复杂、大型的基因组分析将更简单
最近，欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）的研究人员开发出一种新的方法，可研究多重基因变异对不同性状的影响。这种新算法发表在最近的《Nature Methods》杂志，能够同时对多达500,000个人和许多特征，进行遗传分析。延伸阅读：大大降低基因组分析时间的新工具。 基因与疾病之间的一对一关系比较简单，相比之下，基因和特异性状之间的关系则更为复杂。全基因组关联研究（GWAS）表明，许多遗传因素对任何给定的特征起作用，但科学家们刚刚开始探索“特定遗传变异如何影响健康和疾病”。 发现这些联系的两个主要统计学挑战包括：分析许多不同遗传变异与多个性状之间的关联，并充分利用来自大型队列（包括成千上万个个体）研究的数据。 EMBL-EBI研究组组长Oliver Stegle解释说：“确定引起表型或特征的遗传变异，是非常具有挑战性的，一般我们通过逐一分析每种表型和每个变体，达到这个目的。但我们所用的模型过于简单，因此不能解开遗传......阅读全文
衰老如何改变我们的基因
衰老对身体产生的可见影响有时与基因活动的无形变化有关。DNA甲基化的表观遗传过程会随着年龄增长而变得不再精确，造成基因表达的变化。而这种变化与随着年龄增长而出现的器官功能衰退和疾病易感性增加有关。如今，一项针对整个成年生命周期中17种人体组织的表观遗传变化进行的荟萃分析，提供了迄今为止关于衰老如何修
基因调控的研究方法
筛选突变型 这是在原核生物中广泛应用的方法，例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型，包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型，以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖苷酶的超阻遏型等等。 激素诱导 在高等的真核生物中，除了离体培养的体细胞以
Cell：新研究有助于确定使我们成为人类的基因变化
大约700万年前，人类从我们最接近的动物亲戚黑猩猩那里分离出来，在进化树上形成了我们自己的分支。在此后的时间里---从进化的角度看是短暂的---我们的祖先进化出了使我们成为人类的性状，包括比黑猩猩大得多的大脑和更适合用双脚行走的身体。这些身体上的差异是由我们的DNA水平上的微妙变化所支撑的。然而，在
基因检测=算命？基因检测：“我们不一样！”
为何英俊帅气的威廉王子30岁就开始脱发？ 为何同一个宿舍的小美可以狂吃不胖，你却天天吃水煮青菜都长肉？ 为何女朋友吃火锅必点香菜，你却闻一下都想吐？ 为何隔壁老王天天抽烟都没事，倒霉的老张吸了口霾却得了肺癌？ 这一切的背后究竟是人性的扭曲，还是道德的沦丧，让我们把镜头对准本篇文章，一切即
惊人发现：食物会影响我们的基因？
科学家们最近发现，我们的大多数基因都会受到食物的影响。这项引人注目的研究发表在Nature旗下新期刊Nature Microbiology上。 细胞行为是由基因活性决定的，而基因活性受到表观遗传学开关的调控。此前有研究表明，基因调控还存在另一个层面，那就是代谢网络。代谢是维持细胞的生化反应，主
Cell对话：我们该如何应用基因编辑？
CRISPR基因编辑无疑是本世纪以来最受瞩目的生物技术之一。CRISPR可以用来做什么？如何来实现这一过程？这大概是人们目前对这项技术最关心的问题。3月28日，在Cell网站Crosstalk专栏上的一篇文章中，Trends in Biotechnology杂志的编辑Matt Pavlovich
我们为什么不相信基因编辑？
34岁的中国科学家贺建奎以非常规方式站到了“世界级”的聚光灯下。2018年11月26日，中国科学家贺建奎团队宣布，一对名为露露和娜娜的基因编辑婴儿已于11月在中国健康诞生，她们的基因经过人为修饰，能“天然抵抗艾滋病”。此消息一出，他便成了舆论的中心，顿时一片哗然。就在11月26日当晚，中国122名科
基因检测：我们真的想知道结果吗？
英国金融时报网20日发表该报美国商业资深记者为大卫·克罗撰写的题为《基因检测：我们真的想知道结果吗？》的文章。文章说，我的母系亲属有多人患了癌症。我做了一次基因检测。但如果没有治愈之方，提前知道了结果又有什么用呢？ 这是我永生难忘的通话之一。我妈妈的大哥、我们家的实际领袖约翰舅舅打电话告诉我他
当我们渐渐老去－基因表达如何改变
当我们渐渐老去，基因表达会如何改变。伦敦国王学院等机构的研究人员对多个组织的基因表达变化进行了大范围的研究，发现皮肤表现出最明显的年龄相关基因表达变化。这项成果于近日发表在《Genome Biology》上。 衰老是一种复杂的自然现象，表现为结构和机能衰退，适应性和抵抗力减退。年龄也是
关于LacZ基因的医学研究分析
在医学方面，利用LacZ基因在哺乳动物中对某些重要蛋白质基因的时空表达和调控进行研究更是蓬勃发展，文献量也增加较快。在哺乳动物中枢神经系统中，翻磷脂(myelin)对于轴突的形态、功能和生长有显著影响。用由髓磷脂基本蛋白基因的启动子与LacZ基因构成的融合基因制成转基因小鼠来研究髓磷脂的时空表达
基因表达差异分析方法进展
高等真核生物的基因组一般具有80 000～100 000个基因，而每一个细胞大约只表达其中的15%［1］。基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性表达决定了生命活动的多样性，如发育与分化、衰老与死亡、内环境稳定、细胞周期调控等。比较细胞间基因表达的差异为我们揭示生命活动的规律提供了依据。
关于基因调控的研究方法介绍
１、筛选突变型 这是在原核生物中广泛应用的方法，例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型，包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型，以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖糖苷酶的超阻遏型等等。 ２、激素诱导 在高等的真核生物中，除了离体培养的体
Science开发创新基因表达研究方法
来自卡罗林斯卡学院和瑞典皇家理工学院(KTH)的科学家们，开发出了一种高分辨率的新方法来研究组织中活化的基因。这种方法可用于所有的组织类型，对于临床前研究和癌症诊断均具有价值。他们的研究结果发布在7月1日的《科学》（Science）杂志上。 疾病会改变组织中一些RNA分子和蛋白质的表达。在实验
基因检测改变我们生命的游戏规则？
基因检测是否会改变我们的生活？答案是肯定的。 基因组检测技术的发展在临床医疗上其实已经显现了成效。在临床诊断和药物治疗方案制定上提供了重要的参考依据。到了今年，基因检测全面降价，做个特定基因位点检测芯片的钱比买王者农药限量版皮肤的钱也贵不了多少，而一套全基因组测序带分析的开销甚至比不上女朋友的
基因检测到底能帮助我们什么？
专家表示：肥胖、糖尿病、高血压、心脑血管疾病等家族史人群都应做基因检测，预防下一代被遗传。对话专家热线：024-86201277 自从本报刊登《基因检测：你的“身体使用说明书”》对话基因科学开拓先锋——复旦大学首席教授薛京伦的报道后，基因检测一时间成为人们热议的话题。 为什么有些人成天大鱼大
“基因泄密”：我们的遗传资源还安全吗？
六家企业卷入人类遗传资源泄露风波让公众吃惊，但业界却并不意外。“很多流传于江湖的故事终于浮出了水面。” 非法采集的资源已由传统人体组织、细胞等实体样本转向人类基因序列等遗传信息，出境途径也由携带样本转变为通过互联网发往国外。“隐蔽性越来越强，这很难发现。” 网上下单、支付，两天内收到采样盒，
基因大数据深度挖掘，我们将面临挑战
在日前于北京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，众多与会专家就基因技术发展方向及面临的机遇与挑战进行了深入交流。作为一种新型基因检测技术，基因测序能从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性、个体的行为特征及行为合理性。基因测序技术能锁定个人病变基因，予以提前预防和治疗。
转基因动物食品离我们有多远
据美国杂志网站报道，长期以来人类已经几乎改造了所有未他们提供食物的植物和动物，但采用的是传统的育种方法。而借助基因工程技术，将基因在不同的活体生物之间相互迁移植入的做法则让人们感到对未来的疑惑。 而这正是大约两周前在法国发生的事：一头经过转基因改造，旨在表达绿色荧光蛋白的绵羊产下的后代被推
基因扩增产物分析方法介绍
PCR扩增DNA片段只是一个重要手段。扩增片段的检测和分析才是目的,根据研究对象和目的的不同而采用不同的分析法。琼脂糖凝胶电泳可帮助判断扩增产物的大小,有助于扩增产物的鉴定,点杂交除可鉴定扩增产物外,还有助于产物的分型;Southern杂交分析可从非特异扩增产物中鉴定出特异产物的大小,增加检测的特异
基因芯片数据的分析方法
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
基因组分析的代表方法
基因组分析的代表方法 - end -上期回顾“二次元”基因第一回（1）“二次元”基因第一回（2）“二次元”基因第一回（3）“二次元”基因第二回（1）
基因芯片数据的分析方法
研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设
Nature子刊：基因决定我们对药物的反应
来自伦敦大学玛丽皇后学院等处的研究人员完成了一项超过 40,000个他汀类药物治疗个体大型研究，从中发现了两个关键遗传突变，这些突变会影响我们身体中“坏”胆固醇水平对他汀类药物治疗的反应。 这一研究成果公布在Nature Communications杂志上。 他汀类药物（statins）是最
我们该让蚊子灭绝吗？－－——浅谈基因编辑技术
夏天马上就要到了，你是不是开始担心蚊虫袭扰呢？那么，现在给你一个听起来不可思议的选择——让世界上所有的蚊子都灭绝。是的，听起来难以置信，但如果人类熟练掌握基因编辑技术，这一天可能并不遥远。可是，我们有这个权力吗？ 就在五一节前的短短一周时间里，两场关于基因编辑的讲座在北京相继举行，一场是在北京
使我们成为人类的－被删除的基因
来自耶鲁大学和布罗德研究所的研究人员发现，大约10000个遗传信息片段的缺失使人类与我们最亲近的灵长类亲属有所区别。这些保守的缺失，与认知功能和脑细胞的形成有关，表明了一种进化优势，改变了我们基因的功能，并可能促成了我们独特的人类特征。 根据耶鲁大学、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的研究人
plos－biology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS
基因缺失和重复揭示了我们基因变化的“故事情节”
通过在数目极大的人口中仔细观察拷贝数的差异，研究人员如今对选择过程会如何影响全球各地人口的基因组有了较好的了解。拷贝数差异指的是基因组间的结构差异，它是在DNA的大块部分被复制或删除时发生的。它会涉及含有多个基因的基因组区域或重要的调节区域。由于这个原因，研究人员推测这些变化是受到选择的，但对于
我们为什么要进行蛋白质研究？
蛋白质作为生命活动的直接执行者，参与生命的几乎所有过程，如遗传、发育、繁殖、物质和能量的代谢、应激等等。揭示生物体内成千上万种蛋白质的具体功能机制等是蛋白质研究的核心内容，也是后基因组时代生命科学研究极富挑战的领域之一。 蛋白研究贯穿科学研究的各个领域，至关重要，并且存在巨大的研究空间。
“研究更有效疫苗，我们能走在国际前面”
5月22日，在2023大湾区科学论坛生物医药与健康分论坛上，中国工程院院士钟南山透露，能覆盖XBB变异株的疫苗有2个已经初步被批准，很快能面世。 近日，世界卫生组织（WHO）咨询小组对今年的新冠疫苗加强针更新作出建议，提出新的疫苗应主要针对目前占主导地位的变异株XBB。对此，钟南山表示，研发针
张强：我们的研究要面向国家重大需求
“我更看重的是解决研究领域的真问题，这才是科研价值所在。”清华大学化学工程系教授张强说。组建了一支50多人的团队，多次获得各项奖励，38岁的张强已是国际锂电池研究领域的知名学者。张强很早就下定决心研究锂电，在清华大学读完博士，他又前往美国、德国完成了博士后研究。2011年，张强刚回国，就一头扎进实验