武汉病毒所获得首个病毒RdRP转位中间体晶体结构
核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器,是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下,聚合酶以NTP或dNTP为底物将单磷酸核苷(NMP)逐个添加到产物链上。每一次添加过程又称核苷酸添加循环(nucleotide addition cycle或NAC),由底物结合并诱导活性中心关闭、磷酰基转移反应以及聚合酶向模板下游转位三个主要步骤构成,其分子机制是聚合酶领域的核心研究内容。 RNA病毒对人类健康构成严重威胁,超过三分之二的传染性疾病由RNA病毒引起,这类病毒的基因组复制和基因转录由依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase 或 RdRP)执行。前期研究表明,RdRP与DNA聚合酶、依赖DNA的RNA聚合酶、反转录酶等其他主要类型的聚合酶相比,在活性中心关闭和转位这两个关键步骤上具有鲜明的独特性,解析其精确机制将对相关抗病毒研究提供重要依据。中国科学院武汉病毒研究所研究员龚......阅读全文
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合
RNA聚合酶的基本信息
RNA聚合酶(RNA polymerase)是以一条DNA链或RNA为模板,三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶,因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关,所以也称转录酶。
沉淀-σ32-和-RNA-聚合酶实验
试剂、试剂盒 聚乙烯亚胺仪器、耗材 SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶实验步骤 材料与设备SDS-PAGE 电泳装置聚丙烯酰胺小胶(10%)试剂聚乙烯亚胺(PEI)(6% 储液,pH7.9)(配方,见“试剂的配制”,pp.184~189)操作程序1)0.2%DOC 上清 (见 p.153)
以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测...
以丙肝病毒血清样本为例介绍如何提高RNA病毒核酸检测灵敏度这段时间普通民众都是谈新冠病毒色变,无非印证了一句话「人们对不了解的事物才会感到恐惧」。为了减少我们的恐惧感,让我们来深入了解新闻发布会上不断提及的「新冠病毒核酸检测」吧。首先分享中国疾控中心发布的检测新冠病毒的引物、探针序列:推荐选用针对新
哪些病毒属于RNA病毒?
RNA病毒是指病毒的遗传物质为核糖核酸(RNA)的一类病毒。这类病毒包括了多种类型,常见的有流感病毒、艾滋病毒(HIV)、丙肝病毒(HCV)、冠状病毒(包括新型冠状病毒SARS-CoV-2)、鼻病毒等。这些病毒在全球范围内都有分布,且有些还会引起季节性流行或在特定地区流行,例如流感病毒和冠状病毒
RNA病毒介绍
RNA是核糖核酸,single-stranded是单链。一般看脱氧核糖核酸(DNA)的图片都是有两条链扭在一起,而核糖核酸一般都是单链的。讲到ssRNA,一般都是在说RNA病毒。一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。(1)正链RNA病毒(
研究团队解析新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构
近日,“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp(RNA依赖的RNA聚合酶)-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构,揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。新型冠状病毒RdRp
通过记录RNA聚合酶观察早期RNA转录动力学
科学家们通过记录RNA聚合酶在何时何地通过与DNA序列结合启动转录,观察了早期RNA转录动力学。 生命的活动是通过蛋白质的制造而发生的,蛋白质赋予我们的细胞结构和功能。细胞蛋白质从DNA编码的基因指令中获得行进顺序,他们的序列首先被复制并在一个叫做转录的多步骤过程中被制造成RNA。 科罗拉多
关于RNA聚合酶的参与过程简介
该酶需要四种核糖核苷酸三磷酸(NTP:ATP、GTP、CTP、UTP)作为RNA聚合酶的底物,DNA为模板,二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3',第一个核苷酸带有3个磷酸基。
RNA-SI-核酸酶作图
实验材料 [γ-32P」ATP合适的寡核苷酸DNA 模板l10XdNTP 混合物KLenow 片段合适的限 制性内切核酸酶X 射线胶片洗脱缓冲液tRNA 石蜡油S1 核酸酶试剂、试剂盒 10X 激酶缓冲液PNK10X 复性缓冲液6% 聚丙烯酰胺 8mol L 尿素溶液 (溶于 0.5XTBE) 及甲
FFPE样本核酸(DNA/RNA)制备
福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析,开发特定的操作步骤,考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp
RNA-SI-核酸酶作图
实验材料 [γ-32P」ATP 合适的寡核苷酸 DNA 模板l 10XdNTP 混合物 KLenow 片段 合适的限 制性内切核酸酶
研究报道首个病毒RdRP转位中间体晶体结构
核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器,是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下,聚合酶以NTP或dNTP为底物将单磷酸核苷(NMP)逐个添加到产物链上。每一次添加过程又称核苷酸添加循环(nucleotide addition cycle或NAC),由底物结合并诱导活性中心关闭、
武汉病毒所获得首个病毒RdRP转位中间体晶体结构
核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器,是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下,聚合酶以NTP或dNTP为底物将单磷酸核苷(NMP)逐个添加到产物链上。每一次添加过程又称核苷酸添加循环(nucleotide addition cycle或NAC),由底物结合并诱导活性中心关闭、磷
我国学者发现调控核酸聚合酶催化复合物稳定性新机制
RNA病毒是一类独特的生命形式,其转录及基因组复制过程均不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)来主导完成。和其他类别的持续合成聚合酶类似,病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成,因此需要将催化复合物的稳定性维持在较高的水平。在DNA复制过程中
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制,因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的,不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察,也不适于进行文库的筛选。此外,体外制备 siRNA 分子的成本比较高,而且 siRNA
在RNA病毒聚合酶中发现一种独特的保真度调控机制
RNA病毒包括多种人类和动物致病病原,对人类健康构成严重威胁。这类病毒的基因组复制过程不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)来主导完成。病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成,并将合成的出错率水平维持在万分之一上下。在其他生命形式中,长链核酸
RNA聚合酶复合物晶体结构获解析
中科院武汉病毒所研究员龚鹏带领研究小组解析了RNA病毒基因组复制和转录中重要物质——RdRP转位中间体的晶体结构。这将为相关抗病毒研究提供重要依据。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。 核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器,也是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下,聚合
破解埃博拉病毒基因组从头起始复制的分子机制
9月12日,中国科学院微生物研究所施一、齐建勋、高福院士团队,在《自然》(Nature)上,发表了题为Molecular mechanism of de novo replication by the Ebola virus polymerase的研究文章,首次报道了nsNSV聚合酶识别3’-l
提取病毒RNA方法
一、用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤,可参考(我提过N次做定量PCR都没问题):1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时,
病毒RNA提取实验
TE-饱和酚/氯仿提取法 实验方法原理 大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获
病毒RNA提取实验
病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒复制机制研究;(2)用于反向遗传学研究;(3)用于分子病毒学其他研究。实验方法原理大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。实验材料TMV病毒液试剂、试剂盒TE-饱和酚:氯
RNA病毒类型介绍
病毒的核酸包括双链DNA(dsDNA)、单链DNA(ssDNA)、双链RNA(dsRNA)、正单链RNA(+ssRNA)、负单链RNA(-ssRNA)五种不同类型。病毒颗粒中的组成成分有简有繁,有的用颗粒自带专门用于病毒复制的核酸酶,有的则无。有些RNA病毒的RNA并不仅有一个分子,如流感病毒有8条
植物病毒RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA,并且其极性与mRNA极性相同,植物病毒RNA提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液(10mg/ml)。 二、设备 冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。 三、试剂 TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿
RNA病毒的简介
RNA病毒(RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒,除少数例外(如花椰菜花叶病毒Caulif -lower mosaic virus),几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80~160nm,为有包膜的单股RNA病毒RNA的复制过程中,其错误修复机制的酶的活性很低很低,几乎是没有
双RNA病毒介绍
本科病毒形态与呼肠孤病毒相似,过去归于呼肠孤病毒科,亦曾作为分类地位 未定的病毒。1973年,当人们认识到该科成员中的传染性胰坏死病毒和传染性 法氏囊病病毒在形态学上很相似,尤其是它们的基因组都含有双股双节段RNA后 ,建议设立一个新科。1984年正式命名为双RNA病毒科。在国际病毒分类委员会(IC
病毒RNA提取实验
实验方法原理 大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。实验材料 TMV病毒液试剂、试剂盒 TE-饱和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE缓冲液双菌水仪器、耗材 冷冻台式离心机低温真空干燥仪电泳仪电泳槽实验步骤 一、实验
青岛科技大学:RNA检测课题研究取得重大突破
日前,青岛科技大学化学与分子工程学院马翠萍课题组的研究成果,在线发表于化学领域国际顶级权威期刊《美国化学会志》上。该研究发现,几种脱氧核糖核酸(DNA)聚合酶具有内在的反转录酶活性,突破了DNA聚合酶只能以DNA为模板合成DNA的传统认知,对RNA的快速检测具有重要意义。 据了解,核糖核酸(R
各种PCR的“酶”你不行!
聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的核苷酸片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊核苷酸复制,PCR的最大特点是能将微量的核苷酸进行大幅扩增,从而达到容易鉴定和识别程度。 各种PCR到底需要哪些种类的酶?请看中心法则,分子生物学的中心教条。体外的各种聚合酶链式反应就是中心法则的完美
RNA聚合酶的反应需要哪些底物?
该酶需要四种核糖核苷酸三磷酸(NTP:ATP、GTP、CTP、UTP)作为RNA聚合酶的底物,DNA为模板,二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3',第一个核苷酸带有3个磷酸基。其后