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定量蛋白质组学方法分类

1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于质谱技术,科学家们不断开发出新的定量蛋白质组学方法,来了解细胞、组织或生物体的整体蛋白质动力学。2 方法学介绍目前较主流的定量蛋白质组学方法有5种,分别是Label-free、iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、和SWATH。简述如下:2.1 Label-freeLabel-free定量,即非标记的定量蛋白质组学,不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信......阅读全文

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

国内外蛋白质组学大腕云集 聚焦生物质谱前沿技术

  2014年7月3日,全国生物质谱学术报告会--生物质谱前沿技术邀请报告会在上海复旦大学隆重召开。此次活动旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用,加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作,特邀瑞士苏黎世联邦技术学院分子系统生物学

空间蛋白质组学:一种强大的细胞生物学发现工具

真核细胞高度区室化,生物过程被分隔在不同的区室进行。蛋白质功能与亚细胞定位密切相关,不同的区室提供不同的化学环境(例如pH和氧化还原条件)、不同的潜在作用配体或底物。因此,对蛋白质亚细胞定位的严格控制是细胞生理学的重要调控内容。大多数细胞生物学过程涉及蛋白质亚细胞定位的变化,例如转录因子在细胞核-胞

蛋白质组学实用分析技术一览

分析其实也属于技术的一部分,且在蛋白质组学研究中显得尤为重要,因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的,而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性,因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。

质谱沙龙第十九期活动报道

  2009年5月23日,质谱沙龙第十九期活动在清华大学生物医学测试中心举行。此次到会者除了来自二炮总医院、西苑医院、清华大学医学院、发酵研究院、中科院微生物研究所、空军总医院、天津博纳艾杰尔科技、AB公司等老朋友外,还有来自戴安公司、东西电子的新朋友。报告后的讨论一直洋溢着热烈的气氛。   

税光厚:为什么要做脂质组学研究?

“精准分析”我们的成功故事系列  ——写在前面的话  “精准分析•量化释能”——我们的成功故事系列栏目,是SCIEX帮助科学家们分享有意义的科学发现和研究成果的科普平台。我们期待让更多的人感受到科学和“质谱”的力量,”让质谱改变每个人的生活”始终是SCIEX最美好的愿景。SCIEX非常荣幸能够参与到

代谢组学:未来新方向

   加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说,我们自身其实就是一大组生化反应,“因此,基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组,而不是相反的路径。” Wishart说,有别于其他组学方法,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转

2012中国医学科学院蛋白质组学研讨会大会报告

  中国医学科学院药物研究所 再帕尔研究员  来自中国医学科学院药物研究所的再帕尔·阿不力孜教授带来了题为《基于LC-MS/MS技术的代谢组学分析方法研究与应用进展》的报告。   再帕尔教授首先对比了NMR、LC-NMR与LC-MS、GC-MS在代谢组学分析当中的优缺点,发现在代谢组学复杂样本体系的

质谱沙龙第十五期活动报道

    2008年12月21日下午,质谱沙龙第十五期活动在第二炮兵总医院远程会诊中心会议室举行。来自发酵研究院、清华大学、二炮总医院、朝阳医院、北大医学院、北医三院、安贞医院、解放军307医院、中科院植物所、AB公司的各位专家、老师、学生20余人。  

Urimarker 2020线上会议第二弹:探讨多组学方法与应用

  2020年5月15日-17日,第二届尿液生物标志物网络研讨会(Urimarker 2020)线上直播召开。Urimarker 2020由北京师范大学与分析测试百科网联合主办,基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、中国医学科学院基础医学研究所协办,北京师范大学生命科学学院承办。分析测试百科网全程

代谢组学:一项艰巨的任务

  学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢,一系列代谢通路,一大堆代谢产物,简直让人头晕眼花。然而,这又不能跳过。毕竟,DNA编码蛋白质,而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候,科学界对这些分子一无所知。  “如果你测定一滴血中的小分子,大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配,

蛋白质组技术的研究进展

大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信息仅

质谱盛宴AOMSC, 赛默飞Orbitrap技术大放异彩

  AOMSC(Asia-Oceania Mass Spectrometry Conference)作为亚太地区顶级质谱盛会之一,1月4-7日在澳门胜利举行。  此次大会汇集了来自多个国家(地区)的约400位质谱学者参加,议题覆盖质谱原理研究、质谱创新技术、组学研究、环境研究、中药及天然产物研究等多

环渤海色质谱学者精彩报告纷呈 贯彻“绿色化学”理念

  分析测试百科网讯 2016年8月11日,由辽宁省分析测试协会,辽宁省分析科学研究院主办的“第四届环渤海色质谱学术报告会暨辽宁省第十届学术年会分会”在丹东召开(相关报道:第四届环渤海色谱质谱学术会在丹东开幕 首次发布徽标)。大会上,众位环渤海的

Western blotting蛋白印迹市场概况和主要品牌及产品

近日,MarketsandMarkets咨询公司发布了全球western blotting市场的分析报告。据MarketsandMarkets预测,全球western blotting的市场规模将从2016年的5.75亿美元增长到2021年的7.31亿美元,复合年均增长率达4.9%。另一家Futur

首届质谱论坛学术报道

  在2010年10月15日召开的首届质谱论坛(首届质谱论坛召开 质谱中心三年庆典)上,共有四位教授、专家做了学术报告,100余位关心质谱技术的专家、学生和几位报告人一起,分享了精彩的报告。       布鲁克

一文带你回顾首届原子光谱应用与技术交流会全程

  分析测试百科网讯 2017年9月7日,第一届原子光谱应用与技术学术研讨会暨原子荧光交流会在云南昆明开幕。会议由中国质量检验协会检验检测设备分会原子光谱应用与技术专业委员会、中国仪器仪表学会分析仪器分会主办,昆明理工大学分析测试研究中心、《中国无机分析化学》、国家磷资源开发利用工程技术研究中心协办

ANTOP——液质联用类产品获奖盘点

  作为分析测试行业前进的见证者,分析测试百科网忠实记录着行业前进的每一个步伐! 自2017年开启ANTOP奖以来,已成功举办3届,科学仪器企业竞相参与,得到了广大网络用户的好评和业界人士的高度关注,下面小编将为您盘点历届获得ANTOP奖的液质联用产品。  免液氦FT-离子回旋共振质谱  奖项主体:

PPTD2018分论坛:体外诊断试剂研究和质量控制报告集锦

  分析测试百科网讯 2018年10月10日,“2018年蛋白和肽类药物及诊断试剂研发与质控国际研讨会(PPTD 2018)”在四川省成都市香格里拉大酒店召开(相关报道:PPTD 2018在蓉开幕 聚焦测量与标准、质量与安全)。在精彩的大会报告之后,会议还举办了体外诊断试剂研究和质量控制等分论坛,分

十九大!看看分子病理领域,未来发展方向!

  今天党的十九大召开,习近平大大指出:中国特色社会主义进入新时代,我国社会主要矛盾已经转化为人民日益增长的美好生活需要和不平衡不充分的发展之间的矛盾。想想都觉得高中政治课本过时了,而考研又多了一道大题。然而这些年,医疗领域进展可不止一点!就让我们一起看看这些年,分子病理领域的发展!  其实相对于其

关注质谱与生命科学,看2019北京质谱年会

  分析测试百科网讯 2019年3月29日,2019年北京质谱年会在中国科学院大学(雁栖湖校区)隆重举行。本次会议主题为“质谱与生命科学”,邀请了活跃在我国的青年专家知名专家作质谱前沿技术与应用新进展报告。本次年会由北京理化分析测试技术学会北京质谱学会主办,北京质谱中心承办。会议共有400余人出席,

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

穿越蛋白组学数据丛林

数据处理,验证,标准和蛋白质定量都是2007年10月在韩国举行的第六届人类蛋白质组组织(HUPO)世界年度会议的主题讨论内容。 HUPO成立于2001年2月,即人类基因组首张草图公布的同一周。现在,该组织的委员会有来自19个国家的48名成员,总部位于加拿大的麦吉尔大学以及蒙特利尔的基因组魁北克创新

第19届全国色谱大会特邀报告(二)

  2013年4月1日-4月3日,为期三天的第19届全国色谱学术报告会及仪器展览会在福州西湖宾馆召开。继4月1日张玉奎院士、陈洪渊院士、江桂斌院士、庄乾坤主任、陈义研究员和Jan-Christer博士的特邀报告之后,4月3日下午,第19届全国色谱学术报告会又迎来了吴学梯司长、赵宇亮研究员、吴永宁研究

质谱沙龙2012年报告交流会报道

  2012年12月23日质谱沙龙2012年报告交流会即第三十七期质谱沙龙活动在首都医科大学附属北京朝阳医院报告厅如期举行。来自北京朝阳医院、北京大学人民医院、空军总医院、北医三院、北京安贞医院、北京大学、北京师范大学、军事医学科学院、AB SCIEX公司、北京艾米

第三届质谱论坛:质谱技术在组学研究中的应用

学术报告 清华大学生命科学与医学研究院中药现代化研究中心主任 罗国安教授   首先,清华大学生命科学与医学研究院中药现代化研究中心主任罗国安教授给大家带来的是《中医药系统生物学研究进展》。   讲到对中药复方研究方法学创新发展的要求,罗教授分了三个模式:“点-点”模式(P2P),

第22届全国色谱会分会——组学应用

  分析测试百科网讯 2019年4月21日,中国化学会第22届全国色谱学术报告会及仪器展览会在沪召开(相关报道:中国化学会第22届全国色谱学术报告会及仪器展览会)。第22届全国色谱学术报告会组学应用分会场同期举办,整个会场座无虚席,近300人参加了此次分会。分析测试百科网作为本次会议的支持媒体,全程

2010全国质谱大会大会报告(三)

诺华(Novartis)制药 Wang, Karen(王瑛琪)教授  来自诺华(Novartis)制药的Wang, Karen(王瑛琪)教授,做了题为“Application of Mass Spectrometry in Pharmaceutical Drug Discovery Research

基于Q-OT-qIT 平台的第二代“三合一”超高分辨质谱介绍

摘 要 Orbitrap Fusion Lumos 是基于Q-OT-qIT 平台的第二代“三合一”质谱,通过离子入口、离子透镜、四极杆、ETD和真空技术等方面的深度改进,将仪器整体性能优化至极致。配合“三合一”质谱魔法般的功能,Orbitrap Fusion Lumos 能够有效应对蛋白

等电聚焦和二维凝胶电泳实验

对于复杂混合物,如全细胞裂解物或富集的亚细胞组分,通过两步正交的分离 (orthogonalseperation),二维凝胶 (2D 胶)电泳可以很好地分离成几百个至上千个单个蛋白质。第一次分离基于电荷,即使用变性等电聚焦电泳; 第二次分离基于表观分子质量,即使用变性十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电