科学家应用单细胞分析发现小肠干细胞分化的过渡态
对小肠LGR5+细胞进行单细胞分析发现两个不同细胞群体 两群细胞都表达干细胞相关基因,但是只有一群能够激活终末细胞标记物的表达 处于多谱系始发态的LGR5+细胞表达双潜能祖细胞的特征 利用生物信息学工具揭示了这些祖细胞均来自LGR5+小肠干细胞 近日,来自美国哈佛大学医学院的研究人员在国际学术期刊Cell Reports上发表了一项最新研究进展,他们利用单细胞分析技术发现Lgr5+小肠干细胞来源的祖细胞实际上包含了两个不同的细胞群体,进一步揭示了小肠干细胞分化过程的最早期步骤。 位于每个小肠肠窝底部的LGR5+小肠干细胞是维持干细胞和小肠上皮细胞自我更新的动力,之前有研究发现干细胞在分化形成具有成熟功能的终末细胞之前会经历短暂扩充祖细胞(transit-amplifying progenitors)阶段,这些小肠双潜能祖细胞会单向分化形成具有吸收功能的细胞或具有分泌功能的细胞。 之前还有研究发现在血液中造血祖细胞......阅读全文
Nature:单细胞分析力撑癌症干细胞理论
麻省总医院MGH、Broad研究所的研究人员在单细胞水平上对脑瘤进行基因组分析,首次在人类脑瘤样本中鉴定到了癌症干细胞及其分化后代。这项重要的研究成果十一月二日发表在Nature杂志上。少突胶质细胞瘤是一种生长缓慢但无法治愈的脑瘤。“我们提出了强有力的证据,证明癌症干细胞是少突胶质细胞瘤的主要生长源
Nature:新型单细胞分析技术揭示干细胞中的复杂突变
近日,来自波士顿儿童医院等处的研究人员利用新型的单细胞基因分析技术揭示了多能干细胞的多种遗传突变,相关研究刊登于国际著名杂志Nature上,为后期开发治疗疾病的新型再生性疗法提供了一定的帮助和希望。 研究者James Collins表示,在单一细胞之间干细胞群体会包含许多差异,而这在干细胞工程
Cell子刊综述:干细胞研究单细胞定量分析
了解调控细胞命运的关键分子是干细胞研究的核心问题,这需要在单细胞水平上定量分析分子和细胞行为。近年来技术进展实现了单个细胞高通量分子解析,以及持续性的非侵入式细胞行为观察。 Cell Stem Cell发布综述:“Quantitative Single-Cell Approaches to S
Nature:单细胞分析阐明癌症干细胞在脑癌中的关键角色
近日,来自麻省总医院、博德研究所及哈佛大学的研究人员通过联合研究,在单细胞水平上对脑瘤基因组进行了分析,他们发现,癌症干细胞或许能够诱发少突神经胶质瘤的发生,少突神经胶质瘤是一种缓慢发展但却非常难以治愈的脑癌,相关研究刊登于Nature杂志上,同时研究者还首次在人类脑瘤样本中鉴别出了癌症干细胞及
科学家应用单细胞分析发现小肠干细胞分化的过渡态
对小肠LGR5+细胞进行单细胞分析发现两个不同细胞群体 两群细胞都表达干细胞相关基因,但是只有一群能够激活终末细胞标记物的表达 处于多谱系始发态的LGR5+细胞表达双潜能祖细胞的特征 利用生物信息学工具揭示了这些祖细胞均来自LGR5+小肠干细胞 近日,来自美国哈佛大学医学院的研究人员在国
汤富酬最新综述:单细胞测序与干细胞
干细胞能够分化成为机体内任何类型的细胞,既是研究人体早期发育的理想工具,也是细胞治疗的宝贵资源。细胞间差异和异质性是干细胞群体固有的基本特性。如果我们对一群细胞进行组学分析,这些关键的信息就会被掩盖。 单细胞测序技术是近几年备受关注的强大工具,可以在同种干细胞中全面剖析细胞异质性,鉴定不同表型
干细胞先驱发表单细胞RNA测序新成果
人多能干细胞是研究人类胚胎发育的理想模型,可以揭示谱系分化背后的细胞和分子机制。不过,人们还不清楚单个干细胞如何退出多能状态并转化为相应的前体细胞。 Morgridge研究院的科学家们使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,对来自人胚胎干细胞的谱系特异性前体细胞进行了转录组分析,揭示了
新型单细胞活性分析技术
近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究论文中,来自加利福尼亚大学的研究人员通过运用一种分析单一细胞基因活性的先进技术,鉴别出了人类大脑脑细胞的特性,该研究揭示,如今进行大规模的细胞调查分析比过去我们所认为的要更加高效,而且廉价。 研究者Arnold
单细胞分析重大突破
生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上,
单细胞分选效率的分析
引言在单克隆细胞培养时,手动有限稀释法是最经典的分离单细胞手段之一。这种方式分离单细胞,每个孔中落进去的细胞数目符合泊松分布。依靠单细胞分选仪器分离单细胞的效率,无论从分选能力还是重复性都要明显优于手动的有限稀释方法。测定一款设备分选效率的标准方法,是用荧光校准微球来分选检验。实验方法Namocel
单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析
单细胞分离目前主要有三种选择:手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不断涌现,能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。 将细胞分散到悬液中,会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境,就需要用到激光捕获显微切割技术,这种技术通过扫描组织切片来
单细胞蛋白质定量技术解析干细胞异质性
干细胞是具有自我更新和多向分化潜能的未分化细胞。体内或体外研究表明, 干细胞具有表型及功能的异质性, 这一特性也决定了其不同的分化和再生能力。越来越多的证据表明, 干细胞自我更新及分化的分子机制以及与干细胞功能失调的相关疾病的产生都是在单细胞水平发生的, 基于异质性的干细胞群体的研究结果
单细胞水平揭示造血干细胞扩增的动态图谱
造血干细胞具有自我更新和分化的生物学特征,既可以维持其自身在造血组织中的恒定数量,又能向红系、粒系、巨核系和淋巴系等多种血细胞分化。造血干细胞移植广泛应用于白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征等临床血液系统恶性肿瘤的治疗,然而,造血干细胞来源不足,限制其广泛应用。因此,如何模拟体内造血干细
单细胞RNAseq发现调节干细胞发育的新基因
最近,Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量,揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因,以及新 的细胞亚群,可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源
单细胞分析技术的应用前景
单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景,主要体现在以下几个重要方面:癌症研究与治疗:肿瘤异质性分析:能够揭示肿瘤内部不同细胞的基因表达、突变和细胞周期状态等的差异,帮助理解肿瘤的发生、发展、转移机制以及耐药性的产生。精准治疗:指导个性化的癌症治疗方案,例如确定对特定药物敏感的肿瘤细胞亚群,从而提
单细胞分析技术的应用前景
单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够在疾病症状出现之前检测到细胞层面的细微变化,实现超早期诊断。例如,在癌症的萌芽阶段,识别出具有恶变倾向的单个细胞,大幅提高患者的生存率。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,为其定制个性化的治疗方案,包括选择最有效的药物和
结肠癌亚型单细胞分析
一项由新加坡(通讯作者Shyam Prabhakar和Iain Beehuat Tan)、印度、美国(通讯作者Paul Robson)三国共同开展的计算基因组学项目,鉴定了11种结肠癌肿瘤和附近临近的非癌细胞的细胞组成。为更有针对性的结肠癌诊断和治疗开启了一扇门。 来自杰克逊实验室的科学家,本
单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多个发育轨迹和
单细胞研究促生肌腱干细胞生物学新见解
近日,Science旗下子刊《Science Advances》在线发表了浙江大学李达三•叶耀珍干细胞与再生医学研究中心欧阳宏伟教授课题组题为“Single-cell analysis reveals a nestin+ tendon stem/progenitor cell populatio
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
单细胞分析揭示癌症异质性
2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以
单细胞分析之全攻略(上)
均值虽然有用,但无法准确反映单个细胞的表型,它们有时差异甚大。而这些表达上的差异也许包含了重要的信息,有助于我们了解癌症、确定治疗是否有效、鉴定免疫反应等。近两年,单细胞分析发展迅速,文章数以每年40%的速度增长。单细胞方法让微生物学家能够着手研究无法培养且数量有限的微生物,同时也让干细胞研究人员能
单细胞分析色谱仪分类方法
单细胞分析色谱仪种类有多种。1、按流动相物理状态可分:气相单细胞分析色谱仪和液相单细胞分析色谱仪。2、按洗脱方式可分:等度洗脱单细胞分析色谱仪和梯度洗脱单细胞分析色谱仪。3、按产地可分:国产单细胞分析色谱仪和进口单细胞分析色谱仪。4、按分离规模可分:微型单细胞分析色谱仪、小型单细胞分析色谱仪和大型单
低成本单细胞分析新型“移动”设备
近年来人们发现研究单细胞如何影响疾病和治疗反应的潜力越来越大,但是由于缺乏富于成本效益和便于操作的仪器,现阶段单细胞分析的应用发展尚比较受限。 新年伊始,纽约基因组研究中心和纽约大学2月23日在《Nature Communications》发表文章,向我们介绍了一款3D打印便携式低成本微流控单
单细胞分析技术的应用领域
肿瘤研究:有助于鉴别癌前侵袭、分析原发性肿瘤的克隆进化、研究肿瘤内异质性、解析肿瘤微环境的重编程、探索肿瘤转移机制和治疗抵抗(耐药性)等。与常规的 RNA 测序分析相比,其优势在于更容易找出在治疗和预后条件下有差异表达基因的细胞,同时可以重建分化谱系和差异表达亚型,推断描述克隆亚结构、克隆谱系、重建
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
单细胞分析之全攻略步骤
分离单个细胞在您研究单个细胞之前,您需要将它可靠地分离。显微抽取、流式细胞术(FACS)、激光捕获显微切割(LCM)都可用来收集单个细胞。每种方法都各有利弊。FACS将细胞分选到PCR板上,与RT-qPCR仪器兼容。此外,FACS可利用特定的细胞标志物实现细胞富集。FACS的通量也比LCM高得多,但
单细胞分析技术的发展趋势
更高的分辨率和灵敏度:不断改进技术以实现对单个细胞内更微量的生物分子(如核酸、蛋白质、代谢物等)进行更精确的检测和定量分析。例如,新一代的测序技术能够检测到更低丰度的 RNA 分子,从而更全面地揭示细胞的转录组信息。多组学整合分析:不再局限于单一类型生物分子的分析,而是将基因组学、转录组学、蛋白质组
-GEN报告重磅解析单细胞分析技术
本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)市场。 SCA的应用涉及多个的领域,包括癌症、神经科学等。目前,SCA主要应用于生命科学的研究领域,但报告认为,在未来的5-7年,SCA将对诊
单细胞分析技术的发展历程如下:
单细胞分析技术的发展历程如下: -早期阶段:在单细胞分析技术出现之前,人们只能通过显微成像或者流式细胞技术进行细胞水平的研究。显微镜观测或者HE染色、免疫组化、免疫荧光等技术可观察的细胞数量有限。流式细胞术可以高速分析上万个细胞,并同时从一个细胞中测得多个参数,但参数类型和数量都比较局限。 - 单细