RNA聚合酶复合物晶体结构获解析
中科院武汉病毒所研究员龚鹏带领研究小组解析了RNA病毒基因组复制和转录中重要物质——RdRP转位中间体的晶体结构。这将为相关抗病毒研究提供重要依据。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。 核酸聚合酶是核酸生物合成的分子机器，也是实现核酸遗传信息复制和传递的关键蛋白。在模板序列的指导下，聚合酶将单磷酸核苷逐个添加到产物链上。每一次添加过程由底物结合并诱导活性中心关闭、磷酰基转移反应以及聚合酶向模板下游转位三个主要步骤构成，其分子机制是聚合酶领域的核心研究内容。 RNA病毒对人类健康构成严重威胁，超过三分之二的传染性疾病由RNA病毒引起。这类病毒的基因组复制和基因转录由依赖RNA的RNA聚合酶（RdRP）执行。在前期工作的基础上，龚鹏研究小组以手足口病的主要病原体肠道病毒71型的RdRP为研究对象，通过获取多种类型的RdRP复合物晶体并系统性地尝试在晶体中实现单次和多次核苷酸添加，于近期报道了包括首个转位中间体在内的7个......阅读全文
正粘病毒化学组成及其功能（一）
流感病毒由68%～70%的蛋白质、1%～2%的核糖核酸(RNA)、20%～25%脂质和5%～8%的糖组成。病毒蛋白质含有5种多肽，即血凝素、神经氨酸酶、基质蛋白、核蛋白和多聚酶。 (1) 正粘病毒基因组组成 〖HT5SS〗流感病毒的基因组是由8个分节段的单链、负股RNA组成，其中4、6号两个节段
研究团队解析新冠病毒重要药物靶点RNA聚合酶精细结构
近日，“上海科技大学—清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析新型冠状病毒“RdRp（RNA依赖的RNA聚合酶）-nsp7-nsp8复合物”近原子分辨率的三维空间结构，揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征，为开发针对新冠肺炎的药物奠定了重要基础。新型冠状病毒RdRp
我国填补禽流感病毒聚合酶结构研究空白
《自然》：为设计抗流感病毒药物提供了真实可用的模型 ［科学时报 潘锋 报道］《自然》杂志7月9日在线发表由中国科学院生物物理研究所研究员刘迎芳领导的研究组和南开大学饶子和院士领导的南开大学—清华大学—生物物理所联合研究组，共同完成的一项有关禽流感病毒聚合酶结构的研究，在国际上率先揭示出流感病毒聚
通过记录RNA聚合酶观察早期RNA转录动力学
科学家们通过记录RNA聚合酶在何时何地通过与DNA序列结合启动转录，观察了早期RNA转录动力学。 生命的活动是通过蛋白质的制造而发生的，蛋白质赋予我们的细胞结构和功能。细胞蛋白质从DNA编码的基因指令中获得行进顺序，他们的序列首先被复制并在一个叫做转录的多步骤过程中被制造成RNA。 科罗拉多
带您了解单分子测序技术
单分子测序技术，也被称为纳米测序技术，是通过纳米孔只允许一条链进入的方式，根据碱基的荧光或者电流阻断来识别碱基序列的一种新型测序技术。这种技术包括PacBio技术和Nanopore技术两种主要方法。 PacBio技术主要是利用荧光标记不同的碱基与待测序列、DNA聚合酶一起放入纳米孔底部。当DN
单链RNA的基本信息介绍
一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒（如脊髓灰质炎病毒）的ssRNA可直接起mRNA作用，转译早期蛋白质，包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下，以ssRNA（正链）为模板
关于RNA聚合酶的参与过程简介
该酶需要四种核糖核苷酸三磷酸（NTP：ATP、GTP、CTP、UTP）作为RNA聚合酶的底物，DNA为模板，二价金属离子Mg2+、Mn2+是该酶的必需辅因子。其催化的反应表示为：（NMP）n+NTP→（NMP）n+1+PPi。RNA链的合成方向也是5’→3'，第一个核苷酸带有3个磷酸基。
依赖核酸序列的扩增技术相关
NASBA的简要过程如下：1.RNA模板链进入反应混合物后，第一个引物首先与模板链的3'端结束。2. 反转录酶，合成反义的补偿的DNA链。3. RNA 酶H（一种核糖核酸内切酶，能够特异性地水解杂交到DNA链上的RNA磷酸二酯键，分解RNA/DNA杂交体系中的RNA链，但不能消化单链或双
新冠病毒各类检测方法异同－（一）
新型冠状病毒的检测方法主要包含核酸检测、抗体检测、抗原检测几种方法。由于抗原检测检出率较低，目前新冠检测主要集中在抗体和核酸检测。核酸检测目前是新型冠状病毒检测的“金标准”，具有早期诊断、灵敏度和特异性高等特点;但抗体检测操作便捷、检测迅速，可作为核酸诊断的补充手段。1.1核酸检测检测原理：所有生物
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介病毒总核酸提取试剂盒适合于从血清、血浆、组织匀浆等样品中提取病毒总核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术，提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提，也无需进行耗时的醇类沉淀。该产品已经成功地提取了乙肝A/C、丙肝、以及诺如病毒标准品等的核酸。获得的DNA/RNA可直接用于
分子杂交的分类
分子杂交基因探针根据标记方法不同可粗分为放射性探针和非放射性探针两大类，根据探针的核酸性质不同又可分为DNA探针，RNA探针，cDNA探针，cRNA探针及寡核苷酸探针等几类，DNA探针还有单链和双链之分。下面分别介绍这几种探针。DNA探针DNA探针是最常用的核酸探针，指长度在几百碱基对以上的双链DN
再解析：新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能...
再解析：新冠病毒基因组组学特性分析与检测试剂性能的关联性2019新型冠状病毒于2020年1月12日被世界卫生组织（WHO）命名为2019-nCoV。2020年3月13日，世卫组织将2019冠状病毒疫情从流行病升级为全球大流行病，疫情已在全球广泛传播。随着分子生物学技术的发展，分子诊断方法成为病原体检
RNA－SI－核酸酶作图
实验材料 [γ-32P」ATP 合适的寡核苷酸 DNA 模板l 10XdNTP 混合物 KLenow 片段 合适的限 制性内切核酸酶
RNA－SI－核酸酶作图
实验材料 [γ-32P」ATP合适的寡核苷酸DNA 模板l10XdNTP 混合物KLenow 片段合适的限 制性内切核酸酶X 射线胶片洗脱缓冲液tRNA 石蜡油S1 核酸酶试剂、试剂盒 10X 激酶缓冲液PNK10X 复性缓冲液6% 聚丙烯酰胺 8mol L 尿素溶液 (溶于 0.5XTBE) 及甲
FFPE样本核酸（DNA/RNA）制备
福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析，开发特定的操作步骤，考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp
PCR的原理是什么
PCR全称多聚酶链式反应，原理是DNA的体外扩增。具体来说：在EP管里加入DNA、合成原料（dNTP、引物）、耐热的DNA聚合酶（taq）后，放入PCR仪，PCR仪会利用升温使DNA变性，在聚合酶的作用下使单链复制成双链，进而达到基因复制的目的。用途：1、核酸的基础研究：基因组克隆2、不对称PCR制
病毒侵染后多久换液
1.病毒侵染之后不一定都要把基因整合到宿主DNA上,以噬菌体为例,噬菌体分为两类,一类是温和噬菌体，其侵入宿主后，DNA整合到宿主DNA上，造成潜在威胁，在受到刺激后可以裂解产生新的噬菌体。另一类为烈性噬菌体,侵染细菌后,再短时间内会完成复制、转配、裂解几个过程，其DNA不会整合到宿主DNA上，
病毒侵染后多久换液
1.病毒侵染之后不一定都要把基因整合到宿主DNA上,以噬菌体为例,噬菌体分为两类,一类是温和噬菌体，其侵入宿主后，DNA整合到宿主DNA上，造成潜在威胁，在受到刺激后可以裂解产生新的噬菌体。另一类为烈性噬菌体,侵染细菌后,再短时间内会完成复制、转配、裂解几个过程，其DNA不会整合到宿主DNA上，
病毒侵染后多久换液
1.病毒侵染之后不一定都要把基因整合到宿主DNA上,以噬菌体为例,噬菌体分为两类,一类是温和噬菌体，其侵入宿主后，DNA整合到宿主DNA上，造成潜在威胁，在受到刺激后可以裂解产生新的噬菌体。另一类为烈性噬菌体,侵染细菌后,再短时间内会完成复制、转配、裂解几个过程，其DNA不会整合到宿主DNA上，
在RNA病毒聚合酶中发现一种独特的保真度调控机制
RNA病毒包括多种人类和动物致病病原，对人类健康构成严重威胁。这类病毒的基因组复制过程不涉及DNA形式，因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶（RdRP）来主导完成。病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成，并将合成的出错率水平维持在万分之一上下。在其他生命形式中，长链核酸
一文读懂新型冠状病毒的核酸检测
2019年12月以来，武汉市部分医疗机构陆续出现不明原因肺炎病例。国家药品监督管理局随即启动《医疗器械应急审批程序》。目前，已批准7家企业的新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒上市。为进一步合理使用上述产品，有效满足疫情防控需求，现将使用情况做如下说明：1、新型冠状病毒的核酸检测原理所有生物
中国科学家首次揭示病毒内部三维结构
9月18日，国际顶级学术期刊《Science》杂志发表了一篇题为“冷冻电镜揭示双链RNA病毒内部聚合酶和病毒基因组的非线轴结构”的论文。论文中，两位中国科学家首次将病毒的观察视角从“衣壳”深入到内部，改变了过去认为该类型病毒的内部基因组应呈线轴状排列的主流观点，亦用一种全新方法，开启帮助人类认知
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制，因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的，不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察，也不适于进行文库的筛选。此外，体外制备 siRNA 分子的成本比较高，而且 siRNA
新闻中的新冠病毒核酸检测方法到底是什么？
国务院联防联控机制于2月17日召开新闻发布会。对于目前核酸检测试剂检测率不稳定的问题，北大一院主任医师王贵强解释，核酸检测本身的稳定性是很好的。出现一些所谓检不出的情况或者假阴性的情况，主要原因是任何检测方法都有一个敏感性的问题。 核酸检测，是指通过特殊的技术手段检测临床样本中是否存在特定的病
双链RNA病毒的特点
双链RNA病毒有两个特点：一是它的基因组为10-12条双链RNA分子；二是它有双层衣壳，而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中，在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA，它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA，又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白，装配内层衣壳后，正链RNA进
RNA病毒扩拉检测的质控品和标准品研究进展
RNA病毒如丙型肝炎病毒（HCV）、人免疫缺陷病毒（HIV）、严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）等的核酸检测对于感染的早期诊断和抗病毒治疗疗效的动态观察具有重要价值。自1983年发明聚合酶链反应（PCR）技术以来，出现了基因扩增的概念。目前多采用核酸扩增技术（NAT）检测病毒RNA，
穿透“衣壳”，看看病毒内部什么样
人类对疾病的认识进入后基因组时代以来，科学家一直试图测定病毒内部三维结构。湖南师范大学物理与信息科学学院教授刘红荣与清华大学副研究员程凌鹏，利用冷冻电镜及其发展的新方法，求解出了一种双链RNA病毒内部基因组及RNA聚合酶三维结构，首次将对病毒的观察视角从“衣壳”深入到了其内部，该成果刊登于9月1
植物病毒RNA提取
大多植物病毒RNA为单链RNA，并且其极性与mRNA极性相同，植物病毒RNA提取较为简单，一般使用酚氯仿即可获得满意结果。 一、材料 提纯TMV病毒液（10mg/ml）。 二、设备 冷冻台式离心机，低温真空干燥仪，电泳仪，电泳槽。 三、试剂 TE-饱和酚:氯仿（1:1），氯仿
RNA病毒的简介
RNA病毒（RNA virus) 也称RNA型病毒。植物病毒，除少数例外（如花椰菜花叶病毒Caulif -lower mosaic virus），几乎都是RNA病毒。RNA病毒冠状病毒直径为80～160nm，为有包膜的单股RNA病毒RNA的复制过程中，其错误修复机制的酶的活性很低很低，几乎是没有
提取病毒RNA方法
一、用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤，可参考（我提过N次做定量PCR都没问题）：1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍，然后加入对照和样品，再加200ul氯仿，颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时，