大连化物所生物分子模拟理论方法研究取得系列进展
随着生物大分子实验技术的飞速发展,越来越巨大和复杂的分子体系被发现和鉴定出来,凸显了生物分子体系本身特有的多尺度特性,而分子动力学模拟作为生物分子功能解析的强有力工具和研究手段,已经必不可少。但是由于这些体系包含的原子数目巨大,从几千到上百万,行使功能所涉及到的时间尺度从皮秒到毫秒,解析他们行使功能的分子机制和微观机理非常困难。 现有的全原子分子模拟研究手段和方法还无法对这样的体系进行高精度和长时间动力学模拟。自2009年以来,中国科学院大连化学物理研究所分子模拟与设计研究组着眼于上述问题,针对生物体系自身独有的多尺度特性,开展了多精度分子模型的建立和动力学模拟方法发展。 通过巧妙结合全原子可极化分子力场的高精度与粗粒化和刚体动力学模拟的计算速度快两大优势,该研究组创新性地提出和发展了可描述非球形粒子之间广义范德华相互作用的Gay-Berne势、可高精度描述粒子之间静电相互作用的多极距展开势EMP、新型高精度粗粒化分子......阅读全文
台式冷冻水平转子离心机分离生物大分子概述
大多数分析和小规模制备生物大分子首选是台式冷冻水平转子离心机,它能产生强大的离心力,生物大分子在水平转子的离心管中有较长的沉降路径,壁效应较小,可使生物大分子获得精确分离。为获得最佳分辨率,样品体积不应超过梯度体积的3%,梯度上的样品区带应该非常窄。离心管尺寸和转速不同,分离效果不同。小剂量样品可用
高速离心机在分离生物大分子方面的应用
生物大分子蛋白质、核酸等,多糖等。他们都是生物形态结构和功能,最重要的物质基础,其分子大、分子结构复杂、分子被包括在生命活动的基本信息。近年来,分子生物学研究的理论与实践的快速发展。特别是在功能基因组学、蛋白质组学的研究揭示了生命的本质的现象在发挥了积极作用,在前所未有的。诚然,这些研究应该
用于生物大分子药物递送的仿生纳米递释系统
用于生物大分子药物递送的仿生纳米递释系统● 项目简介:生物大分子药物主要包括蛋白质、多肽、抗体、疫苗与核酸等,在重大疾病防治中发挥极其重要的作用,是21世纪药物研发最具前景而又竞争激烈的领域之一。欧洲、美国、日本等发达国家均把生物大分子药物列为药物研发的重点。我国中长期科技发展规划纲要已将“蛋白质药
台式冷冻水平转子离心机分离生物大分子概述
大多数分析和小规模制备生物大分子是台式冷冻水平转子离心机,它能产生强大的离心力,生物大分子在水平转子的离心管中有较长的沉降路径,壁效应较小,可使生物大分子获得分离。为获得最佳分辨率,样品体积不应超过梯度体积的3%,梯度上的样品区带应该非常窄。离心管尺寸和转速不同,分离效果不同。小剂量样品可用细长型离
高速大容量冷冻离心机分离生物大分子概述
生物大分子包括核酸、蛋白质和多糖等,它们是一切生物机体形态和功能发挥最重要的物质基础,其分子量巨大、分子结构复杂,分子中包含有生命活动的基本信息。近年来分子生物学研究的理论和实践飞速发展,特别是功能基因组学和蛋白质组学的研究在揭示生命现象本质中发挥着的作用。这些研究首先要从动、植物组织或生物组织中获
解析生物大分子结构与功能的密切关系
生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。蛋白质分子的结构分4个层次,其中二
生物大分子药物新型给药系统离患者还有多远?
一、生物大分子药物及给药系统概述 大分子药物也被称为生物制品,主要包括多肽、蛋白质、抗体、聚糖与核酸药物等。近年来,全球生物制药市场发展迅速,呈现出高速增长的态势,根据 F&S 报告,全球生物药市场预计将自2017 年的 2,402 亿美元,增至 2022 年的 4,040 亿美元,复合年增长
结构复杂与功能多样的生物大分子蛋白质
蛋白质是一类结构复杂与功能多样的生物大分子,但其中普遍存在着螺旋结构。蛋白质中的α螺旋是遗传信息传递与表达和肽链进一步折叠形成不同构象的分子基础,而球蛋白和纤维蛋白中的螺旋结构是行使特定功能的分子基础。 由20种氨基酸组成的多种多样的蛋白质,具有形形色色的功能,几乎参与生命活动的所有方面并起着关
解析生物大分子结构与功能的密切关系
解析生物大分子结构与功能的密切关系 生物大分子的多种多样功能与它们特定的结构有密切关系。蛋白质的主要功能有催化、运输和贮存、机械支持、运动、免疫防护、接受和传递信息、调节代谢和基因表达等。由于结构分析技术的进展,使人们能在分子水平上深入研究它们的各种功能。酶的催化原理的研究是这方面突出的例子。
台式超高速大容量离心机测定生物大分子分子量
台式超高速大容量离心机的一主要用途是测定生物大分子分子量。在研究过程中不需要已知分子量样品作实验参考标准,也不用知道样品分子的形状和水合状况,因此,用台式超高速大容量离心法测定的分子量是分子量。由于台式超高速大容量离心机的转速范围宽,可以研究小到蔗糖分子,大到病毒颗粒的分子量。对于多分散性样
台式超高速大容量离心机测定生物大分子分子量
台式超高速大容量离心机的一主要用途是测定生物大分子分子量。在研究过程中不需要已知分子量样品作实验参考标准,也不用知道样品分子的形状和水合状况,因此,用台式超高速大容量离心法测定的分子量是绝对分子量。由于台式超高速大容量离心机的转速范围宽,可以研究小到蔗糖分子,大到病毒颗粒的分子量。对于多分散性样
台式超高速大容量离心机测定生物大分子分子量
台式超高速大容量离心机的一主要用途是测定生物大分子分子量。在研究过程中不需要已知分子量样品作实验参考标准,也不用知道样品分子的形状和水合状况,因此,用台式超高速大容量离心法测定的分子量是分子量。由于台式超高速大容量离心机的转速范围宽,可以研究小到蔗糖分子,大到病毒颗粒的分子量。对于多分散性样品,还可
PCR技术、分子杂交、基因测序、核酸质谱、生物芯片5大分子...
PCR技术、分子杂交、基因测序、核酸质谱、生物芯片5大分子诊断技术解析据相关行业调研数据,截至日前,新型冠状病毒核酸检测试剂盒研发企业已超过120家,底层技术应用原理大都是以基因扩增技术打底。而这背后所折射出来的,其实就是分子诊断技术大家族。未来3-5年IVD行业最具发展潜力的产品线是什么?答案无疑
大分子物质的水解试验
实验概要证明不同的微生物对复杂有机大分子的水解能力不同,从而说明不同的微生物有不同的酶系统。实验原理细菌对大分子的淀粉、蛋白质和脂肪不能直接利用,必须靠产生的胞外酶,如淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶将大分子物质分解。胞外酶能分泌扩散到细胞外,将物质分解成小单位如糖、氨基酸、甘油与脂肪酸。这些小单位的物质能被
大分子相互作用仪
大分子相互作用仪。又称光学表面等离子共振生物分析仪。BIACORE是基于表面等离子共振(surface Plasmon resonance, SPR)开发的新型生物分析传感技术。该技术的3个核心部分是传感器芯片,SPR光学检测系统和微射流卡盘。实验时,现将一种生物分子固定在传感器的葡聚糖表面,将
大分子相互作用仪
大分子相互作用仪。又称光学表面等离子共振生物分析仪。BIACORE是基于表面等离子共振(surface Plasmon resonance, SPR)开发的新型生物分析传感技术。该技术的3个核心部分是传感器芯片,SPR光学检测系统和微射流卡盘。实验时,现将一种生物分子固定在传感器的葡聚糖表面,将
大分子物质的水解实验
实验方法原理 水解过程可通过底物的变化来证明,如细菌水解淀粉的区域,用碘测定不再产生蓝色;水解明胶可观察到明胶被液化;脂肪水解后产生脂肪酸改变培养基的pH,其中的中性红指示剂使培养基从淡红色变为深红色。实验材料 金黄色葡萄球菌枯草芽孢杆菌大肠杆菌绿脓杆菌试剂、试剂盒 油脂培养基淀粉培养基明胶培养基卢
大分子物质的水解实验
实验方法原理水解过程可通过底物的变化来证明,如细菌水解淀粉的区域,用碘测定不再产生蓝色;水解明胶可观察到明胶被液化;脂肪水解后产生脂肪酸改变培养基的pH,其中的中性红指示剂使培养基从淡红色变为深红色。实验材料金黄色葡萄球菌枯草芽孢杆菌大肠杆菌绿脓杆菌试剂、试剂盒油脂培养基淀粉培养基明胶培养基卢戈氏碘
生物大分子国家重点实验室召开PI学术讲座
为增进学术交流,12月23日下午,杭海英研究员在9501会议室作了题为“Why study in vitro evolution”的学术报告。报告由王江云研究员主持,孙命、张凯、朱平、梁伟、毕利军、刘迎芳、刘平生、苗龙、江涛、柯莎等参加了这次学术报告。 在报告中,杭海英研究员介绍了他回
生物大分子重点实验室2009年度课题申请
生物大分子国家重点实验室2009年度开放课题申请指南 根据国家科技部《国家重点实验室专项经费管理办法》和《生物大分子国家重点实验室开放课题管理办法》的有关规定,生物大分子国家重点实验室现公开发布2009年度开放课题申请指南。 一、指南内容 实验室开放课题应紧密围绕实验室重点研究方向,
AFM生物大分子的结构及其他性质的观测研究应用
生物大分子的结构及其他性质的观测研究1 蛋白质对于蛋白质,AFM的出现极大的推动了其研究进展。AFM可以观察一些常见的蛋白质,诸如白蛋白,血红蛋白,胰岛素及分子马达和噬菌调理素吸附在图同固体界面上的行为,对于了解生物相溶性,体外细胞的生长,蛋白质的纯化,膜中毒有很大帮助。例如,Dufrene 等利用
层析纯化病毒、病毒样颗粒等生物大分子的瓶颈问题
层析纯化病毒、病毒样颗粒等生物大分子的瓶颈问题随着病毒、病毒样颗粒在疫苗、肿瘤治疗、免疫治疗中的地位越来越重要,这类复杂生物大分子的分离纯化需求也逐渐增加。然而传统填料由于孔径较小,蛋白质只能以扩散方式通过填料,传质速率慢,处理量低,造成分离时间长、容易失活等问题[1]。当蛋白质体积较大时,填料表面
关于分析试验中中生物大分子离心分离实验分享
仪器设备网导读:生物大分子离心分离实验以它的部分优势存在着:分别范围广,容量大;可以研讨自然生物大分子的流体动力学特性;可以在电离介质中中止生物大分子的片段分别;对缓冲剂限制很小(在电泳技术中由于电流的热效应而限制了缓冲剂的运用)等等。另外在各种实验方法的前处置阶段,离心法还是被普遍的运用着。
X射线单晶体衍射仪测定生物大分子的介绍
2001年2月12日,人类基因组框架图发表。接下来的任务是要把各基因的结构和功能搞清楚,有大量的基因结构需要测定。世界上已经成立了结构基因组的国际合作组织,分配人类基因结构的测定任务。除了人类基因以外,还有水稻基因组,各种病毒等范围更广的生物大分子结构需测定。生物大分子的数量将会远远超过各种无机
中科大教授施蕴渝:孜孜探寻生物大分子奥秘
人物名片施蕴渝:中国科学院院士,生物物理学与结构生物学家,中国科学技术大学教授、博士生导师。1942年4月生于重庆,1960年考入中科大生物物理系,自此她与生命科学结下了不解之缘。多年来,施蕴渝始终坚守在科研一线,运用结构生物学方法研究基因表达调控与细胞命运决定的分子机理,取得诸多创新性成就,为中国
检测生物大分子在细胞组织中分布的常用方法
1.PAS反应显示糖原2.福尔根反应后的DNA吸收546nm可见光特性,采用显微分光光度检测细胞中的含量3.米伦反应检测蛋白质4.苏丹Ⅲ,四氧化锇脂类显色
磁场刺激对细胞内生物大分子物质活性的影响
磁场刺激对细胞内生物大分子物质活性的影响 蛋白质和酶是构成生物体的重要成份,某些蛋白质和酶中含有微量过渡金属原(离)子,它们对蛋白质和酶功能起着关键性作用。过渡金属原(离)子存在未满壳层,为顺磁性。磁场的作用不但会对顺磁性原(离)子产生影响,还会改变含顺磁原(离)子的蛋白质和酶的结构和活性。麻海珍
生物大分子药物代谢消除途径及体外代谢研究方法进展
摘要由于理化及生物学性质的差异,生物大分子药物与传统小分子药物相比,药代动力学机制更加复杂,在体内表现出不同的吸收、分布、代谢、排泄过程。大分子药物一般不经CYP 450 酶代谢,其体内消除途径主要有肾小球滤过、酶水解、受体介导的胞吞消除和抗药物抗体介导的消除。近年来,除了常用的免疫分析法、放射性同
生物膜的分子结构模型的介绍
生物膜的主要化学成分是脂类和蛋白质,还有少量糖类。关于这些组分在膜中是如何排列和组织的、以及它们之间是如何相互作用的等问题,许多学者进行了多方面的研究,先后提出了数十种不同的生物膜分子结构模型,下面介绍公认的流动镶嵌模型。 这一模型是Singer和Nicolson在1972年提出的。流动镶嵌模
有机大分子转变为小分子的过程
化学起源学说认为:地球上的生命是在地球温度逐步下降以后,在极其漫长的时间内,由非生命物质经过极其复杂的化学过程,一步一步地演变而成的.化学起源说将生命的起源分为四个阶段:第一个阶段,从无机小分子生成有机小分子的阶段;第二个阶段,从有机小分子物质生成生物大分子物质:这一过程是在原始海洋中发生的,即氨基