科学家应用单细胞分析发现小肠干细胞分化的过渡态
对小肠LGR5+细胞进行单细胞分析发现两个不同细胞群体 两群细胞都表达干细胞相关基因,但是只有一群能够激活终末细胞标记物的表达 处于多谱系始发态的LGR5+细胞表达双潜能祖细胞的特征 利用生物信息学工具揭示了这些祖细胞均来自LGR5+小肠干细胞 近日,来自美国哈佛大学医学院的研究人员在国际学术期刊Cell Reports上发表了一项最新研究进展,他们利用单细胞分析技术发现Lgr5+小肠干细胞来源的祖细胞实际上包含了两个不同的细胞群体,进一步揭示了小肠干细胞分化过程的最早期步骤。 位于每个小肠肠窝底部的LGR5+小肠干细胞是维持干细胞和小肠上皮细胞自我更新的动力,之前有研究发现干细胞在分化形成具有成熟功能的终末细胞之前会经历短暂扩充祖细胞(transit-amplifying progenitors)阶段,这些小肠双潜能祖细胞会单向分化形成具有吸收功能的细胞或具有分泌功能的细胞。 之前还有研究发现在血液中造血祖细胞......阅读全文
单细胞分析技术的发展趋势
更高的分辨率和灵敏度:不断改进技术以实现对单个细胞内更微量的生物分子(如核酸、蛋白质、代谢物等)进行更精确的检测和定量分析。例如,新一代的测序技术能够检测到更低丰度的 RNA 分子,从而更全面地揭示细胞的转录组信息。多组学整合分析:不再局限于单一类型生物分子的分析,而是将基因组学、转录组学、蛋白质组
单细胞分析之全攻略步骤
分离单个细胞在您研究单个细胞之前,您需要将它可靠地分离。显微抽取、流式细胞术(FACS)、激光捕获显微切割(LCM)都可用来收集单个细胞。每种方法都各有利弊。FACS将细胞分选到PCR板上,与RT-qPCR仪器兼容。此外,FACS可利用特定的细胞标志物实现细胞富集。FACS的通量也比LCM高得多,但
-GEN报告重磅解析单细胞分析技术
本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)市场。 SCA的应用涉及多个的领域,包括癌症、神经科学等。目前,SCA主要应用于生命科学的研究领域,但报告认为,在未来的5-7年,SCA将对诊
单细胞分析技术的应用领域
肿瘤研究:有助于鉴别癌前侵袭、分析原发性肿瘤的克隆进化、研究肿瘤内异质性、解析肿瘤微环境的重编程、探索肿瘤转移机制和治疗抵抗(耐药性)等。与常规的 RNA 测序分析相比,其优势在于更容易找出在治疗和预后条件下有差异表达基因的细胞,同时可以重建分化谱系和差异表达亚型,推断描述克隆亚结构、克隆谱系、重建
单细胞分析促进了分析流程的开发和使用
单细胞分析涵盖了数据导入、存储单细胞实验数据的通用数据结构和用于将原始单细胞数据转换为适合下游分析、交互式数据可视化和下游分析的快速而强大的方法。 基本数据的低维形式和描述细胞或特征属性的元数据也可以存储,数据和结果存储在单个实例中,通过单细胞数据和结果的标准化存储,促进了程序包之间的交互性,并
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展有哪些影响?
单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展具有多方面的重要影响:促进方法的比较和评估为不同的单细胞分析方法提供了共同的测试平台,使得研究人员能够客观地比较各种方法的性能,从而筛选出更优的方法。推动方法的改进和优化当新的分析方法在基准数据集上表现不佳时,能够促使开发者反思和改进算法,以提高准确性和可靠
刘澎涛博士:单细胞RNAseq解析干细胞异质性
最近,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表的一项研究中,来自英国威康信托基金会桑格研究所、剑桥大学、上海交通大学等处的研究人员,采用单细胞转录组分析来解析造血干细胞(HSCs)的分子异质性。这项研究论证了单细胞转录学用于解析干细胞区室中的细胞过程和谱系异构性的效用。 英国威康
单细胞生信分析,新的高分热点
关于单细胞测序(Single cell sequencing,ScRNA-seq),相信大家或多或少都听过,粗略的说,这几点是出现频率比较高的关键词:“很火”、“高端,是发大文章的利器”、“价格贵”。不过,大家如果留意最近单细胞测序相关的文章进展,就会发现这样的一个问题:现在只做单细胞测序,
ICPMS-单细胞纳米多元素分析
不同元素在细胞中的作用,是目前细胞生物学中前沿的研究领域之一。在相关的研究当中,如果能在一次分析中得到单个细胞中的多个元素的信息,将会在提高实验效率的同时,也为研究人员提供更多的研究空间。本期向您介绍高灵敏度、多元素的单细胞分析方案,为帮助您检测单个细胞中的阿克 (ag, 1.0 × 10-
单细胞代谢组分析有了新技术
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518065.shtm
单细胞分析技术的主要挑战有哪些?
单细胞分析技术面临的主要挑战包括:技术复杂性和可重复性:单细胞实验操作流程复杂,需要高度熟练的技术人员。例如,单细胞的分离、捕获和处理过程中的细微差异都可能影响结果的准确性和可重复性。不同实验室之间采用的技术和设备存在差异,导致结果难以直接比较和验证。数据解读和分析的困难:单细胞分析产生的海量数据需
张新荣教授:单细胞质谱分析
清华大学化学系 张新荣教授 2014年4月26日,首届全国质谱分析学术研讨会在北京西郊宾馆盛大开幕。来自清华大学化学系的张新荣教授为大家带来题为《单细胞质谱分析》的报告。据张新荣教授介绍,2013年12月Science杂志专门出了一个专刊“Single-
成体干细胞的优点分析
获取相对容易 源于患者自身的成体干细胞在应用时不存在组织相容性的问题,避免了移植排斥反应和使用免疫抑制剂 理论上,成体干细胞致瘤风险很低,而且所受伦理学争议较少 成体干细胞还具有多向分化潜能
暨南大学报道-造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱
来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院(现为解放军总医院第五医学中心)刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
微流控芯片单细胞克隆形成抑制乳腺癌干细胞药物筛选
大量研究结果提示,肿瘤干细胞(cancer stem cells,CSCs)是肿瘤发生、发展、转移的决定因素,也是导致治疗失败的主要原因。传统肿瘤治疗手段如放疗和化疗,并不能彻底清除肿瘤干细胞而且会对正常组织造成损害。鉴于上述事实,针对肿瘤干细胞的靶向清除方法已成为近期肿瘤治疗的一种新策略。肿瘤干细
彗星分析法(单细胞凝胶电泳分析法)
如果我们能阻止其中的任何一个步骤,癌细胞便无法形成。因此,探测致癌物质的技术与癌细胞的及时发现就显得尤其重要!然而截至目前为止,科学家们仍无法研究出一种简易基因测试法或综合的方法来检测出可能的致癌物。因此,致癌物对DNA的作用仍是癌症研究的一个重要课题。遗传毒物学为一专门研究化学及各类物质对人体遗传
彗星分析法[单细胞凝胶电泳分析法]
治愈癌症(cancer)是一个难题,长期以来研究人员们一直在苦苦探索。我们目前知道,致癌的过程与许多因素有关,但如果我们能阻止其中的任何一个步骤,癌细胞便无法形成。因此,探测致癌物质的技术与癌细胞的及时发现就显得尤其重要!然而截至目前为止,研究人员们仍无法研究出一种简易基因测试法或综合的方法来检测出
单细胞分析技术研究呈“井喷”式增长
近年来,单细胞测序逐渐大众化,相关的论文发表数量在2010年后呈指数增长之势,在高品质期刊上发表的单细胞研究成果屡见不鲜。其产生的影响深远,以致Nature Methods将单细胞测序选为2013年度重大技术,并在2014年首刊专述。 学理工的人大概都有这样的感觉,很多规律和现象都可以用理论、公式
单细胞测序数据的分析有什么意义
单细胞测序可以分析一个细胞里面的基因组序列这个主要适用于受精卵的试管婴儿
单细胞分析技术在生殖医学中的应用
胚胎发育评估:对胚胎细胞进行单细胞分析,筛选出具有良好发育潜能的胚胎,提高试管婴儿的成功率。生殖细胞研究:了解精子和卵子发生过程中的基因表达和染色体异常,为不孕不育的诊断和治疗提供依据。
新技术分析单细胞的染色质构象
分析染色质构象的技术不少,但有的需要大量细胞,有的则分辨率太低。这阻碍了我们对于单细胞中染色质构象的了解。近日,瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员在《Biotechniques》上介绍了一种新方法,能够高分辨率地分析单细胞中染色质的接近程度。 对于理解基因调控、DNA复制和修复来说,研究染色体的
新工具实现贴壁细胞的单细胞分析
美国麻省理工学院的研究人员开发出一种微流体装置,一次能吸取一个细胞内的东西,而不干扰周围的细胞,这为研究人员测定单细胞的生化性质带来了一种新方法。它有助于研究不同干细胞之间的差异,或为什么同一肿瘤的不同细胞有着不同的治疗响应。 MIT电气工程与计算机科学系的Jongyoon
单细胞分析技术在临床上的应用介绍
单细胞分析技术在临床上具有广泛的应用,以下为您详细介绍:在肿瘤学中的应用:肿瘤异质性研究:通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞,揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异,为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如,在乳腺癌中,发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变,导致对特定治疗药物产生抗性
BioMark-HD-平台应用于CTC单细胞分析
按:一种可以从癌症病人全血中分离表面抗原EpCAM阴性或阳性的循环肿瘤细胞(CTC)的装置(CTC-iChip)最近被开发出来,结合Fluidigm Corporation 的BioMarK HD 平台,可以对CTC进行单细胞水平的分析,有力的推进了CTC分析在癌症临床检测及监测中的应用。 人们通常
百花齐放的单细胞分析技术
世界上没有完全相同的两片树叶,世界上也没有两个相同的细胞,单个细胞都是dute的,它们在大小、蛋白质水平和所表达的RNA转录子方面都可能相差甚远。单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)即是对单个细胞进行研究,研究单个细胞不仅可以很好的认识到细胞异质性,而且可以更好的对疾病进
用ICPMS分析单细胞的新技术
【摘要】当DVS Sciences公司的技术总监Scott Tanner第一次与斯坦福大学遗传学家Garry Nolan探讨一种新型的质谱分析仪器的时候,Nolan就认为这一想法也许会成为一种热卖的产品,在这之后DVS Sciences公司推出了一个新型细胞分析方法平台:CyTOF Mass C
单细胞分析技术的发展趋势是什么?
单细胞分析技术的发展呈现出以下几个主要趋势: 1. **更高的分辨率和灵敏度**: - 能够检测到更微量的生物分子,更精确地反映细胞内的细微变化。例如,在单细胞蛋白质组学中,新的检测方法将能够识别更低丰度的蛋白质,从而发现更多与疾病相关的关键分子。 - 对于单细胞 RNA 测序
单细胞分析技术在肿瘤学中的应用
肿瘤异质性研究:通过分析肿瘤组织中的单个癌细胞,揭示不同癌细胞之间的基因表达、突变和蛋白水平的差异,为理解肿瘤的发生、发展和耐药机制提供关键信息。例如,在乳腺癌中,发现某些肿瘤细胞具有特定的基因突变,导致对特定治疗药物产生抗性。肿瘤微环境分析:了解肿瘤细胞与免疫细胞、基质细胞等微环境成分之间的相互作
单细胞分析技术的应用会带来哪些挑战?
单细胞分析技术的应用面临以下一些挑战:技术复杂性和成本:单细胞分析涉及到复杂的实验流程和高端的仪器设备,这不仅需要专业的技术人员进行操作和维护,也使得实验成本相对较高,限制了其广泛应用。数据处理和分析的难度:单细胞产生的数据集通常非常庞大且复杂,需要强大的计算资源和专业的生物信息学知识来处理和分析。
单细胞分析技术在癌症研究中应用介绍
单细胞分析技术在癌症研究中的最新进展包括以下几个方面:多组学整合分析:将单细胞的基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组等多组学数据进行整合分析,更全面地揭示癌症细胞的特征和分子机制。例如,通过同时分析单细胞的 DNA 甲基化和基因表达,发现新的肿瘤抑制基因的失活机制。空间单细胞分析:结合空间转录组学和