定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ／TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签，通过特异性 标记多肽的氨基基团，然后进行串联质谱分析，可同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量。iTRAQ/TMT试剂由三部分组成：报告基团、平衡基团和反应基团。反应基团形成2-10种等质量同位素标签。iTRAQ/TMT试剂标记酶解后的肽段，可与氨基酸N端及侧链的伯胺基团发生反应。在一级谱图中，来自于不同样本的同一肽段，标记后表现为相同的质荷比。在二级谱图中，报告基团、平衡基团和反应基团之间的键断裂，带不同同位素标签的同一肽段产生质量不同的报告离子，根据报告离子的丰度可获得样本间相同肽段的定量信息，再经过软件处理得到蛋白质的定量信息。其基本原......阅读全文
定量蛋白质组表达谱分析技术iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签，通过特异性 标记多肽的
定量蛋白质组表达谱分析技术——iTRAQ/TMT
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技术是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术。这两种技术采用2-10种稳定同位素标签，通过特异性 标
蛋白质定量技术――iTRAQ
摘要：同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）技术是近年来最新开发的一种新的蛋白质组学定量研究技术，具有较好的定量效果、较高的重复性，并可对多达四种不同样本同时进行定量分析。研究人员采用iTRAQ蛋白质定量技术加速蛋白质的定量研究，当然这门新兴的工具仍然需要进一步的完善。 仅仅知道蛋白质的身
iTRAQ定量蛋白质组学技术分析抗菌肽F1的抗菌机制研究
本研究利用iTRAQ定量蛋白质组学分析技术，对抗菌肽F1处理的大肠杆菌及空白对照在不同时间段菌体的生长速率以及其产生的蛋白质进行了分析与鉴定，通过比较实验组与对照组蛋白质表达水平差异，以期了解抗菌肽F1的抗菌机制。 抗菌肽在农业和食品工业中受到越来越多的关注，因为它们具有控制病原体的潜力。然而
形形色色的蛋白标签（二）
体内标记 对于in vivo标记，人们通常用化学标记的营养物喂养细胞，让它们掺入新合成的蛋白、核酸或代谢物。之后收获细胞，分离出这些分子，从整体上查看细胞行为，或利用抗体或其他捕获试剂来研究某个蛋白。 蛋白质组研究人员常用的方法是SILAC，即细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记。两
蛋白质组和转录组的表达谱分析方法相同吗
不相同。对生物体特定状态下的基因和蛋白质表达水平进行全方位分析，或得一个表达谱的“全景图”；挖掘受转录后调控的关键蛋白或关键基因，寻找某些关键的代谢通路或者调控因子；对于一些蛋白数据库不完整的物种，通过转录组数据构建蛋白质库，可以大幅度提高蛋白质的鉴定数。
利用蛋白质组学技术（iTRAQ）研究不同育性的油松胚胎
【APT出品】做组学，发文章 so easy！ Differential proteomic analysis revealing the ovule abortion inthe female-sterile line of Pinustabulaeformis Carr.
利用蛋白质组学技术（iTRAQ）研究不同育性的油松胚胎...
利用蛋白质组学技术（iTRAQ）研究不同育性的油松胚胎在蛋白质层面的表达差异Differential proteomic analysis revealing the ovule abortion inthe female-sterile line of Pinustabulaeformis Car
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（一）
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
液质联用中的数据采集和分析
质谱仪器的主要控制系统包括电源控制、同步与时序控制、数据采集三大部分，三大部分的整合则是通过控制软件来达成，本文不再详述。下面主要介绍一些常见术语和一些特殊的方法。 1、质谱图 质谱图的X轴代表质荷比，Y轴代表离子峰的相对强度或以离子数目呈现。原始质谱图称作轮廓谱图（Profile Spec
质谱技术助力全新定量蛋白质组数据差异分析计算模型
8月13日，国际学术期刊Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所中科院计算生物学重点实验室（马普计算生物学研究所）邵振课题组研究论文“MAP: model-based analysis of proteomic data to detect proteins wit
蛋白质组质谱新方法一览
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
应用Orbitrap－Fusion对TMT标记样本进行MS2定量方法...（一）
应用Orbitrap Fusion对TMT标记样本进行MS2定量方法以及SPS MS3定量方法的比较1. 前言目前，蛋白质组学研究已经由传统的大规模鉴定逐步转向了靶向蛋白质组学，研究内容已经由蛋白质鉴定扩展到了蛋白质相对和绝对定量，蛋白质相对定量方法中应用最普遍的为标记定量，包括：ICAT，DIAR
不同标记与非标记蛋白质组学定量准确性分析研究
通过质谱法进行定量蛋白质组分析为生物医学探索研究提供非常重要的途径。 然而，了解生物样品中的定量限制对于准确判断结果非常重要。通过使用加入已知浓度的蛋白质标准品的复杂样本，科学家们研究了无标记（label free）和基于标记（TMT和iTRAQ）的肽定量的定量限制，包括前体混合的评估及其对同重
蛋白质组学（TMT+labelfree）破译衰老密码
众所周知，干细胞的老化被认为是导致组织和器官老化的根本原因，尤其是在高周转率的生物系统中，比如造血作用。随着干细胞的老化，受损组织被替换的潜能也会随之减弱，在人体中，贫血，适应性免疫系统能力的下降，以淋巴细胞为代价的骨髓细胞的扩张，以及频发的血液系统恶性肿瘤，这些都已经被报道与衰老息息相关。但是这些
蛋白质组学相关问题与解答
1．为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到？ 人血浆中的蛋白是有上万种的，而一般质谱只能检测到五六百种，也就是说只占了其中的百分之几，这是普遍现象，说明咱们的方法是不存在问题的；其次，ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样，前者具有放大效应，因为其间会用
技术推广－DIA+PRM技术，全蛋白筛选及目标蛋白验证一体化
随着质谱仪器的不断更新换代，蛋白组学的技术也不断的革新，从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性；从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术，每一次的技术革新都使得蛋白组学研究更上一阶。 当下蛋白组学研究中
蛋白质DIA检测原理
数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。可以对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂，采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白质组学研究手段，如iTRAQ\TMT、 Label-fr
iTRAQ技术常见问题与答疑
1、什么是iTRAQ？ iTRAQ技术，即同位素相对标记与绝对定量技术。该技术可对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对和绝对定量研究，具有较好的定量效果、较高的重复性。由于其能够同时对多达8种样品进行标记分析,故在生命科学的各个领域得到了广泛的应用。2、iTRAQ的原理是什么？
定量蛋白质组学的技术发展
以质谱为基础的定向蛋白质组学研究领域的发展历程并不短，早在上个世纪70年，三重四极杆质谱仪就已经出现，并在80年代首次在发表的文章中，证明可以被用来检测肽段。 过去几年间，更广泛的范围内定向质谱技术的应用迅速攀升，而且新方法，新工具，新资源和新一代方法，也令更多研究领域的科学家们能利用到这项技
iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程（一）
大家好，我是黄博，吉凯一小兵，蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男（我一直是这么定位自己的）是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事，真的是有血、有泪、有shi！情节需要，中间可能会穿插一些技术方面的内容，请各位自动忽略。那是一个月黑风高的晚上，本人和大尾巴狼（我实在不想
iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程介绍
大家好，我是黄博，吉凯一小兵，蛋白质组学实验狗。今天的故事是一个作文从没及格过的闷骚理科男（我一直是这么定位自己的）是如何被陈博内个大尾巴狼生生逼来写文章的故事，真的是有血、有泪、有shi！情节需要，中间可能会穿插一些技术方面的内容，请各位自动忽略。 那是一个月黑风高的晚上，本人和大尾巴狼
iTRAQ蛋白质组学研究原理、优势及实验流程（二）
“那iTRAQ的原理是什么，有哪些优势？”“iTRAQ（Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation）技术由美国AB SCIEX公司研发，最早于2004年美国质谱年会上被提出，是一种基于体外等重同位素标记的相对定量技术。该技术利用同
中科院Nature开源性刊物发表蛋白质研究新技术
来自中科院大连化学物理研究所的研究人员开发一种新型的同位素标记策略，可对6种不同的蛋白质样品进行可靠标记并进行同时定量。并证实这一策略适用于高通量检测蛋白质周转(turnover)动态。这一研究成果发表在国际著名刊物Nature旗下开源性刊物Scientific Reports上。 中
愿iTRAQ亮剑，蛋白质组学助力癌症“登月计划”
老美大当家的奥大叔似乎并不愿悄悄离去，在其任期最后一年又搞了个大动作。年初，奥叔在对国会发表的国情咨文中宣布将发起一项寻找癌症治愈疗法的“登月计划”，并任命二当家的拜登为该项目负责人。此外还有两项分别由个人（陈颂雄）和医院（美国MD安德森癌症中心）发起的癌症“登月计划”，可见老美此次是倾全国之力
“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
1999年，Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun)，其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索，从而确定蛋白质的种类，可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称
水生所非编码RNA分子机制研究取得进展
非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）是指不能编码产生蛋白质的RNA分子，种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA（miRNA）、长链非编码RNA（lncRNA）以及环状RNA（circRNA）等。越来越多的研究表明，非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能。中国科学
NAT－COMMUN－|－蛋白质组学（TMT+labelfree）破译衰老密码
众所周知，干细胞的老化被认为是导致组织和器官老化的根本原因，尤其是在高周转率的生物系统中，比如造血作用。随着干细胞的老化，受损组织被替换的潜能也会随之减弱，在人体中，贫血，适应性免疫系统能力的下降，以淋巴细胞为代价的骨髓细胞的扩张，以及频发的血液系统恶性肿瘤，这些都已经被报道与衰老息息相关。但是
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（四）
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
定量蛋白质组学质谱采集技术进展（二）
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,