最新研究告诉你癌症个性化治疗的必要性
最近,一个西奈山医学院伊坎研究所的试点项目结果显示在许多临床实验室中,多维的个性化基因组分析对于病人的治疗来说比特定基因的筛查面板更加有效。该西奈山科研团队的科学家们使用了一套完整的基因组分析方法完成了其个性化癌症治疗技术的开发与测试。 随着NGS技术运行成本的逐渐降低,临床实验室快速配备了针对于不同癌症肿瘤DNA致病突变筛查面板。癌症患者肿瘤组织中携带的特定遗传变异对于指导病人的癌症个性化治疗至关重要。在目前的癌症个性化治疗项目中,研究人员与临床医生通常都会同时收集病人基因组成的相关数据与其肿瘤组织的测序数据,通过比较探明个性化遗传分析对于病人癌症治疗的作用。 “为每一位病人裁剪癌症治疗方案是一件引人入胜的事情。每一种肿瘤都有其独特的信号通路与遗传特征,这些因素直接影响着肿瘤的发病与癌症的临床疗效。”文章的第一研究作者,西奈山伊坎研究所遗传学和基因组学助教以及临床基因组信息学主任陈荣博士向读者解释道(陈荣博士之前的一篇......阅读全文
外骨骼“靴子”助力个性化行走需求
一个人在便携式踝关节外骨骼的帮助下行走。图片来自斯坦福大学Kurt Hickman 科学家报道了一种外骨骼“靴子”,该装置能帮助使用者在真实世界环境中走得更快、更高效。研究结果演示了可穿戴机器人的一种新设计方法,凸显出这类装置在日常生活中的广泛应用前景。相关研究近日发表于《自然》。
农产品个性化定制“不简单”
一种由消费者提需求,按照消费者的要求或者按照高标准进行全程农产品个性化定制的生产模式逐渐成为时尚。但在采访中,专家表示,虽然农产品个性化定制浪潮不断涌来,但是真正要做到被广泛认可和推广并不简单。农产品个性化定制模式的运行和推广还有很长的路要走。 “经常看到听到各种关于农产品质量安全的问题,心
ICL个性化设计:精准矫正-提高视觉
11月19日,《EVO ICL个性化设计精粹》新书发布会在复旦大学附属眼耳鼻喉科医院举行。该书由眼耳鼻喉科医院王晓瑛、周行涛、汪琳主编,是国际首本ICL手术个性化设计领域专著。书中以ICL检查、设计、手术3个篇章,结合66个典型病例,图文并茂地分享了眼耳鼻喉科医院屈光手术团队在ICL手术精益求精
癌症个性化治疗成功的案例分享
一些癌症个性化治疗成功的案例:黑色素瘤患者 Emily Whitehead:她在接受了多次传统治疗后病情仍未得到控制。后来参与了一项 CAR-T 细胞免疫疗法的临床试验,经过治疗后,她的癌症得到了显著缓解,并且多年来一直保持健康,成为了 CAR-T 细胞疗法成功的标志性案例。一位晚期肺癌患者:通过基
-生物领域新兴职业:-遗传基因咨询师
当本人第一次听说这个名字的时候,着实迷糊了一会,这是什么职业?作为生物界的一员,貌似没有听说过这个新兴的职业,不过它确实是近几年来兴起的一项新职业,也是生科学生未来可以考虑有所发展的岗位。 基因检测催生遗传信息咨询产业化 人为什么要对自己的基因组测序?通过了解房子的结构,我们能预测它
最新研究告诉你-癌症个性化治疗的必要性
最近,一个西奈山医学院伊坎研究所的试点项目结果显示在许多临床实验室中,多维的个性化基因组分析对于病人的治疗来说比特定基因的筛查面板更加有效。该西奈山科研团队的科学家们使用了一套完整的基因组分析方法完成了其个性化癌症治疗技术的开发与测试。 随着NGS技术运行成本的逐渐降低,临床实验室快速配备了针
最新测序技术能用单个细胞分析基因组
美国物理学家组织网9月18日报道,最近,来自美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、克雷格·文特尔研究院和Illumina公司的科学家对现代基因测序算法进行了改良,只需从一个细菌细胞中提取的DNA(脱氧核糖核酸)就可组装成接近完整的基因组,准确率达到90%,而传统的测序方法至少需要10亿个
Nature:癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨
Nature:癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨
基因组分析阐明考拉生存环境
日前,日本京都大学灵长类研究所的研究人员参加的国际研究团队,通过基因组(全遗传信息)分析阐明,在澳大利亚东部生活的有袋类考拉,是从以主食桉树叶所持有的毒素中感觉到的苦味而择食,并仅选择桉树叶为食从而进化的。该研究成果发表在美国《自然—遗传学》杂志电子版。 研究表明,桉树叶含有毒性而味苦,几乎所
复杂、大型的基因组分析将更简单
最近,欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员开发出一种新的方法,可研究多重基因变异对不同性状的影响。这种新算法发表在最近的《Nature Methods》杂志,能够同时对多达500,000个人和许多特征,进行遗传分析。延伸阅读:大大降低基因组分析时间的新工具。 基因与疾病之间的一对
芝麻大规模全基因组关联分析完成
由中国农科院油料所张秀荣研究员领衔的芝麻与特色油料遗传育种创新团队,与中科院国家基因研究中心等单位合作,在国际上率先完成了芝麻高密度单倍型图谱构建、主要农艺性状大规模全基因组关联分析。10月19日,国际知名期刊《自然·通讯》杂志在线发表了上述研究成果。 该研究得到973、国家自然科学基金、中国
只需100个细胞的表观基因组分析
近年来,表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点,但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案,最终实现个性化医疗。问题在于,表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说,检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细
Nature-Methods:超快速的基因组分析工具
近年来,测序市场呈现出百花齐放的美好局面。这使得测序的成本不断下降,但同时也带来了数据分析的难题。经济而又高效地处理全基因组测序的数据,相信是每个人的愿望。如今,一个开源的基因组分析平台也许能满足你的愿望。 这个平台被称为SpeedSeq,由华盛顿大学医学院等机构的研究人员开发。它利用低成本的
人类不同祖先的全基因组关联分析
一项由埃克塞特大学领导的发表在《Nature Genetics》上的研究扩大了人类不同祖先的全基因组关联分析,并最终受益于全球患者护理。到目前为止,近87%的这种类型的基因组研究是在欧洲人身上进行的。 Lundquist研究所翻译基因组学和人口科学研究所研究员和所长,加州大学洛杉矶分校Geff
基因组分析在现实环境的实际应用
这次我们来说说,基因组分析在具有多样性的现实环境里,是如何投入使用的。
全基因组及转录组测序案例分析
案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25
水稻RGA基因组规模的鉴定与分析
实验概要本实验对粳稻蛋白质数据库进行BLASTP,获得所有粳稻的RGA序列,对RGA进行分类,分别统计了各类RGA在不同染色体上的分布情况,对两个亚种间RGA多态性进行了鉴定和开发。实验步骤1. 水稻RGA的搜索搜集已报道的45个R基因,然后用它们对粳稻蛋白质数据库进行BLASTP (参数取E
水稻LEA基因组规模的鉴定与分析
实验概要本实验鉴定了OsLEA基因,将基因定位到水稻染色上,进行了序列对比和基因转变分析,LEA基因的表达分析及启动子基序分析。实验材料基因组及蛋白质序列的来源:分别从TIGR (http://www.tigr.org)和BGI (http://rise.genomics.org.cn/rice
Nature:最大规模基因组分析研究
一个国际研究小组完成了对所有生命形式有史以来最大规模的基因组分析研究。以前所未有的细节绘制出了真核基因的进化史,提供了有关最早期生命形式进化机制的一些新见解。 这篇发表在《自然》(Nature)杂志上的研究论文,是建立在著名古生物学家Stephen Jay Gould的研究工作基础之上,Gou
大型研究为癌症基因组分析奠定基础
12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German
大大加速基因组分析的新软件
最近,新加坡科技研究局(A*STAR)基因组研究所(GIS)和生物信息学研究所(BII)的科学家带领的一个国际研究小组,开发出了一种可以加快基因组分析的软件——SIFT 4G(SIFT for Genomes)。这项研究结果发表在《Nature Protocols》杂志。 基因组测序可帮助我们
华人学者开发基因组分析新工具
最近,来自美国西奈山伊坎医学院的科学家,开发和公布了两种新的数据分析软件,可以帮助研究人员以更高的效率和精确度,识别疾病的遗传触发因子。这些新的分析工具分别发表在11月30日的《PLoS Computational Biology》和11月25日的《Scientific Reports》。 M
PNAS:比较基因组分析揭示熊猫遗传奥秘
中国科学院动物研究所的魏辅文研究员长期从事濒危动物保护生物学研究,是大熊猫和小熊猫保护生态学等领域的权威科学家,2006年有关大熊猫分子生态学的研究成果曾入选了年度美国Discover杂志12大生物科技新闻,去年其研究组还在Science上发文揭示大熊猫维持异常低能量代谢的机制。最新一期的《美国
基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展
与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联 日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema
个性化医疗会带来更昂贵的药物?
尽管基因组测序有望带来更多的个性化医疗,但《温哥华太阳报》上的一篇文章指出,它也可能带来更昂贵的药物。记者Randy Shore写道,以某些基因突变为靶点的治疗方案可能只在一小部分人群中起作用,因此,每位患者每年需要为这些“孤儿药(orphan drugs)”支付10万-100万美元。
单细胞蛋白扫描可协助个性化医疗
一种可在单个癌细胞上检测数百种蛋白的新的条码技术可能会帮助医生决定给病人什么样的蛋白靶向癌症药物的组合。癌细胞可通过蛋白质的表达水平的变化而被发现,这些蛋白的表达变化可进而作为关键性的癌症生物标志。这种条码技术是由Ralph Weissleder及其同事研发的,它是在单细胞的层面用抗体来检测
英将推广基因测序开展个性化医疗
英国卫生部7月5日说,国家医疗服务系统将推广一项基因测序计划,优先为癌症、罕见病和传染病患者进行基因测序,以更好地提供有针对性的治疗方案。 英国卫生大臣杰里米·亨特5日说,这一项目将由卫生部下属机构“英格兰基因组学”负责实施,该机构将与英国研究机构、高校和医院签订合同,由该机构为
英开发个性化丙肝药物测试技术
英国研究人员日前报告说,他们开发出一种针对丙型肝炎药物的测试技术,可以预先测试出哪种药物对患者效果更好,从而实现个性化的丙肝治疗。 英国爱丁堡大学研究人员在新一期《病毒学》杂志上报告说,这项技术可以测试所有6种丙肝病毒对药物的反应,其方法是在实验室中培养肝脏细胞,使用不同丙