黄牛：计算化学驱动的新药设计
黄牛个子很高。当初被戏称“拉高北生所平均身高”的他，如今也成为北生所的一颗学术新星，在计算化学和生物学的交叉领域独树一帜。 “传统的创新药物研发是通过对大量化合物进行实验筛选，找到有活性的药物先导化合物。计算化学手段则是基于物理学原理来‘虚拟筛选’出能够结构和性质上匹配药物靶标的小分子药物候选物。”黄牛说，一些大的制药公司通常都有几百万甚至上千万个化合物库，利用实验筛选寻找药物的源头化合物的过程费时费力，而计算化学则改变了这一模式，将极大提高新药开发的效率。 正因此，从上世纪80年代开始，研究人员开始尝试将计算化学应用于生物医学领域。但这项研究在上世纪90年代进入小高潮后就进展缓慢，因为“理想很丰满，现实很骨感”，要算得准并非易事。 “截至目前，物理学理论中最准确的量子力学模型，也只能用来精确计算小分子化合物的结构和性质，而药物靶点通常是生物大分子，要实现在原子层次上的准确描述，是非常困难的。”黄牛说。 近......阅读全文
细胞化学基础腺苷计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：4氢键受体数量：8可旋转化学键数量：2互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积：140重原子数量：19表面电荷：0复杂度：335同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
腺苷的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：4氢键受体数量：8可旋转化学键数量：2互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积：140重原子数量：19表面电荷：0复杂度：335同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
吡啶的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无 氢键供体数量：0 氢键受体数量：1 可旋转化学键数量：0 互变异构体数量：0 拓扑分子极性表面积：12.9 重原子数量：6 表面电荷：0 复杂度：30.9 同位素原子数量：0 确定原子立构中心数量：0 不确定原子立构中心数量：0 确定
尿酸的计算化学数据
1.疏水参数计算参考值（XlogP）:-1.92.氢键供体数量：43.氢键受体数量：34.可旋转化学键数量：05.互变异构体数量：436.拓扑分子极性表面积：99.37.重原子数量：128.表面电荷：09.复杂度：33210.同位素原子数量：011.确定原子立构中心数量：012.不确定原子立构中心数
油酸的计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（XlogP）：无2、氢键供体数量：13、氢键受体数量：24、可旋转化学键数量：155、互变异构体数量：06、拓扑分子极性表面积：37.37、重原子数量：208、表面电荷：09、复杂度：23410、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：012、不确定原子立构中心数量：0
尿囊素的计算化学数据
1.疏水参数计算参考值（XlogP）：-2.22.氢键供体数量：43.氢键受体数量：34.可旋转化学键数量：15.互变异构体数量：246.拓扑分子极性表面积：1137.重原子数量：118.表面电荷：09.复杂度：22510.同位素原子数量：011.确定原子立构中心数量：012.不确定原子立构中心数量
泼尼松的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：1.5氢键供体数量：2氢键受体数量：5可旋转化学键数量：2互变异构体数量：27拓扑分子极性表面积（TPSA）：91.7重原子数量：26表面电荷：0复杂度：764同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：6不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键
腺苷的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：4氢键受体数量：8可旋转化学键数量：2互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积：140重原子数量：19表面电荷：0复杂度：335同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
可的松的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：1.5氢键供体数量：2氢键受体数量：5可旋转化学键数量：2互变异构体数量：45拓扑分子极性表面积（TPSA）：91.7重原子数量：26表面电荷：0复杂度：724同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：6不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键
腺苷－的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：4氢键受体数量：8可旋转化学键数量：2互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积：140重原子数量：19表面电荷：0复杂度：335同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
睾酮的计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（XlogP）：无2、氢键供体数量：13、氢键受体数量：24、可旋转化学键数量：05、互变异构体数量：56、拓扑分子极性表面积：37.37、重原子数量：218、表面电荷：09、复杂度：50810、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：612、不确定原子立构中心数量：01
胆碱的计算化学数据
1. 疏水参数计算参考值（XlogP）：-0.4 2. 氢键供体数量：1 3. 氢键受体数量：1 4. 可旋转化学键数量：2 5. 互变异构体数量：0 6. 拓扑分子极性表面积：20.2 7. 重原子数量：7 8. 表面电荷：1 9. 复杂度：46.5 10. 同位素原子数量：
泼尼松的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：1.5氢键供体数量：2氢键受体数量：5可旋转化学键数量：2互变异构体数量：27拓扑分子极性表面积（TPSA）：91.7重原子数量：26表面电荷：0复杂度：764同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：6不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键
组胺的计算化学数据
1.疏水参数计算参考值（XlogP）：无2.氢键供体数量：23.氢键受体数量：24.可旋转化学键数量：25.互变异构体数量：26.拓扑分子极性表面积：54.77.重原子数量：88.表面电荷：09.复杂度：64.710.同位素原子数量：011.确定原子立构中心数量：012.不确定原子立构中心数量：01
丙酮的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：-0.1氢键供体数量：0氢键受体数量：1可旋转化学键数量：0互变异构体数量：2拓扑分子极性表面积：17.1重原子数量：4表面电荷：0复杂度：26.3同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：0不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量
蟾毒色胺的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：2氢键受体数数量：2可旋转化学键数量：3互变异构体数量：9拓扑分子极性表面积：39.3重原子数量：15表面电荷：0复杂度：208同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：0不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
草酸的计算化学数据
1.疏水参数计算参考值（XlogP）:-0.32.氢键供体数量：23.氢键受体数量：44.可旋转化学键数量：15.互变异构体数量：无6.拓扑分子极性表面积：74.67.重原子数量：68.表面电荷：09.复杂度：71.510.同位素原子数量：011.确定原子立构中心数量：012.不确定原子立构中心数量
赤藓糖醇计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：-2.3 氢键供体数量：4 氢键受体数量：4 可旋转化学键数量：3 拓扑分子极性表面积（TPSA）：80.9 重原子数量：8 表面电荷：0 复杂度：48 同位素原子数量：0 确定原子立构中心数量：2 不确定原子立构中心数量：0 确定化学键立
阿糖胞苷的计算化学数据
计算化学数据1、疏水参数计算参考值（XlogP）：无2、氢键供体数量：43、氢键受体数量：54、可旋转化学键数量：25、互变异构体数量：36、拓扑分子极性表面积：1297、重原子数量：178、表面电荷：09、复杂度：38310、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：412、不确定原子立构中心
阿糖胞苷的计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（XlogP）：无2、氢键供体数量：4 3、氢键受体数量：5 4、可旋转化学键数量：2 5、互变异构体数量：3 6、拓扑分子极性表面积：129 7、重原子数量：17 8、表面电荷：0 9、复杂度：383 10、同位素原子数量：0 11、确定原子立构中心数量：4 12、不确定原
肌酐计算化学数据
1.共价键单元数量:1 2.氢键供体数量:1 3.氢键受体数量:1 4.可旋转化学键数量:0 5.互变异构体数量:5 6.拓扑分子极性表面积58.7 7.重原子数量:8 8.表面电荷:0 9.复杂度:151 10.同位素原子数量:0 11.确定原子立构中心数量:0 12.不
胆碱的计算化学数据
1. 疏水参数计算参考值（XlogP）：-0.42. 氢键供体数量：13. 氢键受体数量：14. 可旋转化学键数量：25. 互变异构体数量：06. 拓扑分子极性表面积：20.27. 重原子数量：78. 表面电荷：19. 复杂度：46.510. 同位素原子数量：011. 确定原子立构中心数量：012.
腺苷的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：4氢键受体数量：8可旋转化学键数量：2互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积：140重原子数量：19表面电荷：0复杂度：335同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
精胺的计算化学数据
1、 疏水参数计算参考值（XlogP）：-1.12、 氢键供体数量：43、 氢键受体数量：44、 可旋转化学键数量：115、 拓扑分子极性表面积（TPSA）：76.16、 重原子数量：147、 表面电荷：08、 复杂度：86.19、 同位素原子数量：010、 确定原子立构中心数量：011、 不确定原
腺苷的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：无氢键供体数量：4氢键受体数量：8可旋转化学键数量：2互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积：140重原子数量：19表面电荷：0复杂度：335同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立构中心数量：0
溴酚蓝的计算化学数据
1.疏水参数计算参考值（XlogP）:无2.氢键供体数量:23.氢键受体数量:54.可旋转化学键数量:25.互变异构体数量:36.拓扑分子极性表面积92.27.重原子数量:298.表面电荷:09.复杂度:66210.同位素原子数量:011.确定原子立构中心数量:012.不确定原子立构中心数量:013
地高辛的计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）:1.3氢键供体数量：6氢键受体数量：14可旋转化学键数量:7互变异构体数量：0拓扑分子极性表面积（TPSA）:203重原子数量：55表面电荷：0复杂度：1450同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：21不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学
细胞化学基础黄嘌呤计算化学数据
1、 疏水参数计算参考值（XlogP）：-0.72、 氢键供体数量：33、 氢键受体数量：34、 可旋转化学键数量：05、 互变异构体数量：156、 拓扑分子极性表面积（TPSA）：86.97、 重原子数量：118、 表面电荷：09、 复杂度：21710、 同位素原子数量：011、 确定原子立构中心
细胞化学基础鸟嘌呤计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（XlogP）：无2、氢键供体数量：33、氢键受体数量：24、可旋转化学键数量：05、互变异构体数量：266、拓扑分子极性表面积：96.27、重原子数量：118、表面电荷：09、复杂度：22510、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：012、不确定原子立构中心数量：0
细胞化学基础腺苷一磷酸计算化学数据
疏水参数计算参考值（XlogP）：-2.7氢键供体数量5氢键受体数量：11可旋转化学键数量：4互变异构体数量：3拓扑分子极性表面积（TPSA）：186重原子数量：23表面电荷：0复杂度：481同位素原子数量：0确定原子立构中心数量：4不确定原子立构中心数量：0确定化学键立构中心数量：0不确定化学键立