深圳先进院实现医学数据在生物DNA分子中存储

5月29日,中国科学院深圳先进技术研究院研究员姜青山、高级工程师黄小罗、中国农业科学院深圳农业基因组研究所戴俊彪研究员等联合在Small Methods发表最新研究成果。研究人员设计了一种名为"EDS"的DNA存储方法,通过改进编码模型、引入冗余核苷酸和设计索引技术,实现了医学磁共振成像(MRI)数据的可靠归档和检索。医学MRI数据是诊断、治疗规划和疾病监测等多种领域的重要工具。利用DNA存储技术保存医学MRI数据将有助于人类健康管理。通过DNA存储,可以确保这些重要数据在数千年内安全保存并精确恢复,从而保证了这些重要数据的长期存储,为研究疾病进展和治疗效果提供了重要数据支撑。该工作中,研究团队通过三个关键组成部分实现了医学MRI数据的归档。首先,研究团队设计了一种新颖的分块策略,解决了旋转编码导致的数据丢失问题。其次,提出了一种基于规则的四进制转码方法,满足生化约束条件并确保可靠的数据映射。最后,设计了一种......阅读全文

Science:宏基因组研究挑战DNA编码规则

  人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的,例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示,自然界中的生物又一次打破了既定的规则。  美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队,获得来自1776种环境(包括17个人体区域)的微生物宏基因组数据,以便在其中寻找重编

“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”

   “垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的,用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,而在学术上被称为非编码DNA序列。  由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键,而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因,于是“垃圾DNA”这一观念便形

“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”

"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代,用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥? 科学家们发现,人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子,它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性

基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT

  中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop

基因检测DNA分析

DNA分析主要用于识别单个基因异常引发的遗传性疾病,如亨廷顿病等。DNA分析的细胞来自血液或胎儿细胞。

自闭症或因父亲基因突变-非编码区DNA结构变体潜藏祸端

  《科学》杂志官网近日消息称,一项探索非编码DNA的新研究发现,调节基因活性区域的改变也可能导致自闭症,令人惊讶的是,这些变化倾向于从非自闭症的父亲那里继承而来。  过去十年中,研究人员已经发现了数百种可能影响大脑发育,从而增加自闭症风险的基因变异,但这些变异主要来自直接编码蛋白质的DNA中。此外

DNA编码分子库为药物发明提供便利

  随着DNA编码分子库持续扩大以及新的筛选方法不断开拓未知生物学领域,DNA编码分子库将成为制药行业研发新药的支柱之一。  在美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市一座混凝土建筑的二楼,一台普通实验室冰箱的塑料盒子里放着一根透明试管,里面则含有天文数字尺度的混合物。这个分子库里冷冻的是由总部位于英国伦敦的制药公

DNA编码化学库新技术助推药物研发

科技日报讯 (记者张梦然)近年来,科研人员虽然在分子疗法开发方面取得了重要进展,但新发现的活性物质数量依然不足。现在,美国哈佛大学和瑞士苏黎世联邦理工学院共同开发的DNA编码化学库(DEL)技术提供了新的解决方案。该技术能在几周内自动化合成并测试数十亿种化合物,还能用于生产更大的药物分子,这类药物将

调整基因编码蛋白的检测

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DNA发现之前的基因

  三一学院地处都柏林的中心,它那灰色的三层新古典主义建筑环绕在草坪和运动场周围。校园的最东头是另一栋灰色建筑,落成于1905年,则是另一种截然不同的风格。那是菲尔兹杰拉德大楼,或者依据其门楣上刻的字叫物理实验楼。这栋楼的最顶层是一个演讲厅,1943年2月第一个周五的傍晚,约有400余人聚集在这里,

DNA(基因)检测-Southern-Blot

DNA(基因)检测-Southern BlotDNA吸印转移1.室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中,摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟,使DNA双链碱变性。溶液A:5M NaCl     300.0ml10M NaOH    50.0mlH2O         650.0

Nature:复杂生命难道不需要非编码DNA?

  非编码DNA仅占据丝叶狸藻基因组3%的组成成分,这是否证明了对于复杂生命来说,非编码DNA并不需要呢?   自从科学家们首次发现超过95%的人类基因组是由非编码元件组成以来(非编码元件是指不会编码任何特殊蛋白质的 DNA 片段),他们就一直致力于了解这种所谓的“垃圾” DNA 的作用。在过

利用DNA编码化合物库实现新药研发

  2016年12月9日Robert A. 等研究者发表在《Nature Reviews Drug Discovery》上的一篇标题为《DNA-encoded chemistry: enabling the deeper sampling of chemical space》的论文引起了世界范围新药

CAST基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质是一种内源性钙蛋白酶(钙依赖半胱氨酸蛋白酶)抑制剂它由一个N-末端结构域L和四个重复的钙蛋白酶抑制结构域(结构域1-4)组成,参与淀粉样前体蛋白的蛋白水解。calpain/calpastatin系统参与许多膜融合事件,如神经囊泡胞吐、血小板和红细胞聚集编码的蛋白质也被认为会影响编码

GAPDH基因编码功能及结构描述

这个基因编码甘油醛-3-磷酸脱氢酶蛋白家族的一个成员。编码的蛋白质已被鉴定为一个月光蛋白的基础上,它能执行机械上不同的功能该基因产物在糖代谢过程中起着重要的产能作用,在无机磷和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的存在下,可逆的氧化磷酸化作用。编码的蛋白质在细胞核中还具有尿嘧啶DNA糖苷酶活性此外,这种蛋

CASR基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是一种质膜G蛋白偶联受体,能感觉到循环钙浓度的微小变化。编码的蛋白质将这些信息与细胞内的信号传导途径结合起来,这些信号传导途径可以调节甲状旁腺激素的分泌或肾离子的处理,因此这种蛋白质在维持矿物离子的稳态中起着至关重要的作用该基因突变是家族性低钙血症、新生儿重度甲状旁腺功能亢进和常

POLE正相关基因编码功能描述

该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The

CROT基因编码功能及结构描述

这个基因编码肉碱/胆碱乙酰转移酶家族的一个成员。编码的蛋白质将4,8-二甲基壬酰基-CoA转化为相应的肉碱酯这种酯交换反应发生在过氧化物酶体中,是将长链酰基-CoA分子从过氧化物酶体转运到细胞质和线粒体所必需的。因此,蛋白质在脂质代谢和脂肪酸β氧化中起作用。已经描述了选择性剪接的转录变体。[由ref

FANCI基因编码功能及结构描述

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

ENG基因编码功能及结构描述

该基因编码一种同二聚体跨膜蛋白,是血管内皮的主要糖蛋白。该蛋白是转化生长因子β受体复合物的一个组成部分,它与beta1和beta3肽具有高亲和力。该基因突变导致遗传性出血性毛细血管扩张症,也称为Osler-Rendu-Weber综合征1,常染色体显性遗传性多系统血管发育不良这个基因也可能与子痫前期和

ITGAL基因编码功能及结构描述

ITGAL编码整合素αL链整合素是由α链和β链组成的异二聚体膜蛋白含有α整合素的I-结构域与β2链(ITGB2)结合形成整合素淋巴细胞功能相关抗原-1(LFA-1),在所有白细胞上表达LFA-1通过与其配体ICAMs 1-3(细胞间粘附分子1-3)的相互作用,在白细胞间粘附中发挥中心作用,并在淋巴细

FASLG基因编码功能及结构描述

这个基因是肿瘤坏死因子超家族的成员编码的跨膜蛋白的主要功能是通过与fas结合诱导细胞凋亡。Fas/FasLG信号通路是免疫系统调节的关键,包括T细胞的活化诱导的细胞死亡(AICD)和细胞毒性T淋巴细胞诱导的细胞死亡。它也与一些癌症的进展有关。该基因缺陷可能与系统性红斑狼疮(sle)有关。另外,已经描

常见癌基因编码蛋白的检测

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FANCL基因编码功能及结构描述

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增

FUS基因编码功能及结构描述

该基因编码异质核核糖核蛋白(hnrnp)复合物的多功能蛋白成分。hnRNP复合物参与mRNA的前剪接和全加工mRNA向细胞质的输出该蛋白属于FET家族的RNA结合蛋白,参与了包括基因表达调控、基因组完整性维护和mRNA/microRNA处理在内的细胞过程选择性剪接导致多个转录变体该基因缺陷导致肌萎缩

DBT基因编码功能及结构描述

支链α-酮酸脱氢酶复合物(BCKD)是一种线粒体内酶复合物,参与支链氨基酸异亮氨酸、亮氨酸和缬氨酸的分解bckd复合物被认为是由24个转酰酶(e2)亚基和相关的脱羧酶(e1)、脱氢酶(e3)和调节亚基组成。这个基因编码转酰酶(E2)亚单位该基因突变导致枫糖尿病,2型。已经描述了选择性剪接的转录变体,

ATM基因编码的概念和特点

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

KDR基因编码功能及结构描述

KDR所编码的蛋白也命名为血管内皮生长因子受体-2(Vascular endothelial growth factor receptor-2,VEGFR-2),是血管生长因子重要信号转导的重要受体,迄今已发现的VEGF信号转导的主要受体包括fms样酪氨酸激酶VEGFR-1,即Flt- 1,胎儿肝激