蛋白质组学新突破——德学者统一不同质谱软件分析结果

――德国美因兹大学的科学家开发出一种提高蛋白测量技术性能和标准的新方法 现代质谱系统帮助科学家们确定了细胞或者组织样品的具体组分,但是这里存在一个问题――不同分析软件包从相同的原始数据往往会产生不同的结果。 为了解决这个问题,来自德国美因兹大学的一组研究人员通过与这一领域各大著名实验室合作,比较和修改各种分析软件包,令不同的软件产生一致的结果。这对于世界各地的实验室来说无疑是一道福音,这样研究人员就能进行标准化分析比对定量蛋白质组学检测结果,而这也正是检测某些疾病,如癌症早期阶段的关键所在。 这一研究成果公布在10月26日的Nature Biotechnology杂志上,领导这一研究的是美因兹大学Stefan Tenzer教授。 对于某些特定疾病,医师们为了了解它的病理原因,会采样通过现代组学技术分析疾病生物标记,这些高度复杂的数据分析当然需要专门的软件,然而不幸的是,不同软件有时会从相同的原始数据得到不同的结果,导......阅读全文

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

不同标记与非标记蛋白质组学定量准确性分析研究

  通过质谱法进行定量蛋白质组分析为生物医学探索研究提供非常重要的途径。 然而,了解生物样品中的定量限制对于准确判断结果非常重要。通过使用加入已知浓度的蛋白质标准品的复杂样本,科学家们研究了无标记(label free)和基于标记(TMT和iTRAQ)的肽定量的定量限制,包括前体混合的评估及其对同重

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

第三届质谱论坛:质谱技术在组学研究中的应用

技术讲座 沃特世科技(上海)有限公司技术专家 贾伟博士   来自沃特世科技(上海)有限公司技术专家贾伟博士带来了题为《蛋白质结构质谱分析技术进行》的报告。贾博士在报告中重点介绍了蛋白质修饰分析、蛋白高级结构分析和蛋白差异构象分析这三方面内容。   蛋白质修饰分析   蛋白质

4D蛋白质组学:如何通过软件创新变得更强大?

  在过去的二十年中,新技术、新方法的重大进步使蛋白质组学成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的一个极其强大的工具1。随着分析仪器的不断发展,蛋白质组学研究的每一项技术进步都会产生更多的数据。与此同时也给生物信息学软件的开发带来了新挑战。  当代基于高通量质谱的蛋白质组学方法使人们对生命过程获得

改善蛋白组学研究图像分析的新软件

对双向电泳(2DGE)等蛋白分离实验的图像进行分析不仅耗时,而且经常丢失样本或得出假阳性结果。上周在伦敦举行的AngloNordic Biotech Conference IV会议上 ,瑞典Ludesi公司CEO Ola Forsstrom-Olsson宣布这种现状将有可能得到改善,其公司已经获得了

赛默飞世尔举办“蛋白质组学及质谱基础知识”网络讲座

  2011年3月23日,赛默飞世尔科技借分析测试百科网这一平台成功举办了本月第三场网络视频讲座——蛋白质组学及质谱基础知识。赛默飞世尔科技蛋白质组学市场专员唐佳工程师为大家介绍了蛋白质组学、生物质谱的发展历史、基本原理、最新进展以及The

第二届西湖临床质谱研讨会-探讨临床蛋白质组学

  Progresses and Perspectives of Mass Spectrometry-based Clinical Proteomics  基于质谱的临床蛋白质组学的研究进展与展望联合主席:Steve Pennington 贺福初 郭天南主办单位:西湖大学 CNHUPO HUPO会议

如何确定质谱定量分析选择依据

  使试样中各组分电离生成不同荷质比的离子,经加速电场的作用,形成离子束,进入质量分专析器,利用电场和磁场使属发生相反的速度色散——离子束中速度较慢的离子通过电场后偏转大,速度快的偏转小;在磁场中离子发生角速度矢量相反的偏转,即速度慢的离子依然偏转大,速度快的偏转小;当两个场的偏转作用彼此补偿时,它

质谱MRM技术定量分析与应用

质谱多反应监测(multiple reaction monitoring, MRM)技术作为一种质谱检测的分析方法,具有特异性强、灵敏度高、准确度高、重现性好、线性动态范围宽、自动化高通量的突出优点,这些特质能够满足今天很多研究领域的迫切需要。通过MRM技术进行实时的定量监测可以进行药代动

色谱质谱联用仪软件相关特点

  软件  实时采集功能提供了全扫描与选择离子扫描的数据采集,可获得准确的定性、定量结果数据  提供自动调谐与手动调谐功能  数据处理模块提供定量方法创建功能  集成NIST谱图检索功能,可以方便、准确检索目标分析物  用户界面友好、易操作。

布鲁克收购质谱软件企业SCiLS-GmbH

  分析测试百科网讯 2017年1月4日,布鲁克宣布对德国不来梅SCiLS GmbH进行收购,本次收购的具体财务细节未披露。  据介绍,SCiLS的主要业务是开发软件工具,如统计分析软件、复杂的可视化观察,并为复杂的质谱成像(MSI)的数据集提供基于云的安全服务。  SCiLS的创始人来自于不来梅大

Waters质谱masslynx软件使用说明

Waters质谱masslynx软件使用说明  

用什么软件可以处理质谱图

每一个品牌的质谱仪软件都不一样,出来的数据也就不一样,但是所有的质谱仪一定都是可以导出一个文本文件,里面包含数据的。我们实验室要求用Igor pro,用matlab, origin, python甚至excel都可以迅速的导入数据然后出图。因为我们仪器是自己定制的,所以的到的就是原始数据,有些质谱仪

定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT

iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标

定量蛋白质组表达谱分析技术iTRAQ/TMT

  iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签,通过特异性 标记多肽的

赛默飞世尔科技精彩亮相第六届AOHUPO大会

  2012年5月5~7日,第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会在国家会议中心卡隆重召开,这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。赛默飞世尔科技作为此次大会的金牌赞助商,展示了其蛋白质组学领域的最新产品技术及解决方案。赛默飞世尔科技展台大会入口处摆设了赛

大化所高通量多重蛋白质组定量分析方法研究获进展

  近日,中科院大连化学物理研究所王方军博士、邹汉法研究员等人在高通量多重蛋白质组定量分析方法研究方面取得新进展,发展了一级质谱(MS1)谱图中六种不同蛋白质样品同时规模化定量分析的同位素标记方法,并将该方法应用于细胞蛋白质合成-降解周转更新分析,分析通量是常规同位素标记方法的三倍,研究成果发表在自

蛋白质组学技术分析方法及概括

1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月的“Elec

蛋白质组学技术分析方法及概括

1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并在1995 年7月的“Electr

生物质谱——蛋白质组学研究的肱股之臣

  分析测试网讯 2017年11月29日,由北京大学,首都科技条件平台主办,安特百科(北京)技术发展有限公司(分析测试百科网)协办的题为“生物质谱在蛋白质组学研究中的应用”的讲座在北京大学化学与分子工程学院化学楼A201报告厅举办,来自蛋白质行业的专家学者参与了此次讲座。北京大学分析测试中心、美国密

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻

质谱检测法与蛋白质分析(二)

  离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪   随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化,我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪,我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不仅提高了数

质谱检测法与蛋白质分析(三)

  Protein(s):待测蛋白质样品;Enz. Digestion:酶解;Pep. Mixture:裂解产物混合物;   MS Analysis:质谱检测分析;DB Search:数据库比对搜索;Identities:鉴定;   Prot.DB :蛋白质数据库;Proteom

质谱检测法与蛋白质分析(一)

质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质