北京胃癌蛋白质组全套检测时间缩短至1天
胃癌是我国高发的恶性肿瘤之一,晚期胃癌患者五年生存率不足5%。临床上治疗胃癌的一线用药多为广谱抗癌药,造成化疗毒副作用大、疗效不明显。2013年,北京市科委在“生命科学领域前沿技术培育”专项中设立“基于蛋白质组学的胃癌个体化治疗技术研究”课题,日前取得了重要进展,胃癌蛋白质组全套检测时间缩短至1天,达到国际领先水平。 该研究由北京蛋白质组研究中心牵头,联合301医院、307医院等,将国际前沿的蛋白质组学技术应用到临床诊断领域,开展胃癌的个体化诊疗研究。课题组利用蛋白质组学和生物大数据手段,建立了标准化、高效、高精度的临床个体化医疗蛋白质组学技术策略,可以在1天内完成一个胃癌病例的癌组织、癌旁组织蛋白质组的全套检测,而国际上其他技术策略达到此覆盖度和精度需要三周,达到国际领先水平。 此外,课题组通过对100例胃癌病例的癌及癌旁蛋白质组的检测及数据分析,确定了胃癌的特征性蛋白质谱,这套蛋白质谱数据可为胃癌的预警、预防、诊断和......阅读全文
定量蛋白质组学方法分类
1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都
蛋白质组样品制备程序1
一、样品制备试剂的准备二、细菌细胞样品的裂解处理步骤三、人培养细胞样品的裂解处理步骤四、膜蛋白裂解方法步骤一、样品制备试剂的准备1、裂解缓冲液储备液的准备下述本样品制备方法已经过优化, 并被证明配合使用PF-2D 试剂盒可获得最佳的结果。您若选择其他的样品处理和细胞裂解方法,请务必避免使用离子型的表
蛋白质组的研究与发展
2014年5月28日,英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质,这些蛋白质与哪些基因表达有关等,从而进一步揭开人体的奥秘。上世纪90年代,人类基因组计划开始成形时,有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并
蛋白质组结构和功能特点
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基
蛋白质组的研究进展
2014年5月28日,英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质,这些蛋白质与哪些基因表达有关等,从而进一步揭开人体的奥秘。上世纪90年代,人类基因组计划开始成形时,有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并
蛋白质组学的研究内容
主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面: ①针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。 ②以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学
蛋白质组样品制备程序2
2)在4℃条件下以20000g的离心力冷冻离心60分钟 (离心力务必达到或大于20000g)。3)移取上清溶液。若上清样品不立即使用,则须储存于-80℃(最佳条件)或-20℃的无霜冰箱中以防止蛋白质的降解。2、用初始缓冲液(Start buffer)交换处理细胞裂解液1)在上述细胞裂解液中,加入初始
蛋白质组学入门问题FAQ
常见问题——— HPLC 篇 1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法 样品量不足:解决办法为增加样品量 样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子 样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器 检测器衰减太多:调整衰减即可。 检测器时间常数太大:解决办法为降低时间
蛋白质组学鉴定技术流程
蛋白质组(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学(Proteomics)以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象,通过高通量的色谱质谱联用技术
简述蛋白质组的鉴定方法
如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成,dbEST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据
蛋白质组最新研究进展
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋
关于蛋白质组的研究分析
主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面: ① 针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。 ② 以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋
蛋白质组学实验技术大全
每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与
蛋白质组学的样品制备
想要研究蛋白质,首先要得到高度纯化且具有生物活性的目的物质,因此,蛋白样品的制备是重要前提。蛋白提取的质量和效果对后续的研究分析有重要影响。不同种类的样本在制备过程中,存在一些差异,要根据样本特征调整实验方案和操作细节。基本原则样品处理尽量简单,减少蛋白损失;尽量避免蛋白的降解;尽可能提高样品蛋白的
蛋白质组学样品处理方法
蛋白质组学研究已经成为后基因组时代的研究热点,是生命科学研究领域又一个新的突破口。本文从对疏水性强的蛋白质、极性蛋白质、高丰度蛋白的处理、低丰度蛋白的富集和对样品溶液中干扰性物质的去除以及对不同染色后质谱前处理等方面综述了蛋白质样品的一般处理方法。 1. 不溶性蛋白质的处理 天然状态的蛋白质
四川首个精准医疗应用领域重点实验室顺利通过评审
近期,四川省首个在精准医疗应用领域布局的四川省重点实验室——个体化药物治疗四川省重点实验室顺利通过专家评审。实验室依托电子科技大学附属医院·四川省人民医院和成都地奥制药集团有限公司联合建设,主要围绕个体化药物治疗检测和应用、个体化药物治疗指南、个体化药物发现与评价等研究方向开展科学研究。
《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成,但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现,蛋白质才是生命活动真正的执行者,所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究,试图找出人类疾病的致病机理,最终解决人类
如何预防胃癌?
饮食健康:避免暴饮暴食、过度饮酒、吃辛辣、油腻、刺激性食物等,多吃蔬菜、水果、粗粮等富含纤维素的食物。 合理用药:避免滥用非甾体抗炎药、激素类药物等对胃黏膜有刺激作用的药物,如果必须使用,应在医生指导下进行。 改善生活方式:保持良好的心态,避免过度疲劳和精神紧张,保证充足的睡眠。 定期体检
如何预防胃癌?
健康饮食:保持健康的饮食习惯,摄入足够的蔬菜、水果和全谷类食物,减少摄入高脂肪、高盐和高糖的食物。 避免食用腌制、烟熏和烤制的食物:这些食物中含有亚硝酸盐等致癌物质,长期食用会增加患胃癌的风险。 戒烟限酒:长期大量饮酒和吸烟都会增加患胃癌的风险,因此应尽量戒烟限酒。 避免长期使用非甾体抗炎
蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组
申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。 从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完
河南个体化用药基因检测院士工作站在郑揭牌
从“大众医疗”时代,逐步进化到依据个人遗传基因而异的“定制时代” 昨天上午,河南省个体化用药基因检测院士工作站在郑州大学附属郑州中心医院揭牌。 这是我省首个以利用遗传学分子检测,确立针对不同患者的个性化用药方案为研究方向的院士工作站,由中国工程院院士周宏灏教授主持,它的成立标志着
创新血检为治疗非小细胞肺癌的个体化疗法铺路
如果能发现非小细胞肺癌 (NSCLC) 肿瘤中携带的特定基因突变,将可以帮助医生们选择最好的治疗手段。目前,NSCLC 患者通常需接受组织活检来发现这些基因突变,这种侵入性检测手段经常需要数周才能获得检验结果,有可能因此而延误了治疗时机。 日前在《Journal of Molecular D
精准医学:从基因检测技术应用到个体化用药指导
精准医学:从基因检测技术应用到个体化用药指导 第一轮通知 2016年10月10日 上海新国际博览中心(龙阳路2345号) 主办单位: 上海市生物工程学会 上海市生物医药行业协会 上海伯豪生物技术有限公司 慕尼黑展览(上海)有限公司 会议简介: 近年来,在人类基因组计划之后,从
幽门螺杆菌与胃癌:如何清除是关键
幽门螺杆菌(H pylori,Hp)感染与多种疾病相关,包括胃炎及胃腺癌。关于 Hp 清除是否可预防癌症,还是仅降低其发病风险,目前还无明确的结论。此外,有研究提出幽门螺杆菌感染对机体还可能有一定益处(如降低肥胖或儿童哮喘的风险等),但证据也尚不充分。让我们通过这篇文章学习下 Hp 感染的影响、
中以科学家利用呼吸测试新方法诊断胃癌
来自中国和以色列的科学家近日研究成功一种新型的胃癌诊断方法,仅需对患者进行呼吸测试就能确诊。在已经进行的130例癌症诊断中,这种方法的准确率高达90%。《英国癌症杂志》认为,这种方法将彻底改变现有的癌症诊断方式,有效提升癌症的诊断效率。 据悉,英国每年约有7000例新增胃癌患者,大部分患者
Coimbra基因和华大基因联合发起胃癌基因组研究计划
2013年9月30日,华大基因和来自葡萄牙的一家新兴生物公司Coimbra基因联合发起了一项胃癌基因组研究计划,以解密胃癌背后的遗传奥秘。该项目的启动经费达90万美元,将成为胃癌领域内首个大规模基因组研究项目。该项目的科研团队包括来自葡萄牙波尔图顶级癌症研究所 ――IPATIMUP的遗传学家
新探针可实现对蛋白质N端组学深度富集检测
中国科学院上海药物研究所研究员黄河、柳红合作,研究设计合成了一种含有吡啶甲醛片段的可断裂分子探针2PCA-Probe,可实现对蛋白质N-端的深度富集检测。相关研究发表于《美国化学会志》。蛋白质水解是一种广泛存在的翻译后修饰方式,在多种生物过程中发挥重要作用。在正常组织中,大多数蛋白酶的活性受到严格调
DIA蛋白质组检测补体系统异常与精神疾病的关系
Less is more:DIA技术,2table+1figure,得一篇12分的Molecular Psychiatry文章Nature旗下的Molecular Psychiatry(IF=11.64)是精神疾病领域的top期刊。在19年1月发表了一篇题为“Complement pathway
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新探针可实现对蛋白质N端组学深度富集检测
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518515.shtm2月29日,中国科学院上海药物研究所研究员黄河、柳红合作,研究设计合成了一种含有吡啶甲醛片段的可断裂分子探针2PCA-Probe,可实现对蛋白质N-端的深度富集检测。相关研究发表于《美