Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化

N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl(Sex-lethal)基因调控中起到的关键作用。Sxl是一个涉及性别决定的开关基因,果蝇的性别取决于Sxl蛋白是否合成。雄性果蝇和雌性果蝇的Sxl都会转录成mRNA,但只有雌性果蝇的mRNA能通过可变剪切生成功能性蛋白。可变剪切是一种广泛存在的基因表达机制。研究人员发现,m6A介导果蝇Sxl的可变剪切,最终决定果蝇发育成雄性还是雌性。“大自然有许多方式来决定性别,m6A介导的基因表达调节可能就是一个古老的机制,”这项研究的领导者,伯明翰大学的Dr Matthias Soller说。除了决定果蝇性别,Sxl的m6A调控还是生殖干细胞开......阅读全文

北京基因组所揭示半甲基化在基因表达调控中的作用

  DNA甲基化是最早发现的表观遗传标记之一,在真核细胞基因表达调控中发挥重要作用。随着DNA甲基化检测技术的进步,研究发现DNA甲基化具有完全甲基化和半甲基化两种状态,以及可以稳定遗传的半甲基化修饰。关于DNA半甲基化是否具有独特的生物学功能仍有争议,因而需要对DNA半甲基化进行研究。此外,传统的

Nature发表表观遗传学重要发现决定性别的RNA甲基化

N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和长非编码RNA上最普遍的一种RNA修饰,介导了超过80%的RNA碱基甲基化。人们已经陆续鉴定了m6A所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白,但对其生物学功能还知之甚少。伯明翰大学的科学家们在Nature杂志上发表文章,揭示了m6A在Sxl

基因组中表达基因的类型介绍

基因组中表达的基因分为两类:⑴一类是维持细胞基本生命活动所必须的,称管家基因(house keeping gene),如各种组蛋白基因;⑵另一类是指导合成组织特异性蛋白的基因,对分化有重要影响,称奢侈基因(luxury gene),即组织特异性(tissue-specific gene)表达的基因,

北京大学Nature发布重要甲基化景观图

  来自北京大学、教育部辅助生殖重点实验室、哈佛大学等机构的研究人员,绘制出了人类早期胚胎全基因组水平的DNA甲基化景观图谱,提出了有别于以往小鼠研究结果的一些新见解。这些研究结果发表在7月23日的《自然》(Nature)杂志上。  北京大学第三医院的乔杰(Jie Qiao)教授以及汤富酬(Fuch

徐国良院士Nature发表表观遗传学重要成果

  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,而且这种修饰会受到环境因素的影响。DNA甲基转移酶(DNMT)介导的胞嘧啶甲基化是哺乳动物基因组最常见的一种表观遗传学修饰,在基因组印记、X染色体失活等重要过程中起到了关键性作用。TET家族的双加氧酶能够逐步氧化5-甲基胞嘧啶,由此实现

基因组DNA甲基化分析方法

早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基

关于胚胎干细胞的全能原因分析

  天然胚胎里的干细胞是一种“全能”细胞,可以分化成所有类型的细胞。瑞士科学家发现,胚胎细胞全能特性的秘密在于一种蛋白质。这种蛋白质称为Pramel7,它存在于早期胚胎细胞里,可以阻止基因组里的DNA(脱氧核糖核酸)代码被挂上“封存”的化学标签,保持基因组的开放性 [4]。  所有细胞都携带生物体的

华东师大翁杰敏JBC发表新成果

  四月二十一日,来自华东师范大学、中山大学癌症研究中心和芝加哥大学的研究人员,在国际学术期刊《Journal of Biological Chemistry》在线发表题为“Non-germline Restoration of Genomic Imprinting for a Small Subs

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

中国科学家9月参与发表多篇Nature文章

  9月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表,其中包括首次揭示m6A甲基化修饰的新作用,表观遗传调控核心复合物PRC2招募到基因组上重要位点的分子机制,以及兰花基因关键演化机制。  来自中科院动物研究所,北京基因组研究所的研究人员通过m6A测序技术(m6A-Seq),首次揭示m

Cell:两项研究解析胚胎干细胞的表观遗传机制

  在干细胞研究领域中,表观遗传调控,尤其是细胞核内染色体高级组织形式一直是当前的前沿和热点领域。近日,两个研究小组在《细胞》(Cell)杂志上发表文章,分别报道了人类胚胎干细胞的转录和表观遗传动态机制 以及 多向分化胚胎干细胞的表观遗传作用机制。   在第一项研究中,来自哈佛麻省Broad研

动物所突破哺乳动物同性生殖障碍

  同性生殖的现象在动物中并不罕见,例如在爬行类的蜥蜴、两栖类的蛙,以及多种鱼类中,都有“孤雌生殖”现象:即不经过与雄性的交配,雌性个体即可生下后代。作为有性生殖的补充,孤雌生殖能在缺乏雄性的情况下,维持个体的繁衍与种群的更新。与孤雌生殖对应的孤雄生殖则极其罕见,迄今只在一种斑马鱼中发现孤雄生殖。然

我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控

  近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。   CpG岛是指基

我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控

  近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。   CpG岛是指基

中大学子与学术牛人解析RNA修饰与癌症干细胞

  N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰,这种可逆的RNA甲基化修饰与人类疾病有关。研究者们已经陆续定位了哺乳动物转录组中的m6A,鉴定了这种动态修饰所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白。不过,人们还对m6A起到的具体作用还知之甚少。  约翰霍普金斯

甲基化领域重要研究成果解读!

  本文中,小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习!  【1】Science:重大进展!揭示DNA甲基化增强基因转录机制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不

研究人员绘出苹果基因组草图

  一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上报告说,他们绘出了苹果的基因组草图,这将有助于从基因水平上分析苹果性状,培育更多苹果新品种。  意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说,他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果

研究人员揭示超级增强子动态甲基化调控转录异质性

  CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一种用来控制基因表达的DNA化学修饰,而我们对DNA甲基化在基因组不同区域的具体功能,在疾病、发育过程中所扮演的具体角色,以及控制基因表达的详细机理,直到今天并没有全面详细的认知。  2019年8月15日,美国Whitehead研究所Rudolf Jae

Nature:代谢让干细胞永葆青春

  早期胚胎中的干细胞拥有无限的潜力,它们能够成为任何类型的细胞,人们一直希望利用这一点来治疗疾病和修复创伤。怎样才能将干细胞稳定在青春永驻的状态下呢?正确的环境可以帮助人们做到这一点,就像彼得.潘德的永无岛(Neverland)那样。  Rockefeller大学和Memorial Sloan K

甲基化的基因组直接测序法

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

在基因组范围定位DNA甲基化

  DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定,但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来,科学家们开发出多种新方法,试图在基因组范围定位DNA甲基化。   尽管从理论上来说,全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组,但它还是面临技

陈柏仰博士Cell揭示DNA去甲基化动态

  精子和卵子融合是动物个体发育的起点,不过这一过程并不仅仅是简单的融合。人们发现,在哺乳动物胚胎的早期发育中,全基因组的甲基化模式会发生明显的变化。在小鼠胚胎受精之前,雌雄生殖细胞具有较高的甲基化水平,受精后父源基因组迅速的发生主动去甲基化,而母源基因组发生被动的去甲基化。  为了了解人类生殖细胞

美国女院士表观遗传学新成果

  TET(ten-eleven translocation)蛋白是生物体内存在的一种α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2+依赖的双加氧酶,是DNA去甲基化过程中的一种重要的酶,对于维持干细胞的多能性有重要作用。多年来,科学家了解到,TET蛋白家族有肿瘤抑制因子的作用,但是,它们是如何抑制失控的癌细胞增

基因是否表达:cfDNA全基因组测序可揭晓

  《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。  全基因组测序就能知道基因是否表达  基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的蛋白质分子的

Cell重要成果:构建初始态人类干细胞

  来自英国Babraham研究所的科学家,与剑桥干细胞研究所和欧洲生物信息学研究所的同事们在9月11日的《细胞》(Cell)杂志上发表了他们的最新研究成果,这为研究人员能够生成基础状态的、初始态(naïve)人类干细胞满足未来的医学应用增添了希望。  在这项研究中研究人员证实,只需重设转录因子控制

科学家揭示克隆胚胎发育异常表观遗传机制

  同济大学教授高绍荣和张勇课题组通过对不同发育命运体细胞克隆胚胎进行全基因组DNA甲基化分析,揭示了异常的DNA再甲基化是导致克隆胚胎着床后发育异常的关键因素。该研究近日发表于《细胞—干细胞》。  虽然体细胞克隆在多种动物上已获得成功,但克隆胚胎中DNA甲基化的重编程过程及其对克隆效率的影响在很大