Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集来自自然的教训用于应对能源和环境的挑战。 然而要探索地球微生物的多样性,要求更多地了解较少研究的,微生物和感染它们的病毒,影响微生物调控全球循环能力的病毒之间的关系。尽管据估计病毒的数量至少比地球上的微生物细胞高出两个数量级,在序列数据库中相比约5万的细菌基因组,当前的测序DNA病毒基因组不超过2,200个。 在发表于8月17日《自然》(Nature)杂志上的一项研究中,美国能源部联合基因组研究院(DOE JGI)的研究人员利用来自世界各地最大规模采集的组装宏基因组数据集,揭示出了125,000个部分及完整的病毒基因组,其中大多数......阅读全文

华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目

  华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”),将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序,以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。  EMP将对来自全球的20万个样本进

宏基因组学:查明微生物身份新手段

  背景   《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以

我国首次完成寨卡病毒全基因组序列测定

  2月22日,记者从军事医学科学院获悉,该院与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作,在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后,采用高通量测序技术,于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。  寨卡病毒属黄病毒科,是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河

新冠病毒源自哪里?基因组分析解读秒懂

  研究小组分析了2019年12月至2020年3月间测定的各国患者感染的新冠病毒基因组。结果发现全球新冠病毒分为三个有密切“血缘关系”的不同“变体”,分别标记为“A”、“B”和“C”。  美国和澳大利亚的患者主要感染的是A型病毒,在武汉居住的美国人中也发现了A的变异版本。  武汉甚至整个东亚地区主要

PNAs:人类基因组中藏着病毒的“灵魂”

  研究者们发现,从远古时期开始,我们的祖先的DNA中就藏有病毒的"灵魂"。其中一些病毒一旦被唤醒,将会是十分危险的。最近一项研究中,科学家们找到了新的藏在我们DNA中的病毒"灵魂"。  通过筛查2500份人类基因组,研究者们发现有36种病毒随着进化过程在不断地累积。其中有19种病毒此前从未见过,其

中国疾控中心已完成测序MERS病毒基因组

  中国疾控中心近日透露,该中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作,已完成我国首例MERS病例的病毒全基因组序列测定。  6月10日信息显示,韩国目前中东呼吸综合征(MERS)确诊病例为108人,死亡9人,死亡率在7%左右。韩国病例数仅次于沙特,列世界第二。近期MERS在韩国连续报告多例病例,被隔

Cell重磅发布15万人体微生物基因组!-揭示微生物新物种

  微生物宏基因组是当今世界最热门的科研领域之一。越来越多的研究表明,人体微生物发挥着重要的健康作用,但大部分多样性仍未得到充分探索,尤其是在除肠道以外的身体部位及非西方人群。  在今日发表在Cell期刊的一项研究中,由意大利特伦托大学Nicola Segata领导的研究团队利用来自不同地理位置、生

丙肝病毒的微生物学诊断

  RIA或者ELISA  即:放射免疫诊断(RIA)或酶联免疫试验(ELISA)检测血清中抗HCV  1989年,Kuo等建立了抗-C-100放射免疫试验方法(RIA),随后 Ortho公司又研制成功酶联免疫试验方法(ELISA)检测抗-C-100。这两种方法均用重组酵母表达的病毒抗原(C-100

微生物检验:单纯疱疹病毒致病性

病人和健康是传染源,主要通过直接密切接触和性接触传播。HSV经口腔、呼吸道、生殖道粘膜和破损皮肤等多种途径侵入机体。人感染非常普遍,感染率达80~90%,常见的临床表现是粘膜或皮肤局部集聚的疱疹,偶而也可发生严重的全身性疾病,累及内脏。(一)原发感染6个月以内婴儿多从母体通过胎盘获得抗体,初次感染约

微生物的分类(思维导图):细菌,真菌,病毒

《生物圈中的微生物》主题单元教学设计 主题单元标题 生物圈中的微生物 所需时间 课内共用4 课时,每周3 课时 主题单元学习概述 生物圈中的微生物是生物课程内容十大主题之一。微生物种类多,数量大,在生物圈中的分布范围极其广泛,不仅在促进生物圈的物质循环中起着十分重要的作用,而且与生物圈中的绿色植物、

免疫缺陷病毒的微生物学诊断

  检测HIV感染者体液中病毒抗原和抗体的方法,操作方便,易于普及应用,其中抗体检测尤普通。但HIV P24抗原和病毒基因的测定,在HIV感染检测中的地位和重要性也日益受到重视。  抗体检测  主要有酶联免疫吸附试验(ELISA)和免疫荧光试验(IFA)。ELISA用去污剂裂解HIV或感染细胞液提取

微生物等揭示寨卡病毒保护性抗体结合病毒的分子基础

  寨卡疫情自2015年在巴西爆发以来已迅速蔓延至南美其他各国、中北美加勒比海地区,并进一步扩散到全球66个国家和地区。我国于今年2月第一例输入性病例起至今已有12人感染了寨卡病毒。目前,越来越多研究表明寨卡病毒感染与胎儿和新生儿小头症畸形密切相关,该病毒的感染还能引起许多神经系统的疾病,比如格林巴

英国发布新型冠状病毒完整基因组测序结果

        前段时间一种与“非典”病毒相近的新型冠状病毒的出现曾引起各方高度关注,英国卫生部门日前发布了这种病毒的完整基因组测序结果,希望有助于对其研究和防治。   新型冠状病毒之所以引起高度关注,是因为曾造成极大恐慌的“非典”(SARS)病毒与它同属冠状病毒。但基因分析显示,与新型冠状病毒

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组

  新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说,该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制,寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。   相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说,艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA

  基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀

动物、植物、微生物中提取高质量的基因组DNA

  概 述   基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则

中美携手合作“十万食源性病原微生物基因组计划”

  5月28日,北京诺赛基因组研究中心(国家人类基因组北方研究中心)、北京师范大学、中国科学院微生物研究所与美国加州大学戴维斯分校在北京师范大学就“十万食源性病原微生物基因组计划”达成合作协议。据悉,中美双方将共同参与十万食源性病原微生物基因组计划的研发,建立重要的食源性致病微生物基因序列综合数据库

我国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目

  近日,深圳华大基因研究院宣布,我国科学家将参与全球最大微生物基因组研究项目,对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或宏基因组测序,从而建立一个全球性的基因图谱,并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性研究全球范围内微生物群落功能及进化多样性,以便更好地造福社会及人类。  与以往的微

病毒的致肿瘤作用微生物与寄生虫

有一些病毒能诱发良性肿瘤,如痘病毒科的兔纤维瘤病毒、人传染性软疣病毒和乳多泡病毒科的乳头瘤病毒; 有一些病毒能诱发良性肿瘤,如痘病毒科的兔纤维瘤病毒、人传染性软疣病毒和乳多泡病毒科的乳头瘤病毒;另有一些能诱发恶性肿瘤,按其核酸种类可分为DNA肿瘤病毒和RNA肿瘤病毒。DNA肿瘤病毒包括乳多泡病毒料的

生物活性缺损病毒分类微生物与寄生虫

生物活性的缺损病毒分类是微生物与寄生虫检验考试复习需要了解的知识,医学|教育网搜集整理了相关内容与考生分享。1.干扰缺损病毒又称干扰缺损颗粒(defective interfering particles,DI颗粒),是病毒复制时产生的一类亚基因组的缺失突变体,必须依赖于其同源的完全病毒才能复制。D

微生物学技术:病毒的鸡胚培养

一、目的要求掌握鸡胚尿囊腔接种培养新城疫病毒的操作技术。二、器材1.鸡胚 应选用健康鸡群的受精蛋,接种鸡的鸡胚应无母源抗体,以免影响病毒在胚胎中的增殖。实验用的鸡胚多采用9—10日龄的活胚。2.接种材料 新城疫I系疫苗3.各种器械 孵卵器、照蛋箱、蛋架、打孔器、1ml结核菌素注射器、41/2号注射针

病毒感染的微生物学检查方法

经典的病毒学检查方法包括病毒分离鉴定和血清学诊断(抗体的检测)。由于分子病毒学和免疫学的发展,近年来又建立了许多诊断方法,包括电镜直接观察形态、检查病毒抗原、核酸等,使得病毒感染的快速诊断成为可能(图1)。图1病毒感染的实验室诊断方法  一、形态学检查  电子显微镜(electromicroscop

副流感病毒的微生物学检查

微生物学检查(1)标本采集和处理:采集发病早期标本,成人可采取鼻咽分泌物及咽嗽液标本,年幼患者可用咽拭子涂咽后壁,然后放入2ml收集液中,搅拌后,立即接种细胞。(2)分离培养:最敏感的细胞是原代人胚肾和原代猴肾细胞。(3)病毒鉴定:最常用的方法是红细胞吸附抑制试验,亦可用血凝抑制试验,中和试验和补体

微生物所揭示D型流感病毒入侵机制

  流感病毒是重要的病原体之一,不仅严重威胁人类健康,而且给畜牧业生产造成重大损失。之前流感病毒一直分为A、B和C三个类型,从2011年起科学家陆续在猪和牛体内分离到新的流感病毒,由于此新病毒与A、B、C型流感病毒差异很大,被定义为新的D型流感病毒。新发现的D型流感病毒与C型流感病毒最为相似,但不能

微生物所解析寨卡病毒蛋白晶体结构

  中国科学院微生物研究所研究员施一和中国科学院院士高福团队通力合作在揭示寨卡病毒致病机制方面取得新进展,研究结果以Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses(《寨卡病

便携式基因组测序装置可快速检测埃博拉病毒

   [导读] 本周出版的英国《自然》杂志上发表的一项传染病学研究论文,描述了一个可以被装入行李箱并运输到现场使用的埃博拉病毒基因组测序监测系统,这个系统在收集样本后24小时内就可以得出结果。  该便携式基因组测序装置可插入笔记本电脑USB接口   科技日报北京2月4日电 (记者张梦然)本周出版的英

eLIFE:艾滋病毒,人类基因组编辑新工具

  丹麦奥胡斯大学开发出了一项新技术利用HIV病毒来作为对抗遗传性疾病的一种工具。  研究人员首次成功地改造了HIV病毒颗粒,使得它们能够通过一些生物学过程(可以说是)同时“剪切和粘贴”我们的基因组。由奥胡斯大学生物医学系开发的这项新技术,使得以一种新的方式修复基因组变为可能(延伸阅读:2014值得

新冠病毒基因组测序的方法有哪几种?

新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。