我国学者发现调控核酸聚合酶催化复合物稳定性新机制

RNA病毒是一类独特的生命形式,其转录及基因组复制过程均不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)来主导完成。和其他类别的持续合成聚合酶类似,病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成,因此需要将催化复合物的稳定性维持在较高的水平。在DNA复制过程中,某些DNA聚合酶可招募能嵌套在双链DNA上并沿双链滑动的环状复合物“sliding clamp”,从而提升聚合酶催化复合物的稳定性。但迄今为止尚未在病毒RdRP合成核酸的过程中发现类似机制。 中国科学院武汉病毒研究所/生物安全大科学研究中心龚鹏研究员课题组长期从事病毒RdRP的催化与调控机制研究,近期该团队解析了分辨率为1.8埃的肠道病毒(enterovirus, EV)RdRP(又称3Dpol)与RNA形成的延伸复合物的晶体结构(图A,PDB号:6KWQ),发现位于RdRP催化中心下游的5'末端鸟嘌呤碱基与位于RdRP手......阅读全文

我国学者发现调控核酸聚合酶催化复合物稳定性新机制

  RNA病毒是一类独特的生命形式,其转录及基因组复制过程均不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)来主导完成。和其他类别的持续合成聚合酶类似,病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成,因此需要将催化复合物的稳定性维持在较高的水平。在DNA复制过程中

核酸扩增—普通聚合酶链反应

  把DNA分子变性后解链,两条单链DNA分别经复性与两条引物互补结合,在4种dNTP存在和合适的条件下,由DNA聚合酶催化引物由5'到3'扩增延长,每经过变性、复性、延伸一个循环,模板DNA增加1倍,新合成的DNA链又可作为下一个循环的模板,经过30-50个循环,可使原DNA量增加

简述TaqDNA聚合酶的热稳定性

  相对分子质量为94的Taq DNA聚合酶的活性较高,大约为200000 U/mg,在合成DNA时有一个较高的最适温度75~80℃。Taq DNA聚合酶虽然在90℃以上合成DNA的能力有限,但高温时仍比较稳定。有实验证明,在92.5℃、95℃和97.5℃时,PCR混合物中的Taq DNA聚合酶分别

乳化剂的表面作用及其稳定性

  界面的形成以及稳定性的机理:  1)在界面上乳化剂的密度最大,乳化剂分子在小液滴的外面形成保护膜,从几何空间结构观点来看这是合理的,从能量角度来说是符合能量最低原则的,因而形成的乳状液相对稳定;  2)因为乳状液的形成使体系界面面积大大增加,也就是对体系要做功,从而增加了体系的界面能,就导致了体

配体结合口袋的特点

中文名称配体结合口袋英文名称ligand-binding pocket定  义受体的配体结合域中的疏水氨基酸残基通过疏水相互作用所形成的一种口袋形结构。其形状与配体的互补性越大,则受体与配体的亲和力也就越大。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

配体结合口袋是什么结构?

中文名称配体结合口袋英文名称ligand-binding pocket定  义受体的配体结合域中的疏水氨基酸残基通过疏水相互作用所形成的一种口袋形结构。其形状与配体的互补性越大,则受体与配体的亲和力也就越大。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

针对“隐形口袋”治疗中风和癫痫

  理想的药物只影响确切的细胞和神经元,而不产生不必要的副作用。这一概念对治疗精致复杂的人脑尤为重要。冷泉港实验室的科学家揭示了一种机制,为中风和癫痫特异性治疗指出了一条明路。  负责这项研究的资深科学家Hiro Furukawa教授说:“这真的归结于化学。”  当人类大脑受伤时,例如中风,大脑的某

关于基因扩增技术—聚合酶链反应的条件模板核酸的介绍

  基因扩增技术—聚合酶链反应可以以DNA或RNA为模板进行核酸的体外扩增。不过RNA的扩增首先逆转录成cDNA后才能进行PCR循环。不同来源的核酸标本必须经处理后才能用于PCR的扩增,处理不当或处理过程中DNA掉失都会导致PCR扩增失败。采集标本方法不当,未能获得所要检测的靶DNA都会导致出现假阴

怎么判断磁珠法核酸提取仪提取磁珠的稳定性?

  核酸提取磁珠又称为DNA提取磁珠,RNA提取磁珠,硅基磁珠,是生物磁珠的一种,其原理是采用稳定的高分子材料作为分离载体,引入磁性,再偶联上配基,形成含有磁性粒子的高分子微球。核酸提取磁珠适用于各类生物检材的DNA、RNA提取,目前已广泛应用于植物、动物、全血、血清、口腔拭子、唾液、干血片、细菌、

科学家口袋里的科研利器

  近日,中科院推出“中国科讯”应用,致力于打造“文献移动获取第一平台”。  读论文是每个科学家的“必修课”。而在科技创新链上,文献情报亦是一项极为基础性的工作。  然而,本应站在科技与时代发展最前沿的科学家,在这个“互联网+”的时代,却还被动地局限在一些“守旧”的规则中。一个例子就是,一旦科学家离

分子对接计算中如何确定对接口袋?

  在一般的分子对接计算中,一个不可或缺的步骤是定义配体分子(通常为有机小分子)的结合位置,即对接口袋。对于蛋白-小分子复合物X-ray晶体结构,口袋内就有一个配体,它为我们指示了对接口袋的位置。但还有很多X-ray晶体结构、NMR解析的结构没有配体结构,我们该如何确定对接口袋呢?更一般地,对于核酸

《口袋里的人工智能丛书》出版发行

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503302.shtm近日,由人工智能与数字经济广东省实验室(广州)(以下简称琶洲实验室)副主任、华南理工大学计算机科学与工程学院院长陈俊龙总编,琶洲实验室教授张通和谭明奎等主编的《口袋里的人工智能丛书》由

分子对接计算中如何确定对接口袋?(三)

在殷赋云计算平台上定义对接口袋说了这么多,分子对接中使用游离蛋白作为受体时,又该如何定义对接口袋呢?计算平台为我们提供了三种定义口袋的方式,对于复合物蛋白,可以通过“选择文件”选择之前就提取出来的配体分子进行定义(详见平台教程,在微信公众号首页回复“计算教程”即可获得下载链接);对于游离蛋白,可通过

分子对接计算中如何确定对接口袋?(一)

在一般的分子对接计算中,一个不可或缺的步骤是定义配体分子(通常为有机小分子)的结合位置,即对接口袋。对于蛋白-小分子复合物X-ray晶体结构,口袋内就有一个配体,它为我们指示了对接口袋的位置。但还有很多X-ray晶体结构、NMR解析的结构没有配体结构,我们该如何确定对接口袋呢?更一般地,对于核酸、多

分子对接计算中如何确定对接口袋?(二)

3、从返回的结果中找到Output files,下载我们需要的pdb文件文件①是输入的pdb文件(我们输入了PDB ID,POCASA自动从RCSB PDB库中下载蛋白文件),文件②是我们需要的输出结果,包含了若干潜在口袋的位置信息。将两者下载下来,然后使用PyMOL或其他分子图形软件观察分析。(P

口袋装置测序人类基因组

  1月30日,《自然—生物技术》在线发表的一篇论文介绍了利用一个口袋大小的纳米孔装置测序和从头组装人类基因组。该研究报告了迄今为止最连续的人类基因组组装,而且只使用了单一测序技术。  理解和解读人类基因组是现代医学的基石,人们一直希望可以尽可能多地测序基因组。在此之前,因为速度、成本和测序系统有限

-口袋里的医疗器械将成电子私人医院

  10年前谁也不会想到,现代人每天捧着智能手机和平板电脑就将全世界连接了起来。而随着宽带网络、信息技术等领域的蓬勃发展,许多我们早已熟悉的传统事物可能都会发生质的改变,比如与每个人息息相关的医疗健康领域。或许在不久的将来,医疗仪器也可以随意装进我们的口袋,而健康检测会像使用智能手机一样,轻松自如。

科学家鉴别鼻病毒和肠道病毒关键点有望开发新型疗法

  日前,一篇发表在国际杂志PLoS Biology上的研究报告中,来自卢汶大学等机构的科学家们通过研究发现了一大类致病性病毒的新特性,或有望帮助开发治疗普通感冒、脊髓灰质炎和其它人类疾病的新型抗病毒药物。小核糖核酸病毒(picornaviruses)包括鼻病毒和肠道病毒,鼻病毒每年会引发数百万人患

中国科大设计高效蛋白质口袋生成算法

近日,中国科学技术大学认知智能全国重点实验室刘淇教授指导博士生张载熙和哈佛大学医学院Marinka Zitnik教授课题组合作,设计了一种基于图表示学习和蛋白质语言模型的深度生成算法PocketGen,生成与小分子结合的蛋白质口袋序列和空间结构。实验验证表明,PocketGen在生成成功率和效率方面

临走时,给学生的口袋里“放点儿东西”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481808.shtm 位于天津海河教育园区的天津大学与南开大学两校区中间有一块不小的空地,一条名叫洪泥河的小河在此穿流而过。几年前,天津大学机械工程学院教授谢辉在与时任天津大学党委书记李家俊谈话时提出

聚合酶的分类

可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);DNA

聚合酶的分类

  可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);D

核酸检测试剂原材料有哪些呢,赶紧来看看吧

  核酸检测试剂原材料有哪些呢,赶紧来看看吧  核酸检测试剂是基于核酸扩增检测技术的体外诊断试剂,包括等温扩增、PCR,qPCR等。现在有些实验室自己合成引物探针,生产qPCR诊断试剂,也有些试剂生产企业在问如何保证试剂生产过程的质量控制。  检测试剂的生产质控与诊断试剂的评价既有相同点,因为都是基

称重法表面张力仪采用的传感器主要有哪些?其稳定性...

称重法表面张力仪采用的传感器主要有哪些?其稳定性如何?称重法表面张力仪的传感器主要分为扭力丝传感器、应变电阻称重传感器、分析天平传感器。其中扭力丝的传感器主要应用白金环法的表面张力仪,由于环的周长比板而言长得多,因而白金环法测试时称重值较大,从而对传感器要求较低。而应变电阻的称重传感器只在极少数的中

c14呼气检测仪+呼气检测口袋的简介

  C-14呼气检测仪和呼气检测口袋是检测幽门螺杆菌的医学界金标准。只要要吹气5分钟外,无其他任何不适。该方法使众多高血压、心脏病及对胃镜过敏的病人避免了做胃镜的不适感,是理想的检测方法之一。

核酸纯化怎样保存核酸

纯化后的核酸,最后多使用水或者低浓度缓冲液溶解;其中 RNA 以水为主,DNA 则多以弱碱性的 Tris 或者 TE 溶解。经典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,认为 EDTA 可以减少 DNA 被可能残留下来的 DNase 降解的风险;如果操作过程控制得当,DNase 的残留几乎是可以忽

核酸纯化怎样保存核酸

纯化后的核酸,最后多使用水或者低浓度缓冲液溶解;其中 RNA 以水为主,DNA 则多以弱碱性的 Tris 或者 TE 溶解。经典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,认为 EDTA 可以减少 DNA 被可能残留下来的 DNase 降解的风险;如果操作过程控制得当,DNase 的残留几乎是可以忽

核酸纯化怎样保存核酸

纯化后的核酸,最后多使用水或者低浓度缓冲液溶解;其中 RNA 以水为主,DNA 则多以弱碱性的 Tris 或者 TE 溶解。经典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,认为 EDTA 可以减少 DNA 被可能残留下来的 DNase 降解的风险;如果操作过程控制得当,DNase 的残留几乎是可以忽

动态稳定性和暂态稳定性区别

1.电力系统稳定性 电力系统稳定性可分为静态稳定、暂态稳定和动态稳定。 (1)电力系统静态稳定是指电力系统受到小干扰后,不发生非周期性的失步,自动恢复到起始运行状态的能力。 (2)电力系统暂态稳定指的是电力系统受到大干扰后,各发电机保持同步运行并过渡到新的或恢得到原来稳定运行状态的能力,通常指第一或

多管涡旋振荡器提高新冠病毒核酸制备一致性和稳定性

最近“2019-nCoV”冠状病毒肆虐全球,这种突发传染病严重威胁人民的健康和生命安全,目前这种冠状病毒的核酸检测是最高效快速的确诊方法之一,而核酸的制备是精准检测该病毒的重要前提。核酸的自动制备不仅确保了提取核酸质量的一致性和稳定性,还能保护检测人员不受病毒感染威胁。  小编今天就为您介绍一下,