Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集来自自然的教训用于应对能源和环境的挑战。 然而要探索地球微生物的多样性,要求更多地了解较少研究的,微生物和感染它们的病毒,影响微生物调控全球循环能力的病毒之间的关系。尽管据估计病毒的数量至少比地球上的微生物细胞高出两个数量级,在序列数据库中相比约5万的细菌基因组,当前的测序DNA病毒基因组不超过2,200个。 在发表于8月17日《自然》(Nature)杂志上的一项研究中,美国能源部联合基因组研究院(DOE JGI)的研究人员利用来自世界各地最大规模采集的组装宏基因组数据集,揭示出了125,000个部分及完整的病毒基因组,其中大多数......阅读全文
关于病毒基因组的基本介绍
病毒是最简单的生物,完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA(有些病毒的外壳蛋白外面有一层由宿主细胞构成的被膜(envelope),被膜内含有病毒基因编码的糖蛋白。病毒不能独立地复制,必需进入宿主细胞中借助细胞内的一些酶类和细胞器才能使病毒得以复制。外壳蛋白(或被膜)的功能是识别和
病毒基因组的结构特点介绍
1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小,但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也较小,只能编码4种蛋白质,而痘病毒的基因组有300kb之大,可以编码几百种蛋白质,不但为病毒复制所涉及的酶类编码,甚至为核苷酸代谢的酶类编码,因此
SARS病毒基因组复制机制研究获突破
近日,武汉大学生命科学学院教授郭德银领导的研究组以选择冠状病毒特有的多个RNA加工酶作为主要研究目标,通过酵母菌系统的功能筛选和体外生物化学分析,发现SARS病毒基因组1b区编码的一种非结构蛋白nsp14同时具有两种RNA加工酶活性,一是参与RNA 5’-端加帽的N7-甲基转移酶,二是进行RNA
牛乳头瘤病毒基因组结构和功能
乳头瘤病毒(papillomavirus)是感染人和动物皮肤、粘膜并引起乳头状瘤病变的一种DNA病毒,属于乳多空泡病毒(papovavirus)科。根据病毒感染的宿主不同可以分为牛乳头瘤病毒(BPV),人乳头瘤病毒(HPV)等。已发现的乳头瘤病毒基因组都具有相似的结构。下面以BPV为例说明乳头瘤
酵母还能快速“重建”新冠病毒基因组?
据《自然》杂志6日发表的一项合成生物学研究,瑞士一个研究团队开发出一种可以快速重建新冠病毒的方法。重建病毒有助于研究人员开发诊疗方法和疫苗,同时,拥有合成能力也被认为是未来防治相关疫情的重要一环。 在实验室重建病毒,是一种有效的研究疾病暴发所涉病原体的方法。发生疫情时,将病毒样本送至研究机构可
Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组
据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
中国疾控中心已完成测序MERS病毒基因组
中国疾控中心近日透露,该中心病毒病所与广东省及惠州市疾控中心合作,已完成我国首例MERS病例的病毒全基因组序列测定。 6月10日信息显示,韩国目前中东呼吸综合征(MERS)确诊病例为108人,死亡9人,死亡率在7%左右。韩国病例数仅次于沙特,列世界第二。近期MERS在韩国连续报告多例病例,被隔
Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序
人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。 该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋
Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集
Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组
在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集
首次发现细菌病毒携带动物DNA
科学家发现,侵入细菌的一种病毒中潜伏着很多能表达出毒性蛋白的基因。这些基因本非病毒基因组的基因,而是来自于黑寡妇毒液基因以及其他一些动物的DNA。研究者们认为,要么是病毒偷窃了其他生物的基因,要么是其他生物的DNA入侵了病毒基因组。 病毒是一种充满争议的生物。他们几乎可以入侵感染三界(动物、植
破解埃博拉病毒基因组从头起始复制的分子机制
9月12日,中国科学院微生物研究所施一、齐建勋、高福院士团队,在《自然》(Nature)上,发表了题为Molecular mechanism of de novo replication by the Ebola virus polymerase的研究文章,首次报道了nsNSV聚合酶识别3’-l
新冠病毒基因组测序的方法有哪几种?
新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介病毒总核酸提取试剂盒适合于从血清、血浆、组织匀浆等样品中提取病毒总核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀。该产品已经成功地提取了乙肝A/C、丙肝、以及诺如病毒标准品等的核酸。获得的DNA/RNA可直接用于
乙肝病毒基因组的结构特点和功能介绍
乙肝病毒(HBV)的基因组DNA结构很奇特,是一环状的部分双螺旋结构,长约3.2kb。其中的2/3为双螺旋结构,1/3为单链,这就是说,DNA中的两条链不等长。长链的5'端与3'端无共价连接,而是与一种蛋白质共价相连。长链的5'端以250-300对碱基互补结合。长链为负链
中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展
中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展,研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》,并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员
细菌基因组DNA提取实验
细菌基因组DNA提取可应用于:(1)获得细菌基因组DNA;(2)作为PCR模板;(3)用于测序、遗传信息分析等。实验方法原理本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DN
细菌基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0×109 细菌中获得多至20 μg 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD、RFLD 等分子生物学实验。实验材料 细菌培养物
细菌基因组DNA提取实验
实验方法原理 本试剂盒采用独特的细胞裂解和相分离技术,结合DNA 制备膜选择性地吸附DNA 的方法达到纯化基因组DNA 的目的。适合于从1.0x109 细菌中获得多至20 ug 的基因组DNA。用于PCR、Southern 印迹分析、RAPD
吉林病例与北京、内蒙古疫情病毒基因组高度同源
12日,吉林省吉林市召开新冠肺炎疫情防控新闻发布会通报称,12日吉林省对吉林市11月10日报告的新冠肺炎确诊病例完成基因组测序,比对分析结果显示,病毒属于德尔塔变异株,同北京市11月11日报送的5例病例及内蒙古额济纳旗关联疫情代表株共享44个突变位点,病毒基因组高度同源。 据通报,吉林市11月1
瑞丽:此次疫情病毒基因组序列与德尔塔变异株高度同源
7月7日,记者从瑞丽市新冠肺炎疫情防控新闻发布会(第三场)上获悉,为加快基因测序速度,云南省疾控中心紧急调运一台基因测序设备到瑞丽,设立临时基因测序实验室,并派出专业技术人员对检出的阳性样本进行新冠肺炎基因测序。目前,已完成7份阳性样本测序,结果表明,基因组序列与德尔塔(Delta)变异株高度同
一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列
一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列
随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列
Science:科学家挖掘冠状病毒基因组,寻找源头线索
中国科学家正在研究从广东捕捉到的蝙蝠,图源ECOHEALTH ALLIANCE 2020年1月31日,世界顶级期刊Science发布了一篇有关此次新冠病毒的最新科学报道,该报道指出,科学家们正在不断努力挖掘新冠病毒的基因组,通过对病毒基因组的探究,从而试图了解2019-nCoV的起源以及其是否与蝙
寨卡病毒基因组RNA结构与感染性的关系
2018年11月21日,清华大学生命科学学院张强锋课题组、药学院谭旭课题组在《细胞宿主与微生物》(Cell Host & Mircobe)期刊在线发表题为《寨卡病毒基因组RNA结构的综合分析揭示了病毒感染性的关键决定因素》(Integrative Analysis of
新技术拍全身照艾滋病毒基因组结构首破译
美国北卡罗来纳大学8月5日发布新闻公报称,该校研究人员通过使用一种新的成像技术,首次破译出完整的艾滋病病毒(HIV)基因组结构。这对于了解人类艾滋病具有普遍意义,将有效推进抗艾滋病药物和抗流感病毒药物的研发步伐。该研究成果刊登在8月6日的《自然》杂志上。 人类免疫系统缺陷病毒(HIV)是一
乙肝病毒基因组嵌入人类基因与癌变相关
日本理化学研究所和广岛大学近日宣布,他们的联合研究小组对肝脏感染乙型肝炎病毒(HBV)进行基因组分析,发现了乙肝病毒嵌入人类基因组的机制和病毒致癌的部分机制。 全世界约3.5亿人感染乙肝病毒,每年约88万人因乙肝病毒死亡。乙肝病毒感染治疗手段有限,主要使用干扰素和核酸模拟制剂,不但需要长期服药
BIOG血清、血浆游离DNA提取试剂盒(病毒基因组DNA提取)...
BIOG血清、血浆游离DNA提取试剂盒(病毒基因组DNA提取)使用说明特点◎操作简便快速,可在半小时内获得理想的DNA;◎提取DNA纯度高,无抑制剂,A260/A280为1.7-1.9;◎产量更高,较国内同类产品高出20%;◎可用于血清、血浆等游离样本中DNA的提取;◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂,安全
Nature-Microbiology-:成功绘制出甲型流感病毒基因组的结构
近日,一项刊登在国际杂志Nature Microbiology上的研究报告中,来自英国、澳大利亚和美国的科学家们通过研究绘制出了甲型流感病毒基因组的结构,文章中,研究人员描述了他们对甲型流感病毒的遗传分析以及其基因组的特性。 随着时间推移,微生物学家们和卫生官员都非常担心未来致命性的流感病毒会
细菌中制备基因组DNA实验
小量制备 氯化铯法 实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿