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两斤DNA装下“全世界”现代数据存储技术瞄准基因序列

对于Nick Goldman来说,在DNA中编码数据的想法始于一个笑话。或许最多10年之后,没有人会再相信磁带储存。图片来源:Wes Fernandes 那是2011年2月16日,Glodman和一些生物信息学领域的朋友在德国汉堡聊天,话题是他们如何才能储存全世界涌来的基因组序列和其他数据洪流。他记得当时谈话的科学家因为传统计算机技术成本昂贵和具有局限性而懊恼不已,他们开始开玩笑说或许可以尝试科幻方法。“我们想,‘有什么能阻止我们利用DNA储存信息呢?’” 随后,笑声戛然而止。“那是恍然明悟的一刻。”Goldman说,他是英国辛克斯顿欧洲生物信息学研究所(EBI)的一名团队负责人,那时他们想到的是与硅基记忆芯片读写信息的微秒时间量程相比,DNA储存可能会非常缓慢。它可能需要花费数个小时,通过合成DNA链条以形成具体的基础模式来编码数据,还会花费更多时间利用一种测序机器恢复这些信息。但是如果采用DNA,整个人类基因组都能够......阅读全文

基因表达谱数据聚类分析相关内容

DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视

DNA microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

将数据存到DNA里!全世界的信息只有1公斤重

  将数据存到DNA里!全世界的信息只有1公斤重  大数据时代,我们在网络上每一个动作,比如网上冲浪、观看视频,甚至跑步、走路等日常行为,每分每秒都在产生大量数据。它们如一条条河流,汇聚成数据的汪洋大海。  如此大量的信息如何存储?珍贵的数字记忆要如何长久可靠地保存?科学家们想到了一种方法,将数据写

Nature:如何用一公斤的DNA满足全球的信息储存需求?

  DNA如何存储下整个世界的数据  对于英国欣克斯顿欧洲生物信息研究所(EBI)组长Nick Goldman来说,在DNA中编码数据的想法是从一个玩笑开始的。  2011年2月16号星期三,Goldman正在德国汉堡的一家酒店中,与他的一些生物信息学家同事谈论如何将大量现有的基因组序列和其他被世界

详解哈佛如何用DNA遗传物质储存信息

  哈佛大学研究人员将一本大约有 5.34 万个单词的书籍编码进不到亿万分之一克的 DNA 微芯片,然后成功利用 DNA 测序来阅读这本书。   这是迄今为止人类使用 DNA 遗传物质储存数据量最大的一次实验。   “今后,拇指大小的设备就能存下整个互联网的信息。”该项目的首席研究员、哈佛大学遗

打造数据储存“精品店”

  微软研究院5月22日宣布了又一个“小目标”——10年内将DNA数据存储系统纳入数据中心并开始运行。  据《麻省理工技术评论》当日报道,微软研究院计算机设计师道格·卡米安表示,公司计划3年内开发出DNA数据储存的商业化原型系统,并选取一个数据中心,打造数据存储的“精品店”。系统的最终尺寸将与上世纪

Twist向微软提供1000万份DNA分子,助力打造数据存储库

  生产合成DNA并用其来存储数据的初创公司Twist Bioscience刚与微软及华盛顿大学达成了合作关系,它们将在合成基因上为大量信息进行编码。  大数据就意味着业务,而能够收集大量数据的公司在投资者和股东眼里就是值得投资的公司。但是这些数据需要存储在某一个地方,并且需要花费很多金钱进行维护。

DNA研究缺数据 你愿意把你的基因信息"卖"了吗

  据外媒Telegraph报道,你是否曾经担心过那些科技巨头会利用你的个人信息来赚钱?是否猜测过这些“幕后黑手”的身份?在Facebook数据泄露事件愈演愈烈的背景下,设想一下,如果数据泄露所包含的范围超越了“个人喜好”和所谓的问卷调查结果,而进一步触及到了你最私密的生物特征——你个人基因组的细节

硬盘是迟早的事但用 DNA 来存储数据是不是有点太科幻了

  镜头照相机列成一排,拍摄一名骑手骑马快速奔跑的场景。最初的目的是想解决困扰了画家和艺术家几个世纪的难题——马在奔跑时四条腿是否可以同时离地。   (图片来源:Timetoast)   尽管画面不是非常清晰,但是从其中一幅作品上还是可以看出,马在全速奔跑的某个瞬间,四蹄是全部腾空的。后来他把这

开启个人基因服务的新时代

  最近在基因测序领域又有一个惊爆的新闻,MIT Technology Review网站披露,谷歌目前正在同大学以及医院进行接触,说服研究者和医生将基因数据存储在谷歌的云平台——Google Genomics,每份DNA数据存储费用仅为25美元/年。这一举动,宣告个人基因组时代即将到来,预计谷歌的竞

Google Genomics:开启个人基因服务新时代

  最近在基因测序领域又有一个惊爆的新闻,MIT Technology Review网站披露,谷歌目前正在同大学以及医院进行接触,说服研究者和医生将基因数据存储在谷歌的云平台——Google Genomics,每份DNA数据存储费用仅为25美元/年。这一举动,宣告个人基因组时代即将到来,预计谷歌的竞

用DNA藏匿电脑病毒:一次基因测序就劫取机密

  DNA作为储存生物信息的结构,从演化产生以来一直保持着稳定、安全的性能。利用4个碱基的组合,它传递着一代又一代的遗传密码。这种密码组合的优越性如今也被科学家看在眼里,类似计算机中的1和0,他们利用ATCG同样创造了信息储存代码。但是黑客能不能会入侵DNA代码呢?目前来看,答案同样是肯定的。  D

基因国库“存”“用”并重 综合能力世界最强

  位于深圳大鹏新区的国家基因库今天正式运营,这是我国首个、全球第四个国家级基因库。国家基因库将致力于构建从资源到科研、产业的全贯穿、全覆盖模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的联动。未来这里将储存全球生物样本、生物信息数据,而且将依照相关规则开放样本、数据资源,成为一个公共服务平台。  世界最

数据首次存入DNA内并可无损读取

  据美国华盛顿大学(UW)官网消息,来自该校和微软的科学家在DNA储存数据方面的研究更进了一步:他们通过将1和0编码转换成腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶这四种构成DNA的核苷酸序列,把图片和视频成功储存在DNA片段中,并实现了数据的无损读取,最新研究或将彻底变革计算机存储方式。   据英国《每日

数据首次存入DNA内并可无损读取

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植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

基因测序未来研究方向

研究人员对基因测序数据的需求越来越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科学家对未来40年基因测序技术的应用进行了展望。四十年前,也就是1997年前,两篇论文首次报道了确定DNA片段中化学碱基顺序的简易方法。在此之前,分子生物学家们只能检测DNA片段,而不

专业贴:基因创业的“船票”究竟有多贵?

  基因领域的创业热度持续升温。创业门槛有多高?市场规模有多大?哪些领域更适合创业团队切入?  近两年来基因领域的创业热度持续升温,在设备、工具、服务,检测四个跑道上都出现了很多种子创业选手。那么这四个方向的创业门槛有多高?市场规模有多大?哪些领域更适合创业团队切入,下面我给大家盘算一遍。

基因测序区块链项目介绍

   人类基因组区块链HGBC(HumanGenome Block Chain)发布了《基因价值生态链白皮书》。白皮书指出,快速发展的基因测序技术和大幅下降的测序成本,极大的刺激了个人基因检测市场,推动了生命科学研究,但行业中却存在各种问题。  HGBC聚焦于基因行业的核心问题,借助区块链的技术优势

什么是支持基因测序发现DNA生命奥秘的源源动力?

  基因检测是利用科技手段,对基于个体基因、分子、细胞等进行检测,通过海量生物信息学数据的精准分析,为医疗机构提供疾病诊断的依据,从而在此基础上为病人提供个性化治疗服务;此外,也可以用于疾病风险的预测,还能正确选择药物,避免药物滥用和药物不良反应。目前,基因检测在疾病风险预测、临床诊断辅助、癌症早筛

基因检测过去、未来与问题

  10月11日,美国国立卫生研究院美国国家人类基因组研究所所长Eric D. Green,美国加州首席科学官Edward M. Rubin以及美国华盛顿华盛顿华盛顿大学华盛顿大学医学与基因组科学荣誉教授Maynard V. Olson在Nature联合发表了一篇预测性文章,题为The future

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

新年小目标都是啥?看看Genomic Health,Foundation Medicine,Qiage

  Genomic Health  继完成2017年盈利预期之后,Genomic Health首席执行官Kim Popovits表示,公司预计2018年会再创利润,收入将实现两位数的增长。在演讲中,她还列出了几个收入增长的驱动力。  这其中,包括最近通过的《联邦医疗保险法案》(Medicare Ac

子孙后代信息都可能被公开,基因隐私告急!

  基因检测正逐渐广为人知,一些嗅觉灵敏的公司也不失时机地推出利用基因检测预测疾病的商业化服务。在我们面前,一边是精准医学打开的未来医疗世界大门,一边是海量数据带来的隐私安全“黑洞”。关注基因信息安全,正是为了基因检测和精准医学更好地发展。   基因检测乱象丛生   近年来,基因检测揭开神秘面纱

基因检测乱象丛生 当心!子孙后代信息都能被公开

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为存数据 研究人员给细菌编程

  “Hello World!”是许多程序员的第一行代码,但你见过从活的生物体内读出的“Hello World!”吗?哥伦比亚大学的一个研究小组做到了,他们把数据写入活细菌的DNA,相关研究11日发表在《自然-生物化学》上。  对数据存储而言,DNA在许多方面都很有吸引力。比如,相较于目前结构最紧凑

23andMe公司计划使用iPhone与研究人员共享DNA数据

  遗传学公司23andMe计划让客户使用他们的iPhone手机与研究人员分享他们的基因数据以开展医学研究。  该计划将允许大学研究人员能够通过谷歌公司访问收集的DNA图谱,并把他们与目前正在从参与者手机收集的健康相关数据进行配对。  据知情人士透露,此次合作预计会在苹果公司位于加州库部蒂诺总部举行

Illumina子公司Helix将打造DNA定制化王国

  乔布斯在2011年死于胰腺癌之前,曾花10万美金来给自己的DNA做了一次测序。这一做法在当时昂贵又罕见,谁想到在乔帮主离世5年之后,一模一样的基因测序已经降到了几千美金,甚至更低的价格,进入百万民众的视野。  让DNA测序发生革命性改变的公司,毫无疑问是基因测序巨头Illumina。这个价值20

在DNA上存储信息的成本已足够便宜 商业化可期

  7月2日消息,据国外媒体Quartz报道,如今,将数据信息存储在DNA上的成本已经足够便宜,因此该技术有望实现商业化。  我们需要承认这样一个事实:我们已经成为数码囤积者,耗费大量的空间来存储我们的数据。  2016年,人类共计产生了16.1万亿GB的数字信息;到2025年,这一数字预计将增加十

你的DNA被偷窥:基因信息揭示个人特征筛查罪犯

  谁动了我的DNA?   藏匿20多年的连环杀手最终被警方抓捕,DNA数据库在此过程中大显神威。然而另一方面,警方采集和利用DNA数据的情况已经发生了巨大变化,无辜大众的自由和隐私正受到越来越严重的威胁。为了保护海量DNA数据不被滥用,必须制定一系列法规了。   20世纪80年代中以来,一个连