单细胞研究指南:细胞分离
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。 那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这些问题曾经是单细胞研究(尤其是单细胞转录组研究)的拦路虎,令人望而却步。单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞数据分析工具在这方面为人们提供了很大的帮助。 The Scientist杂志最近联系了单细胞研究领域的一些专家,请他们分享了在单细胞中进行转录研究的秘诀。希望帮助研究者们更好地构建文库,处理和分析结果数据。 细胞分离 分离细胞是单细胞研究中最困难的步骤之一。目前的单细胞分离策略主要分为三类:手动分离、荧光激活的细胞分选和微流体技术。 在进行单细胞转录分析之前,我们需要确定自己拿到了正确的细胞。如果你想要的细胞已......阅读全文
CloneSelect单细胞分离系统用于分选基因编辑的间充质干...
CloneSelect单细胞分离系统用于分选基因编辑的间充质干细胞 图1:CloneSelect f.sight单细胞分离系统 最近发表的一篇文章(Characterization of CRISPR/Cas9 RANKL knockout mesenchymal stem cell clone
单核RNA测序的芯片现已上市
高通量的单核RNA测序方法——DroNc-Seq才刚刚在《Nature Methods》上发表。一转眼,相应的芯片已经上市。Dolomite Bio公司针对DroNc-Seq推出一款新的芯片,可实现高通量的单核RNA-Seq分析。 DroNc-Seq方法在Broad研究所的张锋(Feng
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物,比如细菌等,也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞,比如实验室培养的人体细胞等。此外,受精卵也是单细胞,属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
什么是单细胞?
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
什么是单细胞
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物,比如细菌等,也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞,比如实验室培养的人体细胞等。此外,受精卵也是单细胞,属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
单细胞的作用
在人体组织中有着令人难以置信的细胞类型、状态和相互作用的多样性。为了更好地了解这些组织和存在的细胞类型,scRNA-seq 提供了在单个细胞水平上研究表达情况的可能。scRNA-seq 可以用来:探索组织中存在哪些细胞类型识别未知/稀有细胞类型或状态阐明分化过程中或跨时间或跨状态的基因表达变化鉴定特
Anal.-Chem.-封面-|-微珠阵列芯片用于单细胞microRNA定量检测
英文原题:A Cascaded DNA Circuit in Bead Arrays for Quantitative Single-Cell MicroRNA Analysis 近日,南京大学化学化工学院许丹科教授课题组报道了一种基于级联 DNA 线路的微珠阵列芯片,用于单细胞的 micro
Dolomite微流控芯片成功用于高通量单细胞DNA/RNA测序
随着现代生物学的发展,细胞群体的研究已不再能满足科研需求。单细胞测序通过对单个细胞进行测序,解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。 2011 年,《自然方法》杂志( Nature Methods )将单细胞测序列为年
液滴微流控:单细胞高通量液滴测序(Dropseq)
细胞是生物结构与功能的基本单位,形态类型千差万别。通过细胞基因组学,可以描述细胞特性及功能,本文所介绍的单细胞(single-cell)高通量液滴测序(Drop-seq)技术,是一种快速分析成千上万个单细胞的方法,通过将每个细胞包裹在纳升级微滴中,进行RNA杂交并生成mRNA转录物,制作细胞基因表达
2017微流控微尺度分析大会报告一-六位专家分享研究成果
分析测试百科网讯 2017年9月23日,第六届国际微流控学学术论坛(沈阳)、第十一届全国微全分析系统学术会议、第六届全国微纳尺度生物分离分析学术会议在东北大学开幕(相关报道:2017微流控微尺度分析会议在沈阳开幕 14家企业支持)。中国科学院院士、长春应用化学研究所研究员汪尔康,中国科学院大连化
微流体系统帮助预测血管易堵塞程度
镰状细胞性贫血最常见的并发症之一是变形的红细胞聚集在一起阻塞细小血管,引起身体部位剧烈疼痛和肿胀。 麻省理工学院的一项新研究描述了血管闭塞性疼痛危机的细节,并且,这些“蛛丝马迹”也可以帮助患者和医护人员更好地预测危机何时何地将会发生。 “为了预测非常难以预料的疼痛危机,我们需要理解它们为什么
液滴微流体:从概念验证到实际应用?
液滴微流体技术构成了一个多样化的实用工具集,使化学和生物实验能够在高速和高效率的情况下完成。事实上,近年来,基于液滴的微流控工具在材料合成、单细胞分析、RNA测序、小分子筛选、体外诊断和组织工程等方面都取得了良好的应用效果。 来自苏黎世联邦理工学院 (ETH Zurich)的Andrew J.
单细胞基因表达分析的最新进展
将细胞培养板上的细胞放在显微镜下观察。表面上,它们都一样。实际上,它们一点都不相同。无论是DNA或RNA的水平,还是蛋白质或代谢物的水平,这些细胞相差甚远,而这些差异可能对细胞行为产生深远的影响。 多年来,研究人员一直缺乏工具,来高效拷问这些差异,不过今非昔比。有了新一代DNA测序仪和质谱仪,
张锋团队开发出高通量的单细胞RNA测序方法
去年,Broad研究所的研究人员在《Science》上发表了一种称为sNuc-Seq的单核RNA测序方法。这种方法让人们能够研究那些难以分离的单细胞中的基因表达谱。如今,Broad研究所领导的团队克服了sNuc-Seq应用的一大障碍:规模。 8月28日,研究人员在《Nature Methods
单细胞分选实现细胞在源板和目标板之间的自动转移
单细胞分选是一款全新的细胞分离设备,基于激光与物质相互作用的原理,对复杂生物样本中单细胞的逐一分离,具有可视化分选功能,所见即所得,实现单细胞图像智能识别、一键自动分选、全自动细胞收集。 细胞分选操作简单,广泛适用,为单细胞测序、未培养微生物开发、工程细胞筛选、细胞图谱绘制等研究提供完
!单细胞测序的”CPU-2.0”时代
对单个人类细胞的基因组进行准确的变异检测和大范围单倍体型分析一直以来都是测序领域的巅峰挑战。单细胞测序使我们能在更高的分辨率下研究生命的机制。一方面,在像癌症这样的组织样本中存在大量具有不同基因组类型的单个细胞,因此需要分析单细胞水平基因组而不是大量细胞的平均值;另一方面,对于非常珍贵的细胞样品
单细胞表观组学:单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项(批准号:2017YFA0103402)等资助下,北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈,开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术,可适应于不同课题研究需要,解析发育与疾
针对稀有样本——新方法提高单细胞转录组测序的效率
近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a
细胞膜的制备方法_从生长于微载体上细胞中分离细胞膜
实验材料细胞试剂、试剂盒CB仪器、耗材微型离心机临床台式离心机超离心机吊桶式转头离心管振荡器尼龙单丝网探头超声仪实验步骤1. 准备下列仪器:微型离心机临床台式离心机超离心机吊桶式转头和合适的离心管振荡器尼龙单丝网,孔径约 50 μm探头超声仪2. 将微载体培养物转移到 50 ml 的锥形离心管中。3
免疫磁珠法分离细胞原理/MACS微珠/MACS分选柱
免疫磁珠法分离细胞原理 免疫磁珠法分离细胞是基于细胞表面抗原能与连接有磁珠的特异性单抗相结合,在外加磁场中,通过抗体与磁珠相连的细胞被吸附而滞留在磁场中,无该种表面抗原的细胞由于不能与连接着磁珠的特异性单抗结合而没有磁性,不在磁场中停留,从而使细胞得以分离。二、MACS微珠(Micro
微生物所开发新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用
微生物所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明ZL和美国
林金明:微流控单细胞样品预处理与在线质谱检测
分析测试百科网讯 2019年8月31日,在第四届全国样品制备学术报告会上,清华大学化学系教授林金明带来了题为《微流控单细胞样品预处理与在线质谱检测》的报告。清华大学化学系教授 林金明 林金明介绍了一种活体单细胞原位采样及其在线质谱检测技术,基于微流控芯片的单细胞采样与原位检测质谱接口装置。利用
我国首次举办综合性国际分析科学大会ICAS-2017
ICAS 2017开幕式现场 分析测试百科网讯 2017年5月6日,由国际纯粹与应用化学联合会(IUPAC)和中国化学会(CCS)主办的2017 年国际分析科学大会(ICAS 2017)在海口召开,来自全球的分析化学科学家们千余人参加了会议。 ICAS 2017议主题为“From Tool To
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。
如何-解读-单细胞-测序
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。
Nature:单细胞测序(上)
Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序
什么是单细胞生物?
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞测序方法汇总
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整