利用定向外泌体(exosome)介导传递阿片受体Mu siRNA治疗了吗啡复吸。 RNA干扰(RNAi)是指通过降解靶RNA或是阻止其翻译来介导引......阅读全文
RNAi热点文章:一个miRNA的形成
《The Scientist》杂志将一篇2004年介绍miRNAs的文章评选为上周RNAi领域热点文章(hotpaper)。原文 X. Cai et al., “Human microRNAs are processed from capped, polyadenylated transcrip
张辰宇教授权威期刊连发miRNA及RNAi研究新成果
南京大学的张辰宇(Chen-Yu Zhang)主要从事microRNA、线粒体功能和人体及细胞能量代谢研究。近年来因发布了多项有关miRNA的惊人研究成果而广受关注。迄今已在包括Cell, Nature, Science及其子刊(~22篇)在内的国际学术期刊上发表论文约150余篇。 本月,张辰
miRNA-mimics-miRNA-inhibitor
miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已经成功应用于沉默预期靶
RNAi
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果是二者都同样
miRNA海绵—长效抑制miRNA
miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困
miRNA海绵—长效抑制miRNA
随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么
RNA实验方案和应用(二)
miRNA 模拟物是化学合成的,双链RNA分子(通常长度为18–24个核苷酸),通过转染到细胞中,模拟成熟的内源性miRNA分子。miRNA抑制剂是单链(通常长度为21–25个核苷酸),经过修饰的RNA分子,通过转染到细胞中,特异性的抑制miRNA的功能。模拟物和抑制剂包含一些化学修饰,以便提高活性
RNAi-protocol
siRNA protocolsOur current strategy with siRNA is to synthesis relatively small amounts enzymatically and use these to test for efficiency by western
RNAi技术
DNA芯片检测siRNA专一性 长片断的双链RNA (dsRNA) 导入例如植物,真菌,果蝇,线虫等生物的细胞中会引发同源mRNA的降解——这就是所谓的RNA interference (RNAi)。RNAi分两个步骤,首先是长片断双链dsRNAs被核酶Dicer切割成21—25个碱基的sm
RNAi总结
RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。过去几年中,科研工作者已明确转录后基因沉默现象普遍存在于动、植物中,在机体防御病毒入侵和转座子沉默效应中起着重要作用。近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义
miRNA和siRNA的基本介绍及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是
miRNA和siRNA简介及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室
miRNA研究
一、miRNA研究的基本问题和研究方法二、miRNA研究的综合解决方案1. miRNA微阵列芯片服务Agilent miRNA 芯片(21.0) Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA测序服务 miRNA-seq文库构建流程 miRNA测序数据分析流程3. miRNA R
内蒙古大学哈达组:miRNA在大豆感染SMV病毒中的作用
植物通过几种不同的防御机制保护自己免受病毒感染。RNA干扰(RNAi)是一个突出的抗病毒机制,需要AGO(Argonaute)和Dicer / DCL(Dicer-like)蛋白的参与。效应物触发免疫(ETI)是由抗性(R)基因介导的抗病毒机制,其中大部分编码NBS-LRR家族蛋白。microR
RNAi相关术语
1.RNAi :(RNA interference)RNA干扰一些小的双链RNA可以高效、特异的阻断体内特定基因表达,促使mRNA降解,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型,称为RNA干扰(RNA interference,RNAi ,也译作RNA干预或者干涉)。它也是体内抵御外在感染的一种重要保护机制
RNAi-实验介绍
1. RNAi 介绍RNA 干扰(RNAi:RNA interference)是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello(1)在线虫实验中发现的,2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导。这个方法与常规方
RNAi的特征
①RNAi是转录后水平的基因沉默机制;②RNAi具有很高的特异性,只降解与之序列相应的单个内源基因的mRNA;③RNAi抑制基因表达具有很高的效率,表型可以达到缺失突变体表型的程度,而且相对很少量的dsRNA分子(数量远远少于内源mRNA的数量)就能完全抑制相应基因的表达,是以催化放大的方式进行的;
RNAi的功能
1.高通量的研究基因功能在后基因组时代,需要大规模高通量的研究基因的功能,由于RNAi能高效特异的阻断基因的表达,因而RNAi成为研究基因功能的很好的工具。研究者将线虫三号染色体上2232个基因对应的dsRNA合成出来,并注射到线虫性腺内,然后观察子代细胞分裂时出现的异常表型,结果发现了133个基因
RNAi-实验介绍
1. RNAi 介绍 RNA 干扰(RNAi:RNA interference)是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello(1)在线虫实验中发现的,2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导
生命科学研究中常见模式生物简介(二)
2.3 斑马鱼的特殊优势斑马鱼能够成为模式生物,也有这它本身独特的优势。在生物学上,斑马鱼体外受精,胚胎在体外发育并且透明,易于观察和操作,受精卵直径约1mm,便于进行显微注射和细胞移植。在技术上,斑马鱼可以像线虫和果蝇一样,进行细胞标记和细胞谱系跟踪,也可以像爪蟾一样进行胚胎的细胞移植。在基因水平
RNAi相关的名词解释[英文]
Argonaute - A family of proteins containing multiple domains and involved in RNA interference (RNAi). Argonatue is the main component of RNAi effector
上海生科院发明一种高效安全的新型RNAi载体
10月12日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)吴立刚研究组的最新研究成果:Ribozyme-enhanced single-stranded Ago2-processed inter
miRNA--克隆实验
实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达,还有一部分则起着调控基因表达的作用。实验材料 寡核
miRNA克隆实验
在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达,还有一部分则起着调控基因表达的作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主
miRNA克隆实验
实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外,还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA(noncoding RNA,ncRNA),非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用,如 rRNA 和 tRNA 维持着基因
吴立刚课题组Nature子刊发布RNAi新工具
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称,他们设计出了一种替代性的小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)前体,将之命名为saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
Nature发布miRNA重要发现:脂肪细胞的miRNA信号
脂肪细胞并不简单,Joslin糖尿病中心的科学家发现这种细胞并不只是静静的待在我们身体中,而且能释放出激素和其它信号蛋白,影响多种组织,其中一种竟然是miRNA。利用脂肪细胞研发基因治疗方法,也许能用于治疗肝脏或其它器官的代谢疾病,还有癌症等。 这一研究成果公布在2月15日的Nature杂志上
RNAi技术的应用
5 RNAi技术的应用5.1 功能基因组和遗传学应用随着各种模式生物和人类基因组测序的完成,基因功能的研究远远落后于大量序列所提供的信息,研究和发现基因功能成为越来越紧迫的任务。长期以来,破坏基因结构或抑制基因表达是研究基因功能的重要方法,如常用的基因敲除技术( gene knock out) 。基
RNAi表达载体构建
近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够
RNAi的生物特性
RNAi抑制转座子活性两方面的证据提示转座子活性的抑制与siRNA有关① 发现蠕虫mut-7 基因参与RNAi 并且与转座子的转座抑制有关;② 在果蝇中,参与RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突变将导致该基因引起的基因沉默的缺失,同时提高了反转录转座子活性。RNAi抵御病毒感染在拟南